XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search System蛋白酶
分泌的白细胞蛋白酶抑制剂可预防小鼠严重的尿路感染
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2023年10月15日。 https://doi.org/10.1101/2023.10.10.561753 doi：Biorxiv Preprint
通过计算机模拟研究 Lon 蛋白酶作为有希望的治疗靶点
考虑到抗生素耐药性的广泛存在，对新治疗策略的需求是不可避免的。细菌蛋白酶是一类广泛的酶，在细胞存活、应激反应和致病性中起着至关重要的作用。这项计算机模拟研究旨在关注 Lon 蛋白酶在调节大肠杆菌毒素-抗毒素系统中的关键作用，并设计针对该蛋白酶作用的抑制肽。借助相关服务器和软件，检查了 Lon 与相应抗毒素的通信网络、进化历史和相互作用，然后针对这些相互作用设计了抑制肽。结果表明，Lon 蛋白酶在控制这些系统中起着核心作用，是一种保守的蛋白质，尤其是在肠杆菌科中。设计的肽与 Lon 蛋白酶的对接结果具有重要意义。这项研究表明 Lon 蛋白酶可能具有新治疗靶点的特征。
针对 SARS-CoV-2 主要蛋白酶重新利用药物治疗 COVID-19
。CC-BY-NC 4.0 国际许可，根据 未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者（此版本于 2020 年 5 月 23 日发布。；https://doi.org/10.1101/2020.05.23.112235 doi：bioRxiv 预印本
基于片段的筛选针对SARS-COV-2主蛋白酶结合口袋的开放形式
PDB参考：SARS-COV-2主要蛋白酶，与CPD-1、7GRE复合；与CPD-2，7GRF复合；与CPD-3，7grg复合；与CPD-4，7GRH复合；与CPD-5，7Gri复合；与CPD-6，7grJ复合；与CPD-7，7grk复合；与CPD-8，7grl复合；与CPD-9，7grm复合；与CPD-10、7grn复合；与CPD-11、7Gro复合；与CPD-12、7GRP复合；与CPD-13、7grq复合；与CPD-14、7GRR复合；与CPD-15，7grs复合；与CPD-16、7grt复合；与CPD-17、7gru复合；与CPD-18、7GRV复合；与CPD-19、7grw复合；与CPD-20，7grx相关；与CPD-21、7Gry配合；与CPD-22、7grz复合；与CPD-23、7GS0复合；与CPD-24、7GS1复合；与CPD-25、7GS2复合；与CPD-26、7GS3复合；与CPD-27、7GS4复合；与CPD-28、7GS5复合；与CPD-29、7GS6
通过虚拟筛选获得的SARS-COV-2主要蛋白酶的潜在分子抑制剂
化合物V228具有以三级亮氨酸为接头的骨架结构。对接结果表明，复合V228可以与M Pro的活性位点结合，它们的相互作用包括七个氢键（His41，ASN142，His164，his164，Glu166，his172和gln189）。与V253相比，将Tert丁基掺入化合物V228中赋予了显着的空间阻滞，从而导致对接结果中有明显的构象。附着在吡啶上的酰胺结构与His41，His164和Gln189表现出氢键相互作用，而另一种与卤代苯苯苯二苯二酰胺结构相关的氢结构与GLU166和ASN142的氢键合作。与上述化合物不同，带有环丙胺结构的V228缺乏原代胺，因此它不能与GLU166形成独特的盐桥相互作用。
高通量筛选针对新冠病毒主要蛋白酶的治疗药物
此预印本的版权所有者于 2020 年 1 月 30 日发布此版本。；https://doi.org/10.1101/2020.01.28.922922 doi: bioRxiv preprint
二硫代蛋白酶死亡：六个亟待解答的谜题
相关蛋白，以及其他细胞骨架相关蛋白（如中间丝、微管甚至信号蛋白）是否也参与二硫键诱导。目前尚不清楚内质网中的蛋白质为何对应激相关的二硫键不敏感，而内质网中由于氧化环境而形成大量二硫键 [3]。可能，由于还原环境，肌动蛋白细胞骨架等细胞质蛋白通常不会形成广泛的二硫键，因此在应激条件下，它们可能比细胞中其他位置的蛋白质对氧化还原更敏感 [4]。事实上，在葡萄糖饥饿的 SLC7A11 高细胞的粘着斑相关酪氨酸激酶中也发现了二硫键 [2]。酪氨酸激酶信号如何导致二硫键应激将成为研究的热门话题。此外，粘着斑与癌细胞侵袭和转移有关 [5]。粘附-侵袭-转移序列在二硫键凋亡中的作用值得进一步研究，例如在高 SLC7A11 表达抑制转移的情况下 [6]。
靶向木瓜蛋白酶样蛋白酶的共价抑制剂抑制病毒复制
不是疫苗针对的，很可能会在抗疫苗的菌株上活跃。尽管有很大的作用，雷姆斯维尔，mol-nupiravir和paxlovid，它由Nir-Matrelvir和Ritonavir的共同严重组成，但仍然是唯一批准用于治疗SARS-COV-2的FDA小分子药物，并且只有Marginal Clinical Implatike。1,2因此，尽管有显着性，但仍然需要开发可以有效治疗SARS-COV-2的药物。SARS-COV-2的类似木瓜蛋白酶样蛋白酶（PLPRO）是开发小分子药物的有吸引力的靶标。PLPRO在病毒复制中起着至关重要的作用，其抑制作用可防止细胞中的病毒复制。3 - 7此外，PLPRO抑制了干扰素的产生，这对于安装针对SARS-COV-2的免疫反应至关重要。PLPRO裂解肽序列LXGG，它存在于未成熟的SARS-COV-2病毒多蛋白中的3个位点中。PLPRO催化从未成熟病毒多蛋白中释放出三种非结构性蛋白，称为NSP1，NSP2和NSP3。NSP1，NSP2和NSP3在病毒复制中起关键作用，PLPRO抑制细胞中SARS-COV-2复制。3,5,8 PLPRO还切割包含序列RLGGG的宿主蛋白，该蛋白存在于几种泛素（UB）和泛素样蛋白（UBL）中，例如干扰素诱导的基因15（ISG15）蛋白。PLPRO具有显着的de液化和去泛素化活性和PLPRO的抑制可诱导病毒感染细胞的产生，这应该导致
抑制剂结合的主要蛋白酶的晶体结构来自三角洲和γ-核纳病毒
摘要：随着SARS-COV-2在全球范围内传播以引起19009年的大流行，冠状病毒（COV）的人畜共动性传播的威胁变得更加明显。作为人类感染是由α-和β-蛋白库引起的，结构表征和抑制剂设计主要集中在这两个属上。然而，来自三角洲和伽马属的病毒也感染了哺乳动物，并构成潜在的人畜共患传播威胁。在这里，我们确定了来自beluga鲸鱼的Delta-CoV猪HKU15和GAMMA-COV SW1的主要蛋白酶（M Pro）的抑制剂结合的晶体结构。与我们在此处也提出的SW1 M Pro的APO结构进行了比较，启用了在活性位点抑制剂结合时识别结构排列。两个共价抑制剂PF-00835231（lufotrelvir）与HKU15和GC376结合到SW1 M Pro的结合模式和相互作用，揭示了可能将其杠杆性冠状病毒和基于pan-cov抑制剂的结构设计的特征揭示。关键字：冠状病毒；主要蛋白酶； GC376;晶体结构； Lufotrelvir; HKU15;伽马罗龙病毒；蓝鲸；直接作用抗病毒药；药物设计；泛氧化病毒抑制剂