方法:这项在Jean Perrin中心进行的单中心研究将涉及50例UM患者的外显子组测序,这些患者在BAP1或MBD4基因中没有已知的致病变异。主要目标是鉴定UM患者中与遗传癌易感性相关的新型候选基因。将进行多步生物信息学分析,以识别感兴趣的基因。次要目标是探索已知与其他癌症有关的基因,这已经描述了紫抗体黑色素瘤的发生,但尚未完全建立关联。该研究已于2024年10月开始,患者招募持续了12个月。未计划随访期,但是遗传分析的持续时间估计为六个月,最终研究报告预计到2026年10月。
摘要:目前转移性皮肤黑色素瘤的治疗方法包括免疫疗法和针对丝裂原活化蛋白激酶 (MAPK) 通路关键分子的药物,该通路通常由 BRAF 驱动突变激活。转移性 BRAF 突变黑色素瘤患者的整体反应对于结合 BRAF 和丝裂原活化蛋白激酶激酶 (MEK) 抑制剂的疗法更好。然而,大多数最初对疗法有反应的患者在数月内就会产生耐药性。获得性对靶向疗法的耐药性可能是由于黑色素瘤细胞中的其他基因改变以及通常与转录重编程和去分化细胞状态相关的非遗传事件。在第二种情况下,有可能识别由靶向疗法诱导的促纤维化反应,这些反应有助于改变黑色素瘤肿瘤微环境。已证实多种恶性肿瘤(包括乳腺癌和胰腺癌)的慢性纤维化与癌症之间存在密切的相互关系。在此背景下,纤维化对黑色素瘤药物适应性和治疗耐药性的贡献正在迅速显现。在这篇综述中,我们总结了最近的证据,强调了药物暴露和耐药黑色素瘤中纤维化疾病的特征,包括细胞外基质重塑增加、肌动蛋白细胞骨架可塑性增强、对机械线索的高度敏感性以及炎症微环境的建立。我们还讨论了几种潜在的治疗方案,用于操纵这种纤维化样反应来对抗耐药性和侵袭性黑色素瘤。
家蝇(Musca domestica L.,双翅目:家蝇科)是全球最常见的蝇类之一,在传播对兽医和医学都很重要感染和病原体方面发挥着重要作用。这包括传播肠道蠕虫卵以及体外寄生虫、体内寄生虫和原生动物囊肿。防治害虫的方法包括生物、物理、化学和农业技术方法。化学方法仍然是控制害虫种群的主要策略;然而,过度使用、增加剂量和治疗频率导致了抗药性的产生。迄今为止,已在自然种群中记录了大量对杀虫剂产生抗药性的记录。抗药性产生的一个重要机制是细胞色素系统的酶对外来化合物的解毒。本研究旨在总结目前关于 P450 单加氧酶在产生家蝇杀虫剂抗药性方面的作用的知识。本综述重点介绍了家蝇中导致对最常见杀虫剂产生抗性的细胞色素 P450 单加氧酶的多样性及其在基因组中的位置。在这项研究中,我们识别并描述了与杀虫剂抗性相关的主要 P450 候选基因。作者还总结并系统化了该领域的最新研究成果。
预印本(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。该版本的版权持有人于2025年1月17日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.01.14.632956 doi:Biorxiv Preprint
在本期刊的最近一篇文章中概述了2024年原发性皮肤黑色素瘤的建议[1]。但是,读者应意识到,其中一些建议与全球当前的实践不符,该建议基于在仔细考虑所有可用证据后制定的国家和国际准则。特别关注的是,使用前哨节点活检(SNB)进行分期没有任何价值。相反,Dixon等人。主张独家使用原发性黑色素瘤和患者的六种特征来估计预后和指导管理:布雷斯洛的厚度,年龄,溃疡状态,亚型,性别和现场。他们将这六个功能称为“ Bausss BioMarker”。我们完全同意Dixon等人的观点。这些都是重要的临床病理学特征,每个临床病理特征具有预后意义。但是,Dixon等。将Bausss的信息与SNB相提并论,尽管从未提出SNB应该取代主要黑色素瘤作为单一预后因素的特征。SNB被广泛接受为管理较高风险原发性皮肤黑色素瘤的患者的安全,有效和有价值的工具,这是由几项大型的前瞻性临床试验确定的[2-4]。SNB在最早可能的时间中检测到新诊断的原发性黑色素瘤的患者的淋巴结转移,确定了SN中患有微转移性疾病的患者,这些患者可能会从辅助治疗中受益最大的现代全身疗法,这些辅助治疗具有有效的现代全身疗法,这些疗法已被证明可以降低进展到IV期疾病的风险[5]。它也具有治疗价值,大大降低了节点场复发的风险。作者讨论了Bausss和SNB的预后特征的相对C统计数据。C统计是一种数学计算,用于指示特定模型或测试的准确性。它的得分在1.0到0.0之间,C统计量为1.0,表明完美的测试始终可以预测一定的结果,值为
