XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System癌基因
表征三价vav1- ...
在VAV1鸟嘌呤核苷酸交换因子1中的突变最近在周围T细胞淋巴瘤和非细胞肺CER（NSCLC）中发现。为了理解其致病潜力，我们生成了一种基因编辑的小鼠模型，该模型表达了VAV1突变蛋白，该模型可弥补肿瘤中最常发现的VAV1突变体亚类中存在的信号变化。我们无法检测到这些小鼠中任何明显的肿瘤过程。然而，在它们中同时消除TRP53抑制基因的驱动T细胞淋巴细胞化。此过程代表了野生型VAV1在卵泡辅助T细胞中发挥作用的正常功能的加剧。我们还发现，与KRAS癌基因相结合，VAV1突变体版本有利于NSCLC的进展。这些数据表明VAV1突变在肿瘤发生中起作用，尽管高度细胞类型，但虽然高度细胞型。他们还表明，此类功能取决于所涉及的肿瘤的突变景观。
菲律宾乳腺癌健康报道
• 诊断 – 手术活检。 • 分期 – 手术期间，检查癌症周围的区域，包括淋巴结和附近的器官。 • 治愈性 – 当癌症仅出现在身体的一部分，并且很可能可以切除所有癌症时进行。可与其他治疗方法一起使用，如化疗或放射疗法。 • 减瘤 – 当切除整个肿瘤会对附近的器官或组织造成太大损害时进行。 • 姑息治疗 – 可与其他治疗方法一起使用，以纠正导致疼痛、不适或残疾的问题。 • 支持性 – 帮助人们更容易获得其他类型的治疗。例如，血管通路装置，如 Port-A-Cath。 • 重建性 – 用于改善患者在大型癌症手术后的外貌，或用于恢复器官或身体部位的功能。例子包括乳房切除术后的乳房重建。 • 预防性 – 用于切除可能变成癌症的身体组织 – 即使手术时没有癌症迹象。例如，一些有乳腺癌家族病史的女性会遗传乳腺癌基因（称为 BRCA1 或 BRCA2）。
通过原位转化的脑室区域神经干细胞的原位转化
This protocol describes the surgical procedure for co-electroporation of two plasmids targeting neu- ral stem cells (NSCs) in the lateral ventricle of mouse postnatal day 2 (P2) pups: a nonintegrating plasmid encoding for the piggyBase transposase and Cas9 and an integrating piggyBac vector car- rying the oncogenes, CRISPR guide RNAs and a TDTOMATO荧光报告蛋白通过倒末端重复序列（ITRS）倾斜（图1）。在电穿孔后，瞬时CAS9表达会导致肿瘤抑制基因失活，而PiggyBase介导的PIG-GYBAC货物的整合确保了靶向NSC及其后代中的癌基因和流动性记者的稳定表达。的整合是由PiggyBase转疗的酶促活性介导的，该转移的酶活性通过切割和粘贴机制在受体细胞基因组中的TTAA位点识别并将其与它们的内容一起插入。NSC的靶向是通过最小的人GFAP（HGFAPMIN）启动子序列1-3驾驶PiggyBase/cas9的驱动表达来实现的。
转化药代动力学 - 手术学建模，用于口服的新型新型淋巴瘤激酶和C-ROS癌的新型抑制剂1
摘要一种口服的大环小分子，PF06463922 [（（10 R）-7-Amino-12-氟-2,10,16-三甲基-15-oxo-10,15,16,16,16,17-15,17- tetrahydro-2 tetrahydro-2 H -8,4-（Metheno）pryrazolo [4,3-3-3-3-3-3-3-3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3，3,3,3,3，3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3，3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,3,4二氮杂环二环烷-3-碳硝基]，是一种变性淋巴瘤激酶（ALK）和C-ROS癌基因1（ROS1）的选择性抑制剂。