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肠道微生物组在心血管健康中的关键作用
最近的一项从2024年4月的一项研究确定振动杆菌和Eubacterium是协同的胆固醇代谢剂。这些细菌在转化胆固醇时形成的中间产物最终被其他细菌降解，并从体内冲洗掉，减少肠道胆固醇并调节宿主的生化途径，从而降低粪便和血浆胆固醇水平。结果可能有助于促进新型潜在干预措施，例如针对心血管疾病（CVD）治疗中的微生物组。3观察到一种新的关联，高血清C-反应性蛋白（CRP）水平与副胶囊菌毛和未分类的公司相关，并与血浆胆固醇密切相关。对于富公司，发现该门称为MSP_120的明确定义的宏基因组pangenome（MSP）与较高的胆固醇水平相关，表明其在胆固醇代谢中的作用，因此
2024 年跨尺度成像展示
1. 技术平台内提供的最新成像技术和方法产品（新博士生了解可提供哪些支持的绝佳机会！）， 2. 案例研究重点介绍跨尺度成像主题内技术平台以综合方式开展的跨学科工作 3. 听听我们的特邀演讲嘉宾 – Vicki Gold 博士的演讲，她是埃克塞特大学生命系统研究所的副教授，专门研究涵盖真核和原核生物学的大型分子机器的低温电子显微镜。通过整合单粒子低温电子显微镜、低温断层扫描和分子建模，Vicki 为我们理解细菌 IV 型菌毛驱动的细菌运动做出了重大贡献，这将是她演讲的重点。 4. 供应商可以为技术平台内设备用户提供哪些支持（以及他们最新的技术产品！）
针对含有...的质粒编码蛋白质
摘要 抗菌素耐药性 (AMR) 对人类健康构成重大威胁。尽管已经开发出疫苗来对抗 AMR，但将特定疫苗抗原与 AMR 关联起来却极具挑战性。细菌质粒在 AMR 的传播中起着至关重要的作用。我们最近的研究发现了一组细菌质粒（具体来说，IncHI 质粒），它们编码含有细菌免疫球蛋白样结构域的大分子量蛋白质。这些蛋白质位于细菌细胞的外表面，例如鞭毛或接合菌毛中。在这项研究中，我们表明这些蛋白质具有抗原性，可以保护小鼠免受携带其中一种质粒的 AMR 沙门氏菌菌株引起的感染。此外，我们成功生成了针对这些蛋白质的纳米抗体，这些纳米抗体被证明可以干扰 IncHI 质粒的接合转移。考虑到这些蛋白质也编码在其他质粒组中，例如 IncA/C 和 IncP2，针对它们可能是对抗由携带不同组 AMR 质粒的细菌引起的 AMR 感染的有效策略。由于选定的抗原与 AMR 本身直接相关，因此保护作用不仅限于特定微生物，还包括所有携带相应抗性质粒的微生物。
铜绿假单胞菌中的CRISPR-CAS提供瞬时人群水平的免疫力，以防止高噬菌体暴露
原核生物适应性免疫系统，CRISPR-CAS（群集定期间隔短的短滴虫重复序列；与CRISPR相关），需要靶向靶向入侵移动遗传元件（例如噬菌体）的间隔序列。先前的工作已经确定了驱动模型有机体基于CRISPR的免疫的进化的生态变量，铜绿假单胞菌PA14针对其噬菌体DMS3VIR，导致快速噬菌体灭绝。但是，尚不清楚这种获得的免疫力在细菌种群中是否以及如何稳定，以及这如何取决于环境。在这里，我们检查了30天的演化实验中CRISPR间隔者获取和损失的动态，并确定条件使免疫力长期维持之间的平衡与支持噬菌体持久性的替代抵抗策略之间的平衡。具体来说，我们发现初始噬菌体剂量和再感染频率都决定了是否长期保持获得的CRISPR免疫，并且噬菌体是否可以与细菌共存。在人口遗传学水平上，出现和CRISPR免疫的丧失与高水平的间隔多样性有关，随后由于携带菌毛相关突变的细菌的侵袭而下降。在一起，这些结果提供了CRISPR免疫获取和损失动态的高分辨率，并证明累积噬菌体负担决定了CRISPR对生态相关时间表的有效性。
Geobacter OmcZ 细丝的结构表明细胞外细胞色素聚合物多次独立进化
