埃博拉病毒是人类和灵长类动物中严重致死性病毒疾病的病毒剂。它们长,丝状,包裹和非细分病毒,属于家族的RNA基因组,属于Fileviridae。埃博拉病毒属由六种不同的物种组成:Bundibugyo,Bombali,Tai Forest(以前是科特迪瓦),雷斯顿,苏丹和扎伊尔,尽管雷斯顿和孟加拉埃博拉病毒并未被认为是人们的疾病。它们是管状病毒体,通常直径为80 nm,长度为800 nm。基因组长约19 kb,由7个线性排列的基因组成,以3'-np-vp35-vp35-vp40-gp-vp30-vp23-vp24-l组成。Zaire Ebolavirus的第一次记录爆发发生在Zaire,1976年。同年,苏丹埃博拉病毒被发现,尽管最初被认为与扎伊尔物种相同。埃博拉病毒主要通过与感染动物的血液,分泌物,器官或其他体液的血液,分泌物,器官或其他体液传播给人类。然后,它通过与感染者的血液或分泌物直接接触,通过人类对人类的传播传播到社区。最初,它通常是在受感染者的家庭和朋友之间传播的。卫生保健工人在治疗埃博拉病人时经常被感染,并且在医院环境中的暴发很常见。通过感染精液传播可在临床恢复后长达七个星期发生。被感染个体的分解物体可以在死亡后3至4天保持感染。埃博拉血血热的孵育期通常为5至20天。感染的临床体征包括发烧,头痛,喉咙痛,关节和肌肉酸痛,腹泻和无力。这是一种高温出血性疾病,病例竞争率在25%至90%之间。在严重的出血热病例中,血管可能会损害血管以及大量的内部和外部出血或出血。Zaire Ebolavirus在所有埃博拉病毒中的病例型率最高。在某些流行病中最多可达90%,在27年内,平均病例死亡率约为83%。扎伊尔埃博拉病毒的暴发比其他任何物种都多。近年来,已经开发出治疗疗法和疫苗,可能会提高患者的存活率。埃博拉疫情继续定期出现;在2022年,宣布了6例扎伊尔埃博拉病毒感染,死亡率为100%。在2022年还报道了164例苏丹埃博拉病毒,死亡率为34%。
农场经理 1989 农业工程学硕士 1990 德国霍恩海姆大学 植物育种与生物技术 农业理学博士 1994 美国佛罗里达大学 作物生物技术博士后 1994-1997 B. 任职 2012-至今 佛罗里达大学农学系教授 2008-2012 佛罗里达大学农学系副教授 2001-2008 佛罗里达大学农学系助理教授 1997-2001 IPK Gatersleben 植物基因组研究中心研究组长 1994-1997 博士后研究助理 佛罗里达大学园艺系 1991-1994 研究生研究助理 植物育种系 霍恩海姆大学转基因作物的风险管理。 D. 奖项和荣誉 艾哈迈达巴德大学 Rasila 和 Chandrakant Kadia 捐赠客座教授,2023 年 美国作物科学学会研究员,2021 年 体外生物学学会杰出科学家奖,2020 年 体外生物学学会研究员,2018 年 UF 杰出研究项目研究基金会教授职位,2013 年和 2018 年 UF 杰出学术项目任期教授职位,2018 年 UF-IFAS 高影响力出版物奖,2014 年和 2018 年 Gamma Sigma Delta 高级教师功绩奖,2016 年 体外生物学学会杰出服务奖,2012 年 Gamma Sigma Delta 初级教师功绩奖,2009 年 E. 专业服务和编辑委员会主席 美国作物科学学会 C7 分部 2020 年筹款人和研讨会组织者 美国作物科学学会 C7 分部 2018 2020 《基因编辑前沿》副主编 2022-至今 《科学报告》副主编 2019-至今 《作物科学》副主编 2004 – 2009 《植物基因组》副主编 2017-2020 《植物细胞组织和器官培养:植物生物技术杂志》副主编 2008 – 2020 《植物育种》主题编辑 2008 – 2019 体外生物学学会 (SIVB) 董事会成员 2011 – 2012;2014 – 2019 SIVB 会议程序主席 2011 – 2012; 2018 – 2019 第二届植物合成生物学国际会议主席 2018 国际牧草及草皮育种会议程序委员会成员 2018 – 2019 SIVB 植物生物学分会主席 2010 – 2012 SIVB 植物生物技术程序委员会主席 2008 – 2009 SIVB 筹款人兼植物生物技术程序委员会联合主席 2007 – 2008
