描述:重组人全长ADAR1(腺苷脱氨酶,RNA特异性1)转录本1,包含氨基酸2-1226(END)。该蛋白质包含感兴趣的突变E1008Q。此构造包含一个N末端标记标签。重组蛋白具有亲和力纯化。背景:ADAR1(腺苷脱氨酶,RNA特异性1)对RNA中的腺苷进行腺苷进行腺苷,尤其是针对位于特定茎环基序结构中的腺苷。有人提出,ADAR进化为为转录组提供额外的多样性,而大多数ADAR编辑事件发生在非编码RNA中,但其中一些(包括规范GLUA2编辑位点)改变了编码蛋白的氨基酸序列。adar1通过缓解干扰素信号传导在先天免疫中起作用。ADAR1功能障碍会导致自身免疫性疾病,并影响癌细胞的生长和增殖以及对免疫疗法的肿瘤反应。由于ADAR识别双链RNA,因此抑制或修饰RNA病毒的功能也起作用。因此,它与病毒进化和病毒变体(例如SARS-COV-2变体)的出现有关。已经提出了ADAR1的E1008Q突变体比其野生型具有更高的编辑活性,其突变存在于蛋白质的脱氨酶结构域中的高度保守的谷氨酸盐中。物种:人类结构:ADAR1(E1008Q)(FLAG-2-1226(END))浓度:0.39 mg/ml表达系统:HEK293纯度:80%格式:水缓冲液溶液。MW:137 KDA GenBank登录:NM_001111稳定性:-80°C至少6个月。以:50 mM Tris-HCl,pH 8.0、750 mm NaCl,0.01%Triton X-100、10%甘油和100μg/ml的FLAG肽。存储:-80°C使用的说明:在冰上解冻,并在使用前轻轻混合。不要涡旋。在打开前进行快速旋转。等分的小容量,然后闪烁冻结以进行长期存储。避免多个冻结/解冻周期。测定条件:根据ADAR1:RNA TR-FRET分析套件(#82252)进行测定,具有不同量的ADAR1(E1008Q),FLAG-TAG重组(#102535)。应用程序:
作用于 RNA ADAR1 的腺苷脱氨酶促进双链和结构化 RNA 中的 A 到 I 转换。ADAR1 有两种异构体,它们从不同的启动子转录:细胞质 ADAR1p150 是干扰素诱导的,而 ADAR1p110 是组成性表达的,主要位于细胞核中。ADAR1 突变会导致艾卡迪-戈蒂埃综合征 (AGS),这是一种与异常 IFN 产生相关的严重自身炎症疾病。在小鼠中,ADAR1 或 p150 异构体的缺失会导致胚胎死亡,这是由干扰素刺激基因的过度表达引起的。这种表型通过删除细胞质 dsRNA 传感器 MDA5 得到挽救,表明 p150 同工型是不可或缺的,不能被 ADAR1p110 挽救。尽管如此,ADAR1p150 唯一针对的编辑位点仍然难以捉摸。在这里,通过将 ADAR1 同工型转染到无 ADAR 的小鼠细胞中,我们检测到了同工型特异性的编辑模式。使用突变的 ADAR 变体,我们测试了细胞内定位和 Z-DNA 结合域的存在如何影响编辑偏好。这些数据表明 ZBD 对 p150 编辑特异性的贡献很小,而同工型特异性编辑主要由 ADAR1 同工型的细胞内定位指导。我们的研究通过对异位表达标记 ADAR1 同工型的人类细胞的 RIP-seq 进行补充。两个数据集均表明 ADAR1p110 富集了内含子编辑和结合,而 ADAR1p150 优先结合和编辑 3'UTR。
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等,2020 年; Heraud-Farlow 等人,2017 年; Li 等,2017; Liddicoat 等人,2015 年; Mannion 等人,2014;佩斯塔尔和
RNA 传感信号通路作为先天免疫的重要抗病毒机制已被深入研究。然而,它在未感染细胞中的作用尚未彻底确定。在这里,我们证明 RNA 传感信号通路也对内皮细胞 (EC) 中的内源性细胞 RNA 有反应,并且该反应受 RNA 编辑酶 ADAR1 调控。细胞 RNA 测序分析表明,EC RNA 经历广泛的 RNA 编辑,尤其是在短散在核元件的 RNA 转录本中。EC 特异性删除 ADAR1 显著降低了短散在核元件 RNA 的编辑水平,导致小鼠新生儿死亡,多个器官出现明显损伤。全基因组基因表达分析揭示了显著的先天免疫激活,干扰素刺激基因的表达显著升高。然而,通过删除细胞 RNA 受体 MDA-5 来阻断 RNA 传感信号通路,可阻止干扰素刺激的基因表达,并使新生小鼠免于死亡。这一证据表明 RNA 编辑/RNA 传感信号通路显著调节 EC 功能,代表了调节 EC 功能的一种新分子机制。
