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新型裂解噬菌体K14-2的隔离和表征感染了克雷伯氏菌和劳尔特氏菌的多种物种
多药耐药细菌对公共卫生构成了重要的全球威胁，尤其是在严重的医院感染患者中。值得注意的是，由于它们与人类感染和抗生素耐药基因的转移，克雷伯氏菌和拉乌尔特省属引起了人们的关注。噬菌体疗法最近引起了人们的注意，作为治疗这些感染的一种新方法。但是，这种方法的效率依赖于具有广泛宿主范围的噬菌体。在这项研究中，使用肺炎克雷伯氏菌作为宿主，从河水样品中分离出具有较宽宿主范围的噬菌体K14-2。噬菌体的生物学特性的特征是评估其感染的多样性，杀死曲线，一步生长曲线以及跨不同pH水平和温度的稳定性。形态学分析表明，噬菌体非常类似于肌瘤病毒。宿主范围包括来自克雷伯氏菌，拉乌尔特氏菌和埃希里希氏菌的6种菌株。发现K14-2的基因组是双链DNA，包括175,759个碱基对，GC含量为41.8％。基因组注释揭示了280个蛋白质编码基因，其中96个分配了功能。与K14-2具有最高基因组相似性的噬菌体为vb_kpm-牛奶。基于主要衣壳蛋白建造的系统发育树发现噬菌体属于Straboviridae家族的Slopekvirus属。鉴于这些特征，新型噬菌体K14-2的发现具有广泛的宿主范围，具有增强噬菌体疗法在未来研究中的有效性的潜力。
丰富的测量结果揭示了人类肠道微生物组中的裂解与裂解性之间的平衡
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2024年12月11日。 https://doi.org/10.1101/2024.09.27.27.614587 doi：biorxiv preprint
BRAFV600E患者的肿瘤裂解综合征...
肿瘤裂解综合征（TLS）是一种肿瘤学紧急状态，其特征是大量肿瘤细胞裂解，伴随着大量细胞内的胞内电解质和代谢产物过多释放到血液中，并且这种合成是自发地或对Sys-temic癌症治疗的响应（1-3）。tls导致代谢性疾病，例如高尿酸血症，低钙血症，高菌血症和高磷酸血症。这些代谢复杂性进一步导致临床毒性，例如肾衰竭，心律不齐和癫痫发作（1-3）。TLS通常与血液学恶性肿瘤有关，并且在具有化学敏感的实体瘤患者（例如种系肿瘤和小细胞肺癌（SCLC））（1-3）中很少发生。分子分析的最新发展已提出了基于基因组肿瘤亚分类的新概念。微卫星不稳定性高（MSI-H）表型存在于15％的早期转移性结直肠癌（CRC）（4，5）中。尽管许多研究都评估了微卫星不稳定性（MSI）作为MCRC中预后标记的作用，但MSI-H被认为是基于5-氟尿嘧啶治疗的益处的预测指标（5）及其对OUT-
通过CRISPR/CAS9和多个RAAVS 成功建立了基于病毒复制元素的衣原体叶绿体中的外源基因表达系统 散装转录组分析，inmoose，python中的综合多摩管开源环境 标题：在神经退行性疾病的小鼠模型中自动评估区域脑萎缩的工具 揭示了来自单个人类皮肤部位的共生菌群的多样性 探索1 ... 中的遗传转化和基因组编辑 诱惑：纵向微生物组研究的时间信息降低 白血病蛋白PHF6和PHIP形成一种染色质复合物，抑制髓样白血病 靶向trem2-tyrobp跨膜结合的药物筛查 Klebphacol：Klebsiella的社区驱动资源... 干细胞因子抑制purkinje细胞的调节 牛的牛外胚层细胞 丰富的测量结果揭示了人类肠道微生物组中的裂解与裂解性之间的平衡 稳定的登革热病毒2包膜亚基疫苗重定向中和抗体1
我们感谢Ben Humphreys，Gaya Amarasinghe，Daisy Leung和Ting Wang的评论和建议，Robert Fulton，Catrina Fronick，Paul Cliften提供了技术帮助。这项工作得到了Siteman Cancer Center的共享资源投资计划的部分支持。
通过难治性癌症中的聚糖裂解开发治疗性抗体增强剂
2008 年，我开始研究参与代谢调节的信号分子的作用机制，并发现氨基葡聚糖（一种葡聚糖）促进活性受体复合物的形成。2011 年，由于日本东部大地震，我的研究活动被迫停止。我的导师告诉我 RIKEN 的灾难受害者支持计划。我很幸运地被录取进入了这个项目，并加入了一个专门从事葡聚糖有机合成的实验室，继续我的研究工作 10 个月。在此期间，我与专门从事合成有机化学的化学家进行了多次讨论，我认识到从化学角度了解生物功能的好处。这让我有机会探索我之前一直在研究的分子生物学和细胞生物学方法，并将生物化学视角融入我对葡聚糖内在参与机制的研究中。
吉泊汀和佐利氟达星如何稳定与细菌IIA型拓扑异构酶的DNA裂解复合物？1.金属结合位点的实验定义
摘要：21 世纪实验结构生物学面临的挑战之一是观察化学反应的发生。金黄色葡萄球菌 (S. aureus) DNA 旋转酶是一种 IIA 型拓扑异构酶，可产生暂时的双链 DNA 断裂来调节 DNA 拓扑结构。吉泊汀、佐利氟达星和喹诺酮类莫西沙星等药物可以稳定这些通常短暂的 DNA 链断裂并杀死细菌。在相同的 P6 1 空间群 (a = b ≈ 93 Å，c ≈ 412 Å) 中，已解析出含有吉泊汀前体 (2.1 Å GSK2999423) 或双裂 DNA 和佐利氟达星 (或其前体 QPT-1) 的未裂解 DNA 的晶体结构。这表明可能可以观察到该 P6 1 空间群中的两个 DNA 切割步骤（和两个 DNA 连接步骤）。这里，解决了这种晶体形式的 2.58 Å 异常锰数据集，并重新细化了这种晶体形式的四个先前的晶体结构（1.98 Å、2.1 Å、2.5 Å 和 2.65 Å）以阐明晶体接触。这些结构清楚地表明了单一移动金属机制——在附带的（第二篇）论文中提出。先前发表的酵母拓扑异构酶 II 的 2.98 Å 结构，它在晶体二重轴周围具有静态无序，被发表为在一个活性位点包含两种金属。这个 2.98 Å 酵母结构的重新细化坐标与其他 IIA 型拓扑异构酶结构一致，在两个不同的活性位点各只有一个金属离子。
