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表观遗传药物和免疫检查点抑制剂
表观遗传机制是影响基因表达和细胞功能的过程，而无需涉及DNA序列的变化。表观遗传学调节的基因的这种异常或不稳定的表达会引发癌症和其他各种疾病。参与抗肿瘤反应的免疫细胞和肿瘤的免疫原性也可能受到表观基因组变化的影响。这对癌症免疫疗法，表观遗传疗法及其在针对癌症中的联合治疗的发展和应用具有显着意义。我们提供了最近的研究文献概述，重点介绍了免疫细胞中表观基因组的变化如何影响免疫细胞的行为和功能以及癌细胞的免疫原性。以及对关注免疫检查点分子的免疫检查点抑制剂的表观遗传药物的联合利用[例如，程序性死亡1（PD-1），细胞毒性T-淋巴细胞相关蛋白4（CTLA-4），T细胞免疫球蛋白和Mimunoglobulin and Mucunain（Tim-3），tim-3） （lag-3）]存在于与肿瘤相关的免疫细胞和基质细胞中。我们强调了针对表观遗传调节剂扩增抗肿瘤免疫反应的小分子抑制剂的潜力。此外，我们讨论了如何利用癌症表观遗传学与癌症免疫学之间的复杂关系，以创建将表观遗传疗法与免疫疗法相结合的治疗方案。
番茄果实成熟的表观遗传调控
果实作为被子植物特有的器官，为人类提供丰富的膳食纤维、维生素等营养物质，是健康膳食结构的重要组成部分（Giovannoni，2001；Chen et al.，2020）。果实成熟是果实食用品质形成的关键时期，是一个涉及果实质地变化、色素积累、香气和风味物质形成、抗性降低等性状的复杂发育过程，受诸多内外部因素的调控（Giovannoni，2004；Ji and Wang，2023）。内外部因素主要有转录因子和激素等，外外部因素主要有各种生物因素和非生物因素。根据呼吸模式的不同，果实可分为跃变型和非跃变型两类（Mcmurchie et al.，1972）。在果实成熟过程中，呼吸强度和乙烯释放量出现伴随爆发，如番茄、苹果和香蕉等，而非呼吸强度和乙烯释放量变化不显著，如草莓、葡萄、柑橘等（ Shinozaki et al.，2018 ）。乙烯生物合成的两个系统（系统I和系统II）在果实发育和成熟过程中起着至关重要的作用。未成熟的果实和植物其他器官持续产生低浓度的乙烯，即乙烯背景浓度。系统I乙烯以负反馈方式调节背景浓度的乙烯合成并参与果实发育，系统II乙烯以负反馈方式产生。
2.3.7基因组编辑和表观基因组编辑
•这是世界上所有领域的首要发展，包括在微生物中繁殖有用的菌株，农业，渔业和牲畜产品的繁殖，以及将其应用于基因治疗，通过大学机构，大型公司，大型公司，大型公司，捐赠公司之间的密切协作，可以改善研究和发展能力。许多风险投资公司，包括酥脆的治疗剂，编辑医学，内部治疗疗法和光束治疗药，正在从事农作物开发，工业能源开发和人类疾病治疗方面的尖端研究与发展。 •CRISPR/CAS9，CAS12A，CAS13以及许多与CRISPR相关的基本技术和应用技术知识产权都得到了保护。 •Talaen的高油酸大豆的生产和工业用途已经发展。 •主动促进体内和离体基因组编辑处理。 Laber先天性黑色素症，经胸蛋白淀粉样变性和镰状细胞疾病的临床试验已经开始如体内基因组编辑治疗。 •计划进行体内基础变体疗法（镰状细胞疾病）的临床试验。 •使用ZFN和CRISPR进行基因组编辑治疗的研发临床试验以及更安全的表观基因组编辑治疗正在进行中。已有30多次临床试验参加了FDA，领先的基因治疗研究。 •新型核酸检测技术（夏洛克和检测方法）已经开发出来，并正在作为新型冠状病毒中POCT的诊断剂开发。
炎症性肠病中表观遗传学的证据
肺癌是一种恶性肿瘤，全球发病率第二高（11.4％），死亡率最高（18％）（1）。在肺癌类型中，小细胞肺癌（SCLC）是一种高度恶性的病理类型，约占病例的14％（2）。尽管SCLC对化学疗法和放射疗法非常敏感，但它可能会复发和转移，并且对广泛的小细胞肺癌（ES-SCLC）的总生存期（OS）为8-13个月，而5年生存率仅为2-4％（3）。改善SCLC患者的预后是一个紧迫的临床问题。近年来，免疫检查点抑制剂（ICI）改善了肺癌的预后。编程的细胞死亡配体1（PD-L1）抑制剂与含铂双重药物的化学疗法相结合，已在20多年来首次改善了SCLC的预后。Atezolizumab（4,5）和Durvalumab（6-8）目前已获得食品药品监督管理局（FDA）的批准，结合了基于铂的化学疗法，用于
化学和光诱导的表观基因组编辑
摘要：表观基因组定义了不同细胞类型中独特的基因表达模式及其导致的细胞行为。表观基因组失调与各种人类疾病直接相关。表观基因组编辑能够针对基因组位点特异性地靶向表观基因组修饰物，从而直接改变特定的局部表观基因组修饰，为表观基因组调控机制研究以及新型表观基因组疗法的开发提供了革命性的工具。可诱导和可逆的表观基因组编辑提供了独特的时间控制，这对于理解表观基因组调控的动力学和动力学至关重要。本综述总结了使用小分子或光作为诱导物实现表观基因组编辑的条件控制的时空特异性工具的开发进展及其在表观遗传研究中的应用。
经验的生物嵌入：表观遗传学的底漆
