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BGC地图集：探索细菌基因组中编码的全球化学多样性的网络资源
1天然产品的转化基因组挖掘，培养基和感染医学研究所Tübingen（IMIT）（IMIT），研究学研究所生物医学信息学研究所（IBMI），Tübingen，Auf der Morgenstelle 28，72076Tübingen2 28，72076Tübingendenoker -Nord nord sworkity flative forkitizan of Denok nove nord swiment fin Plads，220，2800 Kongens Lyngby，丹麦3计算生物学，国家农业食品生物技术研究所（NABI），S.A.S.德国6生物信息学中心Saar和Saarland大学，Saarland信息学校园，E2 1，66123Saarbrücken，德国7分子生命科学系和瑞士生物信息学研究所和苏黎世大学，苏黎世大学，苏黎世大学，Winterthurerstrasse，190年Drovendaalsesteeg 1 Radix West，6708pb Wageningen，荷兰9德国感染研究中心（DZIF），合作伙伴Tübingen，Auf der Morgenstelle 28，72076Tübingen，德国，德国
使用ECG信号进行血糖监测的非侵入性方法
摘要简介：使用连续的葡萄糖监测仪（CGM），紧密的葡萄糖监测对于糖尿病患者至关重要。现有的CGM从间质液中测量血糖浓度（BGC）。这些技术非常昂贵，其中大多数都是侵入性的。先前的研究表明，低血糖和高血糖发作会影响心脏的电生理学。但是，他们没有确定BGC和ECG参数之间的队列关系。材料和方法：在这项工作中，我们提出了一种使用表面ECG信号确定BGC的新方法。复发性卷积神经网络（RCNN）用于分段ECG信号。然后，使用两个数学方程式使用提取的特征来确定BGC。使用表面ECG信号而不是心脏内信号，已从D1NAMO数据集对04例患者进行了对04例患者的测试。结果：我们能够使用RCNN算法以94％的精度分割ECG信号。根据结果，所提出的方法能够以平均绝对误差（MAE）为0.0539估计BGC，平均平方误差（MSE）为0.1604。此外，本文已经确认了BGC和ECG特征之间的线性关系。结论：在本文中，我们提出了ECG特征来确定BGC的潜在用途。此外，我们确认了BGC和ECG特征之间的线性关系。这一事实将为进一步研究（即生理模型）打开新的观点。此外，发现指出，通过机器学习，可以将ECG可穿戴设备用于非侵入性连续血糖监测。
并行基因簇编辑照明环氧基酮蛋白酶体抑制剂生物合成的机制
DNA测序技术和生物毒素格式的进步揭示了微生物在医学和农业中产生具有不同用途的结构复杂的特殊代谢物的巨大潜力。然而，这些分子通常会重新检查结构修饰以优化它们以供应用，这可能是使用合成化学很难的。生物工程提供了一种互补的结构修饰方法，但通常会因遗传性棘手性而受到影响，并且需要对生物合成基因功能的理解。异源宿主中专门的代谢产物生物合成基因簇（BGC）可以解决这些问题。然而，当前的BGC克隆和操作方法是不具体的，缺乏实现的，并且可能非常昂贵。在这里，我们报告了一个基于酵母的平台，该平台利用了与转换相关的重组（TAR）进行高效率捕获和对BGC的并行操作。作为概念证明，我们克隆，杂酚表达和遗传分析了与结构相关的非核糖体肽epone-epone-epone- mycin和tmc-86a的BGC，阐明了这些重要蛋白质的生物合成中的模棱两可。我们的结果表明，epone- mycin BGC还指导TMC-86A的产生，并揭示了启动这两种代谢产物组装的对比机制。此外，我们的
微生物中的抗生素耐药性
达卡大学药学学院，达卡1000号，孟加拉国B研究系植物生物学与生物技术系，洛约拉学院，伦巴卡卡姆，钦奈，泰米尔纳德邦，印度泰米尔纳德邦，印度印度哥伦比亚省BGC Trust University bgc University consectian c and Trocention bgc Trocention bgc Trocention c。 