对最近的人类基因组组装的比较分析突出了显著的序列差异,这种差异在着丝粒等多态性位点内达到顶峰。这引发了一个问题,即依赖人类参考基因组来准确分析来自实验细胞系的测序数据是否合适。在这里,我们提出了一种称为“同基因组参考”的新方法,该方法利用匹配的参考基因组进行多组学分析。我们为人类视网膜上皮细胞 (RPE-1) 生成了一个新的二倍体基因组组装,RPE-1 是一种广泛使用的非癌症实验室细胞系,具有稳定的二倍体核型,呈现出完全跨越着丝粒的分阶段单倍型和染色体水平支架。利用该组装体,我们表征了 RPE- 1 独有的单倍型解析基因组变异,包括一个稳定的标记染色体 X,其中 73.18 Mb 的 10 号染色体片段重复易位至该细胞系特有的微缺失端粒 t(X q ;10 q )。比较分析揭示了着丝粒区域内的序列多态性,包括所有染色体单倍型之间的意外遗传和表观遗传多样性。使用我们的组装体作为参考,我们重新分析了我们自己的和公开的 RPE-1 中生成的测序、甲基化和表观遗传数据,这些数据之前已使用非匹配和非二倍体参考基因组进行分析。我们的结果表明,同基因组参考可改善比对,将映射质量提高高达 85%,同时将错配减少一半,从而导致与着丝粒相关的峰调用发生显著变化。我们的工作代表了一个概念验证,展示了匹配的参考基因组在多组学分析中的应用,并在规模上为全面组装实验相关细胞系以广泛应用同基因组参考基因组奠定了基础。关键词:人类参考;二倍体基因组;从头组装;基因组参考;着丝粒组装;实验室细胞系;多组学分析;表观遗传学;人类多态性;实验细胞系;同基因组参考。
第三阶段/商业化,美国+欧盟:1 类或 2 类非关键组件的 CoA + 关键组件的 VE,+ 3 类的无菌性;容器的无菌性、完整性和内毒素,MOC 必须是 1 类或 2 类
我们感谢美国国际开发署资助的 Hariyo Ban 计划和塔库巴巴市政府在制定本指南过程中提供的资金和技术支持。我感谢市长 Ghan Narayan Shrestha、所有民选代表和塔库巴巴市各社区在起草定期发展计划期间提出的建议和反馈意见。他们的支持在整个过程中至关重要。专家 Prem Sagar Chapagain、Ram Chandra Lamichhane 和 Sanil Nepal 支持了该计划的制定。RECOFTC Nepal 的 Neeraj Katwal 制定并汇编了本指南,Hariyo Ban 计划的 Sandesh Hamal、Jaganath Joshi、Devraj Gautam、Gupta Bahadur KC 和 Kishwor Gandarva 帮助完成了本指南的定稿。我衷心感谢他们。特别感谢我们的外部审稿人 Hem Raj Lamichhane、客座编辑 Rahul Karki 和平面设计师 Sanjeeb Bir Bajracharya 在本指南的审核和定稿过程中提供的意见。
申请要求 满足草案批准条件后,请将以下材料转发给布鲁斯县规划部: • 填妥的申请表 1 份。 • 申请费,如当前申请费表所列,按开发阶段支付给“布鲁斯县财务主管”。 • 最终 M 计划必须附有测量员证书,列出计划中所有地块和街区的正面和面积。 • 最终分区计划印章或公寓描述印章必须在相应的表格上。请让您的测量员联系我们,以获取印章的适当措辞。 • 最终 M 计划或测量计划的 1 份电子副本,以 Esri 形状文件或地理数据库格式投影到 NAD83 UTM 区域 17N,以及一份 pdf 副本。(注意:不需要建筑和结构计划的数字副本); • 从审批机构收到的所有审批信函的副本。对于分区计划: