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World File Search System表型
用于发现与脑成像表型的遗传关联的多模态基础模型
摘要。由于神经系统疾病的病因复杂，使用标准方法寻找多组学特征之间的可解释关联可能具有挑战性。我们提出了 COMICAL，这是一种对比学习方法，利用多组学数据来生成遗传标记与脑成像衍生表型之间的关联。COMICAL 利用基于转换器的编码器和自定义标记器联合学习组学表征。我们的模态无关方法通过自监督学习方案和跨模态注意编码器唯一地识别了多对多关联。COMICAL 在英国生物银行中发现了多种神经系统疾病的遗传标记和成像衍生表型之间的几种重要关联，并根据学习到的表征预测了跨疾病和看不见的临床结果。COMICAL 的源代码以及预训练权重（支持迁移学习）可在 https://github.com/IBM/comical 上找到。
淋巴细胞抗原 6 家族成员 D (LY6D) 影响干细胞表型和胰腺腺癌进展
摘要。背景/目的：据报道，膜结合蛋白淋巴细胞抗原 6 家族成员 D (LY6D) 是早期 B 细胞谱系的标志物，在几种人类恶性肿瘤中表达，并与癌症干性有关。然而，其在胰腺导管腺癌 (PDAC) 中的表达和在癌症干性中的作用仍未得到充分探索。本研究旨在阐明 LY6D 在 PDAC 中的作用。材料和方法：我们对 LY6D 进行了功能分析，以评估其对体外 PDAC 细胞恶性特征的影响。利用我们内部开发的干细胞分离技术，该技术分离具有低蛋白酶体活性和 CD44 v9 细胞表面标志的癌症干细胞细胞，我们通过敲低 LY6D 表达在小鼠中进行了球体形成和化学敏感性测试以及肿瘤形成试验。还进行了免疫组织病理学分析，以揭示 LY6D 在 PDAC 中的临床意义。结果：体外功能测定表明，LY6D 在促进癌症恶性表型方面发挥关键作用，包括增强侵袭能力、耐药性、迁移能力和癌症
CRISPR屏幕在IPSC衍生的神经元中揭示了tau proteostasis 的原理 分泌信号的正交的人蛋白酶控制 大小选择巨型Unilamellar囊泡（GUV）通过改良的CDICE方法 Cyclin-G相关激酶（GAK）是一种新型有丝分裂激酶和弥漫性大B细胞淋巴瘤作者的治疗靶标：Olivia B. Lightfuss 1 实验微生物群落中的宏观生态模式 机器学习预测酶最佳pH 在阿尔茨海默氏病级联的情节记忆网络的功能障碍 使用分层变压器的机械基因型 - 表型翻译 前序和早期的纵向神经苯胺变化 基于映射的基因组大小估计
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2024年10月21日。 https://doi.org/10.1101/2024.01.18.576308 doi：Biorxiv Preprint
CRC 1470 |心力衰竭表型 - 预防，保护，预测11月4日至6月，2024年CRC 1470 |心力衰竭表型 - 预防，保护，预测11月4日至6月，2024年
11:05 - 11:30早期检测和预测心肌病Yigal Pinto，阿姆斯特丹11:30 - 11:55导航连续体：从HFPEF预防到拦截和跨模型系统Michael Gotthardt，柏林11:55 - 12:20我们可以防止从Hypertensive to Hypertensive to HF hf the Hyf the Hyf the Hyf？ 塞西莉亚·林德（Cecilia Linde），斯德哥尔摩12:20 - 12：35 Speed Pech Phd学生1 Yasmin Aktas，LaraJäschke，CerenKoçana，Clara Barraud11:05 - 11:30早期检测和预测心肌病Yigal Pinto，阿姆斯特丹11:30 - 11:55导航连续体：从HFPEF预防到拦截和跨模型系统Michael Gotthardt，柏林11:55 - 12:20我们可以防止从Hypertensive to Hypertensive to HF hf the Hyf the Hyf the Hyf？塞西莉亚·林德（Cecilia Linde），斯德哥尔摩12:20 - 12：35 Speed Pech Phd学生1 Yasmin Aktas，LaraJäschke，CerenKoçana，Clara Barraud
辣椒囊肿的多样性。基于表型和分子标记的基因型以及父母选择1