Izatnagar研究所，Bareilly，243122，印度北方邦E e Mawlana Bhashani科学与技术大学药学系，Santosh，Santosh，Tangail，1902年，孟加拉国，孟加拉国，牙科和实验性养育研究系，牙科，卫生学院牙科，卫生学院，szeged szeged Secret and arthh hungard sekeged Informance and Hungary Secret and Hungary Secret and Hungary Secrety and Hungary Secret and Hungary Secret and arther secred Grenhh Hungard secred and arther secred and。孟加拉国州立大学巴基斯坦H Peshawar，孟加拉国州立大学，达卡省萨特马吉路77号，达卡，孟加拉国1205，孟加拉国I天然产品系研究，Koirala生物技术研究所，生物技术研究所达卡大学药学学院，达卡1000号，孟加拉国B研究系植物生物学与生物技术系，洛约拉学院，伦巴卡卡姆，钦奈，泰米尔纳德邦，印度泰米尔纳德邦，印度印度哥伦比亚省BGC Trust University bgc University consectian c and Trocention bgc Trocention bgc Trocention c。 Izatnagar研究所，Bareilly，243122，印度北方邦E e Mawlana Bhashani科学与技术大学药学系，Santosh，Santosh，Tangail，1902年，孟加拉国，孟加拉国，牙科和实验性养育研究系，牙科，卫生学院牙科，卫生学院，szeged szeged Secret and arthh hungard sekeged Informance and Hungary Secret and Hungary Secret and Hungary Secrety and Hungary Secret and Hungary Secret and arther secred Grenhh Hungard secred and arther secred and。孟加拉国州立大学巴基斯坦H Peshawar，孟加拉国州立大学，达卡省萨特马吉路77号，达卡，孟加拉国1205，孟加拉国I天然产品系研究，Koirala生物技术研究所，生物技术研究所
生物合成基因簇在植物防御和植物相互作用中的新兴作用
植物王国产生各种化学物质，估计使10 5至10 6不同的代谢产物[1，2]。这些化合物是已知的或可能具有重要的生态功能的，例如，在保护食草动物，害虫和病原体时；在推导性（与邻近植物的竞争）中；并塑造植物微生物组。在某些情况下，它们还被证明是植物生长和防御的调节剂以及原代代谢物Sensu Lato [3]。植物天然产物是由一系列构成生物合成途径的酶介导的化学反应形成的。众所周知，某些特征良好的植物Natu-lol产品途径的基因分散在整个基因组中，但过去20年中，揭示了越来越多的示例，在这些实例中，特定生物合成途径的基因在植物基因组中共同植物基因组中的基因组基因簇（BGC）（BGC）（BGC）。先前已经发表了一些涵盖植物BGC的性质和一般特征的全面评论[4-8]。但是，尚未对这些集群在植物防御和植物相互作用的背景下的作用进行重点回顾。在这里，我们回顾了此主题，重点介绍该领域的最新进展，并讨论了作物改善的潜在影响。
深海：大型语言模型揭示了全球海洋微生物组的隐藏生物合成潜力
图2：在隐性BGC的验证数据集（n = 940）的验证数据集上的现有方法的比较。a，BGC的数量通过每种方法预测至少一个化学有效的结构，并以每种方法（成功率）的至少一个为每种BGC预测的化学有效结构的百分比（成功率）。b，每种方法预测的化学有效SM结构的数量，并用每种方法预测的独特结构的百分比（唯一性）。c，通过每种方法的预测SM结构的化学空间。d，通过每种方法的分子量的分子量分布。e，通过每种方法的综合可访问性（合成可访问性得分）的分布。f，通过每种方法对预测的SM结构的QED分布（药物的定量估计值）。源数据在源数据文件中提供。
mibig 3.0：以社区为导向的努力来注释...
在2015年，我们定义了有关生物合成基因簇（Mibig）的最小信息：一种标准化的数据格式，描述了最小必需的信息，以独特地表征BGC。我们同时以这种格式构建了一个随附的BGC条目的在线数据库，此后，该数据被社区广泛用作BGC的参考数据集。在这里，我们描述了Mibig 3.0，一个数据库更新，包括大规模验证和重新通知现有条目，与自然产品ATLAS数据库的广泛交联以及669个新条目。特别关注复合结构和生物活性的注释以及蛋白质领域的选择性。在一起，这些新功能使数据库保持最新，并将为科学社区提供新的机会，以便使用其免费可用的数据，例如培训新机器学习模型，以预测各种天然产品的序列结构功能关系。