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使用 GAN 预测药物-靶标结合亲和力
药物与靶标之间相互作用的计算预测是药物发现领域的长期挑战。最先进的药物-靶标相互作用预测方法主要基于具有已知标签信息的监督机器学习。然而，在生物医学中，获取标记的训练数据是一个昂贵且费力的过程。本文提出了一种基于半监督生成对抗网络 (GAN) 的方法来预测结合亲和力。我们的方法包括两部分，两个用于特征提取的 GAN 和一个用于预测的回归网络。半监督机制使我们的模型能够学习标记和未标记数据的蛋白质药物特征。我们使用多个公共数据集评估我们方法的性能。实验结果表明，我们的方法在利用免费提供的未标记数据时实现了具有竞争力的性能。我们的结果表明，利用这种未标记数据可以大大帮助提高各种生物医学关系提取过程的性能，例如药物-靶标相互作用和蛋白质-蛋白质相互作用，特别是在这些任务中只有有限的标记数据可用时。据我们所知，这是第一个基于半监督 GAN 的预测结合亲和力的方法。
SLAMF7是多发性骨髓瘤治疗中有希望的免疫治疗靶标
摘要：多发性骨髓瘤（MM）是一种常见的血液性恶性肿瘤，它促进了几种新的治疗方法来对抗新诊断或复发的MM。虽然该领域在过去的20年中一直存在，但大多数患者将对这些治疗产生抗性，从而导致需要新的治疗靶标。slAMF7是多发性骨髓瘤中的一个有吸引力的治疗靶标，靶向SLAMF7的单克隆抗体在迄今为止在临床试验中显示出一致的好处结果。在这篇综述中，我们将重点关注SLAMF7的结构和调节及其作用机理。将审查最新的临床试验，以进一步了解临床意义并改善MM的预后。此外，将讨论抗Slamf7单克隆抗体与标准疗法和可能的抗抗性机制的效率。本综述旨在详细概述SLAMF7在MM患者和基本原理的病原体中的作用，以进一步研究与MM发育相关的SLAMF7介导的分子途径。
基于 AI 的 NLRP3 靶标蛋白质结构预测评估
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证下提供的（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2022 年 4 月 12 日发布。；https://doi.org/10.1101/2021.11.05.467381 doi：bioRxiv 预印本
基于 AI 的 NLRP3 靶标蛋白质结构预测评估
HD1 2.4 (1.4) 2.6 (1.5) 2.5 (1.5) 2.5 (1.5) 2.5 (1.4) WHD 3.2 (2.3) 3.2 (2.3) 3.3 (2.4) 3.2 (2.3) 3.2 (2.4) HD2 16.3 (15.8) 17.6 (17.2) 17.6 (17.6) 16.4 (16.0) 16.5 (16.0) LRR 7.9 (7.4) 8.2 (7.7) 8.2 (7.7) 8.2 (7.7) 8.1 (7.5) 全长 10.7 (10.2) 10.5 (9.9) 10.7 (10.2) 10.5 (9.9) 10.5（9.9）
肥大细胞作为靶标 - 对最近的治疗方法的全面综述
摘要：肥大细胞（MCS）是分布在几乎所有组织中的免疫细胞，主要是在皮肤中，靠近血管和淋巴管，神经，肺部和肠道。尽管MC对于健康的免疫反应至关重要，但它们的过度活动和病理状态可能导致许多健康危害。肥大细胞活性的副作用通常是由脱粒引起的。可以由免疫因子触发，例如免疫球蛋白，淋巴细胞或抗原 - 抗体复合物以及非免疫因子，例如辐射和病原体。肥大细胞的强烈反应甚至会导致过敏反应，这是最威胁生命的过敏反应之一。更重要的是，肥大细胞通过调节肿瘤生物学的各种事件（例如细胞增殖和生存，血管生成，侵袭性和转移）来在肿瘤微环境中发挥作用。肥大细胞作用的机制仍然很少了解，因此很难为其病理状况开发疗法。本综述着重于针对肥大细胞脱粒，过敏反应和MC衍生肿瘤的可能的疗法。
小儿急性淋巴细胞白血病新兴疗法 - 从靶标