The objectives of the present study were to charac- terize the pharmacokinetic-pharmacodynamic relationships of PF06463922 between its systemic exposures, pharmacody- namic biomarker (target modulation), and pharmacologic response (antitumor efficacy) in athymic mice implanted with H3122 non – small cell lung carcinomas expressing echinoderm微管相关的蛋白质样4（EML4） - 烷突变（EML4-ALK L1196M）和表达CD74- ROS1的NIH3T3细胞。在这些非临床肿瘤模型中，PF06463922分别以EML4-ALK L1196M和CD74- ROS1的方式口服，分别为每次剂量的0.3 - 20和0.01 - 3 mg/kg，分别为每次剂量两次。等离子体浓度时间曲线
生物标志物释放：从混乱到基因组数据清晰度的编程管道
生物标志物分析在诊断和临床试验中越来越重要，不仅在肿瘤学，而且在其他领域，随着洞察力获得的见解为个性化疗法铺平了道路。通用术语“生物标志物”包括多种生物分子，这种多样性也适用于其分析方法的类型。一种有希望的情况是使用遗传数据，可以通过下一代测序（NGS）获得。在基因组学领域工作，统计程序员面临着处理大量主要非结构化原始数据的挑战。在这里，我们显示了一个模范管道，该管道详细介绍了NGS数据的处理以创建最终分析集。因此，我们通过使用公共数据库来解决数据标准化，协调和注释基因组数据的问题。分享有关此类工作流程的见解有望提高对生物标志物分析及其解决方案挑战的认识。引言近年来，通过在临床试验中引入大数据应用的彻底改变了患者护理。基因组测序为个体之间的高个体间变异提供了见解，得出的结论是，有可能将疾病定制为个体特征。1因此，个性化医学（也称为精密医学）已进入临床试验领域。通常认为这两个术语是类似的，但“个性化”一词引起了人们的关注，因为可能会误解为每个人的独特开发。精密医学的目标是什么？精确医学旨在使用生物标志物（个体特征）将个体分类为不同的亚群，以量身定制其医疗。分类可能基于对特定疾病的敏感性，疾病的潜在生物学或对特定治疗的反应。因此，个性化医学与常规疗法有所不同，因为它的重点是最有可能受益于这种治疗方法，支付费用和副作用的个人，这些人可能会通过常规疗法而产生。2基于这些分类，可以开发有针对性的方法，这些方法主要具有高度选择性与低级毒性相结合。3一个突出的例子是小分子抑制剂克罗唑替尼，该抑制剂用于NSCLC患者ALK或ROS1基因融合的靶向治疗方法。4–6在这种情况下，两种融合会导致肿瘤发育，因此可以充当基因组生物标志物。通过在诊断中使用它们，可以缩小多达7％4-6个NSCLC患者的小亚种群，这些类型的融合因子对克里佐替尼敏感。然而，这种目标方法也可能有一些陷阱，因为可能有一定数量的子人群中对该疗法没有反应，或者在一段时间后停止反应，这会导致疾病的进一步发展或复发。这是基于耐药性的共同现象，耐药性是精密医学中的另一个热门话题。虽然先前存在的抗性被称为“主要抗性” 7，但仅在治疗期间或由于治疗而形成的机制被称为“获得的抗药性”。8种耐药性的原因可以是多种原因，但是主要的机制是靶基因3中的突变，也称为靶标突变9，其中癌细胞试图逃避给定的疗法。除了其他机制（例如表观遗传变化）外，耐药性的另一个常见原因是肿瘤细胞用于提供持续信号传导的下游信号传导基因突变。这些类型的遗传改变通常称为脱靶突变9，并且可以发生在不同的基因亚型中，这些基因类型通常分为三类：癌基因，肿瘤抑制基因（TSG）和具有模棱两可作用的基因。致癌基因通常介导信号传导以用于细胞的生长和细胞分裂，而TSG速度减慢甚至抑制了这种信号并介导凋亡。这些亚型的突变变化会导致癌基因的激活增加或TSG抑制，这可能导致大规模和不受控制的细胞生长，例如肿瘤细胞。模棱两可的基因可以用作癌基因或TSG，具体取决于各自的细胞信号传导。可以使用遗传数据来分析提到的各种遗传异常，在该数据中，这种抗性突变（无论是靶向）被视为生物标志物。
腹膜和十二指肠的低粘性胃癌...
