XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System群落
变暖增加了温带幼虫群落的组成和功能变异性
helmholtz极地和海洋研究中心的Alfred-Wegener-Institute，Am Handelshafen，12，27570 Bremerhaven，德国B德国B海洋环境化学与生物学研究所（ICBM），Oldenburg大学，旧金堡大学，Schleusstraße1，26382 Wilhelmshaven，compoly compology of Schleussenstra。 FUENTUENUEVA S/N 1，18071 GRANADA，西班牙d生态与动物生物学系，Vigo大学，校园Lagoas Marcosende S/N，36310西班牙Vigo，E西班牙E生态，环境和植物科学系，斯多克大学，斯德哥尔摩大学，Svante Arrhenius v. ag ag20a，Swedig swedig switde v. ag ag 206 91 specten-swud f。在Freiburg，Fahnenbergplatz，79104 Freiburg I.Br.
tidytacos：用于分析微生物群落分类学组成的R包
Tidytacos（整洁的分类组合）软件包是用于探索微生物社区数据的R软件包。这样的社区数据由Agplicon测序产生的读取计数组成（例如，16S rRNA基因的区域或元基因组（shot弹枪）测序。tidytacos基于哈德利·威克姆（Hadley Wickham）引入的整洁原则，该原理以一致的格式存储（Wickham等，2023）。具体来说，Tidytacos使用整洁的格式和语法来选择，转换和准备微生物社区数据以进行可视化和分析。此外，它为流行和鲜为人知的分析和微生物社区数据的可视化提供了一系列功能。Tidytacos是为各种专业知识的研究人员而设计的，既可以提高微生物社区数据的可访问性，又可以轻松地转换数据，以实现新颖的可视化和分析方法。
沿盐梯度的土壤启动效应和相关微生物群落
摘要。土壤盐分介导微生物和土壤过程，如土壤有机碳 (SOC) 循环。然而，土壤盐分如何通过塑造细菌群落多样性和组成来影响 SOC 矿化仍然难以捉摸。因此，沿盐梯度（盐度为 0.25%、0.58%、0.75%、1.00% 和 2.64%）采集土壤样本并培养 90 天，以研究 (i) SOC 矿化（即棉籽粉作为底物引起的土壤启动效应）和 (ii) 负责任的细菌群落，方法是使用高通量测序和 13 C 同位素的天然丰度（以分离棉籽粉衍生的 CO 2 和土壤衍生的 CO 2 ）。我们观察到在培养的前28天中出现负向启动效应，而在56天之后转为正向启动效应。早期的负向启动可能是由于优先利用棉籽粕所致。随后的正向启动随着盐度的增加而降低，这可能是由于高盐度土壤中微生物群落的α多样性降低所致。具体而言，沿盐度梯度的土壤pH值和电导率（EC）是调节微生物群落结构从而调节SOC启动的主要变量（通过基于距离的多元分析和路径分析估计）。通过采用双向正交投影到潜在结构（O2PLS），将启动效应与特定的微生物类群联系起来；例如，变形菌门（Luteimonas、Hoeflea 和 Stenotrophomonas）是归因于底物诱导的启动效应的核心微生物属。在这里，我们强调盐度的增加降低了微生物群落的多样性，并转移了优势微生物（放线菌和 Pro-
淡水虾肠道产酶微生物群落的表征与鉴定
摘要：对淡水虾消化道中降解胞外酶的需氧菌进行了分离。在羧甲基纤维素琼脂平板、淀粉琼脂培养基平板、明胶蛋白胨琼脂培养基平板上分离肠道细菌。在选择性培养基上根据胞外酶对分离的菌株进行定性筛选。根据形态学、生理学和生化特征对菌株进行鉴定，鉴定出芽孢杆菌种。通过使用明胶琼脂培养基、羧甲基纤维素培养基和刚果红CMC培养基以及针对不同酶的淀粉琼脂培养基进行菌落鉴定，分离出芽孢杆菌种。分离物能够水解蛋白质和碳水化合物，表明它们在鱼类营养中的重要性。
盐胁迫对水稻根际土壤细菌群落的影响
盐分是限制沿海滩涂土地利用的首要因素，根际微生物在增强作物抗逆性方面发挥着至关重要的作用，对环境变化高度敏感。水稻（Oryza sativa L.）是盐渍土改良的首选作物。本研究通过高通量测序技术，对不同盐胁迫处理下水稻根际土壤微生物群落进行了研究。研究发现，盐胁迫改变了水稻根际土壤细菌群落多样性、结构和功能。盐胁迫显著降低了水稻根际土壤细菌群落的丰富度和多样性。盐胁迫下，细菌群落中绿弯菌门、变形菌门和放线菌门丰度较高，厚壁菌门、酸杆菌门和粘球菌门相对丰度降低，拟杆菌门和蓝藻门相对丰度增加。水稻根际土壤细菌群落功能主要有化学异养、好氧_化学异养、光能营养等，其中化学异养和好氧_化学异养NS3（基土中添加3‰NaCl溶液）处理显著高于NS6（基土中添加6‰NaCl溶液）处理。本研究为开发水稻专用耐盐微生物菌剂提供了理论基础，为利用有益微生物改善滨海盐渍土土壤环境提供了可行的策略。
