Novartis, Biomedical Research Translational Clinical Oncology Campus Novartis, 4002 Basel Date Wednesday, February 5, 2025 Course Venue UZH, Irchel Campus, Y13-M-12 General Outline 09.00 – 12.00 - Opening/Intro Small molecule anticancer therapeutics - Challenges and perspectives in targeting KRASG12C in KRAS-mutated tumors - Tackling Microsatellite通过抑制WRN解旋酶 - 针对Yap -tead驱动的癌症依赖性12:00 - 13:00午餐休息13.00 - 16.00-患者安全 - 我们需要知道的 - 早期临床试验和创新临床临床试验设计的概述 - 从学术界到行业学习量
非编码 RNA(ncRNA)是恶性疟原虫免疫逃避和传播的新兴调节因子。RUF6 是一个由 RNA 聚合酶 III 转录但积极调节 Pol II – 转录 var 毒力基因家族的 ncRNA 基因家族。目前尚不清楚 RUF6 ncRNA 如何与下游效应物连接。我们开发了一种 RNA 引导的蛋白质组学发现 (ChIRP-MS) 方案来识别体内 RUF6 ncRNA - 蛋白质相互作用。用生物素化的反义寡核苷酸纯化 RUF6 ncRNA 相互作用组。定量无标记质谱法鉴定出几种与基因转录相关的独特蛋白质,包括 RNA Pol II 亚基、核小体组装蛋白和 DEAD 盒解旋酶 5 (DDX5) 的同源物。 Pf-DDX5 的亲和力纯化鉴定出最初由我们的 RUF6-ChIRP 方案发现的蛋白质,验证了该技术在鉴定恶性疟原虫中的 ncRNA 相互作用组方面的稳健性。核 Pf-DDX5 的诱导置换导致活性 var 基因的显着下调。我们的工作鉴定出一种 RUF6 ncRNA - 蛋白质复合物,它与 RNA Pol II 相互作用以维持 var 基因表达,包括一种可能解决 var 基因中 G-四链体二级结构以促进转录激活和进展的解旋酶。
最后我们要介绍的是 DNA 复制在更大规模上是怎样的。由于 DNA 聚合酶 III 只能将 DNA 从 5' 复制到 3',因此存在一条前导链和一条滞后链,导致每条链被合成。前导链的合成方向与 DNA 被进一步打开的方向相同。滞后链的合成方向相反,因此每次当解旋酶解开更多 DNA 时,它都必须设置一个新的引物。这意味着前导链只有一个引物,而滞后链有多个引物。在滞后链上形成的这些新 DNA 片段称为冈崎片段。
Marta Garcia-Forn博士,于2020年1月在De Rubeis实验室加入Seaver Autism Center。与她的年轻研究者Grant一起,她旨在研究DDX3X基因在谷氨酸能脑细胞的产生和功能中的作用,以及其对焦虑样行为的贡献。X连锁RNA解旋酶DDX3X中的突变引起的神经发育障碍主要影响女性,并表现出智力障碍,自闭症谱系障碍,运动功能障碍和焦虑症。该项目有望更好地了解皮质脑发育如何塑造有助于复杂行为的脑细胞多样性。最终,该项目应允许研究人员开始了解自闭症与其他精神病患者之间的共同发病率。
