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SARS-CoV-2 主要蛋白酶 Mpro 通过裂解脑内皮细胞中的 NEMO 引起微血管脑病理
6 德国法兰克福大学心肺研究所 (CPI) 心血管再生研究所。7 德国法兰克福大学医学病毒学研究所。8 德国吕贝克大学实验皮肤病学研究所。9 德国吕贝克大学心脏遗传学研究所。10 法国里尔大学里尔感染和免疫中心、INSERM U1019、CNRS UMR 9017、里尔大学、CHU Lille、里尔巴斯德研究所。11 德国汉堡-埃彭多夫大学医学中心医学微生物学、病毒学和卫生研究所。12 大学。里尔，法国里尔国家健康与医学研究院，里尔中央医院，神经内分泌脑发育和可塑性实验室，里尔神经科学与认知中心，UMR-S 1172，DISTALZ，EGID，里尔，法国。13 德国哥廷根大学医学中心神经病理学研究所。14 德国哥廷根大学生物网络动力学校园研究所。15 德国哥廷根马克斯普朗克实验医学研究所。16 德国吕贝克德国肺脏研究中心 (DZL) 成员北方气道研究中心。17 德国吕贝克大学解剖学研究所。18 瑞士巴塞尔罗氏创新中心罗氏制药研究与早期开发 (pRED)。19 德国汉堡汉堡-埃彭多夫大学医学中心神经病理学研究所。 20 科隆大学遗传学研究所，科隆，德国。21 汉堡-埃彭多夫大学医学中心法医学研究所，汉堡，德国。22 赛诺菲罕见及神经疾病研究中心，弗雷明汉，马萨诸塞州，美国。23 圣地亚哥-德孔波斯特拉大学-卫生研究所 CIMUS 生理学系，圣地亚哥-德孔波斯特拉，西班牙。
共价可逆转的肽蛋白酶抑制剂。设计，合成和临床成功案例
1意大利国家研究委员会晶体学研究所，通过G. Almond 122/O，70126意大利Bari，意大利Bari 2药学系 - Bari Aldo Moro的药学系 - E. Orabona 4，70125意大利Bari，意大利Bari 40125 Bari Aldoy of Bari Aldo Moro of Moro of Moro Oro oorabone 40125 Crystallography, National Research Council of Italy, via Vivaldi 43, 81100 Caserta, iTal 5 laboratory de chimie de coordination du cnrs, 205 Route de Narbonne, Cedex 4, 31077 toulouse, france 6 Universit é Toulouse, 118 Route de Narbonne, CEDEX 4, 31077 Toulouse, France 7 Centrn (Center D'Atudes et by Recerche sur le m是诺曼底的dicament），大学来自法国14032 CAEN，法国8 CQM -MADRG的Madeira，MMRG（分子材料研究小组）头发，Madeira，Madeira，Madeira，9020-105意大利Urbino *通信：andrea.duranti@uniurb.it;电话。 ： +39-0722-303501†这些作者对这项工作也同样贡献。1意大利国家研究委员会晶体学研究所，通过G. Almond 122/O，70126意大利Bari，意大利Bari 2药学系 - Bari Aldo Moro的药学系 - E. Orabona 4，70125意大利Bari，意大利Bari 40125 Bari Aldoy of Bari Aldo Moro of Moro of Moro Oro oorabone 40125 Crystallography, National Research Council of Italy, via Vivaldi 43, 81100 Caserta, iTal 5 laboratory de chimie de coordination du cnrs, 205 Route de Narbonne, Cedex 4, 31077 toulouse, france 6 Universit é Toulouse, 118 Route de Narbonne, CEDEX 4, 31077 Toulouse, France 7 Centrn (Center D'Atudes et by Recerche sur le m是诺曼底的dicament），大学来自法国14032 CAEN，法国8 CQM -MADRG的Madeira，MMRG（分子材料研究小组）头发，Madeira，Madeira，Madeira，9020-105意大利Urbino *通信：andrea.duranti@uniurb.it;电话。： +39-0722-303501†这些作者对这项工作也同样贡献。
蛋白质组学鉴定组织蛋白酶W的潜在靶蛋白作为其发展为流感靶标的药物
摘要插入病毒（IAV）为有效复制的众多宿主因素。半胱氨酸蛋白酶组织蛋白酶W（CTSW）已被确定为IAV进入所需的一个宿主因子，这特别是从后期内体逃脱了IAV。然而，迄今为止，CTSW的底物特异性和前病毒机制尚不清楚。在这里，我们表明细胞内但不分泌的CTSW促进了病毒式进入。我们使用高通量蛋白质组学方法末端胺同位素标记（TAILS）揭示了CTSW的79个潜在的直接和31个潜在的间接细胞靶蛋白，并确定由CTSW底物共享的裂解基序。随后与来自RNA干扰（RNAI）屏幕的数据进行IAV宿主因子的数据集成，从而发现了第一个见解CTSW的病毒功能。值得注意的是，与IAV感染后的野生型小鼠相比，CTSW降低的小鼠的存活率和死亡率延迟25％。完全支持将CTSW作为新型宿主指导的抗病毒疗法的药物的开发。
对盐孢胺的结构见解介导的抑制人类20S蛋白酶体 组合的统计生物物理建模将离子通道基因与皮质神经元类型的生理学联系
。cc-by 4.0国际许可（未经Peer Review尚未获得认证）是作者/资助者，他已授予Biorxiv的许可证，以永久显示预印本。它是制作
间日疟原虫枯草杆菌蛋白酶样药物靶标 SUB1 的 3D 结构揭示了构象变化以适应底物衍生的-酮酰胺抑制剂
多重耐药性疟原虫的不断选择和繁殖要求我们鉴定出参与尚未被靶向的代谢途径的新的抗疟药物候选物。枯草杆菌蛋白酶样 1（SUB1）属于新一代药物靶点，因为它在寄生虫生命周期的不同阶段从受感染的宿主细胞中逃出时起着至关重要的作用。SUB1 的特点是具有一个不寻常的脯氨酸区域，该区域与其同源催化结构域紧密相互作用，因此无法对酶-抑制剂复合物进行 3D 结构分析。在本研究中，为了克服这一限制，采用严格的离子条件和控制重组全长间日疟原虫 SUB1 的蛋白水解，以获得没有脯氨酸区域的活性稳定催化结构域 (PvS1 Cat) 晶体。 PvS1 Cat 的高分辨率 3D 结构（单独存在以及与-酮酰胺底物衍生的抑制剂 (MAM-117) 复合存在）表明，正如预期的那样，SUB1 的催化丝氨酸与抑制剂的-酮基形成共价键。氢键和疏水相互作用网络使复合物稳定，包括抑制剂的 P1 0 和 P2 0 位置，尽管 P 0 残基在确定枯草杆菌蛋白酶的底物特异性方面通常不太重要。此外，当与底物衍生的肽模拟抑制剂结合时，SUB1 的催化槽会发生显著的结构变化，尤其是在其 S4 口袋中。这些发现为未来设计优化的 SUB1 特异性抑制剂的策略铺平了道路，这些抑制剂可能定义一类新的抗疟候选药物。
作者更正：发现口服生物可利用的 SARS-CoV-2 木瓜蛋白酶样蛋白酶抑制剂可作为 COVID-19 的潜在治疗方法
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SARS-CoV-2 主蛋白酶耐药与补偿的分子机制：E166 与 L50 之间的相互作用
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可下可用（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2025 年 1 月 27 日发布。；https://doi.org/10.1101/2025.01.24.634813 doi：bioRxiv 预印本