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细胞到患者的机器学习转移方法揭示了替代剪接变体中的新型基底样乳腺癌预后标记
背景：乳腺癌是全球女性死亡的十大原因之一。约 20% 的患者被误诊，导致早期转移、治疗耐药和复发。许多临床和基因表达谱已成功用于将乳腺肿瘤分为 5 种主要类型，这些类型具有不同的预后和对特定治疗的敏感性。不幸的是，这些谱未能将乳腺肿瘤细分为更多亚型，以提高诊断率和存活率。可变剪接正在成为一种新的高度特异性生物标志物来源，用于将肿瘤分为不同等级。利用乳腺癌细胞系 (CCLE) 和乳腺癌肿瘤 (TCGA) 中的大量公共转录组学数据集，我们已经解决了可变剪接变体对高度侵袭性乳腺癌进行细分的能力。
利用可重复、可解释的深度学习从神经影像数据中对阿尔茨海默病进行诊断、预后和亚型分析
HAL 是一个多学科开放存取档案库，用于存放和传播科学研究文献，无论这些文献是否已出版。这些文献可能来自法国或国外的教学和研究机构，也可能来自公共或私人研究中心。
循环肿瘤 DNA 景观和癌症患者获得性靶向治疗耐药性的预后影响：国家精准医学中心 (PRISM) 的一项研究
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儿童遭受虐待性头部创伤后神经系统预后不良的相关因素：一项多中心回顾性研究
背景：虐待性头部创伤 (AHT) 仍然是婴儿脑损伤的主要原因。目的：本研究旨在描述一组 AHT 患者并确定与不良神经系统结果相关的早期危险因素。参与者和环境：纳入儿科重症监护病房 (PICU) 疑似或确诊为 AHT 的 1 岁以下儿童。出院时和两年随访时通过儿科总体表现分类评分 (POPC) 评估神经系统结果。方法：进行了一项为期 8 年（从 2012 年 1 月至 2020 年 12 月）的多中心回顾性研究。结果：共纳入来自三个 PICU 的 117 名患者（平均年龄 4.3 (+/- 2.5) 个月，61% 为男孩）。共有 99 名（85%）患者完成了 2 年的随访。 61 名（52%）AHT 患儿在离开 ICU 和出院时 POPC（儿科总体表现类别）评分≥ 2（意味着他们至少有中度残疾），而 47 名（40%）AHT 患儿则分别有 41 名（44%）在 2 年随访中 POPC 评分≥ 2，其中包括 19 名（19%）严重残疾。主要的神经系统残疾是神经发育（38 例，35%）、多动症（36 例，33%）和癫痫（34 例，31%）。按照分层模型分析后，入院时心肺骤停和格拉斯哥昏迷评分低是神经系统预后不良的突出因素。结论：本研究强调了 AHT 儿童神经系统残疾范围广泛。早期和多学科随访对于限制神经系统残疾的影响至关重要。
LIV1 表达在早期乳腺癌及分子亚型中的预后和预测价值
摘要：背景：LIV1 是一种跨膜蛋白，通过开发抗体-药物偶联物 (ADC)，可能成为新的治疗靶点。关于临床乳腺癌 (BC) 样本中 LIV1 表达的评估研究很少。方法：我们分析了 8982 例原发性 BC 中的 LIV1 mRNA 表达。我们寻找 LIV1 表达与临床病理数据之间的相关性，包括无病生存期 (DFS)、总生存期 (OS)、病理化疗完全缓解 (pCR) 以及 BC 中使用或正在开发的抗癌药物的潜在脆弱性和可操作性。对整个人群和每个分子亚型分别进行分析。结果：在多变量分析中，LIV1 表达与良好的预后特征以及更长的 DFS 和 OS 相关。然而，在蒽环类新辅助化疗后，高 LIV1 表达患者的 pCR 率低于低表达患者，包括在根据等级和分子亚型调整的多变量分析中。 LIV1 - 高肿瘤对激素疗法和 CDK4/6 抑制剂敏感的概率较高，对免疫检查点抑制剂和 PARP 抑制剂敏感的概率较低。单独分析时，这些观察结果根据分子亚型而不同。结论：这些结果可能通过确定每种分子亚型中 LIV1 表达的预后和预测价值以及对其他全身疗法的相关脆弱性，为 LIV1 靶向 ADC 的临床开发和使用提供新的见解。
危险因素和长期预后，用于共同感染无结核分枝杆菌肺疾病和慢性肺曲霉菌病：日本的多中心观察性研究
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研究论文 宫颈癌术后放疗后循环淋巴细胞亚群的预后价值
