已发现有 50 多个蛋白质家族可抑制 CRISPR(成簇的规律间隔的短回文重复序列)-Cas 介导的适应性免疫系统。在本文中,我们分析了可用的抗 CRISPR(Acr)结构,并描述了 CRISPR-Cas 的化学计量和酶抑制剂的共同主题和独特机制。化学计量抑制剂通常充当蛋白质结合伴侣或核酸靶标的分子诱饵,而酶抑制剂则共价修饰 Cas 核糖核蛋白复合物或降解免疫信号分子。我们回顾了 Acrs 结构揭示的机制见解,讨论了与每种策略相关的一些权衡,并强调了 Acrs 在克服适应性免疫的竞赛中是如何受到调节和部署的。
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Prokaryotic CRISPR–Cas immunity is subverted by anti-CRISPRs (Acrs), which inhibit Cas protein activities when expressed during the phage lytic cycle or from resident prophages or plasmids 1 . Acrs often bind to specific cognate Cas proteins, and hence inhibition is typically limited to a single CRISPR–Cas subtype 2 . Furthermore, although acr genes are frequently organized together in phage- associated gene clusters 3 , how such inhibitors initially evolve has remained unclear. Here we investigated the Acr content and inhibition specificity of diverse Listeria isolates, which naturally harbour four CRISPR–Cas systems (types I-B, II-A, II-C and VI-A). We observed widespread antagonism of CRISPR, which we traced to 11 previously unknown and 4 known acr gene families encoded by endogenous mobile elements. Among these were two Acrs that possess sequence homology to type I-B Cas proteins, one of which assembles into a defective interference complex. Surprisingly, an additional type I-B Cas homologue did not affect type I immunity, but instead inhibited the RNA-targeting type VI CRISPR system by means of CRISPR RNA (crRNA) degradation. By probing viral sequence databases, we detected abundant orphan cas genes located within putative anti-defence gene clusters. Among them, we verified the activity of a particularly broad-spectrum cas3 homologue that inhibits type I-B, II-A and VI-A CRISPR immunity. Our observations provide direct evidence of Acr evolution by cas gene co-option, and new genes with potential for broad-spectrum control of genome editing technologies.
1999 年获得设计认证(有效期 15 年) 7 年内 110 人年的 NRC 审查工作,耗资 3000 万美元 回答了 7400 多个问题,380 多个 NRC 会议,43 个 ACRS 会议 AP1000 设计认证 成本 9 亿美元 2002 年向 NRC 提交许可信息(DCD、PRA) 2005 年获得设计认证(有效期 15 年) 2011 年 6 月提交了第 19 版设计 2011 年 12 月批准了最终修订 摘自 AP1000 概述,Chuck Brockhoff,ASME O&M 委员会会议,2007 年
在附件 1 中,核管理委员会工作人员讨论了 42 个与进化型轻水反应堆、被动型轻水反应堆或两者有关的技术和政策问题。工作人员此前在委员会文件草案《进化型和被动型轻水反应堆问题及其与当前监管要求的关系》(日期为 1992 年 2 月 20 日)和《设计认证许可政策问题》(日期为 1992 年 6 月 25 日)中确定了这些问题。在考虑了反应堆保障咨询委员会 (ACRS)、行业和供应商的意见后,工作人员已就许多问题达成最终立场,并强调了其请求委员会批准的立场。工作人员还讨论了其他问题,
CRISPR-Cas 适应性免疫系统保护细菌和古细菌免受入侵的遗传寄生虫(包括噬菌体/病毒和质粒)的侵害。为了应对这种免疫力,许多噬菌体都具有抑制 CRISPR-Cas 靶向的抗 CRISPR (Acr) 蛋白。迄今为止,抗 CRISPR 基因主要在噬菌体或原噬菌体基因组中发现。在这里,我们使用李斯特菌 acrIIA1 基因作为标记,发现了厚壁菌中存在的质粒和其他接合元件上的 acr 基因座。在李斯特菌、肠球菌、链球菌和葡萄球菌基因组中发现的四个已识别基因可以抑制 II-A 型 SpyCas9 或 SauCas9,因此被命名为 acrIIA16-19。在粪肠球菌中,Cas9 靶向质粒的结合通过源自肠球菌结合元件的抗 CRISPR 得到增强,凸显了 Acrs 在质粒传播中的作用。相互共免疫沉淀表明,每个 Acr 蛋白
