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全基因组的关联研究对绵羊菌群中菌群的抗体反应
摘要。病例淋巴结炎（CLA）是一种慢性且高度传染性的疾病，在绵羊和山羊中广泛影响，对动物福利和生产产生不利影响。这项研究旨在揭示宿主地球杆菌对二氧杆菌抗体抗体水平的影响，作为疾病易感性或抗性的指标，从而有可能识别与这些性状相关的遗传标记。从四个大捷克羊群的321只羊中收集了血液样本。萨福克品种的动物年龄从2至8岁不等，每年定期采样4年。基于两种不同的商业酶连接的免疫吸附测定（ELISA）血清学抗原测试，将绵羊分为健康和患病的组。基因组DNA与Geneseek®基因组pro-firer™卵子50 K进行基因分型，并将41 301个标记用于全基因组关联分析（GWAS）。进行了一种病例 - 对比GWA，包括143种血清阳性和178羊绵羊，以评估使用GCTA软件的绵羊基因组和对磷酸梭菌的磷脂酶D抗原的抗体反应之间的关系。这项研究揭示了染色体11和20上的两个暗示性SNP（单核苷酸多态性），在Trim16的第一个外显子（含三方 - 含量的16）基因中，具有最显着的SNP。通过分析阳性动物和阴性动物之间的基因组改变及其背景，包括对暗示性SNP±500 Kb区域内基因的基因分析（GO）分析，我们鉴定了基因以及与免疫相关的过程以及潜在地影响CLA敏感性的过程和途径。这些包括通过主要的组织相容性复合物（MHC）I和II，Th17粘膜细胞分化，细胞自噬和与吞噬相关的机制的抗原加工和外基肽的呈现。这项研究提供了对抗二链球菌抗体反应的遗传基础的见解，确定了暗示性的关联和潜在的生物学机制，可以指导未来的繁殖和遗传策略，以提高对绵羊CLA的耐药性。
细菌群落结构中的精细尺度一致性，来自iLlumina上的短读和纳米孔上的长阅读的海洋沉积物
在开发高通量测序仪后，环境原核生物群落通常是通过在16S域上用遗传标记来描述的。然而，由于底漆的选择和读取长度，简短读取测序遇到了系统发育覆盖率和分类分辨率的局限性。在这些关键点上，纳米孔测序（一种适用于长读的元编码的上升技术）被低估了，因为其每读的错误率相对较高。在这里，我们比较了模拟社区中的原核生物群落结构和两个对比的红树林遗址的52个沉积物样本，由16SV4-V5标记上的短读描述（Ca。0.4kpb）通过Illumina测序分析（Miseq，v3），由长读细菌对细菌的描述几乎完整16s（Ca。1.5 kpb）由牛津纳米孔（Minion，R9.2）分析。短读和长阅读从模拟中检索了所有细菌属，尽管两者都显示出与所期待的比例相似的偏差。从沉积物样品中，具有覆盖范围的读数稀有性，在单例过滤后，共同恩赐和Procrustean测试表明，从短读和长长读取的细菌社区结构显着相似，表明位点之间的相当对比度和站点内相干的海岸方向是可比的。在我们的数据集中，分别将84.7和98.8％的短阅读分别分别分配给了相同的物种和属，而不是长阅读所检测到的物种和属。长期16的底漆特异性使其能够检测到309个家庭中的92.2％，而在短16SV4-V5检测到的448属中，有87.7％。长阅读记录了973个未检测到的额外分类单元，其中91.7％被确定为该属等级，其中一些属于11个独家门，尽管仅占长期读数的0.2％。
欧洲城市绿色地区的植物层细菌群落与城市强度有关
摘要植物层拥有一个多样化和特定的细菌群落，从而影响了植物健康和生态系统功能。在这项研究中，我们研究了城市绿色地区的连通性和规模对植物层细菌群落的组成和多样性的影响。herto，我们评估了233个Platanus X Acerifolia和Acer Pseudoplatanus树的植物层细菌群落的多样性和组成，整个欧洲六个城市中的77个城市绿色地区。城市之间的社区组成和多样性显着差异，但仅在树种之间有限的程度。我们可以证明，城市强度与腓骨细菌的社区组成显着相关。尤其是，在50个最丰富的家族中有29个相对丰度与城市强度之间发现了显着相关性：经典的浮圈家族（例如乙酰杆菌科，planctctyctomycetes和beijerinkiaceae）的丰富性随着城市强度而降低（即在更绿色，较低的空气污染和较低温度的地区更丰富，而与人类活动有关的地区（例如肠杆菌科和芽孢杆菌科）随着城市强度的增加而增加。这项研究的结果表明，欧洲城市中的细菌群落与城市强度有关，这种影响是由几种组合应力因素介导的。
