eothenomys miletus是一种居住在亨格山区(HDR)的地方性物种,并作为瘟疫和hantaviruses的主要宿主之一。虽然已经对大肠杆菌的生理特征进行了广泛的研究,但分子方面,尤其是Miletus的迁移方向,尚不清楚。在本研究中,我们利用基因组数据来研究四个人群的迁移方向:Ailaoshan(ALS),Jiangchuan(JC),Lijiang(LJ)和Deqin(DQ),它们分布在HDR内部到北部。我们的结果表明,ALS种群位于系统发育树的底部,混合物分析表明,ALS人群与JC和DQ种群更紧密相关。整合了分子遗传结构,米氏大肠杆菌的化石记录以及我们的研究结果,我们推断了米尔塔斯大肠杆菌的迁移方向可能是从南到北的,这表明DQ和JC种群可能起源于ALS的迁移。但是,LJ人群的迁移模式和起源需要进一步研究和讨论。此外,我们专注于识别不同人群中选择和局部适应的基因组信号。我们确定了与DQ:SIX1、64和SOX2中嗅觉位置相关的三个选择基因。我们假设这些基因可能与DQ人群对该地区微气候的适应有关。总而言之,本研究是第一个采用基因组学来探索Miletus的迁移方向,这对于未来对Eothenomys起源的研究至关重要。
我们描述了一种分析复杂微生物种群遗传多样性的新型分子方法。该技术基于通过变性梯度凝胶电泳 (DGGE) 分离编码 16S rRNA 的聚合酶链式反应扩增基因片段,这些片段的长度相同。对不同微生物群落的 DGGE 分析表明,分离模式中存在多达 10 个可区分的条带,这些条带很可能来自构成这些种群的许多不同物种,从而生成了种群的 DGGE 图谱。我们表明,可以识别仅占总种群 1% 的成分。使用针对硫酸盐还原菌 16S rRNA 的 V3 区特异性的寡核苷酸探针,可以通过杂交分析识别某些微生物种群的特定 DNA 片段。对在有氧条件下生长的细菌生物膜的基因组 DNA 进行分析表明,尽管硫酸盐还原菌具有厌氧性,但它们仍存在于这种环境中。我们获得的结果表明,该技术将有助于我们了解未知微生物种群的遗传多样性。
1。2。Medicina,洛杉矶大学,圣地亚哥,智利。 div>3。医学外科医生,洛杉矶大学,圣地亚哥,智利。 div>4。制药化学家,安德烈斯·贝洛大学(Andres Bello University),圣地亚哥,智利。 div>摘要 div>
Motu Profiler或Short Motus是一种软件工具,可以从分类学组成,代谢活性成员的丰富性以及菌株群体的多样性方面对微生物群落的生产。为此,它维护了单拷贝系统发育标记基因序列的数据库,该数据库被用作参考,简短读取的元基因组和元文字读数被映射为识别和定量微生物分类群。在这里,我们描述了两个基本协议中最常见的MOTU剖面用例。其他支持协议提供有关其安装和深入指南的信息,以调整其设置,以增加或降低检测和量化分类单元的严格度,以及用于自定义输出文件格式。提供了解释分析结果的指南,以及有关独特功能,方法学细节和工具的开发历史的其他信息。©2021作者。Wiley Perigonicals LLC发布的当前协议。
研究表明,热带森林正在以惊人的速度破坏(Hartshorn,1989; Sabogal,1992; Legesse Negash,1995; Demel Teketay,1996)。森林砍伐已导致森林覆盖量的下降,全球和国家一级生物多样性的丧失(Skole and Tucker,1993; Epa,1997; Kumar,1997)。贫穷和缺乏替代的生计一直是森林破坏的驱动力。埃塞俄比亚的森林遗传资源保护策略(2002年)和关于森林发展,保护与利用的宣言(2007年)已将森林砍伐视为对埃塞俄比亚森林生物多样性的主要威胁。由于人口不断增长,对燃料木材的需求不断增加,森林中的非法定居点,伐木和非法贸易的扩大是造成森林资源损失的主要因素,因此农业用地的森林砍伐。森林覆盖范围的减少和森林遗传资源的丧失对保护森林生物多样性构成了严重威胁。