背景与目的：循环淋巴细胞亚群对接受术后放疗的宫颈癌患者的预后价值尚不明确。本研究旨在探讨这些淋巴细胞亚群对该患者群体的预后意义。方法：采集101例宫颈癌患者术后放疗前的外周血样本。采用流式细胞术确定淋巴细胞亚群的比例和绝对计数，包括总T细胞、CD4+ T细胞、CD8+ T细胞、自然杀伤（NK）细胞和B细胞。采用Kaplan-Meier方法和Cox回归分析估计总生存期（OS）并确定关键的预后因素。生成受试者工作特征（ROC）曲线以评估预测准确性。结果：生存分析显示，与NK细胞水平较高的患者相比，NK细胞比例降低（P = 0.02）或NK细胞计数减少（P = 0.01）的患者的总生存期（OS）明显较差。单因素Cox分析显示，NK细胞比例（P=0.025；HR，0.33；95%CI，0.12～0.87）和NK细胞计数（P=0.015；HR=0.28）均显著影响OS。多因素分析显示，CD4+T细胞比例（P=0.02；HR，0.08；95%CI，0.01～0.72）和NK细胞计数（P=0.08；HR，0.11；95%CI，0.01～1.37）为独立的预后因素。NK细胞计数预测1、2、3年生存率的ROC曲线下面积（AUC）分别为0.66、0.76、0.68。与早期诊断的患者（特别是 IB3 和 IIA 期）相比，IIIC1 期患者的 NK 细胞绝对计数和比例均显著降低。结论：我们的研究发现，治疗前的循环 NK 细胞计数和比例水平可作为接受术后放疗的宫颈癌患者的有希望的预后生物标志物
脾肿大在BCMA指导中的预后含义
保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。永久性。预印本（未经Peer Review认证）是作者/资助者，他已授予Medrxiv的许可证，以在2025年2月2日发布的此版本中显示在版权所有者中。 https://doi.org/10.1101/2025.01.31.25321490 doi：medrxiv preprint
FGFR2 在 ER 阳性乳腺癌中的预后价值是……
简介：成纤维细胞生长因子受体 2 (FGFR2) 激活与腔内乳腺癌 (BC) 的内分泌治疗耐药性有关，但临床证据仍不一致。鉴于 FGFR 在介导肿瘤微环境 (TME) 相互作用中的作用，FGFR2 的预后价值可能取决于基质成分。本研究旨在验证雌激素受体阳性浸润性导管癌 (IDC) 中基质的 FGFR 相关特征与 FGFR2 预后价值之间的关联。材料和方法：计算机基因表达分析确定了 12 种基质因子（ FAP 、 CXCL12 、 PDG- FRA 、 COL1A1 、 HSPG2 、 CCL2 、 MMP14 、 S100A4 、 MMP9 、 PDGFA 、 MCAM 、 IL6 ），形成了“基质的 FGFR 相关谱”。分析了来自癌症基因组图谱 (TCGA) 的 257 名 ER+ IDC 患者队列。根据基质基因表达使用 k 均值对肿瘤进行聚类，并使用 Cox 比例风险回归模型评估 FGFR2 与总体生存期 (OS) 之间的关联。结果：根据基质基因表达谱确定了两组 ER+ IDC 肿瘤。虽然这两个簇具有相似的肿瘤分期和激素受体状态，但针对临床因素进行的多变量分析显示，FGFR2 表达与簇分配之间存在显著关联。在簇 I（基质基因高表达）中，高 FGFR2 与预后不良相关，而在簇 II（低表达）中，高 FGFR2 表示预后良好。FGFR1、FGFR3 和 FGFR4 没有显示出显著的预后价值。结论：基质谱调节 FGFR2 在管腔乳腺癌中的预后意义，强调 TME 谱对生物标志物评估的重要性并解释 FGFR2 研究中的不一致之处。
eIF4A1 是人类肝细胞癌的预后标志物和可操作靶点
摘要：肝细胞癌 (HCC) 是一种原发性肝脏肿瘤，死亡率高，全球发病率不断上升。虽然肿瘤切除或肝移植在疾病早期有效，但晚期 HCC 的治疗选择仍然有限，且益处是暂时的。因此，迫切需要新的治疗靶点和更有效的治疗方法来对抗这种致命的癌症。在这里，我们研究了真核起始因子 4A1 (eIF4A1) 在这种肿瘤类型中的致病和治疗作用。我们观察到与非肿瘤周围肝组织相比，HCC 病变中 eIF4A1 持续上调。此外，eIF4A1 水平与 HCC 患者的预后呈负相关。在 HCC 系中，暴露于各种 eIF4A 抑制剂会引发增殖显著下降和细胞凋亡增强，同时抑制几种致癌途径。值得注意的是，eIF4A1 抑制剂在纳摩尔浓度下即可达到抗生长效果，同时使用泛 mTOR 抑制剂 Rapalink-1 可进一步增强抗生长效果。总之，我们的研究结果强调了 eIF4A1 在 HCC 中的致病相关性，并建议进一步评估基于 eIF4A 和 mTOR 抑制剂的药物组合在治疗这种侵袭性肿瘤方面的潜在用途。