研究了四名粘性胃癌较差的患者。 分析的类型包括肠道（C1），标志环单元（C2和C4）和未指定的（C3）。 患者C4表现出胃胃肠道的十二指肠浸润。 尽管进行了几次诊断测试和治疗，但不可能确定肿瘤向十二指肠扩展或改善患者的进展。 肿瘤的测序鉴定出CREBBP中的突变，其变体呈现了精氨酸替代半胱氨酸，TP53癌基因中的突变并未改变氨基酸苏氨酸的位置（Thr125 =）。 C1，C2和C3病例在健康和肿瘤胃中进行蛋白质组学分析。 蛋白质与CREBBP和TP53基因相关的蛋白质，与精氨酸和半胱氨酸，组蛋白HAT和HDAC相关的其他蛋白质，以及泛素 - 蛋白酶体系统的蛋白质。 使用XLSTAT程序，观察到SDCBP，NCBP1，MGMT，RARS，HDAC1，UBE1和UBE2K蛋白的表达显着差异，突出了它们作为这种类型胃癌的生物标志物的潜力。 在实验研究中，Inobrodib在调节p300/cbp和使用MC-tRNA纠正突变引起的氨基酸误差方面显示出疗效。 另外，已经提出了靶向蛋白质降解研究了四名粘性胃癌较差的患者。分析的类型包括肠道（C1），标志环单元（C2和C4）和未指定的（C3）。患者C4表现出胃胃肠道的十二指肠浸润。尽管进行了几次诊断测试和治疗，但不可能确定肿瘤向十二指肠扩展或改善患者的进展。肿瘤的测序鉴定出CREBBP中的突变，其变体呈现了精氨酸替代半胱氨酸，TP53癌基因中的突变并未改变氨基酸苏氨酸的位置（Thr125 =）。C1，C2和C3病例在健康和肿瘤胃中进行蛋白质组学分析。蛋白质与CREBBP和TP53基因相关的蛋白质，与精氨酸和半胱氨酸，组蛋白HAT和HDAC相关的其他蛋白质，以及泛素 - 蛋白酶体系统的蛋白质。使用XLSTAT程序，观察到SDCBP，NCBP1，MGMT，RARS，HDAC1，UBE1和UBE2K蛋白的表达显着差异，突出了它们作为这种类型胃癌的生物标志物的潜力。在实验研究中，Inobrodib在调节p300/cbp和使用MC-tRNA纠正突变引起的氨基酸误差方面显示出疗效。另外，已经提出了靶向蛋白质降解
分子遗传学研究生主题课程MMG1316H S
分子遗传学研究生主题课程MMG1316H S课程标题：癌症遗传学课程地点：西奈山医院600大学大街1062室，10楼Murray Street Elevertors课程时间和日期：2月至4月。2:00 PM-4:00PM课程讲师：Irene Andrulis/ Daniel Schramek教练联系信息（电子邮件）：schramek@lunenfeld.ca; ANDRULIS@lunenfeld.ca Additional Lecturers (list name, email, Department): Dr. Peter Dirks, Molecular Genetics Dr. David Malkin, Institute of Medical Science Dr. Steven Gallinger, Laboratory Medicine and Pathology Dr. Hartland Jackson, Molecular Genetics Dr. Kieran Campbell, Molecular Genetics Course Overview: This course will focus on recent advances in cancer molecular genetics and application to human disease. 具体而言，我们将针对癌症易感性（肿瘤抑制和DNA修复基因），肿瘤特异性基因组学和基因表达（肿瘤抑制基因和癌基因）以及针对此知识的治疗方法解决遗传因素。 在每个领域，将强调临床应用和相关性。 将解决这项研究的科学工具，例如统计遗传学，表达分析，基因组筛查和siRNA方法。 该课程将包括演讲，演讲以及选定出版物的讨论。 课程等级将基于演讲，参与讨论和简短的书面论文。 