因其英勇无畏和不畏生命危险的表现,超越了职责要求:1971 年 2 月 18 日至 22 日期间,在越南共和国老挝的救援行动中,五号专家丹尼斯·M·藤井 (Dennis M. Fujii) 担任直升机救护车上的机组长,表现出超越职责要求的英勇无畏。五号专家藤井服役于第 237 医疗支队、第 61 医疗营、第 67 医疗组。该小组的任务是从激烈的战场中撤离严重受伤的越南军人。飞机接近布满弹痕的着陆区时,敌方猛烈的火力向这位专家的直升机射击,导致飞机无法接近。当飞行员第二次尝试降落时,敌人集中高射炮火攻击空中救护车,导致飞机受损并坠毁在冲突地区,五号藤井受伤。片刻之后,另一架美国直升机成功降落在五号藤井飞艇残骸附近,救出了所有被击落的机组人员,但五号藤井除外,因为敌方火力猛烈,他无法登机。为了避免进一步危及第二架直升机上战友的生命,五号藤井挥手示意飞机离开战斗区域,作为战场上唯一的美国人留在原地。由于猛烈的防空火力,随后营救五号藤井的尝试失败了。五号藤井终于拿到了一台无线电,并通知该地区的飞行员,着陆区太热,无法进一步撤离。整个晚上以及第二天,五号藤井专业军不顾自己的伤势,为盟军伤员提供急救。2 月 19 日晚,盟军防线遭到敌军增援团和重炮的无情攻击。五号藤井专业军再次获得无线电发射器,呼叫美国武装直升机协助小部队击退攻击。在连续 17 个多小时的时间里,五号藤井专业军多次暴露在敌方火力下,离开安全的战壕,以便更好地观察敌军阵地并指挥空袭。有时战斗变得非常激烈,五号藤井专业军被迫中断无线电传输,以便在近距离对敌人进行压制性步枪射击。尽管到 2 月 20 日时已经受伤并极度疲劳,这位专家仍承担着保护和保卫友军营地的责任,直到一架美国直升机降落并试图将他从该地区空运出去。当他的空中救护车离开战场时,它收到了
科学陈述 我是西班牙国家研究委员会 (CSIC) 的研究教授。1993 年,我毕业于瓦伦西亚理工大学,获得农业工程师学位,并在荷兰莱顿大学获得分子微生物学博士学位,研究项目在荷兰食品研究所 (TNO) 微生物学系进行。我获得了 Ramon y Cajal 奖,并于 2003 年加入瓦伦西亚农业研究所 (西班牙),开发柑橘基因组学的生物信息学工具。2007 年,我加入 CIPF,并于 2010 年成为高级组长,创建了基因表达基因组学实验室。2014 年 8 月至 2021 年 5 月,我是佛罗里达大学微生物学和细胞科学系和遗传学研究所的正教授。2021 年 5 月,我加入 CSIC 综合系统生物学研究所 (I2SysBio),成为佛罗里达大学的兼职教师。 2022 年 1 月,我当选为西班牙皇家工程院院士。我对了解基因表达在基因组水平上的功能方面、跨不同生物体以及与病理过程的关系很感兴趣。我的团队开发了统计方法和软件工具,用于分析转录组的动态方面,将它们与其他类型的分子数据集成并对其进行功能注释,特别关注下一代测序 (NGS) 数据。我是 Blast2GO、Paintomics、maSigPro、NOISeq、Qualimap、SQANTI、tappAS 等流行生物信息学软件的创建者,在全球拥有数万名用户,并率先使用单分子测序技术进行转录组分析。我的研究得到了国家和国际资助机构的大力资助,包括 Horizon Europa、H2020、Marie Curie Actions、NIH、NASA 和 USDA,以及 Santander、JDRF 和 Helmsley 等私人基金会。我领导过多个国际研究联盟项目,包括 STATegra(欧盟第七框架计划,11 个合作伙伴,8 个国家,600 万欧元,用于多组学数据集成)、DEANN(居里夫人行动,16 个合作伙伴,14 个国家,90 万欧元,用于生物信息学科学交流)、LongTREC(居里夫人行动博士网络,12 个合作伙伴,10 个国家,270 万欧元,长读生物信息学工具开发)以及佛罗里达大学的 6 名 PI 团队,旨在开发 1 型糖尿病进展的多组学模型。