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World File Search System脱氧核糖
小分子靶向疗法诱导残留肿瘤细胞中对DNA双链破裂修复的依赖性
用靶向疗法生存的残留癌细胞充当最终抗性疾病的储层。尽管对靶向残留细胞的治疗非常感兴趣，但由于我们对这种细胞状态中存在的脆弱性的有限了解，努力受到阻碍。Here, we report that diverse oncogene-targeted therapies, including inhibitors of epidermal growth factor receptor (EGFR), anaplastic lymphoma kinase (ALK), KRAS, and BRAF, induce DNA double-strand breaks and, consequently, ataxia-telangiectasia mutated (ATM)–dependent DNA repair in oncogene-matched residual tumor cells.在细胞系，小鼠异种移植模型和人类患者中观察到的这种DNA损伤反应是由涉及胱天蛋白酶3和7激活的途径以及下游caspase激活的脱氧核糖核酸酶（CAD）的驱动的。CAD又通过其内源性抑制剂ICAD的caspase介导的降解而激活。在EGFR突变非小细胞肺癌（NSCLC）的模型中，通过小分子EGFR靶向治疗的肿瘤细胞合成依赖于ATM，并与ATM激酶抑制剂在体内消除这些细胞。这导致EGFR突变体NSCLC小鼠异种移植模型的渗透性和耐用反应更多，包括源自已建立的细胞系和患者肿瘤的响应。最后，我们发现，具有携带共同发生的EGFR突变体NSCLC的罕见患者，ATM中的功能丧失突变在第一代EGFR抑制剂疗法中与EGFR突变NSCLC患者缺乏缺乏有害ATM突变的患者相对于第一代EGFR抑制剂疗法表现出扩展的无进展生存率。一起，这些发现为基于机制的ATM抑制剂与现有靶向疗法的基于机制的整合建立了理由。
非靶向 DNA 加合物组学方法的开发 - ...
■ 摘要背景：源自炎症、饮食和环境的基因毒物可以共价修饰 DNA，可能引发致癌过程。DNA 加合物早已为人所知，但旧方法一次只能针对少数已知 DNA 加合物，无法提供“DNA 加合物组”的整体图景。DNA 加合物组学是一个新的研究领域，旨在通过高分辨率质谱 (HRMS) 筛选未知的 DNA 加合物。然而，DNA 加合物组学带来了一些分析挑战，例如需要高灵敏度和开发有效的筛选方法来识别新的 DNA 加合物。结果：在这项工作中，通过使用超高效液相色谱 (UHPLC) 通过 ESI 源耦合到四极杆飞行时间质谱仪器，开发了一种灵敏的非靶向 DNA 加合物组学方法。含有碳酸氢铵的流动相可产生最佳信号增强效果。MS 毛细管电压、锥孔电压和检测器电压对 DNA 加合物的响应影响最大。选择低吸附小瓶以减少分析物损失。测试了混合表面涂层分析柱以减少 DNA 加合物的吸附。通过执行 MS E 采集（全离子碎片采集）并筛选脱氧核糖和核碱基碎片离子的损失，采用优化方法分析小牛胸腺、猫结肠和人类结肠 DNA 中的 DNA 加合物。初步鉴定了 54 种 DNA 加合物，其中 38 种以前从未报道过。意义：这是第一项针对人类结肠组织的非靶向 DNA 加合物组学研究，也是文献中报告鉴定如此多未知物的少数非靶向 DNA 加合物组学研究之一。这表明，这种敏感方法在未来的人类研究中应用于研究新的潜在致癌因素将带来有希望的结果。
lambda exoniclease
