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肠产毒性大肠杆菌的多表位融合抗原候选疫苗可在兔子模型中预防 B7A 菌株的定植
产肠毒素大肠杆菌 (ETEC) 菌株是导致儿童和旅行者腹泻的主要原因。由于决定其病理的毒素和粘附素的性质各异，开发针对这种异源菌群的有效疫苗已被证明非常困难。使用多表位融合抗原 (MEFA) 疫苗学平台开发了一种多价候选疫苗，并证明其可有效在小鼠和猪中引发广泛的保护性抗体反应。然而，在这些系统中并未测量到对小肠 ETEC 定植的直接保护。众所周知，ETEC 菌株的定植是疾病结果的决定性因素，并且依赖于粘附素。在这项研究中，我们开发了一种非手术兔定植模型来研究兔对 ETEC 定植的免疫保护。我们测试了基于 MEFA 的疫苗粘附素抗原与 dmLT 佐剂结合诱导广泛免疫反应和防止 ETEC 在兔小肠定植的能力。我们的结果表明，候选疫苗 MEFA 抗原在兔体内引发抗体，这些抗体与其结构中包含的七种粘附素发生反应，并可防止持续定植于幼兔体内的攻击菌株的定植。
Tau 靶向抗体疗法：太晚了、错误的表位还是错误的靶标？
参考文献 (1) Golbe, LI 和 Ohman-Strickland, PA 进行性核上性麻痹的临床评定量表。Brain 130, 1552-1565 (2007)。 (2) Dam, T. 等人。单克隆抗 tau 抗体 Gosuranemab 在进行性核上性麻痹中的安全性和有效性：PASSPORT 试验。Nat Medicine X, XX (2021)。 (3) Hoglinger, GU 等人。tilavonemab 在进行性核上性麻痹中的安全性和有效性：一项 2 期随机安慰剂对照试验。Lancet Neurology 20, 182-192 (2021)。 (4) Jadhav, S. 等人。tau 治疗策略概述。Acta Neuropathol Commun. 7, 22 (2019)。 (5) Sopko, R. 等人。 gosuranemab 表征 tau 结合。Neurobiol Dis。146, 105120 (2020)。(6) Yanamandra, K., 等人。抗 tau 抗体可降低不溶性 tau 并减少脑萎缩。Ann Clin Transl Neurol。2, 278-288 (2015)。(7) Kim, B., 等人。Tau 免疫疗法与 FTLD-tau 中的神经胶质反应有关。Acta Neuropathol。doi:10.1007/s00401-021-02318-y。提前在线 (2021)。(8) Jabbari, E., 等人。TRIM11 基因座的变异改变了进行性核上性麻痹表型。Ann Neurol。84, 485-496 (2018)。 (9) Biogen 在阿尔茨海默氏症试验阴性后暂停 Gosuranemab 的治疗。https://www.alzforum.org/news/research-news/biogen-shelves-gosuranemab-after-negative- alzheimers-trial (2021)。(10) Jabbari, E., 等人。进行性核上性麻痹生存的遗传决定因素：全基因组关联研究。