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基于 CRISPR/Cas 的植物功能基因组学和计算建模
博士Prasenjit Saikia 博士阿吉特·辛格博士Biswajit Saha 博士P. Yuvaraj 先生帕萨·马宗德博士Hridoy Jyoti Mahanta 博士Pankaj Bharali 博士Tridip Phukan 博士Romi Wahengbam 博士Saikat Haldar 博士奥雅纳罗伊博士百夏凛空博士Atul Ashok More 博士Leon Raj 博士Pravin G. Ingole 博士吉滕德拉·辛格·维尔马博士萨钦吉德先生Dhanjit Das 博士Jyoti Kumar Doley 博士Biswajit Gogoi 博士Debasis D. Mohanty 博士Hemanta Sankar Dutta 博士Jayashi Phukan 博士桑迪普·戴伊先生Rama Shankar Sharma先生JL Khongsai 先生Vaskar Rajkhowa先生Praveen Mohan Verma 先生希玛塔·萨基亚
文章标题：评论：真菌细胞中的CRISPR/CAS12介导的基因组编辑：植物 - 真菌病Patholo
文章标题：评论：真菌细胞中的CRISPR/CAS12介导的基因组编辑：植物 - 真菌病理学中的进步，机制和未来方向作者：Chiti Agarwal [1]，Vishnutej Ellur [1]附属机构[1]附属机构：华盛顿州立大学[1] ORCID IDS：0000-000-000-0003-41125-25-25-8880 [1] chiti.agarwal@gmail.com许可证信息：这项工作已在Creative Commons Attribution许可证下发布开放访问http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/，只要适当引用任何原始工作，该工作就允许在任何媒介中进行无限制的使用，分发，分发和复制。可以在https://www.scienceopen.com/上找到条件，使用条款和发布政策。预印度语句：本文是预印本，未经同行评审，正在考虑，并提交给ScienceOpen的预印本进行开放的同行评审。doi：10.14293/pr2199.000129.v1预印本在线发布：2023年5月14日关键字：CRISPR，CRISPR/CAS12，真菌病原体，植物病原体
摄入单个引导 RNA 可通过激活 CRISPR 来诱导基因过度表达并延长秀丽隐杆线虫的寿命
秀丽隐杆线虫是一种用于研究发育和衰老遗传学的多功能模型生物，通过给线虫喂养表达特定 dsRNA 的细菌可以抑制其基因表达。之前已证实通过常规转基因技术过表达缺氧诱导因子 1 ( hif-1 ) 或热休克因子 1 ( hsf-1 ) 可延长线虫寿命。然而，目前尚不清楚其他基因过表达方法是否可行，尤其是随着基于 CRISPR 的技术的出现。本文中，我们表明，给经过基因改造以稳定表达 Cas9 衍生的合成转录因子的秀丽隐杆线虫喂养表达启动子特异性单向导 RNA (sgRNA) 的细菌也可以激活基因表达。我们证明，通过摄取针对 hif-1 或 hsf-1 各自启动子区域的 sgRNA 激活 CRISPR 可增加基因表达并延长秀丽隐杆线虫的寿命。此外，作为旨在使用 CRISPR 激活秀丽隐杆线虫的未来研究的计算机资源，我们提供了预测的启动子特异性 sgRNA 靶序列，用于超过 13,000 个秀丽隐杆线虫基因，并具有实验定义的转录起始位点。我们预计本文描述的方法和组件将有助于促进全基因组基因过表达研究，例如，通过将表达 sgRNA 的细菌喂给线虫来诱导转录，以识别衰老或其他感兴趣的表型的调节因子。
使用植物衍生的外泌体样纳米颗粒作为基于CRIS/ CAS9的疗法的输送系统，用于编辑癌症中长的非编码RNA div>
结肠癌是美国癌症的主要原因之一。结肠癌是由结肠癌细胞基因组中的许多基因突变发展而来的。长的非编码RNA（LNCRNA）会导致许多癌症（包括结肠癌）的发育和进展。lncRNA已经并且可以通过簇状的定期间隔短的短质体重复序列（CRISPR）相关的核酸酶9（CRISPR/CAS9）系统的聚类重复序列的基因编辑技术来纠正，以减少结肠癌细胞的增殖。但是，许多用于运输基于CRISPR/CAS9的疗法的当前输送系统需要更多的安全性和效率。基于CRISPR/CAS9的治疗药需要安全有效的递送系统，以更直接，更明确地靶向结肠中存在的癌细胞。本综述将提供有关使用植物衍生的外泌体样纳米颗粒作为纳米载体的效率和安全性的相关证据，以提供基于CRISPR/CAS9的疗法以直接靶向结肠癌细胞。
crispr婴儿和编辑背后的科学家