摘要：在过去的40年中，小儿癌的5年 - 跨性别生存率达到75-80％，急性淋巴细胞白血病（全部）超过90％。白血病仍然是特定患者人群的死亡率和发病率的主要原因，包括婴儿，青少年和具有高风险遗传异常的患者。白血病治疗的未来需要在分子疗法以及免疫和细胞疗法上更好地计算。科学界面的进步自然导致了儿童癌症治疗的进步。这些发现涉及识别染色体异常的重要性，肿瘤基因的扩增，肿瘤抑制基因的像差以及细胞信号传导和细胞周期控制的失调。最近，在年轻患者的临床试验中，正在评估已经证明对复发/难治性有效的新型疗法。tirosine激酶抑制剂已成为pH+所有儿科患者的标准化治疗的一部分，而在临床试验中具有令人鼓舞的结果，在临床试验中获得了有希望的结果，并获得了FDA和EMA批准以用于儿童。此外，其他有针对性的疗法，例如Aurora-激酶抑制剂，MEK抑制剂和蛋白酶体抑制剂，还参与包括小儿患者在内的临床试验。这是从分子发现以及已在小儿种群中应用的新型白血病疗法的概述。
回顾创伤后应激障碍的新型药理学靶标
摘要：创伤后应激障碍（PTSD）是一种心理病理学疾病，具有异性临床图片，既复杂又充满挑战。其多方面的病理生理学仍然是一个尚未解决的问题，当然会促成这个问题。PTSD的药理治疗主要是经验，并以血清素能系统为中心。由于对靶向单个症状的处方药的治疗反应通常不一致，因此迫切需要对新型的致病假设，包括不同的介体和途径。本文被认为是叙事综述，目的是辩论当前对PTSD的药理学治疗，并进一步强调了未来药物的前瞻性靶标。作者访问了可用的科学文献的一些主要数据库，并选择了满足本工作目的的所有论文。结果表明，当前的大多数PTSD药理治疗是基于症状的，仅显示部分益处。这在很大程度上反映了其神经生物学的有限知识。尽管有限，但数据表明，下丘脑 - 肾上腺肾上腺轴，阿片类药物，谷氨酸，大麻素，催产素，神经肽Y和microRNA可能在PTSD的发展中起作用，并且可以用于新治疗。的确，最近的
控制缺氧诱导因子靶标搜索和结合动力学的机制
摘要 转录因子 (TF) 通常被认为是一种模块化结构，包含结构良好的序列特异性 DNA 结合结构域 (DBD) 与无序的激活结构域 (AD) 配对，后者负责靶向辅助因子或核心转录起始机制的蛋白质-蛋白质相互作用。然而，这种简单的分工模型无法解释为什么在体外确定的具有相同 DNA 结合序列特异性的 TF 在体内表现出不同的结合谱。缺氧诱导因子 (HIF) 家族提供了一个鲜明的例子：在几种癌症类型中异常表达的 HIF-1 α 和 HIF-2 α 亚基异构体在体外识别相同的 DNA 基序——缺氧反应元件 (HRE)——但在体内仅共享其靶基因的一个子集，同时在某些情况下对癌症的发展和进展产生对比的影响。为了探究介导异构体特异性基因调控的机制，我们使用活细胞单粒子追踪 (SPT) 来研究 HIF 核动力学及其在遗传扰动或药物治疗下的变化。我们发现 HIF-α 亚基及其二聚化伴侣 HIF-1β 表现出独特的扩散和结合特性，这些特性对浓度和亚基化学计量极为敏感。使用域交换变体、突变和 HIF-2α 特异性抑制剂，我们发现尽管 DBD 和二聚化域很重要，但染色质结合和扩散行为的另一个主要决定因素是含有 AD 的内在无序区域 (IDR)。使用 Cut&Run 和 RNA-seq 作为正交基因组方法，我们还证实了 IDR 依赖的 HIF 靶基因特定子集的结合和激活。这些发现揭示了 IDR 在调节 TF 搜索和结合过程中以前未被重视的作用，这有助于染色质上的功能性靶位点选择性。
设计师co -beta-肽共聚物选择性靶标...
si。Zhangyong，Li，J.，Ruan，L.，Reghu，S.，Ooi，Y.J.，Li，P.，Zhu，Y.，Hammond，P.T.，Verma，C.S.，Bazan，G.C.（2023）。设计师共β-肽共聚物选择性靶向抗性和生物膜革兰氏阴性细菌。生物材料，294，122004-。https://dx.doi.org/10.1016/j.biomaterials.2023.122004
癫痫簇的救援疗法：药理学和治疗靶标
摘要癫痫簇治疗的主要目标是停止簇，以避免发展到更严重的条件，例如长时间的癫痫发作和状态癫痫持续状态。救援疗法是癫痫簇患者的治疗计划的关键组成部分。在美国批准了三种救援疗法用于癫痫簇的治疗：地西epam直肠凝胶，咪达唑仑鼻喷雾剂和地西epam鼻喷雾剂。本综述是表征了癫痫簇的救援疗法的药理功能，并描述了γ-氨基丁酸A（GABA A）受体功能。GABA A受体是异源剂，主要由中枢神经系统中的α1-6，β1-3，γ2和δ亚基组成。这些亚基可以与膜传输以调节膜电位。苯二氮卓类药物，例如地西ep剂和咪达唑仑，是GABA A受体的阳性变构调节剂，其激活导致细胞内CHLO-骑行，细胞膜超极化的增加，并减少激发。GABA A受体亚基突变，运输失调和降解与癫痫有关。尽管苯二氮卓类药物是有效的GABA受体调节剂，但单个配方在实践中具有独特的曲线。地西epam直肠凝胶是癫痫发作的有效救援疗法