柳叶刀神经病学 20, 107-116 (2021)。(11) Evans LD、Strano A、Campbell A 等人。全基因组 CRISPR 筛选确定 LRRK2 调节的内吞作用是人类神经元摄取细胞外 tau 的主要机制。预印本网址为 https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.08.11.246363v1 (2020)。 （12）Myeku，N.，等人。Tau 驱动的 26S 蛋白酶体损伤和认知功能障碍可能是
增加了酪氨酸激酶抑制剂治疗胶质母细胞瘤细胞后EGFRVIII表位可及性，为免疫疗法创造了更多机会
摘要汀类药物是一组降低脂质的药物，可抑制胆固醇生物合成，具有抗炎，抗肿瘤和免疫调节特性。几条证据表明，他汀类药物调节与调节不同细胞途径相关的多种蛋白质。5' - 腺苷单磷酸激活的蛋白激酶（AMPK）途径在代谢稳态中起重要作用，对细胞过程的影响，包括细胞过程和通过多种途径的炎症反应，包括凋亡和炎症反应。最近，已经表明他汀类药物可以以不同的生理和病理方式影响AMPK途径，从而导致抗癌，心脏保护，神经保护和抗结核效应。此外，它们对非酒精性脂肪肝病和糖尿病相关并发症具有治疗作用。汀类药物将AMPK激活为能量传感器，该能量传感器抑制细胞增殖并诱导癌细胞中的凋亡，同时通过抑制炎症和纤维化以及促进血管生成来发挥其心脏保护作用。此外，他汀类药物相关的AMPK激活会导致脂质积累降低，并分别降低肝脏和大脑中的淀粉样ββ沉积，并可能对肝脏和神经元具有治疗作用。在这篇综述中，我们总结了在不同病理条件下汀类药物与AMPK相关治疗作用的研究结果。
针对 SARS-CoV-2 的多表位疫苗设计的免疫信息学方法
新型冠状病毒肺炎 (COVID-19) 大流行在世界范围内导致死亡率飙升。因此，为了对抗这种疾病，我们采用免疫信息学方法设计了一种来自严重急性呼吸道综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 的各种蛋白质的多表位疫苗，并通过计算机模拟验证其稳定性、无过敏性和抗原性。我们通过计算预测了在全球分离的四种病毒株中保守的六种蛋白质序列的细胞毒性 T 细胞 (TC )、辅助 T 细胞 (TH ) 和 B 细胞表位。疫苗构建体中包含与 B 细胞表位重叠的 T 细胞表位，以确保体液和细胞介导的免疫反应。在构建体的 N 端添加了霍乱毒素的亚基作为佐剂以增加免疫原性。疫苗中甚至预测了干扰素-γ 诱导表位。分子对接和结合能学研究表明，疫苗与免疫刺激性 Toll 样受体 (TLR) -2、3、4 有强烈的相互作用。疫苗的分子动力学模拟确保了生物系统中的体内稳定性。疫苗的免疫模拟表明免疫反应增强。利用计算机克隆方法确保了疫苗在表达载体中的有效翻译。当然，这种潜在的疫苗构建体可以可靠地有效对抗 COVID-19。
SARS-CoV2 刺突蛋白多表位疫苗的计算机设计和表征
未经同行评审认证）是作者/资助者。保留所有权利。未经许可不得重复使用。此预印本的版权所有者（此版本于 2020 年 6 月 6 日发布。；https://doi.org/10.1101/2020.06.03.131755 doi：bioRxiv preprint
基于多表位的抗 SARS 肽疫苗设计-...