阿尔茨海默氏病中Aβ肽和tau蛋白的锌（锌）修饰的清除和裂解
Zinc(Ⅱ) can prevent on pre-stage, mild cognitive impairment (MCI) and pathological AD for AD MCI and prevention that an- tibodies prevent MCI, zinc homeostasis, ZnCl2, zinc transporter (ZnT) prevent MCI and AD, ZnT-6 prevents MCI and AD that ZnT-6 is a likely site of Aβ generation through cleavage of amy- loid precursor protein （APP）和用锌 - 金甲肽酶降解酶（IDE）可预防AD。清除率和裂解阶段涉及MMP-2，MMP-2，MMP-2，MMP-2，MMP-3，CAN CAN属于MMP-2，MMP-2，MMP-2，MMP-2，MMP-2，MMP-2，MMP-2，MMP-2，MMP-3，属于Zinc-9）可以降解MMPS，MMP2，MMP9 MMPS，MMP2，MMP9）涉及ADAβ肽聚集阶段。淀粉样β蛋白质清除和降解（ABCD）和具有锌烯型肽酶的胰岛素降解酶（IDE）可以切割多种小肽。清除率和裂解阶段涉及锌指蛋白，锌指蛋白转录因子（ZFP-TFS）可以减少tau的持续抑制作用。生物活性化合物清除，锌-BDNF剥夺会引起AEP的影响和切割tau，并且可以在tau蛋白中切割锌离子。取决于ADAβ毒性的清除和切割阶段，涉及锌金属蛋白酶酶，可以在Aβ和TAU上裂解锌金属蛋白酶酶，膳食生物活性化合物，锌 - 米克罗糖酸锌和tau，通过Aβ和TAU清除和abeave cleaveance和debevenance和taus neb s cleaine s Agrance shep and n s Agn s Agrance shecance shep s Agn and s rep shep s rep shecance。 锌（ⅱ）结合清除和的分子机制取决于ADAβ毒性的清除和切割阶段，涉及锌金属蛋白酶酶，可以在Aβ和TAU上裂解锌金属蛋白酶酶，膳食生物活性化合物，锌 - 米克罗糖酸锌和tau，通过Aβ和TAU清除和abeave cleaveance和debevenance和taus neb s cleaine s Agrance shep and n s Agn s Agrance shecance shep s Agn and s rep shep s rep shecance。锌（ⅱ）结合清除和锌诱导的有毒反应氧（ROS）产生导致过度磷酸的TAU损害和氧化应激增加，以引起TAU高磷酸化并加剧神经元死亡。锌诱导的有毒反应氧（ROS）产生导致过度磷酸的TAU损害和氧化应激增加，以引起TAU高磷酸化并加剧神经元死亡。
使用 3M Harvest RC 色谱澄清剂从 HEK 洗涤剂裂解物中去除宿主细胞 DNA 的调查案例研究
腺相关病毒 (AAV) 是广泛用于递送基因疗法以治疗各种人类疾病的载体。截至 2024 年 3 月，美国 FDA（食品和药物管理局）已批准了 5 种基于 AAV 的疗法，并且正在进行 200 多项临床试验。1 生产 AAV 的方法包括在宿主细胞（例如 HEK293）中进行瞬时三重转染、基于杆状病毒的表达系统和无辅助病毒方法（例如单纯疱疹病毒 (HSV) 系统）。2 AAV 颗粒通常在细胞内，AAV 纯化过程通常始于通过洗涤剂裂解将病毒从宿主细胞中释放出来；该细胞裂解过程也经常将 hcDNA 释放到液体中。最终产品中存在 hcDNA 对经过处理的细胞构成了重大的安全隐患
从MMV大流行响应盒中发现了小分子的KSHV裂解复制抑制剂
Kaposi的肉瘤相关疱疹病毒（KSHV）是原发性积液淋巴瘤（PEL），多中心Castleman疾病（MCD）和Kaposi的S肉瘤（KS）的病因。KSHV是每年有150万例新的感染相关癌症病例的肿瘤病毒之一。当前，尚无针对KSHV相关疾病的靶向疗法。通过开发基于KSHV ORF57蛋白检测的基于中型表型的ELISA筛选平台，我们为非胞毒性溶质抑制剂的KSHV裂解重复抑制剂进行了筛选疟疾风险投资（MMV）大流行反应盒。MMV1645152被鉴定为KSHV裂解复制的有前途的抑制剂，抑制了KSHV的立即和晚期的裂解基因表达，并阻止了或无需EBV confection的KSHV感染细胞系模型中非cytototoxic浓度在非cytotoxic浓度下的感染性KSHV VIRION颗粒的产生。MMV1645152对于开发针对KSHV相关的恶性肿瘤的未来治疗剂的发展是一个有希望的命中。