农业残留物焚烧对土壤微生物生物量和群落组成的影响：
农业残留物焚烧在世界许多地方普遍存在，这引起了重大的环境问题，特别是其对土壤健康的长期影响。这项研究调查了秸秆焚烧对土壤微生物生物量和群落组成的影响，重点关注其对土壤健康和生态系统功能的长期影响。研究强调，反复焚烧会改变微生物多样性，减少固氮细菌和菌根真菌等有益微生物的数量。随着时间的推移，这种破坏会导致土壤肥力下降、养分循环受损，以及抗逆但效率较低的微生物物种增多。研究结果强调，需要采取可持续的农业实践，优先考虑土壤保护，尽量减少秸秆焚烧的不利影响。这项研究提出了切实可行的建议，包括采用无焚烧技术和替代残留物管理实践来恢复和保持土壤微生物健康，确保长期农业生产力。
Atacama沙漠和南极根际微生物群落之间的共同点
1 卓越转化医学中心，医学院，拉弗朗特拉大学，智利，智利，智利2学院，智利工程学院，智利自主大学，智利自主大学，智利，3生物技术研究中心，成本研究所环境，拉弗朗特拉大学，智利，智利5号，巴塞罗那大学自治大学，生物医学研究生生物学研究，生物医学研究I研究院饮食学，瓦尔帕拉索大学药学学院，瓦尔帕拉索大学，智利，8个微型生物培养中心，瓦尔帕拉索大学，瓦尔帕拉索大学，智利瓦尔帕拉索大学，智利9，安提法加斯塔大学健康科学系9生物医学系
使用深度学习识别微生物群落中的基石物种
先前的研究表明，微生物群落可以藏有去除的基石物种，其去除可能会导致微生物组结构和功能的急剧变化。然而，仍然缺乏一种有效的方法来系统地识别微生物群落中的基石物种。在这里，我们提出了一个基于深度学习以解决这一挑战的数据驱动的Keystone识别（DKI）框架。我们的关键思想是通过使用从该栖息地收集的微生物组样本训练深入学习模型，从特定栖息地中隐式学习微生物群落的组装规则。训练有素的深度学习模型使我们能够通过对去除物种的思想实验进行思想实验来量化该栖息地中任何微生物组样本中每个物种的社区特定钥匙ston。我们使用合成数据系统地验证了该DKI框架，并应用DKI来分析真实数据。我们发现，不同社区中中位数钥匙长高的那些分类单元表现出强大的社区特异性。提出的DKI框架展示了机器学习在解决社区生态中的基本问题方面的力量，为复杂微生物社区的数据驱动管理铺平了道路。
卵巢早衰患者卵泡液的微生物群落和代谢特征
卵巢早衰（POI）是一种临床综合征，特征为40岁前卵巢活动减少，伴有闭经或月经不调等月经紊乱，促性腺激素水平高而雌激素水平低。任何阶段POI的根本原因可能是原始卵泡数量减少、细胞凋亡或卵泡破坏增加以及对促性腺激素刺激的反应无效（1、2）。遗传因素、免疫、医学因素、炎症等是已知的POI风险因素。然而，超过50%的POI病例原因不明（3-6）。最近发现肠道菌群可以影响卵巢功能（7）。POI 患者的肠道菌群发生显著变化，表现为厚壁菌门、拟杆菌门和粪杆菌门的丰富度降低，变形菌门和拟杆菌门的丰富度增加。生态失衡和肠道菌群多样性的降低会降低 β-葡萄糖醛酸酶的活性，导致雌激素活性降低 (8)。肠道菌群与血清雌激素、促卵泡激素、黄体生成素和抗苗勒氏管激素水平存在相关性 (9 – 11)。肠道菌群失衡也与自身免疫性 POI 有关。肠道菌群失衡不仅影响B淋巴细胞的活化和自身抗体的产生，还会诱导先天免疫细胞的异常活化，导致促炎性细胞因子的上调。肠道菌群与免疫系统平衡的破坏会加剧POI的进展（12）。卵泡液（FF）是卵母细胞发育的直接微环境，并非无菌。它由卵巢的血浆渗出液和局部分泌物组成，富含单糖、蛋白质、类固醇激素、细胞因子和生长因子。因此，FF被认为是微生物的优良生长培养基（13）。研究表明，不孕女性的卵泡液中微生物群的组成和丰富度存在显著差异，这些变化是
纳米颗粒对植物养分吸收和土壤微生物群落的多方面影响
随着全球人口的增长和资源的日益匮乏，农业生产的可持续性和效率提高已成为迫切的需求。纳米技术的飞速发展为这一挑战提供了新的解决方案，特别是纳米粒子在农业中的应用，正逐渐展示出其独特的优势和广阔的前景。然而，各种纳米粒子可以以不同的方式影响植物的生长，通常通过不同的作用机制。除了对植物本身的直接影响外，它们还经常改变土壤的理化性质并调节根际微生物群落的结构。本综述重点关注纳米粒子调节植物生长的各种方式，深入研究纳米粒子与植物之间的相互作用，以及纳米粒子与土壤和微生物群落之间的相互作用。旨在为功能化纳米粒子在农业领域的应用提供全面的参考。