本预印本的版权所有者（此版本于 2020 年 5 月 23 日发布。；https://doi.org/10.1101/2020.04.23.055467 doi: bioRxiv preprint
靶向疫苗表位
免疫原性表位的计算预测是治疗和预防疫苗设计的有前途的平台。该策略的一个潜在目标是人类免疫缺陷病毒 (HIV-1)，尽管经过数十年的努力，但尚未有可用的疫苗。特别是，设计用于消除受感染细胞的治疗性疫苗将成为治愈策略的关键组成部分。最近，基于 HIV/AIDS 患者个体病毒免疫学数据设计的 HIV 肽显示出能够诱导治疗后病毒设定点的消退。然而，这种方法的可重复性和可扩展性受到与手动肽设计相关的错误和任意性以及耗时过程的限制。我们在此介绍 Custommune，这是一种用户友好的网络工具，用于设计个性化和针对人群的疫苗。当应用于 HIV-1 时，Custommune 使用患者特定的人类白细胞抗原 (HLA) 等位基因和病毒序列以及预期的 HLA 肽结合强度和潜在的免疫逃逸突变来预测个性化表位。值得注意的是，Custommune 预测结果与最近 II 期临床试验 (NCT02961829) 中施用的手动设计肽相比更为有利。此外，我们利用 Custommune 设计了针对受 COVID-19 影响严重的人群的预防性疫苗。结果允许识别针对每个人群量身定制的肽，并预测会引发 CD8 + T 细胞免疫和针对严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV- 2) 结构保守表位的中和抗体。总体而言，我们的数据描述了一种快速开发针对慢性和急性病毒感染的个性化或基于人群的免疫疗法的新工具。介绍
ORANGE：基于 CRISPR/Cas9 的基因组编辑工具箱，用于对神经元中的内源性蛋白质进行表位标记
蛋白质的正确亚细胞分布决定了神经元的复杂形态和功能。荧光显微镜技术对于研究亚细胞蛋白质分布非常有用，但它们在用荧光探针有效可靠地标记内源性蛋白质方面的能力有限。我们开发了 ORANGE：神经元基因组编辑应用的开放资源，它介导啮齿动物分离神经元培养、器官切片和体内表位标签的靶向基因组整合。ORANGE 包括一个用于深入研究内源性蛋白质分布的敲入库、病毒载体和一个详细的两步克隆方案，用于开发针对新靶标的敲入。使用 ORANGE 和（活细胞）超分辨率显微镜，我们揭示了内源性神经递质受体和突触支架蛋白以及以前未表征的蛋白质的动态纳米级组织。最后，我们开发了一种在神经元中创建多个敲入的机制，介导内源性蛋白质的多重成像。因此，ORANGE 能够在纳米级分辨率下量化神经元中几乎任何蛋白质的表达、分布和动态。
基于可变表位库的 COVID-19 疫苗，用于治疗当前和未来相关流行病
SARS-CoV-2 引发的另一场流行病（即 COVID-19 大流行）的爆发提醒科学界，更重要的是提醒全世界，尽管在针对主要疾病的疫苗开发方面投入了大量财力和人力，但成功率并不令人满意。因此，我们必须采取特别措施，试图遏制这种疾病的蔓延并找到有效的治疗方法；预防性/治疗性疫苗的产生可能解决这些目标。COVID-19 和其他疾病是主要的公共卫生问题，到目前为止，仍然难以应对；当然，我们指的不仅仅是最近的流行病，还包括其他流行病，甚至是引发这一切的艾滋病毒/艾滋病。这些疾病（艾滋病毒、流感、寨卡病毒、登革热、疟疾、丙型肝炎等）是由我们所谓的抗原可变病原体 (AVP) 引起的 [1]。针对该组的任何成员生产疫苗都是一项艰巨的挑战，但障碍是相似的。我们的愿景是，这些“不可能”的疾病在一个基本和根本层面上是相似的：基因组和抗原不稳定性。这一压倒性的特征让许多人望而却步，然而，乐观的研究人员尝试了更传统的方法（全病原体或基于细胞的疫苗），而其他人则通过基于结构的反向疫苗学方法转向对生物免疫学事件的还原论思维。数十年来的尝试获得的压倒性科学证据表明，针对 AVP 的疫苗设计的传统和“新”方法多次失败（艾滋病毒就是主要例子）。疫苗效力的最高标准（即 3 期临床试验）证实了这一点。我们可以说，失败的一个可能原因是过去和现在的疫苗生成平台没有解决遗传/抗原变异的主要问题，并且
1 基于表位的嵌合肽疫苗设计……
** 通信至：16 17 M. Anwar Hossain，博士 18 教授 19 微生物学系 20 达卡大学，孟加拉国达卡 21 电子邮件：hossaina@du.ac.bd 22 或者，23 Drs.马里兰州Mizanur Rahaman 24 助理教授 25 微生物学系 26 达卡大学，孟加拉国达卡 27 电子邮件：razu002@du.ac.bd 28 29 30 31 32