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SARS-COV-2表位特异性T细胞：免疫响应特征，TCR库特性和交叉反应性
由SARS-COV-2和多个变体或子变量引起的毁灭性的共同19岁大流行仍然是一个持续的全球挑战。SARS-COV-2-特异性T细胞反应在早期病毒清除，疾病严重程度控制，限制病毒传播和支持COVID-19 COVID-19疫苗效能中起关键作用。研究估计了每个个体中宽阔和稳健的T细胞反应，至少识别30至40个SARS-COV-2抗原表位，并与COVID-19的临床结果相关。几种关键的免疫主导病毒蛋白蛋白质组表位，包括S蛋白质和非S蛋白质衍生的表位，可能主要引起有效和持久的抗病毒保护作用。在这篇综述中，我们总结了靶向不同SRAS-COV-2蛋白质组结构后的免疫主流表位特异性T细胞的免疫反应特征，包括丰度，大小，频率，表型特征和反应动力学。此外，我们分析了表位免疫层次结构，结合了多个表位特异性T细胞属性和TCR曲目特征，并讨论了交叉反应T细胞对HCOV，SRAS-COV-2和SRAS-COV-2和SRAS-COV-2和CARESSS的变种的显着含义。本综述对于映射T细胞反应对SARS-COV-2的景观至关重要，并优化了当前的疫苗策略。
SARS-COV-2感染中的免疫力 诊断和治疗建议 增加了酪氨酸激酶抑制剂治疗胶质母细胞瘤细胞后EGFRVIII表位可及性，为免疫疗法创造了更多机会 汀类药物靶向AMPK：一种潜在的治疗方法 抗曲米尼抗性黑色素瘤细胞显示Mitfhigh ... 组蛋白脱乙酰基酶（HDAC）抑制剂 - valproic Acid将人黑色素瘤细胞敏感到达卡巴嗪和PARP抑制剂 探索心脏 - 敏感连接：揭开抑郁症和心血管疾病之间的共同途径 肾细胞癌患者的选定血管内皮生长因子受体激酶抑制剂的心脏毒性 欧盟儿童队列网络 心血管疾病：SGLT-2抑制剂的治疗潜力
抽象的严重急性呼吸道综合征冠状病毒-2（SARS-COV-2）及其机制已由世界各地的研究人员进行了彻底研究，希望能找到答案，以帮助发现新的治疗方案或预防有效手段。仍然，大流行的两年多，这是医疗保健和经济系统的巨大负担，似乎还有更多的问题。2019年冠状病毒疾病引起的特征和众多免疫反应（COVID-19）因炎症系统的不可控制的激活而异，从而导致广泛的组织损害，从而导致严重甚至致命的疾病，导致患者的轻度或无症状感染，导致患者的主要感染，导致当前的Pervication of Pressivical of Pressivical of Pressivical ovection。该研究的目的是将有关SARS-COV-2的免疫反应的可用数据系统化，以在可用的知识中提供一些澄清。该评论包含有关对Covid-19的最重要免疫反应的简洁和当前信息，包括先天和适应性免疫的组成部分，并额外着重于利用体液和细胞反应作为有效的诊断工具。此外，作者还讨论了有关SARS-COV-2疫苗的当前知识状态及其在免疫缺陷情况下的功效。
双盲、安慰剂对照、剂量递增研究，评估表位特异性化学定义纳米颗粒 RSV 疫苗的安全性和免疫原性
摘要：背景：V-306 是一种病毒样颗粒疫苗候选物，以呼吸道合胞病毒 (RSV) F 位点 II 蛋白模拟物 (FsIIm) 作为抗原表位。方法：这是一项随机、安慰剂对照、双盲、剂量递增的首次人体试验，研究对象为 60 名年龄在 18-45 岁之间的女性。每组 20 名受试者（15 名疫苗组和 5 名安慰剂组）在第 0 天和第 56 天接受两次 V-306 肌肉注射，剂量分别为 15 µ g、50 µ g 或 150 µ g。每次接种后以及总共 1 年内评估安全性和免疫原性。结果：V-306 在所有剂量水平下均安全且耐受性良好，第一次和第二次给药之间反应原性和未引起注意的不良事件没有增加。在 50 µ g 和 150 µ g 剂量下，V-306 诱导 FsIIm 特异性免疫球蛋白 G (IgG) 滴度增加，这种效果至少持续 4 个月。但这并未转化为 RSV 中和抗体滴度的增加，因为 RSV 中和抗体滴度在基线时已经很高。未观察到抗 F 蛋白特异性 IgG 滴度增加，由于过去的自然感染，大多数受试者的抗 F 蛋白特异性 IgG 滴度在基线时也很高。结论：V-306 安全且耐受性良好。未来对疫苗和检测条件的修改可能会改善疫苗接种结果。
