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2020 年以后微生物诊断发生了什么变化......
近年来，耳念珠菌已成为一种具有临床重要性的机会性酵母菌，因为它会导致高危人群（包括重症患者和免疫抑制患者）感染。此外，它对许多抗真菌治疗具有耐药性，并在医院环境中持续存在，导致医院疫情难以控制和根除。早期准确诊断耳念珠菌感染至关重要，但这种微生物很难通过常用的识别系统进行识别，而且经常被误认为是其他念珠菌种。Alvarado 等人 [1] 描述了常规和实时 PCR 方法的开发，该方法利用某些糖基磷脂酰肌醇 (GPI) 修饰的蛋白质编码基因的独特性，准确快速地识别耳念珠菌并将其与密切相关的物种区分开来。他们针对每个物种（包括 C. auris、C. haemulonii、C. pseudohaemulonii、C. duobushaemulonii、C. lusitaniae 和 C. albicans）设计了针对两种独特的 GPI 蛋白编码基因的物种特异性引物。此外，使用 155 个 C. auris 分离株（包括所有已知的遗传多样性进化枝）验证了 C. auris 引物的效率。所有引物组合均表现出极好的物种特异性，在实时多重 PCR 中，C. auris 很容易与其他相关物种区分开来。C. auris 的检测限为 5 CFU/反应，阈值为 32，该方法还能够检测到加标血液和血清中的 C. auris。作者得出结论，这种基于独特 GPI 蛋白编码基因的 PCR 鉴定方法可以准确、快速地鉴定 C. auris 和相关物种。
多重耐药菌 (MDRO) 控制层级
2 在阿肯色州不常见的病原体/耐药机制（目标 MDRO） • 耳念珠菌 (C. auris) • 产碳青霉烯酶的肠杆菌 + • 产碳青霉烯酶的鲍曼不动杆菌 • 产碳青霉烯酶的铜绿假单胞菌 • 耐万古霉素金黄色葡萄球菌 • 泛不敏感革兰氏阴性菌 3 在阿肯色州常见但非地方性的病原体/耐药机制 • 耐碳青霉烯肠杆菌 (CRE)** + • 耐碳青霉烯的鲍曼不动杆菌 (CRAB)** • 耐碳青霉烯的铜绿假单胞菌 (CRPA)** 4 在阿肯色州地方性的病原体/耐药机制和/或流行病学相关性较低 • 先前未列出的其他 MDRO
德克萨斯州Arln |响应计划和EPI-LAB工作计划
首字母缩写全名ACH急诊医院的目标公共卫生实验室协会信息学消息传递服务APHL公共卫生实验室协会和抗微生物抗药性Arln抗菌抵抗实验室网络作为抗微生物抗菌管理AST AST AST AST AST AST AST AST AST AST抗微生物敏感性抗菌敏感性测试Bap Blood Agar Plays Blot Prots Bmuis Microdur c.A a c. a c. a a and Prevention CEMB Clinical and Environmental Microbiology Branch (CDC Branch within DHQP) CFR Code of Federal Regulations CLIA Clinical Laboratory Improvement Amendments CPO Carbapenemase-Producing Organism CRAB Carbapenem-Resistant Acinetobacter baumannii CRE Carbapenem-Resistant Enterobacterales CRO Carbapenem-resistant organism CRPA Carbapenem-Resistant Pseudomonas aeruginosa DHQP Division of Healthcare Quality Prevention (CDC Division) DSHS Department of State Health Services ESBL Extended-Spectrum Beta-Lactamases GAS Group A Streptococcus GBS Group B Streptococcus GC Neisseria gonorrhoeae HAI Healthcare-associated Infection HCP Healthcare Personnel HHD Houston Health Department HSU医疗保健安全部门IATA国际航空运输协会ICAR感染控制评估和反应IP感染预防主义者BLA IMPIMIPENEMASE IP IP感染预防主义者BLA KPC KPECELAKLAKLA KLAEMONIAIAE CARBAPENEMASE CARBAPENEMASE LHD地方卫生局LHD本地卫生部LIMS LIMS实验室信息实验室信息管理系统LTACH长期急诊医院
可重复使用设备的清洁和消毒
所有非关键共享设备，包括居民之间使用的治疗和互动设备，需要使用与设备兼容的医院级消毒剂进行清洁和消毒。消毒水平应满足可疑或确认的生物的要求。可能需要考虑使用诺如病毒，C。diff或C.杀死索赔的低或中级消毒剂。请参阅附录一张常用的消毒表。背景
每月传染病报告...