1。描述了基因化学的历史。2。原核生物和真核生物中的基因结构对比。3。展示了DNA复制的机理和酶学(解旋酶,原始酶,DNA聚合酶,DNA连接酶)。4。对比原核生物和真核生物中的DNA复制。5。定义RNA的结构并赋予RNA亚型的功能。6。研究分子生物学的中心教条。7。解释转录过程。8。解释了细胞核中转录后修饰的过程。9。解释转录的控制,包括操纵子模型。10。解释翻译的机制并提供了启动,伸长和终止的细节。能力3:学生将通过:
DNA中的氮基碱包括腺嘌呤,鸟嘌呤和胞嘧啶,而RNA含有尿嘧啶而不是胸腺素。解旋启动DNA合成,而聚合酶是负责通过在生长链中添加核苷酸来复制DNA的主要酶。DNA的糖磷酸主链由磷酸二酯键一起保持。一个称为复制起源的特定序列是染色体上DNA合成的起点。DNA的双螺旋结构具有主要和次要凹槽,这对于其功能很重要。双螺旋的每个转弯都有这些凹槽,从而允许复制过程发生。在DNA复制过程中,氮基碱的正确配对对于维持遗传信息的完整性至关重要。此过程发生在细胞分裂之前,涉及DNA双螺旋的放松形成两个模板链。领先链是连续合成的,而滞后链则形成短片段,然后通过连接酶将其连接在一起。在复制位点形成Y形结构是过程中的重要一步。RNA或DNA的引物序列是DNA合成的模板,并且在复制完成后必须去除这些引物。参与DNA复制的键酶包括解旋酶,聚合酶和连接酶。旋转酶放松双螺旋,而聚合酶为生长链增添核苷酸。连接酶将滞后链的短片段连接在一起。连接5'和3'时,会形成磷酸酯主链。与DNA复制有关的一些重要术语包括前导链,滞后链,复制的起源和滑动夹具蛋白。DNA复制过程对于忠实地从一代细胞到下一个细胞的遗传信息传播至关重要。仅在RNA中发现的化合物被称为** uracil **,而** okazaki碎片**请参阅滞后链上的短段或片段。DNA的基本三维形状是A **双螺旋**结构,而RNA是单链,不稳定的,并且可以离开细胞核。基因由DNA组成,代表遗传的基本物理和功能单位。通过破坏弱氢键解解酶的酶称为**解旋酶**。平行但在相反方向的两个侧面称为**反平行**。嘧啶由单个碳环组成,而核苷酸由磷酸盐,糖和氮碱组成。DNA是双链,稳定的,并且保持在核内。根据夏尔加夫的统治,鸟嘌呤总是与胞嘧啶配对。核糖是RNA核苷酸中发现的糖,而脱氧核糖是DNA核苷酸中存在的5-碳糖。氢键将DNA的两条链组合在一起,** primase **是负责放下RNA底漆的酶。互补意味着一侧可以与另一侧配对或补充另一侧。由重复核苷酸制成的长聚合物称为DNA。五个氮基是腺嘌呤,鸟嘌呤,胸腺嘧啶,胞嘧啶和尿嘧啶。双螺旋的“主链”是磷酸骨架。** DNA聚合酶**是促催化DNA分子合成的酶中的一种酶。嘧啶衍生物包括三个氮基碱 - 尿嘧啶,胸腺嘧啶和胞嘧啶 - 它们是DNA和RNA的基础。复制涉及半守则复制,其中双螺旋分裂为两个不同的链。嘌呤分子由四个氮原子和六个碳原子组成。嘧啶由一个六元环和两个氮原子和四个碳原子组成。核苷酸是DNA和RNA的构件。** DNA解旋酶**是一种在DNA复制中起重要作用的酶,而氢键在解螺旋酶放松时会破裂。这是文本的重写版本:** DNA结构** DNA的基本构件是由重复核苷酸组成的长聚合物。这些氮碱分为两个主要群体:嘌呤(腺嘌呤,鸟嘌呤)和嘧啶(胸腺胺,胞嘧啶,尿嘧啶)。酶,例如DNA聚合酶,促进了DNA分子的合成。**复制过程**在半守保持复制期间,双螺旋分裂为两个单独的链。这些链充当新DNA合成的模板。该双螺旋的“骨干”由磷酸盐组组成。**核苷酸特征**嘌呤(例如腺嘌呤和鸟嘌呤)由一个六元环组成,带有四个氮原子和六个碳原子,而嘧啶(例如胸腺胺和细胞儿童)具有两个六氮环,具有两个六氮气,带有两个硝基原子和四个碳原子的环。核苷酸是DNA和RNA的基本单位。**涉及的酶** DNA解旋酶通过放开双螺旋在复制过程中起着至关重要的作用,这最终导致链分离。**氢键**作为解旋酶放松DNA链,核苷酸之间的氢键被损坏,从而使链分开。