水产养殖是增长最快的领域之一,预计将进一步增长,以便为不断增长的人口提供食物。彩虹鳟鱼的文化(Oncorhynchus mykiss)是拉丁美洲和加勒比海地区(LAC)地区的主要水产养殖活动之一,是世界第二大生产国。水产养殖主要是由经济资源低的农村社区开发的。因此,该地区的许多国家缺乏足够的基础设施。合格人员;流行病学监测;和足够的卫生控制。由于没有及时的诊断,该地区由于进入边境病原体的进入而经历了鳟鱼种植的死亡率提高。该项目旨在加强鳟鱼种植,以降低由于感染性胰坏死病毒(IPNV)和新兴疾病而引起的彩虹鳟鱼的高死亡率。该项目完全符合区域战略概况(RSP)2022 - 2029年《区域合作协议促进拉丁美洲核科学和技术》和加勒比海(Arcal)(ARCAL)的核科学和技术协议(ARCAL),该协议广泛面向贫困,通过通过内地进行粮食的粮食安全,从而终止荒原和康复,从而降低了贫困。核与核技术的应用,例如分子工具在动物生产和健康中,将发展和升级参与国家的检测和分化鳟鱼疾病的能力,以及鉴定与病毒疾病抵抗的免疫反应以及与免疫反应和遗传机制相关的遗传模式。新的生物技术用于通过分子表征和诊断不同病原体的诊断来促进该部门的健康(RSP 2022 - 2029)。这将有助于积极影响脆弱的社区,并将水产养殖和将水产养殖定位为自我 - 在该地区足够的活动。
遥感和机器学习的技术和方法论进步为推进野生动植物调查创造了新的机会。我们组建了一个实践社区(COP),以利用这些发展,以探索从管理层的角度来提高空中野生动植物监测的效率和有效性。COP的核心目标是组织遥感和机器学习方法的开发和测试,以改善支持管理决策的空中野生动植物种群调查。从2020年开始,COP合作确定了由野生动植物调查数据所告知的自然资源管理决策,重点是水鸟和海洋野生动植物。我们调查了我们的会员资格以建立1)他们使用野生动植物数量数据的管理决定; 2)在遥感/机器学习方法出现之前,如何收集这些计数数据; 3)过渡到遥感/机器学习方法学框架的动力; 4)从业者过渡到此框架时面临的挑战。本文记录了这些发现,并确定了朝着基于遥感的野生动植物调查迈向野生动植物管理方面的研究优先级。
最初发表于:Cora Olpe;塞巴斯蒂安(2023)的杰斯伯格(Jessberger)。成人海马神经性过程中的细胞种群动力学:剩下的未知数。海马,33(4):402-411。doi:https://doi.org/10.1002/hipo.23475
抽象密钥消息提出了一个原始的GWAS模型,该模型集成了等位基因的祖先,并允许探测背景特定的添加剂和优势QTL,涉及异性群互补性和混合性能。抽象的玉米遗传多样性被构造成彼此选择和改善的遗传群体。此过程会随着时间的流逝而增加组的互补性和分化,并确保由小组间杂交产生的杂种表现出较高的表现和异性症。为了确定与混合性能和杂种群体互补涉及的基因座,我们引入了一个原始的关联研究模型,该模型将等位基因的异性群的起源与异性构成群体分离,并将其与常规的添加剂/优势模型进行了比较。这个新模型应用于凹痕和弗林特线之间的阶乘,以及具有两种不同分析层的凹痕混合线之间的拨号线:在每个环境中和多种环境中。我们确定了所有特征的几个强大的添加剂QTL,包括一些用于开花时间的众所周知的加性QTL(在染色体8上的VGT1/2区域)。屈服特征在拨号面板中显示出显着的非加性效果。大多数检测到的产量QTL表现出过度势力或更有可能的伪过分效应。在这些QTL上明显过度污染,导致了遗传组互补性的一部分。环境之间的比较显示,添加QTL效应的稳定性高于非添加效应。我们还揭示了显示遗传群起源作用的大型染色体区域。根据局部杂种群的起源,几个QTL显示出效应的变化。总的来说,我们的结果说明了混合面板如何与专用的GWAS建模相结合,允许识别新的QTL,这些QTL无法通过通过传统建模分析的经典混合面板无法揭示的新QTL。