我(共同)组织过许多生物信息学和 NGS 会议,包括计算生物学领域的主要会议 ISMB,并在五大洲的 10 多个国家开设了专门的生物信息学课程,参加人数超过 500 人。我是 Biobam Bioinformatics 的联合创始人和科学顾问,该公司自 2010 年成立,致力于为生物学家打造生物信息学解决方案。我目前的研究兴趣是开发系统生物学多组学数据整合的统计方法,创建第三代测序数据分析工具,并通过群落建模了解微生物相互作用。
Marwan Abdellah 是洛桑联邦理工学院 (EPFL) 蓝色脑项目计算部门的高级可视化专家和研究工程师。他于 2017 年获得 EPFL 神经科学博士学位。Juan José García Cantero 是洛桑联邦理工学院 (EPFL) 蓝色脑项目计算部门的系统专家。他于 2020 年获得胡安卡洛斯国王大学高级信息技术学院计算机科学博士学位。Nadir Román Guerrero 是洛桑联邦理工学院 (EPFL) 蓝色脑项目计算部门的可视化工程师。 Alessandro Foni 是洛桑联邦理工学院 (EPFL) 蓝色脑项目计算部门的系统专家。他于 2013 年获得日内瓦大学信息科学研究所经济学和社会科学博士学位。Jay S. Coggan 是洛桑联邦理工学院 (EPFL) 蓝色脑项目模拟神经科学部门分子系统小组的高级科学家。Corrado Calì 是 Cavalieri Ottolenghi (NICO)—Unito 神经科学研究所人体解剖学小组组长和 RTDB 助理教授。Marco Agus 是哈马德·本·哈利法大学 (HBKU) 科学与工程学院的助理教授。Eleftherios Zisis 是洛桑联邦理工学院 (EPFL) 蓝色脑项目的软件工程师。 Daniel Keller 是洛桑联邦理工学院 (EPFL) 蓝色脑项目模拟神经科学部门分子系统小组的组长。Markus Hadwiger 是阿卜杜拉国王科技大学 (KAUST) 计算机科学和视觉计算中心 (VCC) 的副教授,领导着 VCC 的高性能可视化研究小组。Pierre J. Magistretti 是洛桑联邦理工学院 (EPFL) 大脑思维研究所名誉教授、精神病学系/CHUV 精神神经科学中心主任、阿卜杜拉国王科技大学 (KAUST) 杰出教授兼研究副校长以及 KAUST 智能健康计划主任。亨利·马克拉姆 (Henry Markram) 是洛桑联邦理工学院 (EPFL) 的神经科学全职教授、神经微电路实验室 (LNMC) 主任以及蓝脑项目的创始人和主任。费利克斯·舒曼 (Felix Schürmann) 是洛桑联邦理工学院的兼职教授、蓝脑项目的联合主任,并参与了洛桑联邦理工学院 (EPFL) 欧洲人类脑项目的多项研究挑战。收稿日期:2022 年 8 月 2 日。修订日期:2022 年 9 月 27 日。接受日期:2022 年 10 月 14 日 © 作者 2022。牛津大学出版社出版。这是一篇开放存取文章,根据知识共享署名许可协议 ( https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ ) 分发,允许在任何媒体中不受限制地重复使用、分发和复制,只要对原始作品进行适当的引用。