是开发抗生素佐剂的新兴靶标是细菌DNA修复和SOS反应途径,它控制了细菌胁迫期间的超突变,水平基因转移,持久细胞的形成和毒力的上调。8 - 13个细菌基因组中的DNA损伤可能是由中性粒细胞在感染过程中产生的氧化爆发或诱导DNA双链断裂(DSB)的抗生素治疗的氧化爆发。在细菌中,DSB的修复是由主要在革兰氏阳性细菌或RECBCD中发现的酶复合物ADDAB启动的,主要是在革兰氏负面的。9 ADDAB和RECBCD是ATP依赖性解旋酶 - 通过DNA加工的复杂生化机理起作用的核酸酶,14-16最终导致3 0单链DNA产生。15多重
2019年的出现,SARS-COV-2的出现对人类的生活造成了巨大的损失,并对社会产生了巨大影响。有必要确定具有不同作用机制的有效抗病毒药,以便加速临床前发展。这项研究集中在直接作用小分子抗病人的五种最成熟的药物靶蛋白上:NSP5主蛋白酶,NSP12 RNA依赖性RNA聚合酶,NSP13解旋酶,NSP16 2'-O甲基转移酶和尖型蛋白的S2亚基。使用溶剂映射和自由能计算的工作流程来识别和表征芳族药理(苯)的有利的小分子结合位点。识别最有利的位点后,使用计算片段筛选进行了比较计算出的配体效率。最有利的位点总体位于NSP12和NSP16上,而NSP13和S2 Spike的最有利位点相对于NSP12和NSP16,配体效率相对较低。利用在NSP13解旋酶上的许多可能位点上进行片段筛选,我们在N末端锌结合结构域(ZBD)上鉴定了一个有利的变构位点,这可能适合虚拟或生物物理片段筛查工作。NSP12:NSP13复制 - 转录复合物的最新结构研究在该位点实验证实了配体的结合,该结合在该位点揭示为功能性NSP8:NSP13蛋白质 - 蛋白质相互作用。我们希望,这些药物靶标的200多个可能的小分子结合位点的图可能用于持续的发现,设计和药物重新利用。NSP13 ZBD构象的详细结构分析显示了诱导拟合柔韧性在该配体结合位点的作用,并确定哪些构象状态与有效的配体结合有关。此信息可用于优先考虑筛查工作或有助于破译筛查击中如何与特定目标蛋白结合的过程。
微卫星不稳定性 (MSI-H) 是错配修复缺陷 (dMMR) 的表型结果,发生在各种肿瘤类型中,包括高达 15% 的结直肠癌、10% 的胃癌和 30% 的子宫内膜癌。尽管随着免疫检查点抑制剂的使用,MSI-H 的治疗前景正在改善,但对于几种使用当前标准治疗疗法无法产生反应或最终复发的 MSI-H 肿瘤类型,仍然存在大量未满足的医疗需求。沃纳综合征解旋酶 (WRN) 已被证实是 MSI-H 肿瘤的一个有前途的合成致死药物靶点,因此 WRN 抑制剂可能为 MSI-H 肿瘤患者提供一种新的治疗选择。
A.pylalis iflavirus的序列信息的注释图1。该图的顶部代表10,561bp的基因组,每个KB在5'至3'方向上指示。显示了多蛋白的ORF的位置以及该动物酸序列的程度。该图的底部显示了核域和登录数,包括病毒外套蛋白,解旋酶和RNA依赖性RNA聚合酶。B.具有分支支持值的昆虫特异性iflavirus多蛋白氨基酸序列的系统发育。PPIV1以橙色显示。C. partiti样病毒的序列信息的注释图。分别显示了两个片段,以及分别为RDRP编码的ORF和每个段上的假设蛋白。在图的底部显示了Interpro域和登录号。