心血管疾病(CVD)是一类对全球健康有重大影响并是导致死亡的主要原因的疾病。核糖核酸(RNA)中大量的化学碱基修饰与心血管疾病相关。细胞中存在着各种各样的核糖核酸修饰,其中腺苷脱氨酶依赖性修饰是最常见的核糖核酸修饰之一。作用于核糖核酸的腺苷脱氨酶1(Adenosine deaminase acting on RNA 1)是一种广泛表达的双链核糖核酸腺苷脱氨酶,它通过催化腺苷在目标核糖核酸的特定位点脱氨形成肌苷(A-to-I)。本综述对腺苷脱氨酶RNA-1的结构进行了全面的概述,并总结了ADAR1介导的核糖核酸编辑在心血管疾病中的调控机制,表明腺苷脱氨酶RNA-1是心血管疾病的一个有希望的治疗靶点。
简介胶质母细胞瘤 (GBM;世界卫生组织 IV 级胶质瘤) 是成人中最常见、最具侵袭性的原发性恶性脑肿瘤 (1)。尽管进行了最大限度的手术切除,然后进行放化疗和辅助化疗,GBM 仍然普遍致命 (2-4)。GBM 表现出显著的细胞异质性,含有干细胞样 GBM 干细胞 (GSC;也称为脑肿瘤起始细胞),导致治疗耐药性和快速复发 (5-8)。与非干细胞或分化 GBM 细胞 (DGC) 相比,GSC 表达干细胞标志物,在无血清条件下产生球体,并在体内快速形成肿瘤 (9, 10)。体细胞突变导致 GBM 的发生和发展,但精准医疗迄今为止在其治疗中取得的成功有限 (11, 12)。表观遗传改变也可能促进神经胶质瘤的形成,从而提供治疗靶点(13-15)。肿瘤生物学的一个最新进展是将改变的 A-to-I RNA 编辑归因于多种致瘤途径(16,17)。在哺乳动物中,RNA 编辑会改变表达 RNA 的转录序列,而不会影响 DNA 序列(18-20)。A-to-I RNA 编辑由 ADAR(作用于 RNA 的腺苷脱氨酶)催化,是哺乳动物中最常见的 RNA 编辑事件,超过 85% 的 RNA 可能在编码和/或非编码区域进行编辑(19,21)。三种酶在 A-to-I RNA 编辑中起着重要作用。
作用于 RNA 1 的腺苷脱氨酶 (ADAR1) 是一种负责腺苷到肌苷 RNA 编辑的酶,由两种亚型组成:核 p110 和细胞质 p150。小鼠中 Adar1 或 Adar1 p150 基因的缺失会导致胚胎致死,并伴有干扰素刺激基因 (ISG) 的过表达,这是由于黑色素瘤分化相关蛋白 5 (MDA5) 对未编辑的内源转录本的异常识别所致。然而,在众多 RNA 编辑位点中,有多少 RNA 位点需要编辑,尤其是由 ADAR1 p150 编辑,以避免 MDA5 激活,以及 ADAR1 p110 是否有助于此功能仍不清楚。具体来说,ADAR1 p110 在小鼠脑中含量丰富,而 ADAR1 p150 的表达量微乎其微,而 ADAR1 突变会导致艾卡迪-痛风综合征,在这种综合征中,大脑是受影响最严重的器官之一,同时伴有 ISG 表达升高。因此,了解 RNA 编辑介导的预防大脑中 MDA5 活化的方法尤为重要。在这里,我们建立了 Adar1 p110 特异性敲除小鼠,在这种小鼠中未观察到 ISG 表达上调。这一结果表明 ADAR1 p150 介导的 RNA 编辑足以抑制 MDA5 活化。因此,我们进一步创建了 Adar1 p110 / Adar2 双敲除小鼠来确定 ADAR1 p150 介导的编辑位点。这项分析表明,尽管没有观察到 ISG 表达升高,但在 Adar1 p110 / Adar2 双敲除小鼠的大脑中,只有不到 2% 的编辑位点得以保留。值得注意的是,我们发现一些位点被高度编辑,与野生型小鼠的编辑位点相当,这表明存在 ADAR1 p150 特异性位点。这些数据表明,在非常有限的位点上进行 RNA 编辑(由少量 ADAR1 p150 介导)足以阻止 MDA5 激活,至少在小鼠大脑中是如此。
摘要 弥漫性大 B 细胞淋巴瘤 (DLBCL) 是最常见的侵袭性淋巴系统恶性肿瘤之一。在这里,我们探讨了 RNA 编辑对 DLBCL 发病机制的贡献。我们观察到 DNA 突变和 RNA 编辑事件通常是互相排斥的,这表明肿瘤可以通过改变基因组或转录组水平的序列来调节通路结果。RNA 编辑靶向已知疾病驱动通路内的转录本,例如细胞凋亡、p53 和 NF-k B 信号传导以及 RIG-I 样通路。在这种情况下,我们表明 ADAR1 介导的 MAVS 转录本内的编辑与 MAVS 蛋白表达水平呈正相关,并与干扰素/NF-k B 信号传导增加和 T 细胞耗竭有关。最后,使用靶向 RNA 碱基编辑工具恢复 ADAR1 缺陷细胞中 MAVS 3 0 UTR 内的编辑,我们证明在没有典型核酸受体感应激活的情况下,编辑可能是导致下游信号增加的原因。