ESCAPE-2：配对 HSC CD117 表位工程和通过碱基编辑直接编辑镰状等位基因，用于抗体介导的自体 HSC 治疗 c
通过碱基编辑在人类β珠蛋白基因 ( HBB ) 中引入天然存在的 Hb G-Makassar 变异，以消除聚合镰状蛋白 HbS（镰状细胞性贫血的主要分子驱动因素），这代表了治疗这种疾病患者的潜在新模式。虽然临床上正在推进几种用于治疗镰状细胞性贫血的体外基因编辑技术，但这种具有潜在变革性的细胞疗法仍然存在一些挑战，即在自体造血干细胞移植 (HSCT) 之前必须进行基因毒性骨髓清除性预处理。为了解决这个问题，我们开发了一种策略，即将一种与 CD117 结合的单克隆抗体 (mAb) 与多重工程化 HSC (eHSC) 结合，CD117 是 HSPC 上对生存至关重要的关键受体。我们的 eHSC 旨在逃避 mAb 结合并携带 Makassar 治疗性编辑。我们的工程干细胞抗体配对逃避（ESCAPE）策略旨在为当前的预处理方案提供一种非基因毒性的替代方案。
突变的糖胺聚糖结合结构域作为一种新型探针，可在肿瘤细胞上有选择地靶向肝素样表位
癌细胞的高异质性和突变率通常会导致靶向治疗的失败，因此，迫切需要需要进行多白素治疗的新靶标。异常表达的糖胺聚糖（GAG）已被证明与静脉内糖浆杂质及其含量有关。在这项研究中，我们发现RVAR2还可以与肝素（HEP）和chon- droitin硫酸盐结合。因此，我们使用RVAR2作为模型来建立基于GAG结合蛋白和噬菌体显示的随机诱变的方法，以识别和优化探测探测探针tar-geting tar-tar-trumor Gags gags gags。我们识别了一种新的探针VAR2HP，该探针通过与由Adecasacacharide structurethatcontains组成的独特表位进行选择性识别的HEP，至少是hexa2s（1-4）Glcns6s disaccharides。此外，我们发现这些HEP样表位在各种癌细胞中过表达。最重要的是，我们的体内实验表明，VAR2HP具有良好的生物相容性，并且优先定位于肿瘤，这表明VAR2HP在肿瘤诊断和靶向治疗中具有巨大的应用潜力。总而言之，这项研究提供了一种发现新型肿瘤相关的GAG表位及其特定探针的策略。
综述针对肿瘤特异性粘蛋白糖表位的抗体-药物偶联物
找到理想的靶表位是开发抗体-药物偶联物 (ADC) 的关键要素。为了最大限度地将药物输送到肿瘤细胞并减少副作用，该表位应特定于癌细胞并保留所有正常组织。在癌症进展过程中，糖基化途径经常发生改变，从而产生针对癌细胞的新型糖基化模式。粘蛋白是高度糖基化的蛋白质，经常在肿瘤上表达，因此是改变的糖表位的理想呈递者。在这篇综述中，我们描述了三种不同类型的糖表位，它们被单克隆抗体 (mAb) 识别，因此可作为 ADC 的理想支架；仅含糖链、糖肽和屏蔽肽糖表位。我们回顾了针对 MUC1 或足糖萼蛋白 (Podxl) 上表达的糖表位的 ADC 以及针对 MUC16 或 MUC5AC 上表达的糖表位的两种 mAb 的临床前和临床结果，这些结果可作为 ADC 开发的潜在候选药物。最后，我们讨论了目前使用糖表位靶向 ADC 治疗癌症的局限性，并提出了提高其疗效和特异性的方法。
使用 i-GONAD 生成 Flag/DYKDDDDK 表位标签敲入小鼠，可检测内源性 CaMKII 和蛋白质
摘要：特异性抗体对于蛋白质复合物的细胞和组织表达、生化和功能分析必不可少。然而，制备特异性抗体通常费时费力。将内源性蛋白质的表位标记在适当的位置可以克服这个问题。在这里，我们使用 AlphaFold2 蛋白质结构预测研究了表位标签位置，并结合 CRISPR-Cas9 基因组编辑和电穿孔 (i-GONAD) 开发了 Flag/DYKDDDDK 标签敲入 CaMKII α 和 CaMKII β 小鼠。使用 i-GONAD，可以将长达 200 bp 的小片段插入目标基因的基因组中，从而实现高效便捷的小表位标记。使用市售的抗 Flag 抗体进行实验，可以通过蛋白质印迹、免疫沉淀和免疫组织化学轻松检测内源性 CaMKII α 和 β 蛋白。我们的数据表明，通过 i-GONAD 生成 Flag/DYKDDDDK 标签敲入小鼠是一种有用且方便的选择，特别是在没有特定抗体的情况下。
