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原核生物适应性免疫系统,CRISPR-CAS(群集定期间隔短的短滴虫重复序列;与CRISPR相关),需要靶向靶向入侵移动遗传元件(例如噬菌体)的间隔序列。先前的工作已经确定了驱动模型有机体基于CRISPR的免疫的进化的生态变量,铜绿假单胞菌PA14针对其噬菌体DMS3VIR,导致快速噬菌体灭绝。但是,尚不清楚这种获得的免疫力在细菌种群中是否以及如何稳定,以及这如何取决于环境。在这里,我们检查了30天的演化实验中CRISPR间隔者获取和损失的动态,并确定条件使免疫力长期维持之间的平衡与支持噬菌体持久性的替代抵抗策略之间的平衡。具体来说,我们发现初始噬菌体剂量和再感染频率都决定了是否长期保持获得的CRISPR免疫,并且噬菌体是否可以与细菌共存。在人口遗传学水平上,出现和CRISPR免疫的丧失与高水平的间隔多样性有关,随后由于携带菌毛相关突变的细菌的侵袭而下降。在一起,这些结果提供了CRISPR免疫获取和损失动态的高分辨率,并证明累积噬菌体负担决定了CRISPR对生态相关时间表的有效性。

铜绿假单胞菌中的CRISPR-CAS提供瞬时人群水平的免疫力,以防止高噬菌体暴露

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