质谱成像(MSI)是一种众所周知的分子在组织切片上电离及其定位的可视化方法。最近,已将不同的样品制备方法和新的仪器用于MSI,并且不同的分子变得可见。另一方面,尽管已经提出了几种量化方法(Q -MSI),但仍有开发简化过程的空间。在这里,我们尝试使用从样品冷冻片段的组织碎片制备的校准曲线来开发可再现可靠的定量方法,当我们修剪冷冻块时。我们讨论了这种方法在不同样本批次的可重复性以及生物矩阵(离子抑制)对我们的结果的影响。根据准确性和相对标准偏差评估了定量性能,并通过酶联免疫吸收测定(ELISA)进一步评估了通过基质辅助激光解吸/电离MSI获得的定量值的可靠性。我们的Q -MSI方法用于定量小鼠脑组织中多巴胺的方法是高度线性,准确且精确的。发现,通过MSI获得的定量值与ELISA从同一组织提取物获得的结果高度可比(> 85%相似性)。
摘要:天然质谱法(NMS)筛选天然聚糖库针对聚糖结合蛋白(GBPS)是配体发现的强大工具。但是,由于血糖浓度未知,因此不能直接从天然文库中测量亲和力。在这里,我们引入了依赖性(硬币)-NMS,通过利用在纳米流电喷雾电离发射器内的溶液的缓慢混合来实现自然聚糖库的定量筛选。通过对时间依赖性相对丰度变化的NMS分析,同时确定了检测到的GBP-聚糖相互作用的亲和力(K d)。我们使用具有已知K D值的纯化聚糖和GBP之间的相互作用来建立硬币-NMS的可靠性。我们还使用用于糖基化GBP的捕获和释放(CAR)-NMS分析来证明硬币-NMS。与含有数百种N-聚糖和糖肽的天然文库获得的植物,真菌,病毒和人类凝集素获得的硬币 - 核NMS结果突出了该测定的多功能性,以发现新的配体,可精确测量其亲属,并揭示“好”的特殊性。值得注意的是,硬币-CAR-NMS结果阐明了SARS-COV-2受体结合结构域的唾液酸结合特性,并确定了单溶解的杂种和二胞质N-聚糖的识别。此外,宿主复合物n-聚糖的药理耗竭可降低伪型病毒体和SARS -COV -2细胞的进入,这表明复杂的n-聚糖可以用作附着因子。■简介
摘要:从化石燃料到绿色能源的全球过渡是对有效可靠的储能系统的需求。电池材料的高级分析和表征不仅对于了解基本电池特性,而且对它们的持续开发至关重要。对这些系统的深入了解通常很难仅通过预/或验尸后的分析获得,而电池的全部复杂性被隐藏在其操作状态下。因此,我们开发了一种操作方法,用于在结构上,化学,期间和循环后在结构上以及化学上分析固态电池(SSB)。该方法基于特殊设计的样品持有人,该样品持有人可以实现各种电化学实验。由于整个工作流程是在配备了内部发达的磁性扇形辅助离子质谱仪的单个聚焦离子梁扫描电子显微镜中执行的,因此我们能够随时暂停循环,进行分析,然后继续循环。微结构分析是通过二级电子成像进行的,并使用二级离子质谱仪进行化学映射。在这项概念验证研究中,我们能够在短路的对称细胞中识别树突和化学绘制树突结构。虽然此方法专注于SSB,但该方法可以直接适应不同的电池系统及其他地区。我们的技术显然比电池分析的许多替代方案具有优势,因为不需要在仪器之间进行样品的转移,并且直接获得了微结构,化学组成和电化学性能之间的相关性。
摘要:用传统质谱法分析核酸时,反离子会造成质量不均匀,限制可分析的 DNA 大小,因此分析起来十分复杂。在这项研究中,我们使用电荷检测质谱法分析兆道尔顿大小的 DNA,从而克服了这一限制。使用正模式电喷雾,我们发现 DNA 质粒的电荷分布截然不同。低电荷群体的电荷像紧凑的 DNA 折纸一样,而高电荷群体的电荷分布范围很广。对于高电荷群体,测量质量与 DNA 序列预期质量之间的偏差始终在 1% 左右。对于低电荷群体,偏差更大且变化更大。高电荷群体归因于随机卷曲配置中的超螺旋质粒,其宽电荷分布是由随机卷曲可以采用的丰富多样的几何形状造成的。高分辨率测量表明,随着电荷的增加,质量分布会略微向低质量方向移动。低电荷群体归因于质粒的浓缩形式。我们认为凝聚形式是由熵捕获引起的,其中随机线圈必须经历几何变化才能挤过泰勒锥并进入电喷雾液滴。对于较大的质粒,剪切(机械破碎)发生在电喷雾期间或电喷雾界面。降低盐浓度可以减少剪切。■简介质谱 (MS) 在核酸表征中发挥着重要作用。1、2 电喷雾和基质辅助激光解吸/电离 (MALDI) 都已用于将 DNA 和 RNA 离子引入气相进行分析,但 MALDI 与飞行时间 (TOF) MS 的组合应用最为广泛。例如,MALDI-TOF 继续用于表征单核苷酸多态性 (SNP),这可提供有关疾病易感性遗传特征的重要信息。对于突变和 SNP 的分析,只需要分析小于 25 nt 的小寡核苷酸(核苷酸)。这是幸运的,因为反离子(通常是 Na +、K + 或 Mg 2+)与 DNA 和 RNA 的高电荷磷酸骨架结合,导致峰宽和灵敏度降低。已经开发出几种方法来脱盐核酸。3、4 然而,由金属离子加合引起的异质性会随着尺寸的增加而增加,并且由于电荷状态分辨率的丧失,常规 MS 不再可能分析兆道尔顿大小的 DNA 和 RNA 物种。另一方面,新型疫苗和基因疗法等新兴疗法携带着大量的遗传物质。基因组完整性对于有效的治疗是必不可少的,对完整基因组的质量测量提供了一种快速而直接的方法来检查缺失和添加。5