课程目标：2:00 PM-4:00PM课程讲师：Irene Andrulis/ Daniel Schramek教练联系信息（电子邮件）：schramek@lunenfeld.ca; ANDRULIS@lunenfeld.ca Additional Lecturers (list name, email, Department): Dr. Peter Dirks, Molecular Genetics Dr. David Malkin, Institute of Medical Science Dr. Steven Gallinger, Laboratory Medicine and Pathology Dr. Hartland Jackson, Molecular Genetics Dr. Kieran Campbell, Molecular Genetics Course Overview: This course will focus on recent advances in cancer molecular genetics and application to human disease.具体而言，我们将针对癌症易感性（肿瘤抑制和DNA修复基因），肿瘤特异性基因组学和基因表达（肿瘤抑制基因和癌基因）以及针对此知识的治疗方法解决遗传因素。在每个领域，将强调临床应用和相关性。将解决这项研究的科学工具，例如统计遗传学，表达分析，基因组筛查和siRNA方法。该课程将包括演讲，演讲以及选定出版物的讨论。课程等级将基于演讲，参与讨论和简短的书面论文。课程目标：
BRAF的时间依赖性
候选心肌细胞（CM）有丝分裂原（例如影响细胞外信号调节激酶（ERK）信号通路的促菌根，代表了功能性心脏再生的潜在靶标。我们探讨了通过B-RAF原始癌基因（BRAF），BRAF-V600E（CABRAF）的组成性活性突变体激活ERK是否可以诱导新生大鼠工程性心脏组织（ECTS）中的普遍效应。持续的CM特异性CABRAF表达诱导了慢性ERK激活，实质性组织生长，肉瘤和收缩功能的缺陷以及组织僵硬，所有这些都持续了至少4周的培养。表现出广泛的转录组变化，转向糖酵解代谢，连接蛋白43的丧失和备受射击表型。瞬态，强力霉素控制的CABRAF表达表明，CM循环的诱导是迅速的，并且在功能下降之前，并且仅通过短暂的ERK激活才能可逆。一起，BRAF激酶的直接激活足以调节CM循环和功能表型，从而提供了机械洞察力，可以使ERK信号传导在心脏发展和再生背景下的作用。
实体瘤管道
缩写：1L，第一行； 2L，第二行； 3L，第三行； 4-1BB，肿瘤坏死因子受体超家族成员9; ADC，抗体 - 药物结合； BSAB，双特异性抗体； CCR8，C-C基序趋化因子受体8； CD16A，FC受体FCγRIIIA; CD3，分化3群； CDAC，嵌合降解激活化合物； CEA，癌脑抗原； DGKζ，二酰基甘油激酶ζ； DLL3，类似三角洲的配体3; EGFR，表皮生长因子受体； ES-SCLC，广泛的小细胞肺癌； FGFR2B，成纤维细胞生长因子受体2，同工型IIIB； GBRCAM，种系乳腺癌基因（BRCA）突变；胃肠道，胃肠道； GPC3，Glypican-3; IL-15，白介素15; Kras，Kirsten大鼠肉瘤病毒； LS-SCLC，有限阶段的小细胞肺癌； MCRPC，转移性cast割前列腺癌； MTX，维护处理； MUC1，粘蛋白1; PARP 1/2，聚（ADP-核糖）聚合酶1和2； PRMT5，蛋白精氨酸甲基转移酶5； PSOC，铂敏感的卵巢癌； SCLC，小细胞肺癌； STEAP1，前列腺1的六跨膜上皮抗原。
在非小细胞肺癌中具有小分子和免疫疗法组合的毒性
第四阶段NSCLC中的抽象治疗分层是通过鉴定癌基因驱动突变的指导。具有当前许可的治疗剂的可作用突变包括表皮生长因子受体（EGFR），变性淋巴结淋巴瘤激酶（ALK），ROS-1和BRAF V600的重排。除了小分子疗法的进展外，免疫检查点抑制剂（CPI）的发展已经改变了III期和IV期NSCLC的景观。CPI的成功导致在并发和顺序设置中使用小分子治疗进行了评估。在这篇综述中，我们总结了IV期NSCLC中CPI和酪氨酸激酶抑制剂（TKI）的最新结果，并以并发和顺序方法详细介绍了显着的毒性及其潜在机制。由于发现越来越多的治疗靶标的临床医生越来越重要，可以纠正序列治疗以提供安全有效的治疗。除了第四阶段疾病外，我们还建议关键NSCLC驱动因素的全面分子分析，尤其是在第三阶段疾病中，将有助于告知最佳治疗测序并最大程度地减少潜在毒性。