Rickettsia物种与tick菌群的差异相互作用。 Sanguineus和Rh。 turanicus
摘要近年来，可持续和生态粮食生产的发展引起了全球的兴趣。很明显，随着新的整合系统的发展，这种现象正在引起以水产养殖研究的变化。但是，仍然有必要了解综合系统中涉及的不同方面，包括虾和海藻等共培养系统。这项研究评估了绿色海藻作为食物来源对白虾penaeus vannamei肠道细菌群落的影响。虾：仅用颗粒（P）喂食，仅ulva Clathrata（UC），U。Clathrata + Pellet（UCP），仅ULVA LACTUCA（UL）（UL）和U. lactuca + lactuca + pellet（ULP）。在生长和生存方面，与对照（P）相比，ULP和UCP处理之间没有发现显着差异（P> 0.05）。对虾肠的细菌生物群的分析显示，与对照（P）相比，ULP，UL和UC中社区组成的显着差异（P <0.05）。我们发现，蛋白杆菌是所有治疗中最丰富的门，其次是用于UC，UCP和UL和UL和ULP治疗的细菌菌。虾只用海藻U. lactuca（UL，ULP）的rubritalea，lysinibacillus，acinetobacter和bellopopirellula的丰富度明显更高，用于U. Clathrata治疗（UC，UCP），是litoreibacter。对照（P）中颤动的相对丰度更高，显示出UC和UL处理的减少。我们的发现可以更好地了解综合的水产养殖系统，特别是那些利用海藻作为天然饲料来源的水产养殖系统。
复杂细菌群落的防御力
细菌已开发出各种防御机制，以避免对病毒和其他遗传寄生虫的快速进化和周转，以避免感染和杀死。这样的泛免疫系统（防御）包括越来越多的防御线，其中包括良好的先天和适应性系统，例如限制性模型，CRISPR-CAS和堕胎感染，以及新发现的机制仍然不足以理解。虽然防御系统的丰度和分布在完整和可培养的基因组中是众所周知的，但我们对它们在复杂的微生物群落中的多样性和丰富性的理解中存在空白。在这里，我们对从土壤，海洋和人类肠道的7759个高质量细菌种群基因组进行了大规模的深度分析。我们观察到大型门的防御频率和性质有很大变化，这与生活方式，基因组大小，栖息地和地理背景有关。防御者的遗传迁移率，其在防御岛上的聚类以及遗传变异性是系统的，并由细菌环境塑造。因此，我们的结果提供了环境不同细菌群落中存在的多种免疫屏障的详细图片，并为随后鉴定出未经文化的微生物中多元化的新颖和巧妙的策略奠定了基础。
确定最佳细菌DNA提取方法以探索尿液菌群
摘要：分子生物学的最新进展已成功地应用于各种流体的菌群探索。然而，由于其分析需要特定的技术考虑，因此泌尿菌群仍然对探索较差。的确，尿液是一种低的微生物生物量环境，其中必须尊重每个细菌的代表性以获得准确的数据。因此，必须使用敏感的提取方法来获得高质量的DNA，同时保留物种之间的比例。为了解决这个问题，我们比较了对人工尿液样品的效率效率五种，这些尿液样品含量较低。通过不同的分子生物学方法进一步评估获得的DNA的质量，包括定量PCR和基于扩增子的下一代测序（NGS）。尽管两种提取方法允许获得NGS分析的DNA DNA，但一个试剂盒提取了更大量的DNA，这更适合于检测低丰富的细菌。随后对29个人类临床样品的评估的评估与使用常规细菌尿培养的结果良好相关。我们希望我们的工作能使调查人员意识到在探索微生物群的分子生物学方法方面具有挑战性和适应实践的重要性。
SLE中的肠道菌群：从动物模型到临床证据和药理观点