X8030测定SDS纯度特异性活性DS核酸内切核蛋白酶DNA污染单位测试了N/A N/A N/A 1500 1500规格> 99％80,000 U/mg NOCONCONION <10份蛋白质来源：从大肠杆菌中纯化的大肠杆菌菌株过表达外生核酸内核酸内核酸酶源于bactreperepteriperophage lambda。单位定义：1个单位定义为在37°C下30分钟内从双链底物中产生10 nmol的酸性脱氧核糖核苷酸所需的酶量。分子量：25.9 kDa质量控制分析：使用2倍连续稀释法测量单位活动。稀释液，并将其添加到含有1.1 kb triTID的DNA片段的50 µL反应中，并加入1x lambda Exo反应缓冲液。在37°C下孵育10分钟，浸入冰上，并使用TCA-PECICTITITART方法进行分析。蛋白浓度（OD 280）由OD 280吸光度确定。物理纯度，然后进行银色染色检测。通过比较浓缩样品中污染物带的聚集质量与稀释样品中蛋白蛋白蛋白带的质量来评估纯度。双链核酸内切酶在50 µL反应中确定，该反应含有0.5 µg质粒DNA和10 µL的酶溶液在37°C下孵育4小时。大肠杆菌16S rDNA的污染是使用5 µL重复的酶溶液的重复样品，并在Taqman QPCR测定中筛选，以使用与16S RRNA locus相应的寡核苷酸引物，以存在污染的大肠杆菌基因组DNA。提供：25毫米Tris-HCl，50 mm NaCl，1 mm DTT，0.1 mm EDTA，50％甘油（25°C时pH 7.5）提供：10x lambda exo反应缓冲液（B8030）：670 mm glycine，25 mm mgcl 2（25 mm mgcl 2（pH 9.4）
综合代谢组和宏基因组策略阐明了种植环境之间的相互作用，根际微生物群和Yunnan的烟草代谢物，中国
气候因子和根际微生物群的变化导致植物在不利的环境条件下调整其代谢策略以生存。植物代谢产物的变化可以介导农作物的生长和发育，并与植物根际的根际微生物相互作用。了解环境因素，根际菌群和烟草代谢产物之间的相互作用，是通过在中国尤恩南的四个典型代表性烟草种植地点使用综合的元基因组和代谢组策略进行了一项研究。结果表明，农艺和生化特征受到温度，降水（PREP），土壤pH和高度的显着影响。相关分析显示，温度与叶片的长度，宽度和面积有显着的正相关性，而PREP与植物高度和有效的叶子数相关。此外，烘焙叶的总糖和还原的糖含量明显更高，而在现场烟叶中，总氮和总生物碱水平较低，而Prep较低。与其他三个地点相比，在Chuxiong（CX）的不同丰富的代谢物（DMS）中，总共770个代谢产物被检测到，其中二次代谢物在两种叶子和根中都更丰富。共有8479种，属于2,094个属，有420个单独的垃圾箱（包括13个高质量的垃圾箱），它们被检测到851,209个CDSS。微生物的门水平，例如euryarchaeota，粘菌球和脱氧核糖核，在CX部位显着富集，而假胞植物在高温位点富集了良好的prep。相关分析表明，低prep位点样品中的代谢化合物与二氨基丁酸，nissabacter，nissabacter，alloactinosynnema和catellatospora和catellatospora和catellatospora呈正相关，并与niculibibacterium，Noviherbasterium，Noviherbasuspirillim和Limnobrim s himnicibrim and Novibasterium s himnicibrim seriaterts re招募。根际诱导的二氨基丁基菌，尼萨拉克菌，同骨促和catellatospora
Kumar S等。兽医医学的未来：整合生物技术以改善动物健康和福利。 OA J Ani植物饲养2024，4（1）：180021。manasa K.维生素B12在DNA合成及其临床表现中的作用。 Pharma Sci Analytical Res J 2024，6（4）：180115。
