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丁香假单胞菌和柔软腐烂的果皮细菌种群的比较丰度和多样性在整个Durance河流集水区中从其法国阿尔卑斯山到其delta
河流，小溪，溪流是在将源头与插座连接起来的土地覆盖物中发生的生物，化学和物理过程的集成商。在流域中人类和动物病原体的动态已在各种情况下进行了广泛研究，从而优化了疾病风险的降低。并行，有一种新兴的意识，即可能还可以通过地表水传播作物病原体，尤其是在用于灌溉时。但是，在整个过程中，没有关于潜在的植物病原体存在的程度 - 也没有关于其动态的程度。在这里，我们比较了假单胞菌（PSY）和软腐烂的果皮杆菌（SRP）种群的季节性动态，沿着Durance River的270公里，从上游高山河（Alpestream Alpine）到达了与Rhone河的下游农业生产区。在2016年和2017年秋季，冬季，春季和夏季在21个地点收集的168个样品中，在所有采样地点均检测到PSY菌株，在人口密度的156个样品中，在最高10 5细菌L -1的人口密度下都检测到PSY菌株。相比之下，在98个样品中检测到SRP菌株，主要来自河的南部，人口密度不超过3´10 4细菌L -1。在每个采样位点表征的生物学和化学参数中，温度是唯一解释了两个物种复合物种群大小的可变性的唯一因素。PSY密度随温度升高而降低，而SRP密度随温度升高而增加。SRP的河流种群主要由多功能胸膜杆菌和水生假子组成，它们的流行病学重要性鲜为人知。仅观察到少数几个因其流行病学影响而被称为其流行病学影响的果蝇菌株。相比之下，所有地点的PSY种群都是由从其他研究中以广泛宿主范围及其地理和栖息地无处不在的遗传谱系为主的。我们的观察结果表明，可以利用对SRP的河水进行监视来发出诊断和管理反应，以避免疾病爆发。相反，由于这组细菌，由于没有规则和广泛的疾病暴发，整个集水区的持续存在表明，监视应集中在土地使用，河水条件和农艺学实践的未来变化上，这些实践可能会破坏当前在检查中持Psy暴发的机制。
CRISPR耗竭可以对复杂样品中病毒和细菌种群的敏感鉴定。
图4：将HELA细胞接种在苯酯96孔微孔板（15,000个细胞/孔）中，并在37°C下孵育48H，5％CO 2孵育。活细胞用现象641线粒体染色（0.5 µm）在37°C下染色30分钟，然后固定并透化。接下来，将细胞与细胞绘画混合物孵育，其中包括现象512核酸染色（3 µm），现象Hoechst 33342核染色（5 µg/mL），势氟568-腓罗（33 nm），33 nm），现象488 -contovue fluor 488 -contavue fluor 488 -contavue a（contavue fluor a fluor fulor a fluor a fluor）a（100 µgla）an（100 µL）5和m。最小在RT。在Operetta CLS高气结分析系统上获取图像。
与肠道健康相关的细菌种群的短暂抑制对于CROH儿童的独家肠内营养成功至关重要
美国芝加哥卢里儿童医院，美国伊利诺伊州60611，美国B Biophysical Sciences计划，芝加哥大学，芝加哥大学，伊利诺伊州60637，美国芝加哥大学，芝加哥大学，芝加哥大学，芝加哥大学，芝加哥大学，伊利诺伊州60637，美国芝加哥大学，芝加哥大学，芝加哥大学芝加哥，芝加哥，伊利诺伊州60637，美国F有机体和生态系统，Earlham Institute，Norwich，NR4 7UZ，英国G G12 8QQ，G12 8QQ，G12 8QQ，G12奥尔登堡大学环境，26129，德国奥尔登堡，J Alfred-Wegener海洋与极地研究所，27570德国Bremerhaven，德国K Helmholt k Helmholtz功能性海洋生物多样性研究所，德国26129德国Oldenburg，德国Oldenburg，德国，德国，作者： 60611，美国。电子邮件：jrunde@ luriechildrens.org; A. Murat Eren，博士，Helmholtz功能海洋生物多样性研究所，德国奥尔登堡26129。电子邮件：meren@hifmb.de电子邮件：meren@hifmb.de
适应性实验室进化对提升非常规酵母菌种生物技术潜力的贡献
摘要：通过选择压力和全基因组重测序控制实验室中的短期进化过程，可以诱导几代生物特性的变化，这有助于确定微生物适应性实验室进化 (ALE) 的遗传基础。由于该技术的多功能性以及对石油基策略替代品的迫切需求，ALE 已在多种酵母中积极开展，主要使用常规酿酒酵母，但也使用非常规酵母。由于转基因生物是一个有争议的话题，而且全球尚未就其使用达成共识，因此 ALE 成为了当前的热门话题，出现了大量采用 ALE 方法的新研究，并在此背景下开发了许多不同的应用。在本综述中，我们首次收集了相关研究，这些研究展示了非传统酵母物种的 ALE 对其生物技术改进的作用，并根据研究目的对其进行了分类，并根据所用的物种、实验结果和所采用的方法对其进行了比较。本综述阐明了 ALE 作为一种强大工具的适用性，可以增强物种特征并提高其在生物技术中的性能，重点是非传统酵母物种，作为替代方法或与基因组编辑方法相结合。
追踪微流体液滴中细菌种群的随机生长
微流体液滴中的细菌生长与生物技术、微生物生态学以及了解小群体中的随机种群动态有关。然而，自动测量液滴内的绝对细菌数量已被证明具有挑战性，迫使人们使用替代测量方法来测量种群大小。在这里，我们介绍了一种微流体设备和成像协议，可以对数千个液滴进行高分辨率成像，这样单个细菌就可以停留在焦平面上，并且可以自动计数。使用这种方法，我们跟踪了液滴中数百个重复大肠杆菌种群的随机生长。我们发现，在早期，生长轨迹的统计数据符合 Bellman-Harris 模型的预测，其中没有分裂时间的继承。我们的方法应该可以进一步测试随机生长动力学模型，并有助于更广泛地应用基于液滴的细菌培养。