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World File Search System蛋白酶
BEAM-302 碱基编辑作为 α-1 抗胰蛋白酶缺乏症 (Alpha-1) 的潜在治疗方法
代码中的一个拼写错误（称为点突变）可能会导致严重的疾病，就像单词中的一个拼写错误的字母可能会导致完全不同的含义：list 或 lost，batter 或 better。
隔离和分子鉴定蛋白酶产生相关细菌
发酵技术，基因工程和酶应用技术的进步增加了酶的使用。酶。蛋白水解细菌或蛋白酶产生酶的细菌在含有蛋白质的食物或植物中，例如棕色海藻氢氯拉斯sp。这项研究旨在获得与海洋藻类氢化层相关的产生蛋白酶的细菌。从瓦卡托比地区霍加岛附近的水域，并根据其16S rRNA基因序列识别生物体。用营养琼脂（NA）培养基对细菌分离，而在脱脂牛奶琼脂（SMA）培养基上选择蛋白水解细菌。 然后使用27F-1492R引物的PCR（聚合酶链反应）方法鉴定出在SMA培养基上产生蛋白水解区域的细菌分离株，以靶向16S rRNA基因。 基于隔离结果，有3个独特的细菌菌落可以从藻类样品和编码HIHA-1培养到HIHA-3（HIHA代表Hoga Island Hyleolathrus acroalgae）。 SMA培养基上产生蛋白酶的细菌的选择过程导致1个分离蛋白水解细菌，即HIHA-1。 通过PCR在HIHA-1分离株上的分子鉴定导致电泳凝胶大小〜1500bp的单个DNA带。 测序结果显示了DNA序列，大小为1421bp，与aestuarii aestuarii菌株TF-16（同源性水平为99,93％）的大小相似性最高。 获得并确定为Aestuarii菌株HIHA-1。，而在脱脂牛奶琼脂（SMA）培养基上选择蛋白水解细菌。然后使用27F-1492R引物的PCR（聚合酶链反应）方法鉴定出在SMA培养基上产生蛋白水解区域的细菌分离株，以靶向16S rRNA基因。基于隔离结果，有3个独特的细菌菌落可以从藻类样品和编码HIHA-1培养到HIHA-3（HIHA代表Hoga Island Hyleolathrus acroalgae）。SMA培养基上产生蛋白酶的细菌的选择过程导致1个分离蛋白水解细菌，即HIHA-1。通过PCR在HIHA-1分离株上的分子鉴定导致电泳凝胶大小〜1500bp的单个DNA带。 测序结果显示了DNA序列，大小为1421bp，与aestuarii aestuarii菌株TF-16（同源性水平为99,93％）的大小相似性最高。 获得并确定为Aestuarii菌株HIHA-1。通过PCR在HIHA-1分离株上的分子鉴定导致电泳凝胶大小〜1500bp的单个DNA带。测序结果显示了DNA序列，大小为1421bp，与aestuarii aestuarii菌株TF-16（同源性水平为99,93％）的大小相似性最高。并确定为Aestuarii菌株HIHA-1。总而言之，蛋白水解细菌分离株HIHA-1与海洋棕色藻类氢层sp。
生物工程分泌的蛋白酶将不同的RCR3直系同源物和旁系同源物转化为细胞外免疫受体
。cc-by 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他已授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权所有，于2024年5月23日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.02.14.580413 doi：Biorxiv Preprint
通过 CRISPR-Cas9 产生的大豆 Bowman–Birk 抑制剂突变体显示胰蛋白酶和糜蛋白酶抑制剂活性急剧降低
摘要：尽管大豆蛋白质量很高，但由于 Kunitz (KTi) 和 Bowman-Birk 蛋白酶抑制剂 (BBis) 的存在，生大豆和豆粕不能直接添加到动物饲料混合物中，这会降低动物的生产率。热处理可以显著灭活胰蛋白酶和糜蛋白酶抑制剂 (BBis)，但这种处理耗能大、成本高，并对种子蛋白的质量产生负面影响。作为一种替代方法，我们采用 CRISPR/Cas9 基因编辑来在 BBi 基因中产生突变，从而大幅降低大豆种子中的蛋白酶抑制剂含量。农杆菌介导的转化被用于产生几个稳定的转基因大豆事件。使用 Sanger 测序、蛋白质组学分析、胰蛋白酶/糜蛋白酶抑制剂活性测定和 qRT-PCR 将这些独立的 CRISPR/Cas9 事件与野生型植物进行了比较。总的来说，我们的结果表明，影响大豆主要 BBi 基因的一系列等位基因功能丧失突变的产生。两个高表达种子特异性 BBi 基因的突变导致胰蛋白酶和糜蛋白酶抑制剂活性大幅降低。
使用基于共价片段的筛选方法发现细胞活性Chikungunya病毒NSP2蛋白酶抑制剂