维生素B12（钴胺素）是必不可少的微量营养素，在DNA合成，细胞复制和维持基因组稳定性中具有关键作用。其生化功能是通过两个酶促反应介导的，这些酶促反应对于核苷酸生物合成和甲基化循环的正常功能至关重要。首先，维生素B12充当蛋氨酸合酶的辅助因子，蛋氨酸合酶是一种酶，负责将同型半胱氨酸对甲氨酸的再甲基化。蛋氨酸随后转化为S-腺苷硫氨酸（SAM），这是用于DNA，RNA，RNA，蛋白质和脂质甲基化的主要甲基供体供体。DNA甲基化是调节基因表达的关键表观遗传机制，可确保正确的染色质结构和基因组稳定性。由于维生素B12缺乏而导致的该途径中的破坏会导致异常的DNA甲基化模式，这些模式与各种病理状况有关，包括癌症，心血管疾病和神经退行性疾病。其次，维生素B12参与通过甲基甲基甲基甲酰基-COA突变酶转化甲基甲硅烷-COA到琥珀酰-COA。这种反应对于奇数链脂肪酸和某些氨基酸的分解代谢至关重要，并且在DNA的构成块的脱氧核糖核苷酸的合成中也起作用。由于维生素B12缺乏而导致的甲基甲硅烷-COA突变酶的功能受损导致甲基甲酸的积累，这会破坏线粒体功能并有助于神经毒性。在临床上，维生素B12缺乏表现出各种血液学和神经系统症状。最值得注意的是大型贫血贫血，其特征是血液中存在大型，不成熟和功能失调的红细胞。这种情况是由DNA合成受损引起的，DNA合成导致无效的红细胞生成和细胞分裂的停滞。神经系统并发症，包括周围神经病，认知衰落和骨髓病，也很常见，这是由于髓磷脂合成和维持的破坏而引起的。总而言之，维生素B12对于维持DNA完整性，有效的细胞复制以及血液学和神经系统的整体健康是必不可少的。这种维生素的足够水平对于防止DNA损伤，支持适当的甲基化过程以及预防缺乏症的长期后果至关重要，包括贫血，神经变性和疾病易感性提高。
AAVS的空间基因组学揭示了转录串扰的机制，该机制可以靶向大型遗传货物
DNA结构设计通过人工扩展的基本对字母（包括循环和不匹配热力学参数）Tuan M. Pham 1，§，Terrel Miffin 2，§，Hongying Sun 3，§，肯尼斯·K·肯尼斯·K·肯尼斯·K·夏普2，Xiaoyu wang 2，米格尼Jason D. Kahn 2*和David H. Mathews 1*摘要：我们表明，通过将基本配对字母扩展到A-T和G-C之外，可以改善DNA二次结构的硅设计中，以包括2-氨基-8--（1'-β-β-D-2-2'-deoxyrabofuranosyl）之间的一对 - ）-4-和6-氨基-3-（1'-β-d-2'-脱氧核糖核基）-5-硝基 - （1 H）-Pyridin-2-One，简单p和Z。为了获得在设计中包括P-Z对所需的热力学参数，我们进行了47个光学熔化实验，并将结果与先前的工作结合在一起，以适合P-Z对和G-Z摇摆对的一组新的自由能和焓最接近的邻居折叠参数。我们发现G-Z对具有与A-T对相当的稳定性，因此应通过结构预测和设计算法进行定量考虑。此外，我们推断了循环，末端不匹配和悬挂端参数的集合，以包括P和Z核苷酸。这些参数已纳入用于辅助结构预测和分析的RNAstructure软件包。使用RNAstructure设计程序，我们使用ACGT字母或补充P-Z对提出的100个设计问题中的99个。通过归一化的集合缺陷（NED）评估，延长了字母，降低了序列折叠成脱靶结构的倾向。延长了字母，降低了序列折叠成脱靶结构的倾向。在提供Eterna-player溶液中的91个情况中，有91个中的91例中，NED值相对于来自Eterna示例解决方案的值提高了。含P-Z的设计的平均NED值为0.040，明显低于仅标准DNA设计的0.074，并且包含P-Z Pairs会减少在设计上收敛所需的时间。这项工作提供了将任何扩展的字母核苷酸纳入预测和设计工作流中的样本管道。关键词：DNA二级结构设计，合成生物学，DNA折叠热力学，扩展的DNA字母
迷人的DNA复制过程：揭开生命蓝图