1。smriti mallapaty。如何保护第一个“ CRISPR婴儿”引发道德辩论。自然。2022年2月25日。https：//www.nature.com/articles/d41586-022-00512-w 2。Antonio Regalado。 CRISPR婴儿的创建者已从中国监狱释放出来。 MIT技术评论。 2022年4月4日。https：//www.technologyreview.com/2022/04/04/04/1048829/he-jiankui-prison-prison-free-crispr-babies/ 3. J. Benjamin Hurlbut。 解码CRISPR的故事。 MIT技术评论。 2021年2月24日。https：//www.technologyreview.com/2021/02/24/1017838/crispr-baby-gene-gene-gene-editing-jiankui-history/ 4。 David Cyranoski。 什么Crispr-baby监狱判处男子进行研究。 自然。 2020年1月3日。https：//www.nature.com/articles/d41586-020-00001-y 5。 Patrick Foong。 CRISPR婴儿：故事展开。 Mercatornet。 2021年12月6日。https：//mercatornet.com/the-crispr-babies-the-story-unfolds/76262/ 6。 海蒂·莱德福德（Heidi Ledford）。 顾问说，应该领导基因组编辑政策。 2021年7月12日。https：//www.nature.com/articles/d41586-021-01922-y 7。 当归Peebles。 CRISPR先驱期望在25年内看到基因编辑的婴儿。 2022年4月4日。Antonio Regalado。CRISPR婴儿的创建者已从中国监狱释放出来。MIT技术评论。 2022年4月4日。https：//www.technologyreview.com/2022/04/04/04/1048829/he-jiankui-prison-prison-free-crispr-babies/ 3. J. Benjamin Hurlbut。 解码CRISPR的故事。 MIT技术评论。 2021年2月24日。https：//www.technologyreview.com/2021/02/24/1017838/crispr-baby-gene-gene-gene-editing-jiankui-history/ 4。 David Cyranoski。 什么Crispr-baby监狱判处男子进行研究。 自然。 2020年1月3日。https：//www.nature.com/articles/d41586-020-00001-y 5。 Patrick Foong。 CRISPR婴儿：故事展开。 Mercatornet。 2021年12月6日。https：//mercatornet.com/the-crispr-babies-the-story-unfolds/76262/ 6。 海蒂·莱德福德（Heidi Ledford）。 顾问说，应该领导基因组编辑政策。 2021年7月12日。https：//www.nature.com/articles/d41586-021-01922-y 7。 当归Peebles。 CRISPR先驱期望在25年内看到基因编辑的婴儿。 2022年4月4日。MIT技术评论。2022年4月4日。https：//www.technologyreview.com/2022/04/04/04/1048829/he-jiankui-prison-prison-free-crispr-babies/ 3.J. Benjamin Hurlbut。 解码CRISPR的故事。 MIT技术评论。 2021年2月24日。https：//www.technologyreview.com/2021/02/24/1017838/crispr-baby-gene-gene-gene-editing-jiankui-history/ 4。 David Cyranoski。 什么Crispr-baby监狱判处男子进行研究。 自然。 2020年1月3日。https：//www.nature.com/articles/d41586-020-00001-y 5。 Patrick Foong。 CRISPR婴儿：故事展开。 Mercatornet。 2021年12月6日。https：//mercatornet.com/the-crispr-babies-the-story-unfolds/76262/ 6。 海蒂·莱德福德（Heidi Ledford）。 顾问说，应该领导基因组编辑政策。 2021年7月12日。https：//www.nature.com/articles/d41586-021-01922-y 7。 当归Peebles。 CRISPR先驱期望在25年内看到基因编辑的婴儿。 2022年4月4日。J. Benjamin Hurlbut。解码CRISPR的故事。MIT技术评论。 2021年2月24日。