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严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 或 SARS-CoV-2 是一种属于冠状病毒科的病毒。这类病毒通常会引起感冒,但具有巨大的致病潜力。在人类中,由 SARS-CoV 病毒引起的 SARS 疫情于 2003 年首次报道,随后 2012 年,中东呼吸综合征冠状病毒 (MERS-CoV) 导致中东呼吸综合征 (MERS) 疫情爆发。此外,COVID-19 是一个严重的社会经济和全球健康问题,已夺走了 400 多万人的生命。迄今为止,只有少数几种治疗方法可以对抗这种疾病,而且只有一种直接作用的抗病毒药物,即有条件批准的瑞德西韦。由于迫切需要针对 SARS-CoV-2 的有效药物,药物再利用策略是实现这一目标的最快方法之一。进行了一项使用两种方法的计算机模拟药物再利用研究。对 FDA 批准的 SARS-CoV-2 主蛋白酶药物数据库进行了基于结构的虚拟筛选,并确定了 11 种具有已知 3CL pro 活性的得分最高的化合物,同时使用该方法报告了另外 11 种潜在的全新 3CL pro 抑制剂。然后,对整个病毒蛋白数据库以及冠状病毒科蛋白子集进行逆分子对接,以详细检查命中化合物。不是进行靶向筛选,而是为每种命中化合物以及作为对照的五种最常报告和直接作用的再利用药物生成逆对接指纹。通过这种方式,检查和比较了靶向命中空间,我们可以支持对所有 11 种新报告的 SARS-CoV-2 3CL pro 命中化合物进行进一步的生物学评估,并建议对抗蠕虫类成员化合物进行进一步的深入研究。作者承认该方法对于未来成熟的逆对接指纹筛选具有普遍的实用性。

利用逆对接指纹重新利用 SARS-CoV-2 药物

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