2023; 19（13）：4052-4060。 doi：10.7150/ijbs.80468评论看到SARS-COV-2和SARS-COV的T细胞免疫：相信面向表位的疫苗
截至2022年3月的引言，SARS冠状病毒2（SARS-COV-2）是2019年冠状病毒病的病因（Covid-19）（1）（1），已感染了超过4.5亿人，全世界造成了超过601万人死亡（2）。来自SARS-COV-1和MERS-COV候选疫苗的临床前开发数据有助于很大程度上消除了SARS-COV-2疫苗的初始探索步骤的需求，从而节省了相当大的时间（3）。到目前为止，WHO已发布了有关辉瑞-biontech，Moderna，Astrazeneca，Janssen Covid，Sinopharm和Sinovac疫苗的建议（https://wwwww.who.int/emergencies/disease/disease/diseases/diseases/diseases/dieseases/diseases/diesease/div>这些疫苗已得到世界卫生组织在世界各地的紧急用途的批准。截至2021年11月1日，全球服用了70.4亿剂疫苗，世界人口中有49.4％的人口至少接受了1剂Covid-19-19-19疫苗（4）。重要的是，SARS-COV-2继续发展。迄今为止，WHO已经确定了5种关注的变体（VOC），包括B.1.1.7（Alpha），B.1.351（Beta）（Beta），p.1（Gamma），B.1.617.2（delta）和最新的B.1.1.529（Omicron）。积累的证据表明，与原始循环菌株相比，VOC随着潜在改变的疾病表现而迅速传播（5-8）。据报道，多种SARS-COV-2变体可以通过抗体中和，从而导致疫苗突破感染（7，9-16）。因此，迫切需要制定替代免疫策略。
使用免疫信息学方法设计针对 SARS-CoV-2 的多表位肽候选疫苗
摘要 简介：目前，新型冠状病毒感染的肺炎病例数仅略有下降，已成为一项重大的公共卫生挑战。我们仍在鼓励开发针对该病毒的有效疫苗，例如从 SARS-CoV-2 的成分（包括其刺突、核衣壳和 ORF1a 蛋白）设计的多表位疫苗。由于添加包括 HABA 蛋白和 L7/L12 核糖体在内的佐剂被认为有助于提高所设计疫苗的有效性，我们建议通过两种不同的佐剂设计多表位疫苗。方法：我们使用 IEDB 服务器预测使用 VaxiJen、AllPred 和 IL-10 Prediction 等在线工具表征的 BCL 和 TCL 表位。将选定的表位进一步构建成多表位疫苗。我们还在疫苗成分中添加了两种不同的佐剂，以提高疫苗的有效性。使用 trRosetta 构建了 3D 结构的疫苗。进一步用ClusPro和PatchDock将它们与不同的Toll样受体（TLR 3、4和8）以及SARS-CoV-2的进入受体ACE2对接，并用FireDock进行精炼。所有结构均通过USCF Chimera和PyMOL可视化。结果：本研究通过添加HABA蛋白和L7/L12核糖体作为佐剂成功设计了两种不同的候选疫苗。两种疫苗的理化性质和特性几乎同样好。同样，它们与TLR3、4、8和ACE2的强相互作用表明两者的最低能级估计都在-1,000以上。疫苗与ACE2和TLR的相互作用对于激活免疫反应和产生抗体至关重要。结论：设计和构建的两种多表位疫苗具有良好的特性，可能具有激活针对SARS-CoV-2的体液和细胞免疫反应的潜力。值得考虑进一步研究以证实本研究的结果。
通过使用纳米抗体识别的表位标签实现果蝇蛋白质的可视化和操控
摘要 扩大可用于蛋白质可视化和操作的试剂库将有助于了解其功能。与目标蛋白质相连并被现有结合剂（如纳米抗体）识别的短表位标签有助于进行蛋白质研究，因为无需分离针对它们的新抗体。纳米抗体比传统抗体有几个优势，因为它们可以表达并用作体内蛋白质可视化和操作的工具。在这里，我们描述了两个短（<15aa）纳米标签表位 127D01 和 VHH05，以及它们相应的高亲和力纳米抗体。我们展示了它们在果蝇体内蛋白质检测和重新定位、直接和间接免疫荧光、免疫印迹和免疫沉淀中的应用。我们进一步表明，CRISPR 介导的基因靶向提供了一种用纳米标签标记内源性蛋白质的直接方法。纳米标签的单个副本，无论其位置如何，都足以进行检测。这种多功能且经过验证的标签和纳米抗体工具箱将作为广泛应用的资源，包括果蝇及其他物种的功能研究。