https：//www.technologyreview.com/2021/02/24/1017838/crispr-baby-gene-gene-gene-editing-jiankui-history/ 4。 David Cyranoski。 什么Crispr-baby监狱判处男子进行研究。 自然。 2020年1月3日。https：//www.nature.com/articles/d41586-020-00001-y 5。 Patrick Foong。 CRISPR婴儿：故事展开。 Mercatornet。 2021年12月6日。https：//mercatornet.com/the-crispr-babies-the-story-unfolds/76262/ 6。 海蒂·莱德福德（Heidi Ledford）。 顾问说，应该领导基因组编辑政策。 2021年7月12日。https：//www.nature.com/articles/d41586-021-01922-y 7。 当归Peebles。 CRISPR先驱期望在25年内看到基因编辑的婴儿。 2022年4月4日。MIT技术评论。2021年2月24日。https：//www.technologyreview.com/2021/02/24/1017838/crispr-baby-gene-gene-gene-editing-jiankui-history/ 4。David Cyranoski。 什么Crispr-baby监狱判处男子进行研究。 自然。 2020年1月3日。https：//www.nature.com/articles/d41586-020-00001-y 5。 Patrick Foong。 CRISPR婴儿：故事展开。 Mercatornet。 2021年12月6日。https：//mercatornet.com/the-crispr-babies-the-story-unfolds/76262/ 6。 海蒂·莱德福德（Heidi Ledford）。 顾问说，应该领导基因组编辑政策。 2021年7月12日。https：//www.nature.com/articles/d41586-021-01922-y 7。 当归Peebles。 CRISPR先驱期望在25年内看到基因编辑的婴儿。 2022年4月4日。David Cyranoski。什么Crispr-baby监狱判处男子进行研究。自然。2020年1月3日。https：//www.nature.com/articles/d41586-020-00001-y 5。Patrick Foong。 CRISPR婴儿：故事展开。 Mercatornet。 2021年12月6日。https：//mercatornet.com/the-crispr-babies-the-story-unfolds/76262/ 6。 海蒂·莱德福德（Heidi Ledford）。 顾问说，应该领导基因组编辑政策。 2021年7月12日。https：//www.nature.com/articles/d41586-021-01922-y 7。 当归Peebles。 CRISPR先驱期望在25年内看到基因编辑的婴儿。 2022年4月4日。Patrick Foong。CRISPR婴儿：故事展开。Mercatornet。2021年12月6日。https：//mercatornet.com/the-crispr-babies-the-story-unfolds/76262/ 6。海蒂·莱德福德（Heidi Ledford）。应该领导基因组编辑政策。2021年7月12日。https：//www.nature.com/articles/d41586-021-01922-y 7。当归Peebles。 CRISPR先驱期望在25年内看到基因编辑的婴儿。 2022年4月4日。当归Peebles。CRISPR先驱期望在25年内看到基因编辑的婴儿。2022年4月4日。
Mammoth 已经是基于 CRISPR 的疾病检测领域的领导者，最新一轮融资将推动 Mammoth 强大的平台
蛋白质发现扩展到基因编辑和治疗应用 加州南旧金山（2020 年 1 月 30 日）Mammoth Biosciences 是世界上第一个基于 CRISPR 的疾病检测平台背后的公司，今天宣布其 B 轮融资获得 4500 万美元超额认购。此次融资由德诚资本领投，Mayfield、NFX、Verily 和 Brook Byers 参投，使公司的融资总额超过 7000 万美元。这笔资金将推动该公司进一步开发 CRISPR 诊断和下一代 CRISPR 产品，同时该公司将其平台扩展到包括基因编辑和下一代治疗方法。Mammoth 还在探索与生物技术和制药公司的深度合作，以利用 Mammoth CRISPR 平台改变医疗保健并造福患者。CRISPR 在治疗疾病方面具有巨大的前景，Cas9 的临床试验已经在进行中——这是将 CRISPR 从实验室带入日常生活的关键一步。