摘要 虽然早期的基因和低分辨率结构观察表明，Geobacter 等金属还原生物的细胞外导电丝由 IV 型菌毛组成，但现在已经确定细菌 c 型细胞色素可以聚合形成能够进行长距离电子传输的细胞外丝。有两种这样的细胞色素丝具有原子结构，它们由六血红素细胞色素 OmcS 和四血红素细胞色素 OmcE 形成。由于中心 OmcS 和 OmcE 核心内的血红素包装高度保守，并且亚基之间血红素配位模式相同，因此有人认为这些聚合物具有共同的起源。我们现在使用低温电子显微镜 (cryo-EM) 来确定第三种细胞外丝的结构，它由 Geobacter sulphurreducens 八血红素细胞色素 OmcZ 形成。与来自同一生物体的 OmcS 和 OmcE 中的线性血红素链相比，OmcZ 中的血红素堆积、血红素：血红素角度和亚基间血红素配位截然不同。OmcZ 内的分支血红素排列导致每个亚基中血红素高度暴露在表面，这可能解释了导电生物膜网络的形成，并解释了 OmcZ 细丝测量到的更高电导率。这一新的结构证据表明，导电细胞色素聚合物不止一次独立地从不同的祖先多血红素蛋白中出现。
巴氏涂片检测 DNA 中的基因组不稳定性分析为高级别浆液性卵巢癌的早期诊断提供了原理验证
由于诊断较晚和缺乏早期发现的筛查方法，高级别浆液性卵巢癌 (HGSOC) 成为死亡率最高的妇科恶性肿瘤。在本文中介绍的工作中，我们研究了一项回顾性和多中心队列，该队列包含 250 份在常规妇科筛查中收集的巴氏涂片检查档案。样本采集于不同时间点（从诊断前 1 个月到 13.5 年），来自 113 名随后被诊断为 HGSOC (pre-HGSOC) 的无症状女性和 77 名健康女性。通过对巴氏涂片检查样本中的 DNA 进行低通全基因组测序，以拷贝数谱异常 (CPA) 的形式检测基因组不稳定性。从 HGSOC 前女性的巴氏涂片检查样本中提取的 DNA 的 CPA 值明显高于健康女性样本的 CPA 值。与克隆致病性 TP53 突变的纵向分析一致，该检测可在诊断前 9 年内检测到 HGSOC 的存在。这一发现证实了肿瘤细胞不断从菌毛脱落到宫颈管，为 HGSOC 的早期诊断提供了一条新途径。我们将 CPA 评分整合到 EVA（早期卵巢癌）测试中，其敏感性为 75%（95% CI，64.97 至 85.79），特异性为 96%（95% CI，88.35 至 100.00），准确率为 81%。这项原理验证研究表明，通过分析宫颈管涂片中的 DNA 基因组变异可以早期诊断 HGSOC。
新颖的目标，它们的设计，交付和临床潜力
包括核苷酸实体的疗法是非常广泛的类别，涵盖了核苷酸类似物，寡核苷酸和基于核酸的疗法。核苷酸/基于核苷的药物已经进行了很好的探索，临床批准的候选者是抗病毒，抗癌，抗细菌和抗毛状细胞类似（Garner，2021）。寡核苷酸疗法是相对近期且有前途的，包括反义寡核苷酸（ASOS），小型干扰RNA（siRNA），短发夹RNA（SHRNAS），抗菌毛（抗微生物）（抗MIRS）。寡核苷酸选择性地结合RNA或蛋白质，阻断其功能或促进降解。寡核苷酸疗法显示出在治疗遗传疾病，癌症，病毒感染和神经退行性疾病方面的潜力（Roberts，2020年）。目前，批准了15种寡核苷酸疗法治疗美国各种罕见疾病，其中四种批准针对Duchenne肌肉营养不良。尤其是在2020年3月，Viltolarsen的批准引起了全世界研究人员对寡核苷酸疗法的关注（Igarashi，2022年）。基于核酸的疗法包括长多核苷酸的靶向疾病，旨在调节基因表达，正确的遗传突变或干扰引起疾病的过程（Sridharan，2016）。发现CRISPR-CAS9基因编辑技术已彻底改变了基于核酸的治疗剂，但仍在研究持久的研究，以改善其递送方法，增强靶向特异性，并确保此类治疗剂的安全和效果（Udddin，2020）。发现CRISPR-CAS9基因编辑技术已彻底改变了基于核酸的治疗剂，但仍在研究持久的研究，以改善其递送方法，增强靶向特异性，并确保此类治疗剂的安全和效果（Udddin，2020）。研究人员正在努力继续探索寡核苷酸的转化潜力，同时解决了各种相关的挑战，例如特殊的挑战，交付，