DNA 复制是一个复杂的过程，是所有生物体的核心。它是细胞确保遗传信息从一代准确传递到下一代的基本机制。DNA 复制的发现和理解彻底改变了我们对生物学、遗传学和进化的认识。在本文中，我们将深入研究 DNA 复制的复杂性，探索其重要性、所涉及的步骤、关键参与者以及确保保真度的机制。DNA 复制是一个复杂而迷人的过程，是所有生物体的核心。它是细胞确保遗传信息从一代准确传递到下一代的基本机制。DNA 复制的发现和理解彻底改变了我们对生物学、遗传学和进化的认识。在本文中，我们将深入研究 DNA 复制的复杂性，探索其重要性、所涉及的步骤、关键参与者以及确保保真度的机制。每个生物体的核心都是一种被称为 DNA 或脱氧核糖核酸的非凡分子 [1]。 DNA 携带着所有生物体发育、功能和繁殖所必需的遗传指令。它是生命的蓝图，编码了构建和维持细胞、组织和整个生物体所需的信息。然而，为了将这些遗传信息准确地从一代传到下一代，DNA 复制至关重要。DNA 复制的意义远远超出了它在遗传中的作用。它在细胞分裂中起着至关重要的作用，确保每个新细胞都能获得完整准确的遗传物质副本 [2]。如果没有适当的 DNA 复制，可能会发生错误和突变，导致遗传疾病、发育异常甚至细胞死亡。DNA 复制也是生长、发育、组织修复和维持基因组稳定性不可或缺的一部分。在深入研究复制过程之前，了解 DNA 的结构至关重要。DNA 由两条互补链组成，以双螺旋形式缠绕在一起。每条链由核苷酸组成，核苷酸由一个糖分子（脱氧核糖）、一个磷酸基团和四种含氮碱基之一组成：腺嘌呤 (A)、胞嘧啶 (C)、鸟嘌呤 (G) 和胸腺嘧啶 (T)。两条链是反向平行的，这意味着它们以相反的方向运行，并且碱基通过氢键进行特异性配对（A 与 T 配对，C 与 G 配对）。DNA 复制遵循半保守模型，这意味着每个新合成的 DNA 分子由一条原始链（模板）和一条新合成的互补链组成。该模型由詹姆斯·沃森和弗朗西斯·克里克提出，后来由经典的梅塞尔森-斯塔尔实验证实。DNA复制的半保留特性保证了遗传信息的保存，有助于生命的稳定性和连续性[3]。
一直想在自然，牢房或科学中发表...
Duran K，M Kohlstedt，G Van Erven，Ce Klostermann，AHP America，E Bakx，JJP Baars，A Gorissen，R de Visser，Rp de Vries，C Wittmann，Rnj Comans，Rnj Comans，Tw Kuyper，Tw Kuyper，Ma Kabel。2024。从13 c-林蛋白到13 c-甲纤维：agaricus bisporus使用聚合物木质素作为碳源。科学进步10：EADL3419。Wei W，CC Wong，Z Jia，W Liu，C Liu，F JI，Y Pan，F Wang，G Wang，L Zhao，Esh Chu，X Zhang，Jjy Sung，J Yu。2023。副细胞动物蒸馏剂使用饮食中的菊粉通过其代谢物五核酸抑制NASH。自然微生物学8：1534–1548。li H，X Kang，M Yang，Bd Kasseney，X Zhou，S Liang，X Zhang，J-L Wen，B Yu，N Liu，N Liu，Y Zhao，J Mo，J Mo，Cr Currie，J Ralph，DJ Yelle。2023。分子见解对白蚁肠道中木质植物腐烂的演变。科学进步9 EADG1258。Palmer M，JK Covington，E-M Zhou，Sc Thomas，N Habib，Co Seymour，Dai，D Lai，J Johnston，A Hashimi，J-Y Jiao，J-Y Jiao，Ar Muok，Ar Muok，L Liu，W-D Xian，W-D Xian，X-Y Zhi，X-Y Zhi，M-M Li，M Li，LP LP Silva，LP Silva，BP Bowen，bp bowen toch weie，w louie，w louie，w louie，w louie，w louie，w loue， T Woyke，Tr Northen，X Mayali，W-J Li，BP Hedlund。