(续)指示统计上显着的差异(两尾t检验)。c和d,用媒介物(车辆)或20μmol/l d16处理的MDAH-2774细胞流式细胞仪细胞周期分析过夜。c,用PI染色的细胞的定量表明g 1-,s-和g 2 – m相间的细胞分布百分比。d,代表性pi files。*,p <0.05; **,p <0.01(两尾t检验,n = 3个生物学重复)。e,H1299稳定的殖民地形成
不同的KRAS变体如何影响体内肿瘤的启动和进展。我们假设KRAS G12D或KRAS G12V突变启动肿瘤形成的能力取决于上下文。AMHR2-CRE小鼠在组织中发育到输卵管,子宫和卵巢中的组织中表达CRE重组酶。我们使用这些小鼠来有条件地表达KRAS G12V/ +或KRAS G12D/ +突变。具有基因型AMHR2-CRE PTEN(FL/ FL)KRAS G12D/ +(G12D小鼠)的小鼠具有异常的卵泡结构,并在18周内开发了低级浆液卵巢癌,其渗透率为100%。相比之下,具有基因型AMHR2-CRE PTEN(FL/ FL)KRAS G12V/ +(G12V小鼠)的小鼠具有正常的卵泡结构,其中约90%的子宫肿瘤具有类似于平滑肌瘤和Leiomyosarcomarcoma的组织学特征多样的组织学特征。颗粒细胞肿瘤也在G12V小鼠中发展。 使用RNA测序和反相蛋白阵列分析鉴定出G12D和G12V小鼠子宫组织中细胞信号途径的差异。 我们发现CTNNB1,IL1A,IL1B,TNF,TGFB1,APP和IL6在G12V小鼠中的活性高于G12D小鼠。 这些小鼠模型将有助于研究由KRAS G12V/ +或KRAS G12D/ +突变驱动的信号传导途径的差异,以帮助开发针对特定的KRAS突变变体的靶向疗法。 由KRAS G12V/ +突变驱动的我们的平滑肌瘤模型也将有助于解密从平滑肌瘤到平滑肌肉瘤的恶性发展。颗粒细胞肿瘤也在G12V小鼠中发展。使用RNA测序和反相蛋白阵列分析鉴定出G12D和G12V小鼠子宫组织中细胞信号途径的差异。我们发现CTNNB1,IL1A,IL1B,TNF,TGFB1,APP和IL6在G12V小鼠中的活性高于G12D小鼠。这些小鼠模型将有助于研究由KRAS G12V/ +或KRAS G12D/ +突变驱动的信号传导途径的差异,以帮助开发针对特定的KRAS突变变体的靶向疗法。由KRAS G12V/ +突变驱动的我们的平滑肌瘤模型也将有助于解密从平滑肌瘤到平滑肌肉瘤的恶性发展。
在2009年中国急性肝癌坏死病(AHPND)的第一次爆发后,这种疾病仍被认为是虾类水产养殖业的全球危险疾病。当前,没有有效的方法来预防和治疗AHPND。因此,可以避免并控制这种疾病的快速检测方法被认为是最有效的策略。在2021年,建立了一种新的PCR反应,可以同时检测AHPND和突变体AHPND。为了开发PCR试剂盒,建立了包括富集前步骤和DNA提取方法的PCR程序以进行PCR反应。新的PCR程序被验证,检测极限为5.10 3 CFU/mL。此检测极限是当前用于检测AHPND的常规PCR方法的两倍。弧菌溶血性在37°C的肉汤中显示出最佳的生长,并伴有虾的肝癌。也修改了用虾组织中提取DNA的简单沸腾方法。PCR程序已在42个AHPND的样本上成功验证。使用PCR试剂盒快速检测AHPND和相关的突变体AHPND,用于快速诊断虾农场的AHPND和相关突变体-AHPND。关键字:AHPND,突变体-AHPND,DNA提取,PCR,Vibrio parahaayticus 1-分子和环境生物技术的部门,生物学和生物技术学院,生物学实验室,生物传感器,生物传感器,科学大学,Ho Chi Minh City,Viet Nam,生物传感器。2-越南胡志明市科学大学分子生物技术实验室。3-越南国立大学,林格·沃德(Linh Trung Ward),越南城,越南城,越南 *
。cc-by 4.0国际许可(未经Peer Review尚未获得认证)是作者/资助者,他已授予Biorxiv的许可证,以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人,该版本发布于2023年3月8日。 https://doi.org/10.1101/2023.03.07.531591 doi:Biorxiv Preprint
令人兴奋的是,该团队使用遗传方法表明,小麦中相同的基因突变通过固定氮在田间条件下也可以增强定殖。这些发现代表了长期以来的野心的一个令人兴奋的突破,即使用增强的内共生伙伴关系作为跨主要农作物(包括谷物和豆类)的无机肥料的天然替代品。
