文章标题:综述:真菌细胞中的 CRISPR/Cas12 介导的基因组编辑:植物真菌病理学的进展、机制和未来方向 作者:Chiti Agarwal[1] 所属机构:华盛顿州立大学 [1] Orcid ids:0000-0003-4125-2880[1] 联系电子邮件:chiti.agarwal@gmail.com 许可信息:本作品已根据知识共享署名许可 http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/ 以开放获取的方式发表,允许在任何媒体中不受限制地使用、分发和复制,只要对原始作品进行适当的引用。条件、使用条款和出版政策可在 https://www.scienceopen.com/ 上找到。预印本声明:本文为预印本,尚未经过同行评审,正在考虑并已提交给 ScienceOpen Preprints 进行开放同行评审。 DOI:10.14293/PR2199.000129.v2 预印本首次在线发布时间:2023 年 6 月 8 日 关键词:CRISPR、CRISPR/Cas12、真菌病原体、植物病原体
文章标题:评论:真菌细胞中的CRISPR/CAS12介导的基因组编辑:植物 - 真菌病理学中的进步,机制和未来方向作者:Chiti Agarwal [1],Vishnutej Ellur [1]附属机构[1]附属机构:华盛顿州立大学[1] ORCID IDS:0000-000-000-0003-41125-25-25-8880 [1] chiti.agarwal@gmail.com许可证信息:这项工作已在Creative Commons Attribution许可证下发布开放访问http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/,只要适当引用任何原始工作,该工作就允许在任何媒介中进行无限制的使用,分发,分发和复制。可以在https://www.scienceopen.com/上找到条件,使用条款和发布政策。预印度语句:本文是预印本,未经同行评审,正在考虑,并提交给ScienceOpen的预印本进行开放的同行评审。doi:10.14293/pr2199.000129.v1预印本在线发布:2023年5月14日关键字:CRISPR,CRISPR/CAS12,真菌病原体,植物病原体
方法这项研究得到了卫生科学大学伦理委员会的批准(批准号:2021.11.251,日期:2021年12月20日)。从所有临时患者中获得书面知情同意。由皮肤科部门组成,并在2020年6月至2021年8月之间由皮肤科部门进行了总共254例患者及其皮肤活检。从医院记录和病理报告中明显地收集了临床和病理数据。从医院记录中获得了患者信息,包括年龄,性别,活检位置和前临床诊断。Preliminary clinical diagnoses were grouped as follows: group 1 (erythematous scaly patch, papule and plaque, tumor, erythro- derma), group 2 (petechiae, purpura), group 3 (pigmentation dis- order), group 4 (follicular involvement), and group 5 (other, such as alopecia, atrophy/poikiloderma, nonspecified病变)。在患者表现出多种临床模式的情况下,他们被视为“单个”或“多个”临床表现。由于某些患者有多次临床表现,因此1例患者可能会超过1组。在初步临床诊断中诊断为MF的患者根据诊断顺序分为组:“第一”,“第二”,“第三”或“第四及以上”。
植物细菌病原体的诊断经历了从基于文化的策略到无文化检测的跨越发展。常规诊断,这种基于PCR的方法和基于PCR的方法非常敏感,可以在后期鉴定自然感染的农作物中富含富集的病原体。然而,它们遭受了与速度,信号强度以及实际植物提取物中灵敏度显着降低有关的缺点。通过开发标记和未标记的光谱法,已经取得了进展来解决这些挑战。特别是微拉曼光谱可以在单细胞水平上快速,无标记和无创的病原体歧视。全面的光谱数据库始终是识别的先决条件,但是这些基于光谱的方法不足以检测以前未知的植物病原体。单细胞测序和合成生物学的进步开始解决这些关键问题,并用于相关的实际应用中。成功将继续在学科之间的接口上找到。