青霉素* 类别：β-内酰胺概述
青霉素* 类别：β-内酰胺 概述 青霉素是典型的β-内酰胺，至今仍是一种重要的抗菌药物。兽医学中使用的窄谱青霉素包括天然存在的青霉素、青霉素 G (苄基青霉素) 和口服的生物合成稳定青霉素，如青霉素 V (苯氧甲基青霉素) 和苯乙青霉素。青霉素对大多数敏感细菌有杀菌作用。这些窄谱 β - 内酰胺酶敏感青霉素主要对抗革兰氏阳性菌。 耐药性 在 20 世纪 40 年代初青霉素广泛使用后不久，产生青霉素酶的金黄色葡萄球菌开始出现。青霉素酶通过酶抑制破坏β - 内酰胺环，使菌体产生耐药性。耐药性的垂直进化是指通过突变和选择获得耐药性。通过这一过程，肺炎球菌能够改变青霉素结合的靶蛋白。先前对青霉素敏感的生物体也可以通过转导获得耐药性。耐药金黄色葡萄球菌可以通过将包裹在噬菌体、细菌宿主病毒中的质粒 DNA 转移给敏感金黄色葡萄球菌，从而将 β-内酰胺酶产生能力转移给敏感金黄色葡萄球菌。生物体还可以通过转化、从死细菌中吸收暴露的 DNA 并导致基因型改变（DNA 重组）获得耐药性。这可能是肺炎链球菌传播青霉素耐药性的主要手段。结合是获得青霉素耐药性的另一种方式。结合涉及同属或不同属的细菌之间质粒或其他染色体外 DNA 的单向转移。这种转移通过生育因素介导发生，并通过性菌毛从供体延伸到受体进行。这种机制通常是多药耐药性转移的原因。这种现象发生在一系列携带抗多种抗菌药物的耐药性转移因子的紧密相关基因发生交换时。这些质粒通过转移含有形成 β -内酰胺酶所需信息的基因来携带对青霉素的耐药性。
二氢藻蛋白抑制药物中的质粒转移 -
质粒抗生素抗性基因（ARGS）的共轭转移是ARG传播的重要途径。 据报道，越来越多的抗生素和非抗生素化合物有助于ARG的传播，强调了控制这种水平转移的潜在挑战。 开发阻断或延迟含有ARG质粒转移的共轭抑制剂是控制抗生素耐药性传播的有前途的策略。 尽管这种抑制剂很少见，但它们通常表现出相对较高的毒性和体内效力低，并且它们的作用机制却不足以理解。 在这里，我们研究了一种用于治疗疟疾的青蒿素衍生物（一种用于治疗疟疾）对结合的影响。 dha抑制了埃斯耐里希亚大肠杆菌中超过160倍的体外体外，在小鼠模型中，含有超过160倍的（INCX4质粒）在大肠杆菌中超过160倍（MCR-1）的结合，在体外的体外超过160倍（INCI2质粒）。 它还抑制了带有碳青霉烯电阻基因BLA NDM-5的Incx3质粒的转移，体外超过两倍。 检测细胞内三磷酸（ATP）和质子动力（PMF）以及转录组和代谢组分析的结合表明，DHA损害了电子传输链（ETC）的功能，通过抑制三碳酸（TCA）循环范围，并破坏分裂的PMF，并破坏pmf的临时性。 转移。 我们的发现为提供了新的见解质粒抗生素抗性基因（ARGS）的共轭转移是ARG传播的重要途径。据报道，越来越多的抗生素和非抗生素化合物有助于ARG的传播，强调了控制这种水平转移的潜在挑战。开发阻断或延迟含有ARG质粒转移的共轭抑制剂是控制抗生素耐药性传播的有前途的策略。尽管这种抑制剂很少见，但它们通常表现出相对较高的毒性和体内效力低，并且它们的作用机制却不足以理解。在这里，我们研究了一种用于治疗疟疾的青蒿素衍生物（一种用于治疗疟疾）对结合的影响。dha抑制了埃斯耐里希亚大肠杆菌中超过160倍的体外体外，在小鼠模型中，含有超过160倍的（INCX4质粒）在大肠杆菌中超过160倍（MCR-1）的结合，在体外的体外超过160倍（INCI2质粒）。它还抑制了带有碳青霉烯电阻基因BLA NDM-5的Incx3质粒的转移，体外超过两倍。检测细胞内三磷酸（ATP）和质子动力（PMF）以及转录组和代谢组分析的结合表明，DHA损害了电子传输链（ETC）的功能，通过抑制三碳酸（TCA）循环范围，并破坏分裂的PMF，并破坏pmf的临时性。 转移。我们的发现为此外，在DHA暴露期间，与结合和菌毛产生相关的基因的表达水平显着下调，这表明可以抑制结合的转移设备。