核糖核酸酶测定DRR:在37°C下将10 µL DRR与160 ng 2 Kb RNA转录物一起孵育10 µL DRR后,检测到无污染的RNase。对于DNase I:在37°C下以160 ng的2KB RNA转录本与160 ng的2KB RNA转录本孵育5U后,未检测到污染RNase 4小时。
摘要:对于细胞周期蛋白依赖性激酶12和13(CDK12和CDK13)的有效抑制剂的合理设计和开发在很大程度上取决于对动态抑制构象的理解,但很难通过常规特征工具来实现。在此,我们整合了赖氨酸反应性分析(LRP)和天然MS(NMS)的结构质谱法(MS)方法,以系统地询问动态分子相互作用和CDK12/CDK13-CYCLIN K(cyck)的整体蛋白质组装,而小型分解物的调节构成。基本结构见解,包括抑制剂结合袋,结合强度,界面分子细节和动态构象变化,可以从LRP和NMS的互补结果中得出。我们发现抑制剂SR-4835结合可以极大地破坏CDK12/CDK13-CYCK相互作用,以异常的变构激活方式,从而为激酶活性抑制提供了一种新颖的替代方法。我们的结果强调了LRP与NMS的巨大潜力,用于评估和合理设计分子水平的有效激酶抑制剂。
摘要:人们普遍认为溶解有机物 (DOM) 可以控制环境中痕量金属的溶解度和反应性。然而,控制金属-DOM 络合的机制仍然不清楚,主要是因为在组成 DOM 的复杂有机化合物混合物中分离和定量金属-有机物种的分析难度很大。本文,我们描述了一种使用液相色谱在线电感耦合等离子体质谱 (LC-ICP-MS) 对有机-金属络合物进行定量分离和元素特异性检测的方法。该方法实施柱后补偿梯度以稳定整个 LC 溶剂梯度中的 ICP-MS 元素响应,从而克服了实现 LC-ICP-MS 定量准确度的主要障碍。通过外部校准和内部标准校正,该方法得到的有机-金属络合物浓度始终在其真实值的 6% 以内,无论络合物的洗脱时间如何。我们利用该方法评估了四种固定相(C18、苯基、酰胺和五氟酰基苯基丙基)对苏旺尼河富里酸和苏旺尼河天然有机质中环境相关痕量金属(Mn、Fe、Co、Ni、Cu、Zn、Cd 和 Pb)回收率和分离率的影响。C18、酰胺和苯基相通常可获得最佳的金属回收率(除 Pb 外,所有金属的回收率均 > 75%),其中苯基相分离极性物质的程度大于 C18 或酰胺相。我们还对氧化和还原土壤中有机结合的 Fe、Cu 和 Ni 进行了分馏,揭示了土壤氧化还原环境中金属-DOM 形态的不同。通过对 DOM 结合金属进行定量分馏,我们的方法为加深对整个环境中金属-有机络合物的机理理解提供了一种手段。■ 引言
体外诊断医疗装置*液相色谱串联质谱系统可以在生物基质中进行各种化合物的体外定量。本文提供的绩效数据仅是出于说明目的,可能不能代表实验室将获得的绩效。Thermo Fisher Scientific不建议使用其系统对本文描述的分析物进行分析。在单个实验室中的性能可能与由于因素,包括但不限于实验室方法,使用的材料,操作员技术和系统状况的因素可能不同。实验室有责任验证其打算在其设施中使用并遵守所有适用法律和政策的任何测定法。
探测DNA复制动力学的主要方法是DNA纤维分析,该分析利用胸苷类似物掺入新生的DNA中,然后将DNA纤维的免疫荧光显微镜检查。除了耗时且容易出现实验者偏见外,它不适用于研究线粒体或细菌中的DNA复制动力学,也不适合进行高通量分析。在这里,我们介绍了质谱 - 基于新生DNA(MS波段)的分析,作为DNA纤维分析的快速,无偏,定量的替代方案。在这种方法中,使用三重四极尖串联质谱法对胸苷类似物的结合进行定量。MS波段准确地检测到人类细胞的细胞核和线粒体以及细菌的DNA复制改变。在大肠杆菌DNA损伤诱导基因库中捕获的MS-BAND捕获的复制改变的高通量能力。因此,MS波段可以作为DNA纤维技术的替代方案,并具有对不同模型系统中复制动力学的高通量分析的潜力。
Thermo Scientific™ Element GD Plus™ GD-MS 重新定义了先进高纯度固态材料的分析。对于高通量和超低 ppb 级检测限,Element GD Plus GD-MS 是常规和研究应用中进行批量样品分析和深度剖析的最方便和最强大的工具。