抽象的系统性红斑狼疮（SLE）是一种由遗传学和环境因素之间复杂相互作用驱动的多因素自身免疫性疾病。SLE的特征是破坏了自免疫耐受性和自身抗体的产生，从而触发多个器官的炎症和损害。鉴于SLE的高度异质性质，目前使用的治疗方法仍然不满意，并且新疗法的发展是更好的患者管理的主要健康问题。在这种情况下，小鼠模型显着有助于我们对SLE发病机理的了解，并且是测试新型治疗靶标的宝贵工具。在这里，我们讨论了最常用的SLE小鼠模型的作用及其对治疗改进的贡献。考虑到为SLE开发靶向疗法的复杂性，辅助疗法也越来越多地提出。的确，鼠类和人类研究最近透露肠道菌群是一个潜在的靶标，并为成功的新SLE疗法带来了巨大的承诺。然而，肠道菌群营养不良的机理在SLE中尚不清楚。在这篇综述中，我们提出了现有研究的清单，研究了肠道菌群营养不良和SLE之间的关系，以建立微生物组的签名，这可能是该疾病的潜在生物标志物及其严重性以及新的潜在治疗靶标。这种方法可能为基于肠道微生物组的SLE的早期诊断，预防和治疗观点提供新的可能性。
doi：10.29261/pakvetj/2025.007怀孕母羊的高密度饲养对其后代mingji wei 1,2的肠道菌群的影响，zh
这项研究探讨了怀孕母羊高密度饲养对其后代肠菌群的影响。将40个小尾羊绵羊随机分为两组，包括高密度组（1羊/m 2）和对照/低密度组（1羊/2m 2）。粪便样品，以进行高通量测序和多种意义分析。我们发现了肠道菌群在母羊和后代对不同饲养密度的反应。潜在有害细菌的数量（Ralstonia Pickettii，Ruegeria，Rhodobacteraceae等）在高密度组中增加了，而几种益生菌（振荡器，Akkermansia，Rusinococcaceae-UCG-010等）的丰度发现比对照组的明显小得多（p <0.05）。此外，高密度组中的肠道菌群随着年龄的增长而表现出更大的可变性，这表明住房密度的增加具有显着的相关性。在一起，怀孕绵羊的饲养密度不当会损害自己和后代，这不仅无法改善经济利益，而且会产生有害影响。这项研究可能为健康和可持续的绵羊繁殖和农业提供新的想法。
人类阴道菌群在调节中的作用
人类阴道菌群在调节女性生殖道（FRT）炎症中具有核心作用。的确，一方面，最佳环境可以保护性传播感染（STI）与乳酸杆菌属的比例很高有关。（卵巢菌）。另一方面，具有大量非乳杆菌属的更多样化的微生物群。（营养不良）与较高的局部炎症和STI敏感性增加有关。阴道菌群的组成受到可能导致失调环境的许多因素的影响。在这篇综述中，我们首先讨论了阴道微生物群的组成如何影响局部炎症，重点是细胞因子profles，免疫细胞募集/表型以及大部分专门用于阴道微生物群和中性粒细胞之间的相互作用。其次，我们分析了STI与阴道菌群之间的相互作用，并描述了阴道菌群的几种作用机理。最后，讨论了NHP模型在研究重点是FRT健康的研究中的输入，包括阴道微生物群或STI获取/控制和治疗。
口服牛结核病疫苗到自由放映的白尾鹿 影响中风患者皮质肌肉相干性的因素 苯丙氨酸与糖尿病持续时间对中国T2DM患者小血管疾病风险的互动作用 针对小儿中枢神经系统肿瘤中脑脊液中无细胞DNA中序列变异的靶向检测 钩端螺旋力感染后，葡萄膜炎和失明 与链球菌感染和肠道菌群组成相关的小儿自身免疫性神经精神疾病：我们知道什么？ 与艾滋病毒共同患者的心理健康相关 - 编辑：OncoMumumumanology中的数学建模和计算预测 中央和肾脏基糖尿病 手机介导的农业技术规模的驱动因素和影响：荟萃分析 引用Hundal K，Scherr CL，Fakhari H，Ramesh S，Dellefave-Castillo L，Duquette D，Cherny S，McNally EM，Webster G和Rasmussen-Torvik LJ（2025）MA 对医疗保健环境中无生命表面的基于微生物的抗菌消毒的批判性评估 粪便样品中的DNA甲基化生物标志物 静止状态fMRI研究
简介：自由放养的白尾鹿（Odocoileus virginianus）是位于密歇根州东北部（美国）的牛结核病（BTB）的自我维持的水库，（美国）不断使该地区的牛业陷入困境。自由娱乐鹿的收获，诱饵禁令和农场的缓解措施减少了但没有消除鹿的BTB，也没有消除向牛的传播。鹿的明显患病率很低（1-2％），但恒定，疫苗接种可能是帮助解决该问题和值得研究的附加工具。结核分枝杆菌Calmette-guérin（BCG）疫苗是一种广泛使用的人类疫苗用于结核病，在家庭牲畜和野生动植物中也接受了很好的研究。它是主要的疫苗候选者，口服输送是将其交付给自由放养鹿的逻辑手段，尽管以前从未尝试过。