肠病毒(EVS)被分类为Picornaviridae家族中肠病毒属的成员。这些非发育的单链RNA病毒具有封装在病毒衣壳中的基因组,形成直径约为20-30 nm的对称二十面体颗粒(1,2)。肠内病毒属包括12种肠病毒物种(A-L)和3种鼻病毒物种(RV A-C)。属于肠病毒的肠病毒A71(EV-A71)通过粪便途径传输物种(2,3)。ev-A71于1969年在美国加利福尼亚州的无菌性脑膜炎的婴儿的粪便标本中首次分离出来(4)。从那时起,EV-A71的许多爆发和流行病已在全球范围内报道(5-8),自1990年代后期以来,亚太地区的出现了显着的事件(9)。EV-A71主要影响五年以下的儿童,是手,脚和口腔疾病(HFMD)的主要病因之一,通常在1 - 2周内作为一种自我限制疾病解决。但是,在严重的情况下,EV-A71会引起神经系统并发症,导致预后不良甚至死亡,对婴儿和幼儿构成重大健康威胁。因此,EV-A71被认为是脊髓灰质炎病毒后最显着的神经肠病毒(10-12)。EV-A71基因组长约为7,500个核苷酸,编码四种结构蛋白(VP1至VP4)和7种非结构性蛋白质(2A至2C至2C和3A至3D)。结构蛋白VP1至VP4首先结合形成杂种,六十个brotemer组装成一个封装病毒基因组的病毒式衣壳中(13)。暴露在衣壳的表面上,而VP4则位于内部(13,14)。VP1是由297个氨基酸组成的最免疫主导结构蛋白,并包含主要中和表位。它在EV-A71生命周期期间的病毒吸附,渗透和脱落中起着至关重要的作用,使其成为分子研究和疫苗发育的主要目标(15-17)。目前,尚无针对EV-A71的特定药物,因此支持治疗是与EV-A71相关疾病的主要治疗方法。疫苗接种是预防EV-A71的最有效,最有效的策略。最近对EV-A71疫苗的研究主要集中在灭活的疫苗(18、19),病毒样颗粒(VLP)(20-22),活疫苗(23、24)和亚基疫苗(25、26)。其中,只有灭活的EV-A71疫苗已经完成了人类的临床试验,而其他候选者仍在临床前动物评估中(27)。在2015年至2017年之间,中国食品药品监督管理局(CFDA)批准了针对EV-A71 C4子基因型的三种灭活疫苗的商业化(28-30)。III期临床试验表明,所有三种疫苗都有效地降低了与EV-A71相关的HFMD(27)。然而,灭活的疫苗面临挑战,包括高生产成本,长期发育时间表以及潜在的免疫原性,这可能导致细胞免疫反应的刺激不足(22)。作为一种有希望的多功能疫苗平台,基于mRNA的疫苗适用于传染病和癌症。此外,越来越多的证据表明,与共同循环的EV-A71菌株的突变以及造成了快速病毒进化的突变,对灭活疫苗构成了潜在的挑战(31,32)。他们提供了几个优势,包括较短的发育周期,强大的免疫原性,有利的安全性和对突变的适应性(33,34)。RNA分子修饰和
SUSANNA AVAGYAN +16505469317 • savagyan@stanford.edu 摘要我是斯坦福大学的生物医学数据科学研究生和研究助理,专攻精准医疗的 AI/ML 方法。我精通 R 和 Python,处理批量、单细胞、空间基因组和临床数据。之前,我是亚美尼亚生物信息学研究所与莱比锡大学合作的 Binder 实验室的初级组长。我的行业经验包括在伦敦的 Vivan Therapeutics 担任数据科学家。我曾为《自然精神分裂症》和《转化癌症研究》上的出版物做出贡献,目前正在《细胞》上修订工作。我通过管理学术计划、专业研讨会和研究指导计划展示了领导能力。经验 斯坦福医学院,纽曼实验室 斯坦福,加利福尼亚州 研究助理,研发 2023 年至今 • 开发了 CytoTRACE 2 工具的 R 和 Python 包 - CytoTRACE 2 是一种根据单细胞 RNA 测序数据预测绝对发育潜力的计算方法。 • 带头对该工具进行针对其他算法(ML、Monocle3、scVelo 等)的基准测试 • 为该工具构建了一个基于 R Shiny 的交互式 Web 应用程序,允许运行预测并可视化/探索内置和用户提供的数据集的结果。 VIVAN THERAPEUTICS 英国伦敦(远程) 数据科学家,研发 2022-2023 • 开发了一个概念验证 ML 模型,根据肿瘤基因变异创建结直肠癌患者亚型,并在动物模型中进行设计并用于优化治疗药物组合。 • 为实验室实验建立了一个统计评估框架,以估计测试药物组合对特定基因型的治疗效果。 • 负责数据科学团队的战略规划、目标设定、任务管理和招聘。 