2023。具有异常特征的嗜热脱氧核糖核能在出乎意料的过去揭示了。ISME期刊17：952–966。Zeng X，X Xing，M Gupta，FC Keber，JG Lopez，Y-CJ Lee，A Roichman，L Wang，MD Neinast，Donia，Donia，Mwühr，C Jang，JD Rabinowitz。2022。肠道细菌营养偏好在体内定量。单元格185：3441–3456。2022。NAD前体循环宿主组织与肠道微生物组之间。细胞代谢34：1947-1959。Chellappa K，MM Reynolds，W Lu，X Zeng，F Hayat，F Hayat，F Hayat，F Hayat，S Mukherjee，S Mukherjee，S Mukherjee，RT Descamps，T Cox，L Ji，L Ji，L Ji，l Ji，s Sm，Sm，Sm Sm，Sm，Sm，Sm，Me Thaid，Me Thaid，Me Thaid，Me thaid，Ja Rabintz，Ja Rabintz，Ja Baur。
2023技术报告 - 诱导诱变
DNA：在细胞内发现的双链螺旋分子，其中包含生物体发育和功能所需的遗传信息。氢键连接嘌呤和嘧啶核苷酸碱基对，形成双螺旋结构。核苷酸：由DNA和RNA组成的分子，由含氮的核苷酸酶，磷酸基团和糖组成。DNA中的糖是脱氧核糖，而RNA中的糖为核糖。核碱酶：含氮分子，是核苷酸的组成部分。在DNA中，这些碱是腺嘌呤（a），胞嘧啶（C），鸟嘌呤（G）和胸腺素（T）。DNA碱基搭配在一起，连接了双螺旋的两个链。在DNA的正常情况下，腺嘌呤将与胸骨（A-T）配对，而胞嘧啶将与鸟嘌呤（G-C）搭配。在RNA中，胸腺氨酸被核碱尿嘧啶（U）取代。 核仁酶通常称为碱基。 嘌呤：在DNA和RNA中发现的两类核苷酸酶之一，其中包括腺嘌呤（a）和鸟嘌呤（G）。 嘧啶：在DNA和RNA中发现的两类核苷酸酶之一，其中包括胞嘧啶（C），胸腺嘧啶（T）和尿嘧啶（U）。 DNA聚合酶：在DNA复制过程中负责形成新的DNA副本的一类酶。 在DNA复制过程中，将一个双链DNA分子复制成两个相同的DNA分子。 此过程对于细胞分裂至关重要。 某些DNA聚合酶能够纠正错误，而另一些DNA聚合酶缺乏这种能力或显示误差校正减少。在RNA中，胸腺氨酸被核碱尿嘧啶（U）取代。核仁酶通常称为碱基。嘌呤：在DNA和RNA中发现的两类核苷酸酶之一，其中包括腺嘌呤（a）和鸟嘌呤（G）。嘧啶：在DNA和RNA中发现的两类核苷酸酶之一，其中包括胞嘧啶（C），胸腺嘧啶（T）和尿嘧啶（U）。DNA聚合酶：在DNA复制过程中负责形成新的DNA副本的一类酶。在DNA复制过程中，将一个双链DNA分子复制成两个相同的DNA分子。此过程对于细胞分裂至关重要。某些DNA聚合酶能够纠正错误，而另一些DNA聚合酶缺乏这种能力或显示误差校正减少。转录：将DNA转录为RNA的细胞过程。RNA：一种核酸，其中包含从DNA复制的信息。虽然RNA具有许多功能，但其中许多与在细胞内生产蛋白质有关。翻译：使用RNA携带的遗传信息的细胞过程用于与细胞传达如何将氨基酸连接在一起形成蛋白质（多肽）。RNA序列（通过核糖体）在三个核苷酸的片段中读取，称为密码子，这对应于一个氨基酸。单个核苷酸的变化可能会导致氨基酸链和随后的蛋白质形成的变化。蛋白质：蛋白质是由氨基酸组成的分子，是身体结构的基础。蛋白质在酶，细胞因子和其他活组织中发现。
DNA的结构，功能和临床意义