Chikungunya病毒（Chikv）是一种蚊子播的α病毒，在过去的二十年中一直导致许多大规模爆发。当前，任何α病毒感染都没有FDA批准的治疗剂。CHIKV非结构蛋白2（NSP2）包含半胱氨酸蛋白酶域，对于病毒复制至关重要，使其成为药物发现运动的吸引人目标。在这里，我们优化了CHIKV NSP2蛋白酶（NSP2PRO）生化测定法，以筛选6,120个混合的半胱氨酸指导的共价片段。使用50％的抑制阈值，我们确定了153次命中（2.5％的命中率）。在剂量反应随访中，RA-0002034（一种共价片段，包含乙烯基磺基弹头，抑制了具有58±17 nm的IC 50的CHIKV NSP2PRO，并且具有时间依赖性抑制研究的进一步分析产生了6.4 x INACT /K IACT /K IACT /K INACT /k i k I k inact /k iinact /ki。LC-MS/MS分析确定RA-0002034以特定于位置的方式将催化半胱氨酸共价修改。此外，RA-0002034对一系列半胱氨酸蛋白酶没有明显的脱靶反应性。除了对CHIKV NSP2PRO活性和特殊选择性的有效生化抑制外，在α-病毒感染的细胞模型中测试了RA-0002034，并有效地抑制了CHIKV和相关α病毒的病毒复制。这项研究强调了化学探针ra-0002034的发现和表征，这是一种有希望的命中化合物，从基于共价碎片的筛选到CHIKV或PAN-α-阿尔巴病毒治疗。
小环藻蛋白酶基因基因（MCY基因）的分子检测和半定量免疫学检测微囊蛋白毒素在体外生长的蓝细菌
实验室质量培养物。minimus，A。fortilissima，P。uncinatum和S.细长。通过监测浊度，叶绿素浓度和蛋白质含量来评估这些培养物的生长。经过18天的接种期，观察到纯培养物的最大生长。使用离心浓缩的发育良好的培养物并随后冻干以将其保存为粉状形式。DNA提取在冻干的培养物上进行，从而在井下导致透明的DNA带。由A260/280比率确定的提取的DNA的质量范围为1.6至1.8。Mcyabde基因在铜绿节和O. Laetevirens var中成功扩增。minimus，而A. fortilissima和P. uncinatum分别显示了McYabd和McYabe基因的扩增。在弹性链球菌中未观察到放大。使用半定量ELISA技术，仅在微囊孢子虫中检测到显着浓度的微囊藻蛋白，水平为0.5 ppb，而其他培养物的痕量量低于0.5 ppb。
植物蛋白酶抑制剂作为新兴的抗菌肽剂：全面评论
1生态与可持续发展研究所，贝斯科学系，卢吉大学国立大学，第5号公路和阿根廷布宜诺斯艾利斯卢克斯B6700的宪法大道； 2植物蛋白蛋白投资中心（Ciprove）和生物科学系，精确科学学院，美国国立大学（B.O.）; 生物学与生物医学研究所（BIRT） ）;电话。 ： +34-93-5 +54-221-423-5333（Ext。 57）（W.D.O.）生物学与生物医学研究所（BIRT））;电话。： +34-93-5 +54-221-423-5333（Ext。57）（W.D.O.）
凝血蛋白酶驱动的癌症免疫逃避
摘要：血液凝血和癌症本质上是连接的，在某些类型的癌症中通常观察到与高凝相关的血栓并发症，通常会导致癌症患者的生存率下降。除了在凝血中的共同作用外，凝血蛋白酶通常通过激活G蛋白偶联的repeptor超家族蛋白酶来触发各种癌症的细胞内信号传导：蛋白酶激活的受体（PARS）。尽管PAR的作用在某些类型的癌症的发展和进展中已经建立了良好，但它们对癌症免疫反应的影响只是出现。本评论强调了凝血蛋白酶驱动的PAR信号如何在调节先天和适应性免疫反应中起关键作用。这是关于凝血蛋白酶诱导的信号在癌症免疫逃避的贡献的详细讨论，从而支持某些肿瘤的生长和发育。审查的一个特殊部分展示了凝血蛋白酶，凝血酶，因子VIIA和XA因子在癌症免疫逃避中的作用。靶向凝血蛋白酶引起的信号传导可能是一种潜在的治疗策略，可以提高宿主对抗癌症的免疫监视机制，从而增加靶向免疫治疗方案的临床后果。
蛋白酶抑制剂ASP通过抑制kumquat
冷适应是一个复杂的生物学过程，导致植物中冻结耐受性的发展。在这项研究中，我们证明了柑橘类物种中蛋白酶抑制剂FMASP的表达[Fortunella Margarita（Lour。）swingle]通过最大程度地减少蛋白质降解来促进其冻结耐受性。首先，我们发现，尽管冰冻期间叶片损伤广泛，但只有冷熟练的kumquat植物能够在缓解压力后恢复正常的生长。为了剖析冷适量对这种抗冻结性能的影响，我们对受冷适应的kumquat叶片进行了蛋白质丰度分析和定量蛋白质组学分析（4℃），冷冻治疗（-10°C）和后冻结后的恢复（25℃）。FMASP（针对丝氨酸蛋白酶）和几种非特异性蛋白酶被确定为差异表达的蛋白质，该蛋白质是由冷适应的诱导的，并且在整个低温治疗过程中与稳定的蛋白质丰度相关。fMASP进一步被描述为多种蛋白酶的鲁棒抑制剂。此外，拟南芥中FMASP的异质表达证实了其在冻结耐受性中的积极作用。最后，我们提出了一个FMASP的工作模型，并说明了该细胞外细胞化蛋白酶抑制剂如何保护蛋白质免受降解，从而维持了基本的细胞功能以进行冰冻后恢复。这些发现揭示了蛋白酶抑制在冻结反应中的重要作用，并提供了有关该作用如何有助于开发新策略以增强植物冻结耐受性的见解。