癌症是由于遗传和表观遗传学改变的积累而发展的,这些改变最终决定了患者中观察到的疾病表现。了解每种DNA改变如何破坏细胞行为,最终影响疾病发展的能力将支持更有效的,定制的疗法的设计。皮肤皮肤黑色素瘤是鉴定疾病表型分子原因的肿瘤类型。每个患者由于阳光引起的损害而引起的复杂的突变曲线,这使得通过比较患者的样本来辨别单个突变的影响很复杂:它们在许多方面有所不同,并非全部驱动疾病。除了突变之外,表观遗传改变是黑色素瘤发育的特征。黑色素瘤在DNA甲基化和可及性中表现出严重的破坏,并且影响染色质结构的突变在患者中很常见。尽管如此,尚不清楚染色质状态因遗传改变而导致染色质状态以及它们在塑造细胞行为中的作用。学生将结合实验和计算方法,以阐明黑色素瘤中DNA序列/结构与分子表型之间的连接。尤其是该项目将利用黑色素瘤的新型人细胞模型(Hodis*,Torlai Triglia* et al。,10.1126/science.abi8175)和单细胞基因组工具来研究DNA序列和结构中的变化如何影响黑色素瘤中的黑色素瘤表型在黑色素瘤中影响遗传和表观群体的细胞行为,并驱动遗传元素。项目的细节将根据学生的利益量身定制,并将在面试中进行讨论。该学生将成为伦敦Blizard Institute的Torlai Triglia Lab(https://ettlab.science)的一部分。关键词:癌症发展;基因型到表型;染色质;表观遗传学;黑色素瘤;单细胞技术研究环境Torlai Triglia Lab是伦敦皇后玛丽大学的生物学和行为科学学院(SBBS)中新建立的小组。我们的研究目标是通过实验和计算工具的结合结合疾病发育期间在疾病发育过程中将DNA改变与分子和细胞表型联系起来,以鉴定可行的个性化疗法靶标。
摘要 在真核生物中,血红素通过两个硫醚键附着到线粒体细胞色素 c 和 c 1 上,由多亚基细胞色素 c 成熟系统 I 或全细胞色素 c 合成酶 (HCCS) 催化。前者是从线粒体的 α 变形菌祖先遗传而来;后者是一种真核创新,其原核祖先并不明显。HCCS 是真核生物中从头蛋白质创新的少数几个例子之一,但对 HCCS 的结构功能了解有限。独特的是,眼虫原生生物(包括医学上相关的动基体锥虫和利什曼原虫寄生虫)通过单个硫醚键将血红素附着到线粒体 c 型细胞色素上。但该机制尚不清楚,因为缺乏编码与其他分类群中参与细胞色素 c 成熟的蛋白质具有可检测相似性的蛋白质的基因。在这里,通过生物信息学搜索所有含血红素蛋白的动质体中保守的蛋白质,鉴定出动质体细胞色素 c 合成酶 (KCCS),我们发现它是必需的和线粒体的,能催化血红素附着到锥虫细胞色素 c 上。KCCS 与其他蛋白质没有序列同一性,除了四个短基序内的轻微相似性表明与 HCCS 相关。因此,KCCS 为研究真核细胞色素 c 成熟提供了一种新的资源,可能具有更广泛的相关性,因为人类 HCCS 的突变会导致疾病。此外,与许多其他真核生物相比,眼虫的许多线粒体生物化学例子都不同;因此,KCCS 的鉴定为进化分化的原生生物群体中极端、不寻常的线粒体生物化学提供了另一个典范。
摘要 癌症治疗疫苗用于通过放大现有的免疫反应来增强患者自身的免疫系统。基于细菌的 emm55 疫苗与 PD1 检查点抑制剂一起在病灶内给药对 B16 黑色素瘤小鼠模型产生了强大的抗肿瘤作用。然而,设计联合疗法的最佳注射顺序和注射频率并非易事。在这里,我们开发了一个根据实验数据校准的耦合常微分方程模型,并使用网格自适应直接搜索法优化 emm55 疫苗和抗 PD1 联合治疗的治疗方案。该方法确定,早期连续疫苗注射与减少间隔时间的分布式抗 PD1 注射相结合可产生最佳的肿瘤尺寸减小效果。优化的方案导致单独疫苗治疗的肿瘤面积减少了两倍,联合治疗的肿瘤面积减少了四倍。我们的结果揭示了最佳治疗条件下的肿瘤亚群动态,为有效的治疗设计定义了路径。类似的计算框架可以应用于其他肿瘤和其他联合疗法,以在相当不受限制和廉价的环境中产生可通过实验检验的假设。1. 简介虽然免疫系统提供了抵御病毒或癌细胞等异物的第一道防线,但患者自身的激活 T 细胞很少能有效杀死大肿瘤。因此,需要其他方法来增强患者的免疫系统。其中一种方法是施用治疗性癌症疫苗,旨在通过诱导新的或放大现有的免疫反应来增强患者自身的免疫系统,从而消灭癌细胞 [1-4]。当这种疫苗被注射到肿瘤中时,它们会转染肿瘤
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