摘要 沙门氏菌病是欧盟第二大常见的食源性人畜共患病,猪是这种病原体的主要宿主。养猪生产中的沙门氏菌控制需要采取多种措施,其中可通过接种疫苗来减少流行血清型(如鼠伤寒沙门氏菌血清型)的亚临床携带和脱落。减毒活疫苗株在增强细胞介导免疫和允许通过口服途径接种方面具有优势。然而,这些疫苗的主要缺点是对异源血清型的交叉保护作用有限,并且会干扰感染的血清学监测。我们最近表明,减毒沙门氏菌菌株 (ΔXIII) 在鼠感染模型中对鼠伤寒沙门氏菌具有保护作用。ΔXIII 菌株含有 13 条染色体缺失,这使得它无法产生 sigma 因子 RpoS 和合成环二鸟苷酸 (c-di-GMP)。在本研究中,我们的目标是测试 ΔXIII 菌株对猪的保护作用,并研究使用 ΔXIII 是否可以区分已接种疫苗的猪和已感染的猪。结果表明,在断奶前仔猪口服 ΔXIII 疫苗可减少断奶和屠宰时的粪便脱落和回盲淋巴结定植,从而交叉保护仔猪免受鼠伤寒沙门氏菌的攻击。接种疫苗的猪在断奶时既没有粪便脱落,也没有疫苗菌株的组织持续存在,从而确保屠宰时不存在 ΔXIII 菌株。此外,ΔXIII 菌株中缺乏 SEN4316 蛋白,这使得开发血清学测试成为可能,从而区分感染动物和接种疫苗的动物 (DIVA)。
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摘要背景分枝杆菌包括各种毒力的普遍存在种。然而,环境和个体特定因素,特别是宿主遗传因素,在接触分枝杆菌的结果中起着至关重要的作用。单基因分枝杆菌易感性的第一个分子证据来自对分枝杆菌病 (MSMD) 孟德尔易感性的研究,这是一种罕见的 IFN-γ 免疫先天缺陷,即使对低毒力分枝杆菌感染也具有选择性易感性,患者大多为儿童,常规检查中没有可识别的免疫缺陷。本文全面、最新地描述了所有已知的 MSMD 单基因缺陷最重要的分子、细胞和临床特征。结果 在过去的 20 年中,已发现 MSMD 患者中有 19 个基因发生突变(IFNGR1、IFNGR2、IFNG、IL12RB1、IL12RB2、IL23R、IL12B、ISG15、USP18、ZNFX1、TBX21、STAT1、TYK2、IRF8、CYBB、JAK1、RORC、NEMO 和 SPPL2A),这些基因位点的等位基因异质性已导致 35 种不同的遗传缺陷的定义。尽管存在临床和遗传异质性,但几乎所有 MSMD 的遗传病因都会改变干扰素 γ (IFN- γ ) 介导的免疫力,方法是削弱或消除 IFN- γ 的产生或对该细胞因子的反应,或两者兼而有之。已证明人类 IFN- γ 水平是决定分枝杆菌感染结果的数量性状。结论 这些单基因缺陷的研究有助于了解人类分枝杆菌感染的分子机制,并有助于开发新的诊断和治疗方法以改善护理和预后。这些发现还弥合了简单的孟德尔遗传与复杂的人类遗传学之间的差距。关键词 分枝杆菌病、单基因、先天性免疫缺陷、孟德尔易感性、IFN-γ
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印度的独立研究员印度印度C raiganj政府医学院和医院C内科医学院,Rutgers Health Community Medical Center,Toms River,NJ,美国新泽西州汤姆斯河D,美国纽约州Bronxcare Health System,美国纽约州Bronxcare Health System,美国E纽约州纽约州e,哈佛大学,美国医学院/BIDMC,BOSTON,美国波士顿,美国医学院。印度勒克瑙(Lucknow),HO OO Bogomolets国家医科大学,基辅,乌克兰I内科学系,德克萨斯理工大学健康科学系,美国德克萨斯州埃尔帕索市,美国J.华沙医科大学药理学,临床前研究与技术中心,华沙,波兰n心脏病学系,奥地利维也纳医科大学印度印度C raiganj政府医学院和医院C内科医学院,Rutgers Health Community Medical Center,Toms River,NJ,美国新泽西州汤姆斯河D,美国纽约州Bronxcare Health System,美国纽约州Bronxcare Health System,美国E纽约州纽约州e,哈佛大学,美国医学院/BIDMC,BOSTON,美国波士顿,美国医学院。印度勒克瑙(Lucknow),HO OO Bogomolets国家医科大学,基辅,乌克兰I内科学系,德克萨斯理工大学健康科学系,美国德克萨斯州埃尔帕索市,美国J.华沙医科大学药理学,临床前研究与技术中心,华沙,波兰n心脏病学系,奥地利维也纳医科大学