抽象新合成的蛋白质是从核糖体出口隧道中涌现出来的未折叠多肽。将这些新生的链折叠成天然构象,对于蛋白质功能和防止行驶的相互作用至关重要,从而触发错误折叠和危害蛋白质组稳定性。但是,实现正确的3D结构是暴露于细胞质中高浓度分子的新生链的主要挑战。一般与核糖体相关的伴侣有助于各种新生肽的共转折叠。目前尚不清楚该“单尺寸合适”系统是否确保具有挑战性折叠路径的蛋白质表达,还是专门与核糖体相关的伴侣管理此类苛刻客户的折叠。在研究I中,我们研究了HSP70伴侣如何调节HSF1,这是一种转录因子,介导细胞对蛋白毒性应激的反应。我们证明了HSP70直接与HSF1结合,使其在非压力条件下保持潜在状态。蛋白质错误折叠,特别是新合成的蛋白质,将HSP70滴定,激活HSF1并诱导应力反应。因此,响应错误折叠蛋白的HSP70可用性是HSF1活性的关键调节机制。在研究II中,我们确定了一种专业的核糖体相关伴侣CHP1,该伴侣CHP1有助于EEF1A的共同折叠,这是一种高度丰富的多域GTPase,对于mRNA转化至蛋白质至关重要。删除CHP1导致EEF1A的快速蛋白水解,广泛的蛋白质聚集以及HSF1介导的应激反应的激活。最后,在研究III中,我们阐明了CHP1如何有助于EEF1A折叠和EEF1A折叠途径中伴侣作用的有序序列。我们发现CHP1与EEF1A G域的开关I区域中的α3螺旋结合,对于核苷酸结合至关重要,从而延迟了G域的核苷酸引导的折叠。随着EEF1A结构域II的合成开始,将基板转移到下游伴侣ZPR1以进行最终成熟。我们的结果提供了洞察共同翻译蛋白折叠的分子机制及其对蛋白质组稳定性的影响,以及对HSF1的调节,这是真核细胞中对蛋白质毒性应激的反应的中心介体。
在本文中,我们讨论了基于融合蛋白的 SARS-CoV-2 疫苗的特征。我们重点研究了重组疫苗抗原,该疫苗抗原由融合蛋白组成,融合蛋白由 SARS-CoV-2 衍生的抗原或肽的组合或 SARS-CoV-2 抗原/肽与 SARS-CoV-2 无关的蛋白质/肽的组合组成。这些融合蛋白是为了增加疫苗抗原的免疫原性和/或实现免疫系统的特殊靶向性。基于蛋白质的疫苗方法仅在概念验证研究中得到举例说明,该研究使用 W-PreS-O,一种基于单一融合蛋白 (W-PreS-O) 的嵌合疫苗,将来自武汉 hu-1 野生型和 Omicron BA.1 的 RBD 与吸附于氢氧化铝的乙肝病毒 (HBV) 衍生的 PreS 表面抗原相结合。在感染 Omicron BA.1 之前,对叙利亚仓鼠进行了 W-PreS-O 疫苗评估,这些仓鼠每隔三周接种 W-PreS-O 或氢氧化铝(安慰剂)三次。通过 RT-PCR 测量上呼吸道和下呼吸道的中和抗体 (nAB) 滴度、体重、肺部症状和病毒载量。此外,还使用斑块形成试验测量了肺部的传染性病毒滴度。我们发现接种 W-PreS-O 疫苗的仓鼠产生了针对 Omicron BA.1 的强效 nAB,几乎没有出现肺炎,并且肺部的传染性病毒滴度显著降低。重要的是,接种 W-PreS-O 疫苗的仓鼠鼻腔中的病毒载量接近或高于 PCR 循环阈值
摘要 将干扰素处理过的细胞的细胞质提取物与双链 RNA 和 ATP 一起孵育,可形成一种低分子量的无细胞蛋白质合成抑制剂,其有效浓度为亚纳摩尔。通过将来自此类细胞的 poly(I)poly(C)-Sepharose 结合酶级分与 [:IH 或 [a- 或 y-32P]ATP 一起孵育,可方便地合成该抑制剂。该放射性抑制剂的特征在于其在尿素存在下在 DEAE-Sephadex 上的行为,以及在酶、碱和高碘酸氧化和 ft 消除的顺序降解中获得的产物。其结构似乎是 pppA2'p5'A2'p5'A。除了 2'-5' 键之外,我们没有发现任何其他修改或异常的证据。有时抑制剂制剂似乎包括相应的二聚体 (pppA2'p5'A)、四聚体 [ppp(A2'p)3A]、五聚体 [ppp(A2'p)4A],以及数量逐渐减少的高级寡聚体。三聚体、四聚体和五聚体的活性相似,但二聚体的活性较低,即使有活性。
图。5:用酪蛋白钝化的悬臂背面的AFM图像在0.5pm T5溶液的溶液中孵育1.5h(箭头标记T5噬菌体或可能的酪蛋白聚集体)请注意,这里的条件与手稿中呈现的原位实验不同。
