研究人员经常依靠Silico CRISPR计算设计算法来产生高性能的GRNA,但仍会在体内经历编辑故障。我们的另一个客户就是这种情况,一个研究团队开发了转基因无菌男性蚊子来打击疟疾的传播。他们的基因编辑实验经常失败,导致大量延迟,每个失败的实验都将项目恢复了8到12个月。在此问题上与他们合作,我们使用CRISPR Analytics平台来量化两个GRNA候选者的扩增子裂解活性。数据表明,两个GRNA都表现出裂解活性在远高于阴性对照的水平上,其中一个GRNA显示出大约是另一个活性的两倍(图2A)。
抽象阴离子交换膜(AEM)是燃料电池和水电解系统不可或缺的一部分,但在碱性条件下耐用性较差。醚裂解是基于聚(芳基醚)AEM的重要故障途径,它损害了机械稳定性和离子转运。虽然这种降解途径通常是通过聚合物碎片化来进行的,但新形成的水力组的作用在很大程度上被忽略了。我们表明,聚合物的分析导致机械刚度降低,而引入液体则部分减轻了这种损失。在碱性条件下,在醚裂解过程中形成的苯氧化物基团中和聚合物阳离子,导致以前未报告的离子兑换能力损失(IEC)。这种IEC损失机制加剧了离子连续性的降低,强调了以太裂解作为降解途径的严重程度。Recognizing that ether cleavage introduces significant chemi- cal changes beyond polymer fragmentation provides critical insights into its interplay with other degradation mechanisms, such as the direct reduction of cationic sites by E2 and S N 2 and provides molecular-level interpretations for the concurrent effects of polymer scission and in- creased hydrophilicity on membrane performance.
肿瘤裂解综合征(TLS)是一种肿瘤学紧急状态,其特征是大量肿瘤细胞裂解,伴随着大量细胞内的胞内电解质和代谢产物过多释放到血液中,并且这种合成是自发地或对Sys-temic癌症治疗的响应(1-3)。tls导致代谢性疾病,例如高尿酸血症,低钙血症,高菌血症和高磷酸血症。这些代谢复杂性进一步导致临床毒性,例如肾衰竭,心律不齐和癫痫发作(1-3)。TLS通常与血液学恶性肿瘤有关,并且在具有化学敏感的实体瘤患者(例如种系肿瘤和小细胞肺癌(SCLC))(1-3)中很少发生。分子分析的最新发展已提出了基于基因组肿瘤亚分类的新概念。微卫星不稳定性高(MSI-H)表型存在于15%的早期转移性结直肠癌(CRC)(4,5)中。尽管许多研究都评估了微卫星不稳定性(MSI)作为MCRC中预后标记的作用,但MSI-H被认为是基于5-氟尿嘧啶治疗的益处的预测指标(5)及其对OUT-
基于疫苗的病毒(VACV)的载体广泛用作疫苗和癌症免疫疗法。VACV工程传统上依赖于父母病毒基因组和含转基因转移质粒之间的同源重组,这是一个不具体的过程,它需要使用选择或筛选标记物来分离重组者。这种方法的最新扩展试图通过使用CRISPR-CAS9工程来裂解感染细胞中的病毒基因组,以增强持续转基因病毒的恢复。但是,这些方法并不能完全消除WT病毒后代的产生,因此继续需要多轮病毒传播和斑块纯化。在这里,我们描述了MAVERICC(通过体外CRISPR/CAS9裂解对重组的无标记疫苗病毒工程),这是一种以克服当前限制的方式来设计重组VACV的新策略。Mavericc还利用CRISPR/CAS9系统,但不需要标记,并且在一个步骤中基本上可以对所需的重组剂进行本质上的纯制剂。我们使用这种方法在Vacv基因组中的多个位置和组合中引入点突变,插入和缺失。MAVERICC的效率和多功能性使其成为在病毒基因组中任意选择的位置生成突变体和突变体库以构建复杂的VACV载体的理想选择,并促进对矢量的改善,并促进POXVIRUS生物学的研究。2021 Elsevier Ltd.保留所有权利。
CRISPR-CAS是细菌和古细菌中使用CRISPR RNA引导的监视复合物的自适应免疫系统,以靶向互补的RNA或DNA,以破坏1-5。定期间隔的目标RNA裂解是III型效应子复合物6-8的特征。在这里,我们确定了synechocystis型III-DV复合物的结构,这是从多蛋白到单蛋白III型效应物9、10,在裂解前和裂解后状态下的明显进化中间体。结构显示了效应子中的多生成融合蛋白如何以不寻常的排列束缚在一起,以组装成活性和可编程的RNA核酸内切酶,以及效应子如何利用与其他III类型效应子的靶RNA播种的独特机制。使用结构,生化和量子/经典分子动力学模拟,我们研究了三个催化位点的结构和动力学,其中靶RNA上的核糖的2'-OH在上层磷酸盐的线体自我裂解中起着核噬菌的作用。引人注目的是,大多数III型复合物的催化转移的排列类似于核酶的活跃位点,包括锤头,手枪和Varkud卫星核酶。我们的工作提供了对III型效应型复合物进化中重要的中间体对RNA靶向和裂解机制的详细洞察力。
热哌啶通常用于在损伤部位裂解无碱性和紫外线辐射的DNA。它可能对DNA造成非特异性损害,这可能是因为它是一个强大的基础,并且会产生大量浓度的羟基离子,这些羟基离子可以攻击嘌呤和雌性。我们表明,其他几个胺可以在中性pH或接近中性pH下切割无碱性DNA而不会造成非特异性损害。一个二氨酸,n,n-二甲基乙二胺,根据温度有效地通过i8-或i,8- ellations pH 7.4的pH NNA裂解。使用最终标记的寡核苷酸,我们表明裂解主要是基于消除反应的,但是4',5'-周期化也很重要。该试剂还以UVC和UVB诱导的光产物裂解,产生与哌啶相同的总体模式,但没有非特异性损害。在DNA中定位低水平的光产物(例如由天然阳光引起的含量)中应该很有价值。
ATP柠檬酸裂解酶(ACLY)抑制剂:葡萄糖和脂质代谢十字路口的抗癌策略ATP柠檬酸裂解酶(ACLY)抑制剂:葡萄糖和脂质代谢十字路口的抗癌策略