PITTING 行动是英国 70 多年来规模最大的军事撤离行动,约 15,000 人得以离开阿富汗并安全撤离。在 PITTING 行动期间,外交、联邦和发展办公室 (FCDO)、内政部和国防部 (MoD) 迅速开展工作,除了阿富汗重新安置和援助政策 (ARAP) 特遣队和英国国民外,我们还能够“召集”一些人进行撤离。这些人被确定为特别危险。他们包括女性政治家、LGBT+ 社区成员、妇女权利活动家和法官。这群人构成了 ACRS 的途径 1。由于撤离速度快和喀布尔机场周围的混乱,一些撤离人员与直系亲属失散。阿富汗重新安置和移民政策声明 (ARIP) 规定,已确定符合条件的个人的配偶、伴侣和 18 岁以下的受抚养子女
学龄前儿童中的ADHD症状对社会发展有影响,尤其是社会能力。学龄前儿童中的ADHD症状将增加对立的行为和同龄人的行为问题,从而使儿童难以结交朋友并建立健康的关系。早期发现多动症风险很重要,但是学龄前儿童的ADHD风险的情况仍然不为人知。本研究旨在获得东爪哇幼儿儿童的多动症症状的描述。这项研究使用了描述性定量研究,样本量为202名学龄前儿童。检测ADHD风险的仪器是缩写的Conners评级量表(ACRS)。使用单变量分析分析了数据结果。数据分析的结果表明,有30%(202名)学龄前儿童患有多动症风险。最常见的ADHD症状是不懈或活动过多。这些发现表明,ADHD风险检测需要在学前班水平上注意。
细菌CRISPR-CAS系统采用RNA引导的核酸酶破坏噬菌体(病毒)DNA。噬菌体反过来又进化了多样化的“抗Crispr”蛋白(ACR)以抵消获得的免疫力。在单核细胞增生李斯特菌中,预言编码2-3个不同的抗Cas9蛋白,始终存在Acriia1。但是,Acriia1s普遍存在及其机制的重要性尚不清楚。在这里,我们报告了AcriiA1通过催化HNH结构域与Cas9高亲和力结合。在李斯特菌的裂解过程中,Acriia1触发Cas9降解,但在裂解感染期间,由于其多步灭活机制,Acriia1无法阻止Cas9。因此,噬菌体需要额外的ACR,以迅速结合并灭活Cas9。acriia1还唯一地抑制了在李斯特菌(类似于saucas9)和II-C型Cas9中发现的高度差异Cas9,这可能是由于Cas9 HNH域的保护。总而言之,李斯特菌噬菌体在裂解生长中灭活cas9
DOI:https://doi.org/10.22271/j.ento.2020.v8.i6n.7968 摘要 成簇的规律间隔的短回文重复序列 (CRISPR)-Cas 系统是一种序列特异性的适应性免疫策略,广泛存在于原核生物系统中,赋予针对各种噬菌体和其他 MGE(如质粒、基因组岛、整合和接合元件)的先天免疫力。即使存在如此复杂的机制,细菌也并非总是能完全战胜噬菌体。这是由于噬菌体和其他 MGE 产生的抗 CRISPR 蛋白。自 2013 年发现以来,迄今为止已鉴定出 60 多个 Acr 家族,还有更多家族尚待发现。研究揭示了 Acrs 采用的多种机制,通过这些机制介导对 CRISPR 防御系统的控制。随着该领域的发展,Acrs 可作为 CRISPR-Cas 技术的潜在控制策略。在本综述中,我们重点介绍了各种抗 CRISPR 蛋白的发现、它们对抗细菌 CRISPR-Cas 系统的作用机制,以及 Acrs 在基因编辑和基因治疗技术中的潜在应用。 关键词:抗 CRISPR、噬菌体、Cas 蛋白、CRISPR、基因组编辑 简介 噬菌体和细菌已经战争了数百万年,噬菌体控制着细菌种群的数量和组成。为了对抗来自噬菌体的这种持续威胁,细菌进化出了非常多样化的防御策略,将检查点设置在噬菌体生命周期的各个阶段。这包括阻断噬菌体附着、抑制 DNA 进入、开发限制-修饰系统、流产感染系统 (Abi) 和干扰噬菌体组装 [1] 。除了上述策略外,细菌还进化出了一种称为 CRISPR Cas 的序列特异性适应性免疫策略 [2] 。 CRISPR 阵列是有关先前感染细菌细胞的噬菌体的数据仓库。Cas 蛋白与 CRISPR 阵列一起构成了这种 RNA 引导的核酸酶复合物。宿主细胞借助称为原间隔区相邻部分 (PAM) 的短序列区分自身 DNA 和入侵的外来移动遗传元件的 DNA [3] 。作为适应性免疫的一部分,所有系统都通过三个主要阶段发挥作用:适应或间隔区获取、表达或生物发生以及干扰阶段。在第一阶段,Cas1-Cas2 复合物识别 PAM 并切除目标 DNA 的一小部分(称为原间隔区),然后将其作为间隔区序列整合到 CRISPR 基因座中。其他辅助因子(如 Cas4、Cas1、Csn2 和逆转录酶 (RT))也可以参与获取阶段。在下一个阶段,CRISPR 基因座转录为单个前 crRNA,然后加工成成熟的 CRISPR RNA (crRNA) [4] 。每个 crRNA 包含部分侧翼重复序列和间隔序列。在干扰阶段,crRNA 与 Cas 蛋白一起被招募以形成核糖核蛋白复合物,该复合物继续在细胞中寻找与 crRNA 间隔序列的任何匹配。如果发现,则根据 CRISPR Cas 系统的类别,通过招募新蛋白质或在复合物本身内激活来启动核酸酶活性。CRISPR-Cas 系统分为两类、六种类型和 30 多个亚型 [5, 6, 7]。第 1 类 CRISPR Cas 系统包括 I、III 和 IV 型,并使用多亚基 Cas 效应分子形成级联复合物。而在第 2 类系统(II、V 和 VI 型)中,靶标识别、结合和切割功能由单个效应蛋白执行。由于这种高度多样化和高效的机制,CRISPR Cas 系统不仅可以保护细菌免受噬菌体的侵害,还可以保护细菌免受其他移动遗传元件 (MGE) 的侵害,如质粒、基因组岛、整合元件和接合元件 [8]。