半个多世纪以来,蛋白质折叠一直是最困难的问题之一,随机热运动导致构象变化,从而导致能量下降到天然结构,这是漏斗状能量景观中捕获的原理。未折叠的多肽具有广泛的可能构象。由于潜在构象随链长呈指数增长,搜索问题对于经典计算机来说变得难以解决。到目前为止,有理论和实验证据表明,使用量子退火、VQE 和 QAOA 等量子计算方法解决此类优化问题具有优势。虽然谷歌的 DeepMind-AlphaFold 已经取得了很大成就,但我们可以通过量子方法走得更远。在这里,我们展示了如何使用变分量子特征求解器预测蛋白质结构以及 RNA 折叠,并使用条件风险值 (CVaR) 期望值来解决问题并找到最小配置能量,我们的任务是确定蛋白质的最小能量结构。蛋白质的结构经过优化以降低能量。还要确保满足所有物理约束,并将蛋白质折叠问题编码为量子比特算子。
使用的缩写:ACK,激活的CDC42相关酪氨酸激酶; GEF,鸟苷核苷酸交换因子; PH,Pleckstrin同源性; DH,DBL同源性; PIP 2,磷脂酰肌醇4,5-双磷酸;间隙,GTPase激活蛋白; GDI,鸟苷核苷酸解离抑制剂; SRF,血清反应因子; NF-κB,核因子κB; Jnk,c-jun n末端激酶;婴儿床,cdc42/rac-Interactive结合; REM,Rho ectector同源性; RKH,ROK – Kinectin同源性; MLC,肌球蛋白轻链; PI-4-P5K,磷脂酰肌醇-4-磷酸5-激酶; GTP [s],鸟嘌呤5« - [γ -thio]三磷酸; MAP激酶,有丝分裂原激活的蛋白激酶; MLK,混合细胞激酶; ACC,反平行线圈; BTK,布鲁顿的酪氨酸激酶; MBS,肌球蛋白结合亚基; ERM,Ezrin/radixin/Moesin; FH,形态学;黄蜂,Wiskott-Aldrich-Syndrome蛋白;波浪,黄蜂样的垂直蛋白质蛋白; lim激酶; EGF,表皮生长因子; TNFα,肿瘤坏死因子α; Mekk,地图激酶激酶激酶; PAK,P21激活的激酶; PKN,蛋白激酶N; MRCK,肌发育症激酶相关的CDC42结合激酶。1应向谁致辞(电子邮件Anne.bishop!ucl.ac.uk)。
多面体蛋白纳米局量作为疫苗平台取得了很大的成功(1-3),并且是生物制剂递送的有前途的车辆(4-7)。因此,人们对设计能够显示大量抗原或包装更大的更大的碳的更大且更复杂的结构有很大的兴趣。然而,常规的多面体是所有亚基都具有相同局部环境的最大闭合结构(8-11),因此访问更大,更复杂的封闭结构需要打破局部对称性。病毒通过在独特的环境(伪对称)(12)中放置化学不同但结构上相似的链条或利用相同的亚基来解决这个问题,或者利用在不同环境中采用不同构象的相同亚基(准对象)(13-15)(13 - 15),以访问具有更高的三角形(T)数量(13)结构(13),具有较大的亚基和互联剂和较大的子燃料。设计更大,更复杂的纳米焦点的一种有希望的途径是从定期的多面体纳米局(t = 1)开始,该纳米局(t = 1)是由对称的同构构构建块构建的,这些构建块的分离式环状布置是通过在假异构的异构体中代替这些构建块的隔离循环排列,然后通过将t = 4和大型结构与其他结构结合在一起,并与这些其他结构相结合。在这里,我们提供了这种设计方法的高级几何概述,以说明如何使用设计多样性和设计经济之间的权衡方向来实现不同的设计成果,正如在两篇随附的论文中实验证明的那样,Lee等人(16)和Dowling等人(17)。
1 liaoning 121000,P.R。中国2富国血管外科系的第一附属医院中国Binghui du,医学博士,Jinzhou医科大学的第一家附属医院,血管外科系,Jinzhou,Jinzhou,Liaoning 121000,P.R。 中国binghui.du@mail.com,2024年3月4日,2025年3月4日,摘要目的:深静脉血栓形成(DVT)是一种血管疾病,发病率约为0.1%。 内皮祖细胞(EPC)是内皮细胞的前体细胞,有助于血管修复和再生。 circrnas成为一种新的研究热点,因为它们参与了各种生物学过程,包括DVT的进展。 材料和方法:在从DVT患者(n = 42)和健康对照组(n = 42)获得的静脉血液样本中评估了HSA_CIRCRNA_092488的表达。 进行了HSA_CIRCRNA_092488的功能丧失研究。 通过QRT-PCR,Western印迹和免疫荧光测定法检查了相关RNA和蛋白质的表达。 通过CCK-8,Transwell分析和流式细胞仪测量转染细胞的增殖,迁移,细胞周期和凋亡。 