但是，尽管这种酶在体外环境中显示出成功的初步迹象，但在体内应用方面仍然存在挑战，限制了 Cas9 在广泛疾病领域的广泛应用。此外，Cas9 不能用于基于 CRISPR 的诊断，这是 Cas 系统的一个新兴和突破性应用。Mammoth 凭借其广泛的新型 Cas 系统组合，在克服这些障碍方面具有独特的优势，这些系统可作为诊断、基因编辑和治疗应用的工具箱。4500 万美元的 B 轮融资将推动 CRISPR 平台的开发，特别关注 Mammoth 发现的 Cas14。Cas14 是一种独特的酶，由于其极小的尺寸、多样化的靶向能力和高保真度，开辟了新的可能性。这些特性将使 Mammoth 能够实现下一代编辑，在体外和体内应用中具有更广泛的靶标范围，并为实现先进的 CRISPR 模式（如靶向基因调控、精确编辑等）奠定基础。最近，包括 Casebia（拜耳与 CRISPR Therapeutics 的合资企业）前联合创始人 Peter Nell 和 Synthego 和 Bio-Rad 前高管 Ted Tisch 在内的业内资深人士分别以首席商务官和首席运营官的身份加入了该公司，以加速公司的发展。Grail 联合创始人、前 Illumina 董事会成员 Jeff Huber 已加入公司董事会担任独立董事，斯坦福大学医学院院长 Lloyd Minor 已加入 Mammoth 顾问委员会。Mammoth Biosciences 首席执行官兼联合创始人 Trevor Martin 解释说：“作为 CRISPR 发现前沿的团队，我们亲眼目睹了对新工具的需求，以实现这项技术所提供的治疗和诊断前景。通过为诊断以外的新产品提供支持，我们正在使
AAVS1 和 ROSA26 位点的 CRISPR 转基因敲入
pCas-Guide-scramble（SKU GE100003） AAVS1 供体载体（SKU GE100024、GE100035、GE100046、GE100048） 预先设计的 AAVS1 供体对照，具有不同的转基因和耐药标记组合（SKU GE100037、GE100039、GE100026、GE100063、GE100064、GE100065、GE100066、GE100068、GE100069、GE100070、GE100071、GE100072、GE100073） AAVS1 转基因敲入载体试剂盒（puro）（SKU GE100027） AAVS1 转基因敲入载体试剂盒（BSD）（SKU GE100036） AAVS1 转基因敲入载体试剂盒（EF1a-puro）（SKU GE100046） AAVS1 转基因敲入载体试剂盒（EF1a-BSD）（SKU GE100048） AAVS1 Cas9 插入载体试剂盒，Puro（SKU GE100038）和 BSD（SKU GE100040）
CRISPR技术在植物药有效成分次级代谢途径中的应用及发展
CRISPR/Cas9系统作为一种高效的基因编辑工具，被广泛应用于研究和调控药用植物有效成分的生物合成途径，在提高药用植物有效成分的产量和质量方面具有巨大的潜力。通过精准调控关键酶和转录因子的表达，CRISPR技术不仅加深了我们对药用植物次生代谢途径的认识，也为药物研发和中药现代化开辟了新的途径。本文首先介绍了CRISPR技术的原理及其在基因编辑中的应用，然后详细讨论了其在药用植物次生代谢中的应用，包括有效成分的组成和CRISPR策略在代谢途径中的实施，以及Cas9蛋白变体和先进的CRISPR系统在该领域的影响。此外，本文还展望了CRISPR技术对药用植物研发进程的长远影响，并提出了目前研究中存在的问题，包括脱靶效应、基因组结构复杂、转化效率低、对代谢途径了解不足等，同时提出了一些见解，以期为CRISPR在药用植物中的后续应用提供新思路。总之，CRISPR技术在药用植物次生代谢研究中具有广阔的应用前景，有望促进生物医药和农业科学的进一步发展。随着技术进步和挑战的逐步解决，CRISPR技术有望在药用植物有效成分研究中发挥越来越重要的作用。
CRISPR-CAS9 技术在开发中的应用
鲶鱼（Clarias sp.）的动物蛋白质含量足够高，可以满足人体的需要。要想培育出鲶鱼，无论在生产力、外观还是尺寸方面，都需要合适的技术，即CRISPR Cas9基因工程技术。压缩规律间隔短回文重复序列 (CRISPR) 是一种利用 Cas9 酶功能的变化来编辑基因组的现代技术。希望CRISPR技术能够在基因工程领域得到更多的认识和发展。编写本文所采用的方法是对 CRISPR Cas9 在水产养殖中使用的鲶鱼 (Clarias sp) 的发展中进行的文献研究。所用方法是对之前进行的几项研究进行文献研究并进行描述性分析。 CRISPR Cas9 技术可应用于转基因鲶鱼 (Clarias sp.)，这得到了先前应用于鲑鱼科 (大西洋鲑)、罗非鱼 (Oreochromis niloticus)、斑马鱼 (Danio reiro) 和鲶鱼 (Ictalurus punctatus) 的研究成功的支持。通过CRISPR Cas 9技术形成转基因鲶鱼可以实现的前景包括加速生长发育、增大骨骼肌，从而增加鲶鱼的体重。