通过RNA引导的核酸酶(例如SP Cas9)编辑的基因组编辑,已用于许多不同的植物特种中。然而,尚未得到充分记录在多大程度上可以通过多重独立基因座对准。在这里,我们基于高度内含器优化的ZCAS9I基因开发了一个工具包,该基因允许组装核酸酶构建体,该核酸酶构建体表达高达32个单导RNA(SGRNA)。我们使用此工具包探索了两个主要模型物种中多路复用的限制,并报告了无基因八个八个八杆的分离(8 3)Nicotiana Benthamiana和Duodecuple(12 3)拟南芥Thaliana thaliana突变线(分别是T 1和T 2,分别是T 1和T 2)。我们开发了新的本坦氏菌(N. benthamiana)的新颖的反式标记,最重要的是SL -Fast2,可与良好的拟南芥种子植物植物标记物和FCY-upp相当,并基于在存在先例的情况下产生有毒的5-氟中性含量。用九个不同的sgrNA靶向八个基因,并依靠fcy-upp选择非转基因t 1,我们确定了n。benthamiana突变型的n。benthamiana突变线,并具有惊人的高效效率:所有ana-属于所有基因的植物(大约112/11/11/11 target serited)。此外,我们在A. thaliana的24个sgrnas阵列获得了12个基因。效率在a中的显着较低。thaliana,我们的结果表明CAS9的可用性是这种高阶多路复用应用程序中的限制因素。我们通过表型筛选和扩增子测序的结合来识别十二指肠突变系。所呈现的资源和结果为如何使用多路复用来生成复杂的基因型或在功能上询问候选基因的基团。
Arabella Bouzigues 1 · Lucy L. Russell 1 · Georgia Peakman 1 · Martina Bocchetta 1 · Caroline V. Greaves 1 · Rhian S. Convery 1 · Emily Todd 1 · James B. Rowe 2 · Barbara Borroni 3 · Daniela Galimberti 4.5 · Pietro Tiraboschi 6 · Mario Masellis 7 Maria Carmela Tartaglia 8·Elizabeth Finger 9·John C. Van Swieten 10·Harro Seelaar 10·Lize Jiskoot 10·Sandro Sorbi 11.12·Chris R. Chris R. Butler 13.14·Caroline Graff 15.16·Caroline Graff 15.16·亚历山大·盖尔哈德(Alexander Gerhard)17,18·tob tob tob tob tob lobers langheinrich。拉奎尔·桑切斯(Raquel Sanchez)-Valle 21·Alexandre deMendonça22·Fermin Moreno 23.24·MATTHIS SANOFZIK 25.26·Rik Vandenberghe 27,28.29·Simon Ducharmor 30.31 ·Markus Otto 38·佛罗伦萨Pasquier 39,40.41·Isabel Santana 42.43·Jonathan D. Rohrer 1·遗传FTD倡议,Genfi
胆汁淤积性肝病的病因是复杂的,临床表现非特异性,生化异常主要以碱性磷酸酶升高(ALP)和谷氨酸转肽酶(GGT)为特征。由于缺乏特定症状和不同原因,诊断带来了某些挑战。在这里,我们提出了一个肝硬化的病例,具有未知病因的主要胆固醇特征。尽管有多次全面的常规病因筛查和肝活检,但诊断尚不清楚。随后的整个外显子组测序表明,由与ZFYVE19基因突变有关的家族性胆汁淤积引起的肝肝硬化的诊断。通过此案例报告分析,我们旨在扩大未知病因胆固性肝病的诊断方法,准确确定原因并迅速进行干预。
摘要:由于对有效的治疗干预措施的需求不断增长,计算方法被用于药物发现中。这项工作的重点是使用一种硅胶方法来寻找可能的药物靶标,并检查它们如何与人类突变体复合物中的AG-881(Vorasidenib)抑制剂和NADPH相互作用。我们使用分子对接,结构验证和毒性预测评估了Tovorafenib和姜黄素作为可能的治疗剂的有效性。cb-dock用于分子对接。使用Pymol计算用于结构稳定性分析的根平方偏差(RMSD)。为了确定所选化合物的安全性,使用毒素毒性鉴定进行了毒性评估。我们的结果表明,姜黄素和Tovorafenib在目标稳定性分析中都表现出令人鼓舞的结合亲和力和结构稳定性。使用正毒素进行毒性评估,以确定所选化合物的安全性。我们的发现表明,Tovorafenib和姜黄素在靶复合物中都表现出有希望的结合亲和力和结构稳定性,姜黄素表现出良好的毒性特征。这项研究强调了计算药物发现在识别新型治疗候选者中的潜力,这有助于精确医学的发展。关键字:分子对接;结合亲和力; Tovorafenib;药效团建模;结构分析; AG-881抑制剂
亨廷顿蛋白(MHTT)的聚谷氨酰胺扩展引起了亨廷顿疾病(HD)和神经变性,但这些机制尚不清楚。在这里,我们发现MHTT促进核糖体失速并抑制小鼠HD纹状体神经元细胞中的蛋白质合成。MHTT的耗竭可增强蛋白质的合成并增加核糖体转移的速度,而MHTT直接在体外抑制蛋白质合成。fmrp是核糖体失速的已知调节剂,在HD中上调,但其耗竭对HD细胞中蛋白质合成或核糖体停滞的影响没有明显的影响。我们发现核糖体蛋白质和将核糖体与MHTT翻译的相互作用。高分辨率全球核糖体足迹(核糖表)和mRNA-seq表明,核糖体占用率向5'和3'端的核糖体占用率广泛转移,并且在HD细胞中选定的mRNA靶标上的独特单轴暂停。因此,MHTT阻碍了翻译伸长过程中的核糖体易位,这是一种可用于HD疗法的机械缺陷。
