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鉴定 SARS-CoV-2 的 3CLpro 的先导抑制剂......
(IC50) 值是从欧洲化学分子生物学实验室 (CHEMBL) 数据库中检索到的。18 下载数据后，我们过滤掉缺少 IC50 值的 SMILES 条目，只保留以纳摩尔 (nM) 为单位测量的生物活性条目，并删除重复的分子，得到 744 个数据点。由于 IC50 值的尺度各不相同，它们被转换成相应的负对数，称为 pIC50 值。此阶段使用 P zer 规则，也称为 Lipinski 五规则 (RO5)，根据药物相似性过滤数据。19,20 满足大多数 Ro5 参数并不能确保化合物会成为药物；它仅表示药物相似性并有助于在临床前阶段淘汰较弱的化合物。我们使用应用 RO5 过滤器后剩余的 659 个数据点来训练模型。图 2 显示了数据集中 RO5 域内或域外的化合物的蜘蛛图。
随着酶促活性扩展的合成CRISPR-CAS核酸酶
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。它是制作
发现CMX990：有效的SARS-COV-2 3CL蛋白酶抑制剂带有新型的共价弹头
1 4.4 N.D. N.D. 72 99.3 147.7 31.8 A- <1 a -2 3.3 14.8 n.d. 54 93.4 1109.4 47.6 a，b 50.3 1.3 a，b 1.5 3 2.8 76.3 133 133 17 7.6 173 19.3 99 39.8 34.2 45.1 38.8 25.2 21.6 7 2.6 24.0 n.d. 117 54.8 62.2-36.2 - 8 3.0 34.7 n.d. 61 43.5 26.2 53.2 C -51.3 C -9 2.0 36.5 n.d. 108 58.8 16.3-40.3--10 1.3 35.4 n.d. 346 <1 12.8 71.0 11.7 7.2 28.0 11 28.0 11 2.0 34.5 50.8 62 31.7 8.4 35.6 C 51.8 35.3 C 35.3 C 35.7 12 1.0 33.7 20.7 20.5 24 47.3 17.4 11.4 11.1 C 56.9 20.7 C 56.9 20.7 C 25.7 C 25.0 13 3.6 34.8 34.8 13 3.6 34.8 13 3.6 34.8 14 38 14 38 38 38 38 38 67.5 67.5 67.5 67.5 67.5 67.5 67.5 17.5 67.5 67.5 67.5 67.5 67.5 17.5 19.c. 15.0 2.4 35.3 14 2.0 60.1 51.8 138 34.3 12.2 107 18.4 19.0 48.7 15 0.3 15 0.3 160 N.D. 245 51.8 13.0 N.C. A 23.3 4.6 A 37.7 16 2.6 22.0 n.d. 50 50.1 14.9 19.3 c 23.7 10.2 c 57.2 CMX990 2.3 23.4 9.6 101 56.3 7.5 125 23.0 14.5 52.8 Nirmatrelvir 1.5 28.1 44.8 148 54.8 21.8 35.8 1.92 53.5 68.7 PF-00835231 1.2 101 81.4 630 77.2 13.9 86.4-1.0- a =仓鼠，B =近距离类似物的数据，C =大鼠EC 90 = 90％有效浓度，Cl int =固有清除率，Clp =血浆清除率，F =生物利用度，HLM =人肝微染色体，HPPB = HPPB = HUMEN PLASMA蛋白质结合，IV = IV = IV = inv = intravenos，iv = intravenous，n. n。 =未确定，N.C。 =未计算，po = per per os（oral）1 4.4 N.D. N.D. 72 99.3 147.7 31.8 A- <1 a -2 3.3 14.8 n.d. 54 93.4 1109.4 47.6 a，b 50.3 1.3 a，b 1.5 3 2.8 76.3 133 133 17 7.6 173 19.3 99 39.8 34.2 45.1 38.8 25.2 21.6 7 2.6 24.0 n.d. 117 54.8 62.2-36.2 - 8 3.0 34.7 n.d. 61 43.5 26.2 53.2 C -51.3 C -9 2.0 36.5 n.d. 108 58.8 16.3-40.3--10 1.3 35.4 n.d. 346 <1 12.8 71.0 11.7 7.2 28.0 11 28.0 11 2.0 34.5 50.8 62 31.7 8.4 35.6 C 51.8 35.3 C 35.3 C 35.7 12 1.0 33.7 20.7 20.5 24 47.3 17.4 11.4 11.1 C 56.9 20.7 C 56.9 20.7 C 25.7 C 25.0 13 3.6 34.8 34.8 13 3.6 34.8 13 3.6 34.8 14 38 14 38 38 38 38 38 67.5 67.5 67.5 67.5 67.5 67.5 67.5 17.5 67.5 67.5 67.5 67.5 67.5 17.5 19.c. 15.0 2.4 35.3 14 2.0 60.1 51.8 138 34.3 12.2 107 18.4 19.0 48.7 15 0.3 15 0.3 160 N.D. 245 51.8 13.0 N.C. A 23.3 4.6 A 37.7 16 2.6 22.0 n.d. 50 50.1 14.9 19.3 c 23.7 10.2 c 57.2 CMX990 2.3 23.4 9.6 101 56.3 7.5 125 23.0 14.5 52.8 Nirmatrelvir 1.5 28.1 44.8 148 54.8 21.8 35.8 1.92 53.5 68.7 PF-00835231 1.2 101 81.4 630 77.2 13.9 86.4-1.0- a =仓鼠，B =近距离类似物的数据，C =大鼠EC 90 = 90％有效浓度，Cl int =固有清除率，Clp =血浆清除率，F =生物利用度，HLM =人肝微染色体，HPPB = HPPB = HUMEN PLASMA蛋白质结合，IV = IV = IV = inv = intravenos，iv = intravenous，n. n。 =未确定，N.C。 =未计算，po = per per os（oral）
提高草草的非生物胁迫耐受性
有几种针对SARS-COV-2的抗病毒药已批准或正在开发中。这些可以分类为单克隆抗体（mAb）或旨在干扰病毒复制的小分子。4当前，mAb需要在医院环境中给药，并且由于它们靶向S蛋白，因此它们可能会失去临床功效，如Omicron变体所观察到的那样。4，5与疫苗和mAb不同，口服抗病毒是直接作用，并且不容易受到病毒突变的影响和S蛋白的变化。口服治疗剂批准使用或显示潜力的靶向病毒RNA依赖性RNA聚合酶（RDRP）或3C样蛋白酶。 临床开发的药物包括靶向3Cl蛋白酶的莫纳皮拉维尔，靶向RDRP和Nirmatrelvir。 6 - 8 molnupiravir是抗病毒核苷酸类似物的前药形式，β -d -n 4-羟基胞丁胺（NHC）。 另一种针对RDRP的药物是Remdesivir，Remdesivir是一种核苷酸ANA Logue前药，最初是为治疗埃博拉病毒感染个体而开发的。口服治疗剂批准使用或显示潜力的靶向病毒RNA依赖性RNA聚合酶（RDRP）或3C样蛋白酶。临床开发的药物包括靶向3Cl蛋白酶的莫纳皮拉维尔，靶向RDRP和Nirmatrelvir。6 - 8 molnupiravir是抗病毒核苷酸类似物的前药形式，β -d -n 4-羟基胞丁胺（NHC）。另一种针对RDRP的药物是Remdesivir，Remdesivir是一种核苷酸ANA Logue前药，最初是为治疗埃博拉病毒感染个体而开发的。