3伊拉克库法大学药学学院，伊拉克库法大学4护理学院，摘要：脱氧核糖核酸（DNA）带有遗传性代码，这些代码由细胞翻译而成，可以同步核糖核酸（RNA）和多肽（RNA）和多肽，这些核酸（RNA）和多肽可以产生和表演VITARE VILATE和PERRACE VITAR。 双螺旋结构是Watson和Crick提出的DNA的最多研究的模型。 DNA作为遗传物质起作用的能力可以在细胞分裂过程中存储和进行，以使该信息加倍并传输到传入的一代。 DNA结构中的任何损害是癌症和其他疾病进展的基本直接原因。 DNA损伤的因素可以归类为外源性和内源性因素。 在本文文章中，我们重点介绍了有关DNA的结构，功能和临床意义的证据支持的信息。 1。 引言DNA的发现可以追溯到1869年，当时一位名叫Friedrich Miescher的瑞士生物化学家正在研究其化学成分来源的白细胞。 他从干净的手术敷料中获得了这些白细胞。 尽管他在细胞的所有细胞器和结构中都是原始的，但他很快将其范围缩小到细胞核，因为在用酸治疗后，出现了他称为“核素”的沉淀物。 大多数分子生物科学学生都会在实验室中进行该实验的某种版本，在这些实验室中，它们将DNA与细胞分离。 DNA的优雅结构，从核苷酸到染色体，是使其充当遗传信息的载体的原因。3伊拉克库法大学药学学院，伊拉克库法大学4护理学院，摘要：脱氧核糖核酸（DNA）带有遗传性代码，这些代码由细胞翻译而成，可以同步核糖核酸（RNA）和多肽（RNA）和多肽，这些核酸（RNA）和多肽可以产生和表演VITARE VILATE和PERRACE VITAR。双螺旋结构是Watson和Crick提出的DNA的最多研究的模型。DNA作为遗传物质起作用的能力可以在细胞分裂过程中存储和进行，以使该信息加倍并传输到传入的一代。DNA结构中的任何损害是癌症和其他疾病进展的基本直接原因。DNA损伤的因素可以归类为外源性和内源性因素。在本文文章中，我们重点介绍了有关DNA的结构，功能和临床意义的证据支持的信息。1。引言DNA的发现可以追溯到1869年，当时一位名叫Friedrich Miescher的瑞士生物化学家正在研究其化学成分来源的白细胞。他从干净的手术敷料中获得了这些白细胞。尽管他在细胞的所有细胞器和结构中都是原始的，但他很快将其范围缩小到细胞核，因为在用酸治疗后，出现了他称为“核素”的沉淀物。大多数分子生物科学学生都会在实验室中进行该实验的某种版本，在这些实验室中，它们将DNA与细胞分离。DNA的优雅结构，从核苷酸到染色体，是使其充当遗传信息的载体的原因。其他研究人员后来进一步表征了“核素”，并将其更名为核酸，因为研究表明该核酸由嘌呤和嘧啶碱，糖和磷酸盐组成。核酸，包括确定四个碱基以及它们含有脱氧核糖核酸的发现 - 因此被称为脱氧核糖核酸（DNA）。发现形成DNA分子主链结构的含氮碱基是对：鸟嘌呤（g）的胞嘧啶（C）和与胸腺氨酸（T）相同量的腺苷（A）（Minchin＆Lodge，2019）。但是这种复杂性并非一无所获。沃森（Watson）和克里克（Crick）在1953年的论文中揭示了两个关键方面，这些方面构成了这种美丽的设计：以互补的方式配对核苷酸碱基（与胺的腺嘌呤，胰鸟嘌呤的鸟嘌呤）和双螺旋（Watson＆Crick，1953年）。结构DNA结构是众所周知的，许多几何参数被认为是它们的特征，这些参数包括：螺旋弯曲，凹槽宽度，骨干和糖苷扭转角，糖冰瓶，螺旋桨扭曲，螺旋桨扭曲，滚动，滚动，倾斜，倾斜度，螺旋式上升和旋转和扭曲（Sagenger，Sagenger，1984年）。如图（1）所示，脱氧核糖核酸是聚合分子。它是由识别为核苷酸的单体单元的重复而形成的。核苷酸由5-碳糖（脱氧核糖），氮基碱和一个或多个磷酸基团组成。但是，在通过这些充当构建基块的核苷酸形成的DNA中，将三个磷酸基团相互引入。（Lamprecht等，2015）。在此过程中丢失了两种磷酸盐；因此，最后，DNA链每个核苷酸具有一个磷酸基团。