教育 斯坦福医学院,斯坦福,加利福尼亚州 硕士,生物医学数据科学 2023 年至今 预计毕业时间:2025 年 6 月 亚美尼亚美国大学,亚美尼亚埃里温 学士,数据科学(生物信息学轨道) 2018-2022 • 顶点:结直肠癌的分子亚型:个性化诊断的前沿 出版物 • 使用可解释的深度学习绘制健康和疾病中的单细胞发育潜力(2024 年)。正在为 Cell 修订,发表在 biorxiv 上。 • 健康、精神分裂症、躁郁症和重度抑郁症中基因表达的时间变化(2024 年)。发表在《自然精神分裂症》上。 • 用于发现微观组织切片中基因表达景观的空间转录组学浏览器 (2024)。发表于 CIMB。• 使用基于多组学和临床结果数据的 ML/DL 方法对癌症进行亚型分类 (2023)。发表于转化癌症研究技能和语言编程语言:Python | R | SQL | Bash 脚本软件:GitHub | RStudio | Jupyter | BioRender | Jira | Trello | Microsoft Office 软件包:机器学习 | 深度学习 | 统计分析 | 生物信息学分析 | Web 应用生物信息学命令行工具:sra-tools | STAR | kallisto | velocyto | 等云和集群计算:Google Cloud | AWS | sherlock 软技能:领导力 | 项目管理 | 公开演讲语言:英语 | 亚美尼亚语 | 俄语
迈克尔·E·本肯多夫士官长是沙特阿拉伯国民警卫队项目经理办公室的高级士兵顾问。他是爱荷华州布拉德盖特人。他于 1996 年 1 月 27 日参军,在密苏里州伦纳德伍德堡参加单站单位训练,在那里接受了战斗工程师培训。他的职务和任务包括:伦纳德伍德堡第 577 工程兵营 C 连战斗工程师;德国班贝格第 130 工程兵旅第 54 工程兵营 B 连组长;纽约州德拉姆堡第 10 山地师(轻步兵)第 41 工程兵营 A 连小队领队;德拉姆堡第 10 山地师(轻步兵)第 3 旅战斗队第 3 旅特种部队营 A 连排长;高级教练士官,A 连,第 1 营,第 34 步兵团,第 4 训练旅,南卡罗来纳州杰克逊堡;2006 年度 TRADOC 教练士官,TRADOC 总部,弗吉尼亚州门罗堡;排长,第 630 工兵连(工兵),第 7 工兵营,第 20 工兵旅,德拉姆堡;营作战士官,HHC,第 7 工兵营;高级工程师 NCO,DIVENG,G3,第 10 山地师(轻步兵),德拉姆堡;一等军士,第 693 工兵连(工兵)(轮式),第 7 工兵营,德拉姆堡;一等军士,HHC,第 7 工兵营;营作战士官,HHC,第 7 工兵营;指挥军士长、第 41 工程兵营、第 2 旅战斗队、第 10 山地师(轻步兵)、指挥军士长、科威特地区支援组、美国陆军中央司令部、美国陆军驻马里兰州乔治·米德堡司令部、美国陆军设施管理司令部指挥军士长。他曾参与的部署包括持久自由行动(03-04、10-11 和 12-13)和伊拉克自由行动 09-10。Behnkendorf 军士长已通过美国陆军士官学院 66 班、游骑兵课程、工兵领袖课程、空降课程、空中突击课程、速降大师课程和教练军士学校完成了士官专业发展系统所有必需的级别。他获得了哥伦比亚南方大学通识教育副学士学位、埃克塞尔西奥学院文科理学士学位和埃克塞尔西奥学院公共管理硕士学位。他获得的奖章和勋章包括功绩勋章(1 OLC)、铜星勋章(3 OLC)、功绩服务勋章(4 OLC)、陆军表彰勋章(3 OLC)、陆军成就勋章(4 OLC)、优良品行勋章(第 8 次颁发)、国防服务勋章、阿富汗战役勋章(2 颗战役之星)、伊拉克战役勋章(1 颗战役之星)、全球反恐战争远征勋章、全球反恐战争服务勋章、士官专业发展勋带(数字 5)、陆军服务勋带、海外服务勋带(数字 6)和北约勋章。他还曾获得过游骑兵徽章、工兵徽章、基本空降徽章、空中突击徽章、教练士官识别徽章、轮式驾驶员徽章和德国武装部队效率徽章(银质)。贝恩肯多夫中士是 2009 年罗伯特·B·弗劳尔斯中尉最佳工兵竞赛第一名团队的成员,并获得了德弗勒里勋章铜质勋章。