摘要：观赏辣椒植物具有遗传变异性，可以通过形态学和分子特征进入。基因型选择以形成基本种群进行育种，可以通过对几种类型的数据的联合分析进行繁殖，从而提供更高的选择准确性。从这个角度来看，这项研究旨在根据对表型性状和分子标记的分析评估胡椒加入之间的多样性，并选择在育种计划中用作父母的最佳方法。这项研究是在巴西Paraíba的联邦DaParaíba大学的CenciasAgrárias进行的。使用了16种观赏性胡椒基因型，并针对八个定量性状，九个定性性状和18对微卫星引物进行了表征。使用Tocher的聚类方法，Ward的群集算法和差异矩阵进行了同时变量分析。通过定量，定性和分子数据的联合分析，聚类方法在分离基因型，鉴定遗传变异性和准确性方面是有效的。通过Tocher方法（六组）和Ward的方法（三个组）形成了基因型之间的不同组。考虑到定量，定性和分子数据的联合分析，观赏性胡椒基因型之间存在遗传变异。定性性状对于鉴定观赏辣椒垫之间的遗传差异很重要。UFPB基因型46、134、137、443和449，迷你胡椒akamu和品种Calypso被指示用于选择，可用于执行十字架并继续育种计划。
DNAA和DNA在大肠杆菌细胞中的相对分布是其表型变异性的一个因素
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权所有，该版本于2024年10月7日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.08.06.606784 doi：Biorxiv Preprint
流式细胞仪辅助分析在永生的树突状细胞系上表型成熟标记
Geneva Campia a, Manuel Beltrán-Visiedo A, Ruth Soler-Agest A, B, Ai Sato A, Norma Bloy A, Lewei Zhao C, D, Peng Liu C, D, Oliver Kepp C, D, Guido Kroemer C, D, E, Lorenzo Galluzzi A, F, G, *, and Claudia Galassi A, * Oncology, Weill Cornell Medical College, New York, NY, United States B University of Zaragoza/Arago´n Health Research Institute, Biochemistry and Molecular and Cell Biology, Zaragoza, Spain C Equipe Labellis Ee Par La Ligue Contre Le Cancer, University and De Paris, Sorbonne Universit and, Centro de Recheche des Cordeliers，法国大学，法国，法国，D代谢组学和细胞生物学平台，Gustave Roussy，University and Paris Saclay，Villejuif，France和P ^ ole de Biologie，H ^ Opital europe Europe Europe Europe Euroge Een Georges een Georges een Georges Pompidou，Pompidou Caryl and Israel Englander Precision Medicinate，纽约，纽约州，美国 * Corpsontding作者：电子邮件地址：Deadoc80 @ gmail.com； clg4005 @ med.cornell.edu
自动抗原特异性CD4 + T细胞获得了疲惫的表型，并持续存在于人类抗原特异性自身免疫性疾病
促炎性自身抗原特异性CD4 + T助手（自动三）细胞是自身免疫性疾病（AIDS）的中央编排者。我们的目的是通过结合人类白细胞抗原（HLA） - 四聚体基于定义的自身抗原在人类辅助中表征这些细胞，基于基于激活的多维外体离体分析。在Aquaporin4-抗体阳性神经瘤谱谱障碍（AQP4-NMOSD）患者中，自动三细胞表达CD154，但增殖能力和促炎性细胞因子大大降低。相反，与耗尽相关的共抑制受体与Foxp3一起表达，即规范调节T细胞（Treg）转录因子。自动三细胞在体外对检查点抑制作用并提供有效的B细胞帮助。细胞。最初在癌症和慢性感染中描述了，我们的数据表明T细胞耗尽是对跨辅助类型的慢性（自我）刺激的常见机制，并将示例性的CD4 + T细胞与体液自身免疫反应联系起来，这对治疗靶向的意义。
单细胞基因型 - 表型映射标识Vexas综合征的治疗漏洞
抽象的躯体进化导致跨组织中克隆多样性的出现，对人类健康具有广泛的影响。躯体进化的一个引人注目的例子是由造血干细胞中的体细胞UBA1突变引起的Vexas（液泡E1酶X连接自身炎症体细胞）综合征，诱发了治疗治疗 - 恐怖分子，全身炎症。然而，导致突变体HSC生存和扩展的机制尚不清楚，从而限制了有效疗法的发展。缺乏UBA1突变HSC的动物或细胞模型阻碍了对原代人Vexas样品的分析，该样品具有野生型和UBA1的混合物的分析。为了应对这些挑战，我们应用了单细胞多词，以全面定义了VEXAS患者的转录组，染色质的可及性和信号传导途径改变，从而可以直接比较突变体与野生型细胞在同一环境中的直接比较。我们证实了髓样细胞中UBA1 M41V/T突变的预期富集，并还发现这些突变在天然杀手（NK）