生物嵌入会发生时，生活经历会改变生物学过程以影响以后的生活健康和福祉。尽管存在广泛的相关数据，但仍支持表观遗传机制（例如DNA甲基化基础生物学嵌入）的观念，但缺乏因果数据。我们描述了特定的表观遗传机制及其在经验生物嵌入中的潜在作用。我们还考虑了基因组，表观基因组和基因表达之间的细微关系。我们将生物学嵌入到其复杂性中的生物学嵌入到表观遗传景观的能力受到了多种因素的影响而具有挑战性和复杂性。这些包括细胞类型，年龄，经验时机，性别和DNA序列。分子分析和表观基因组编辑的最新进展，再加上比较动物和人类纵向研究，应使该领域能够从相关性分析过渡到因果分析。
免疫疗法抗性的表观遗传机制
Rachael Natrajan博士领导的功能性基因组学实验室是一个多学科动态研究小组，其使命是为抗乳腺癌的新治疗策略制定耐药性护理疗法的新治疗策略。实验室使用艺术分子分析的状态，例如在整个疾病进展的患者样本上进行单细胞测序和空间基因组分析，以了解乳腺癌的分子进化以及对靶向疗法的反应。与患者衍生，合成性和GEMM模型中的分子条形码策略一起，在体外和体内和候选生物标志物或治疗选择中评估了机理假设，以临时测试，以告知概念临床试验或药物发现计划的设计证明。We have made novel advances into the understanding of genomic alterations both at bulk and single cell level and their impact on breast cancer in different contexts and how to target these effectively (including Bland et al Nature Genetics 2023 PMID: 37524790; Peck et al Cancer Res 2021 PMID:33509944; Inayatullah et al PMID: 38480932 PMID: 24240700; Natrajan等人PLOS Medicine 2015 PMID：2688177，Maguire等人2016 PMID：27512948;
衰老的表观遗传改变：简短的审查
结果：衰老伴随着表观遗传标记的各种改变，包括DNA甲基化（非CPG区域中的全球低甲基化和CPG岛的高甲基化），染色质的重排（整体减少组蛋白和组蛋白的重新分布和组织纳修饰）和NCRNA（尤其是miRNA）。表观遗传学是一种可逆的分子机制，可允许治疗干预措施改善或逆转与衰老相关的发病机理。可以开发基于化学的表观遗传操作和基于生活方式的表观遗传重编程策略来改善或逆转与衰老相关的条件。
个体年龄相关 CpG 的表观遗传编辑会影响全基因组的表观遗传衰老状况
PDE4C 中的区域保持稳定超过三个月。此外，表观遗传编辑引发了许多全基因组脱靶效应，这些效应具有高度可重复性，并在其他与年龄相关的 CpG 中富集 - 因此，它们不是随机的脱靶效应，而似乎类似于共同调节的表观遗传旁观者修饰。年龄相关位点的 4C 染色质构象分析显示与旁观者修饰和其他与年龄相关的 CpG 位点的相互作用增加。随后，我们在 HEK293T 和原代 T 细胞中的五个基因组区域多重分析了表观遗传修饰，这些区域在衰老时会变得高甲基化或低甲基化。虽然在年龄低甲基化的 CpG 处进行的表观遗传编辑似乎不太稳定，但它也导致其他与年龄相关的 CpG 处旁观者修饰明显富集。相反，表观遗传时钟往往会在靶向 DNA 甲基化后长达十年内加速，尤其是在高甲基化的 CpG 处。这些结果表明，有针对性的表观基因组编辑可以调节整个表观遗传衰老网络，从而干扰表观遗传时钟。
雄激素信号和前列腺癌的表观转录组机制
前列腺癌 (PCa) 是男性中第二常见的癌症。虽然根治性前列腺切除术和放射疗法通常可以成功治疗局部疾病，但治疗后复发很常见。由于雄激素受体 (AR) 和雄激素在前列腺癌变和进展中起着至关重要的作用，因此雄激素剥夺疗法 (ADT) 通常用于剥夺 PCa 细胞的雄激素促增殖作用。ADT 通过阻断雄激素生物合成（例如阿比特龙）或阻断 AR 功能（例如比卡鲁胺、恩杂鲁胺、阿帕鲁胺、达洛他胺）起作用。ADT 通常在最初抑制 PCa 生长和进展方面有效，但 ADT 后出现去势抵抗性 PCa 和进展为神经内分泌样 PCa 是主要的临床挑战。因此，迫切需要找到调节雄激素信号的新方法，以阻止 PCa 进展，同时防止或延迟治疗抵抗。雄激素和表观转录组信号传导的机制融合为治疗 PCa 提供了一种潜在的新方法。表观转录组涉及 mRNA 的共价修饰，特别是在本综述中提到的 N(6)-甲基腺苷 (m 6 A) 修饰。m 6 A 参与调节 mRNA 剪接、稳定性和翻译，最近已被证明在 PCa 和雄激素信号传导中发挥作用。m 6 A 修饰受含 METTL3 的甲基转移酶复合物以及 FTO 和 ALKBH5 RNA 去甲基化酶的动态调节。鉴于需要新的方法来治疗 PCa，人们对针对调节 AR 表达和雄激素信号传导的 m 6 A 的新疗法产生了浓厚的兴趣。本综述严格总结了此类表观转录组疗法对 PCa 患者的潜在益处。