使用RNA下拉分析,未透露EPC中HSA_CIRCRNA_092488和NLRP3的关联。 此外,在转染的EPC中检查了NLRP3 mRNA的稳定性。 结论:HSA_CIRCRNA_092488/NLRP3/NF-KB信号传导可能是治疗DVT治疗的新型治疗候选者。中国Binghui du,医学博士,Jinzhou医科大学的第一家附属医院,血管外科系,Jinzhou,Jinzhou,Liaoning 121000,P.R。中国binghui.du@mail.com,2024年3月4日,2025年3月4日,摘要目的:深静脉血栓形成(DVT)是一种血管疾病,发病率约为0.1%。内皮祖细胞(EPC)是内皮细胞的前体细胞,有助于血管修复和再生。circrnas成为一种新的研究热点,因为它们参与了各种生物学过程,包括DVT的进展。材料和方法:在从DVT患者(n = 42)和健康对照组(n = 42)获得的静脉血液样本中评估了HSA_CIRCRNA_092488的表达。进行了HSA_CIRCRNA_092488的功能丧失研究。通过QRT-PCR,Western印迹和免疫荧光测定法检查了相关RNA和蛋白质的表达。通过CCK-8,Transwell分析和流式细胞仪测量转染细胞的增殖,迁移,细胞周期和凋亡。使用RNA下拉分析,未透露EPC中HSA_CIRCRNA_092488和NLRP3的关联。此外,在转染的EPC中检查了NLRP3 mRNA的稳定性。结论:HSA_CIRCRNA_092488/NLRP3/NF-KB信号传导可能是治疗DVT治疗的新型治疗候选者。结果:在这项研究中,在DVT样品中检测到HSA_CIRCRNA_092488的上调,这可以抑制EPC的增殖和迁移,诱导细胞周期从S到G0/G1相和触发细胞凋亡。此外,NLRP3被确定为HSA_CIRCRNA_092488的电势下游分子,并且可以通过激活NLRP3/NF-KB信号传导发挥其调节功能。在细胞中过表达的HSA_CIRCRNA_092488明显升高了caspase-1,IL-1B,P-NF-κB-P65/NF-κB-P65和P-IκB-p65和p-iκBA/IκBA的蛋白质表达;反之亦然,HSA_CIRCRNA_092488的敲低显着降低了EPC中这些相关蛋白的水平。关键字:hsa_circrna_092488; nlrp3; NFKB; DVT引言深静脉血栓形成(DVT)是一种多因素疾病,并且有许多危险因素可以触发DVT,例如妊娠,固定性和血栓形成[1]。和DVT的危险因素可以分为有利于血栓形成的基本元素,包括静脉停滞,血管损伤和高凝性[2]。但是,尚未完全了解DVT发作和进展的详细机制。据报道,静脉血流,内皮激活,血小板和白细胞的粘附以及凝结激活的改变在DVT的发病机理中起着至关重要的作用[1,2]。诊断是基于高度怀疑的,包括危险因素病史,D-二聚体测量和超声扫描,显示出深静脉血块的存在[1]。其他相关测试包括肺动脉CT扫描和通风 - 灌注扫描时,当怀疑PE时[1,2]。内皮祖细胞(EPC)是内皮细胞的前体细胞,有助于血管修复和
基于蛋白质的微纤维在生物工程和食品领域具有潜在的应用,但在微米级上保留和利用其蛋白质构件的独特纳米机械性能仍然是一项挑战。本研究通过同轴微流体纺丝果胶和 β-乳球蛋白在不同构象状态(单体、淀粉样蛋白原纤维、缩短的淀粉样蛋白原纤维,处于各向同性/向列相)下自下而上制造核壳纤维,在 CaCl 2 溶液中凝胶化。纤维直径范围为 478 至 855 μ m(湿态)和 107 – 135 μ m(干态)。它们显示出清晰的核壳横截面,但果胶-β-乳球蛋白单体纤维除外,据推测紧凑的蛋白质会扩散到果胶基质中。纤维构建块的分子取向表示为有序参数,代表果胶链和淀粉样蛋白原纤维平行于纤维轴的排列,该参数通过空间分辨率为 20 μ m 的同步加速器广角 X 射线散射 (WAXS) 计算得出。与纯果胶纤维相比,引入淀粉样蛋白原纤维作为蛋白质核心可使杨氏模量从 3.3 增加到 6.4 GPa,拉伸强度从 117 增加到 182 MPa。然而,将蛋白质核心流速从 1 mL/h 增加到 2 mL/h 会导致核心喷射螺旋弯曲、有序性降低,最终导致机械性能恶化。总体而言,与缩短的淀粉样蛋白原纤维相比,全长淀粉样蛋白原纤维对机械性能更有益。通过深入了解蛋白质构象、纺丝流速和由此产生的核壳微纤维的机械性能之间的关系,这些结果可能有助于新型纤维蛋白质材料领域。