年初至今 2023 阿米巴病 1 2 24 14 边虫病-嗜吞噬细胞边虫 0 0 3 2 巴贝斯虫病 0 0 2 2 肉毒杆菌中毒 - 婴儿 0 0 1 0 肉毒杆菌中毒，食物传播 0 0 0 0 布鲁氏菌病 0 0 1 2 耳部弯曲菌 1 1 23 9 耳部弯曲菌 - 定植筛查 8 5 65 23 弯曲杆菌病 7 5 96 104 基孔肯雅病毒 0 0 1 0 衣原体感染 170 172 2,595 2,831 霍乱 0 0 0 0 球孢子菌病 1 0 4 6 新冠肺炎 998 387 9,175 13,993 CPO 11 8 101 120 CPO - 定植筛查 1 2 18 36 克雅氏病 0 0 0 2 隐孢子虫病 1 2 22 16 环孢子虫病 0 0 2 3 登革热 0 0 0 2 白喉 0 0 0 0 产志贺毒素大肠杆菌（O157:H7，非 O157，未知血清型） 4 4 38 19 埃里克体病-恰菲埃里克体 0 0 1 3 贾第虫病 7 6 115 108 淋球菌感染 67 73 1,046 1,069 流感嗜血杆菌（侵袭性疾病） 3 2 18 10 汉坦病毒感染 0 0 0 0 溶血性尿毒症综合征(HUS) 0 1 1 0 甲型肝炎 0 1 3 12 乙型肝炎 - 围产期感染 2 1 5 7 乙型肝炎（包括丁型肝炎）- 急性 0 2 6 7 乙型肝炎（包括丁型肝炎）- 慢性 3 8 82 115 丙型肝炎 - 急性 1 0 7 0 丙型肝炎 - 慢性 20 30 272 330 丙型肝炎 - 围产期感染 0 0 5 2 戊型肝炎 0 0 0 1 HIV/AIDS 7 2 61 40 流感 - ODH 实验室结果 7 4 54 35 流感相关住院治疗 22 8 345 129 流感相关儿科死亡 0 0 0 0 拉克罗斯病毒病 0 0 0 0 军团菌病 2 3 62 37 李斯特菌病 0 0 1 1
特刊 - 新兴的传染病...
新兴的传染病是根据最近出现在人群中还是其发病率或地理范围正在迅速增加或威胁要在不久的将来增加的感染疾病定义为感染。它们可能是由多种病原体引起的，现有的例子包括SARS病毒，SARS-COV-2，MERS病毒，丝状病毒，出血热病毒，登革热病毒，Chikungunya病毒，西尼罗河病毒，Zika Virus，Zika Virus，Monkeypox病毒，Monkeypox病毒，Borrelia Burgdorferi和Candida a Aruris和Candida auris。新兴的传染病在局部和可管理的情况下未检测到和控制，可能会对公共卫生产生严重的影响，就像Covid-19-19的大流行一样。我们很高兴邀请您提交与新兴和重新出现传染病的流行病学，诊断，治疗和控制有关的文章，尤其是对上述领域的最新进展。欢迎原始研究文章和评论。我们期待收到您的贡献。
抗生素 - 细胞穿透肽结合物靶向...
自从近一个世纪前第一种抗生素被发现以来，抗生素已经改变了全球的医学。然而，几乎与每种抗生素被广泛使用一样快，耐药性也使许多这些抗菌药物的临床实用性黯然失色（Aslam 等人，2018 年；Zaman 等人，2017 年）。对大多数（如果不是全部）可用抗生素具有耐药性的病原体正在定期识别，例如耐药性淋病奈瑟菌、鲍曼不动杆菌和耳念珠菌，美国疾病控制中心将这些细菌列为紧急威胁（CDC 2019）。随着时间的推移，新抗生素的开发速度已经放缓。制药公司传统上主导着抗生素的研究和开发，但由于缺乏长期成功以及将新药推向市场的经济回报低，许多公司放弃了努力（Jackson 等人，2018 年）。目前迫切需要解决耐药问题，八个中只有两个
ARLN 响应计划 | 2023 年 7 月
根据美国疾病控制与预防中心 (CDC) 2019 年《抗生素耐药性 (AR) 报告》，美国每年发生超过 280 万例抗生素耐药性感染，导致超过 35,000 人死亡 1 。CDC 根据对人类健康的三个关注程度将抗生素耐药性威胁分为：紧急、严重和令人担忧。紧急威胁包括耐碳青霉烯类肠杆菌 (CRE)、耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌 (CRAB) 和耳念珠菌。严重威胁包括产超广谱β-内酰胺酶 (ESBL) 的肠杆菌和多重耐药 (MDR) 铜绿假单胞菌 1 。令人担忧的威胁包括耐红霉素 A 组链球菌 (GAS) 和耐克林霉素 B 组链球菌 (GBS) 1 。这些微生物都代表着对公共卫生的新威胁，因为它们可导致高死亡率的感染，具有高度传染性，并且很有可能在社区传播。针对这些微生物的治疗选择有限，而且可能还需要数年时间才能出现新的治疗药物。
果蝇的效用作为真菌感染模型
机会性真菌感染的全球影响很长一段时间（1）。然而，随着慢性和免疫抑制健康状况的增加，包括艾滋病毒/艾滋病，癌症，囊性纤维化和糖尿病，抗菌治疗和侵入性程序，使个人容易受到机会性感染的影响，这些感染的影响变得更加明显（1，2）。真菌通过直接感染宿主或通过其继发代谢产物，霉菌毒素，可能污染环境，食品和空气的颜料引起疾病（3）。这种疾病负担从超级到侵入性真菌感染范围，估计每年为100亿患者，每年死亡> 150万人死亡（2，4）。这些感染是由长期识别的病原体（如曲霉和白色念珠菌）（5-7）引起的，如Eumyycetoma（8、9）等被忽视的热带疾病以及新出现的病原体，例如念珠菌（10，11）。随着晚期分子和细胞生物学技术的发展，正在更详细地研究真菌致病性和毒力因子（12-14）。然而，随着新颖有效的抗真菌疗法的发展仍然不足，真菌威胁继续增长（15、16）。在2022年，世卫组织发布了WHO