季节性的p-葡萄糖酸和抗菌活性的季节性变化。Pharm Biol 46:889-893。Karamat,F,Olry,A,Munakata,R等。 (2014)香豆素 - 特定的pren- yltransferase催化了欧洲裔弗拉诺科·马林形成的关键生物合成反应。 工厂J 77:627-638。 Kohnen -Johannsen,KL和Kayser,O(2019)Tropane生物碱:化学,药理学,生物合成和生产。 分子24:796。 li,H,Ban,Z,Qin,H等。 (2015)一种异源膜 - 霍普的结合前蛋白基 - 转移酶复合物在苦酸途径中催化三种顺序芳族预奈尔。 植物生理学167:650-659。 Luo,X,Reiter,MA,D'Espaux,L等。 (2019a)大麻素及其在酵母中的非天然类似物的完全生物合成。 自然567:123-126。 luo,ZW,Cho,JS和Lee,SY(2019b)微生物炭疽甲酯的微生物产生,葡萄味。 Proc Natl Acad Sci USA 116:10749-10756。 MA,J,GU,Y,Marsafari,M等。 (2020)Yarrowia脂溶剂的合成生物学,系统生物学和代谢工程,可用于可持续的生物填充平台。 J Ind Microbiol Biotechnol 47:845-862。 mori,T,(2020)芳族前转移酶的酶学研究。 J Nat Med 74:501-512。 Munakata,R,Inoue,T,Koeduka,T等。 (2014)柠檬中的香烷基双磷酸 - 特异性芳基丙烯基转移酶的分子克隆和表征。 植物生理学166:80-90。 社区生物2:384。Karamat,F,Olry,A,Munakata,R等。(2014)香豆素 - 特定的pren- yltransferase催化了欧洲裔弗拉诺科·马林形成的关键生物合成反应。工厂J 77:627-638。Kohnen -Johannsen,KL和Kayser,O(2019)Tropane生物碱:化学,药理学,生物合成和生产。 分子24:796。 li,H,Ban,Z,Qin,H等。 (2015)一种异源膜 - 霍普的结合前蛋白基 - 转移酶复合物在苦酸途径中催化三种顺序芳族预奈尔。 植物生理学167:650-659。 Luo,X,Reiter,MA,D'Espaux,L等。 (2019a)大麻素及其在酵母中的非天然类似物的完全生物合成。 自然567:123-126。 luo,ZW,Cho,JS和Lee,SY(2019b)微生物炭疽甲酯的微生物产生,葡萄味。 Proc Natl Acad Sci USA 116:10749-10756。 MA,J,GU,Y,Marsafari,M等。 (2020)Yarrowia脂溶剂的合成生物学,系统生物学和代谢工程,可用于可持续的生物填充平台。 J Ind Microbiol Biotechnol 47:845-862。 mori,T,(2020)芳族前转移酶的酶学研究。 J Nat Med 74:501-512。 Munakata,R,Inoue,T,Koeduka,T等。 (2014)柠檬中的香烷基双磷酸 - 特异性芳基丙烯基转移酶的分子克隆和表征。 植物生理学166:80-90。 社区生物2:384。Kohnen -Johannsen,KL和Kayser,O(2019)Tropane生物碱:化学,药理学,生物合成和生产。分子24:796。li,H,Ban,Z,Qin,H等。(2015)一种异源膜 - 霍普的结合前蛋白基 - 转移酶复合物在苦酸途径中催化三种顺序芳族预奈尔。植物生理学167:650-659。Luo,X,Reiter,MA,D'Espaux,L等。(2019a)大麻素及其在酵母中的非天然类似物的完全生物合成。自然567:123-126。luo,ZW,Cho,JS和Lee,SY(2019b)微生物炭疽甲酯的微生物产生,葡萄味。Proc Natl Acad Sci USA 116:10749-10756。MA,J,GU,Y,Marsafari,M等。 (2020)Yarrowia脂溶剂的合成生物学,系统生物学和代谢工程,可用于可持续的生物填充平台。 J Ind Microbiol Biotechnol 47:845-862。 mori,T,(2020)芳族前转移酶的酶学研究。 J Nat Med 74:501-512。 Munakata,R,Inoue,T,Koeduka,T等。 (2014)柠檬中的香烷基双磷酸 - 特异性芳基丙烯基转移酶的分子克隆和表征。 植物生理学166:80-90。 社区生物2:384。MA,J,GU,Y,Marsafari,M等。(2020)Yarrowia脂溶剂的合成生物学,系统生物学和代谢工程,可用于可持续的生物填充平台。J Ind Microbiol Biotechnol 47:845-862。mori,T,(2020)芳族前转移酶的酶学研究。J Nat Med 74:501-512。Munakata,R,Inoue,T,Koeduka,T等。 (2014)柠檬中的香烷基双磷酸 - 特异性芳基丙烯基转移酶的分子克隆和表征。 植物生理学166:80-90。 社区生物2:384。Munakata,R,Inoue,T,Koeduka,T等。(2014)柠檬中的香烷基双磷酸 - 特异性芳基丙烯基转移酶的分子克隆和表征。植物生理学166:80-90。社区生物2:384。Munakata,R,Olry,A,Takemura,T等。 (2021)UBIA超家族蛋白的平行演化为植物中的芳族O-前转移酶。 Proc Natl Acad Sci USA 118:E2022294118。 Munakata,R,Takemura,T,Tatsumi,K等。 (2019)分离用于苯基苯甲酸的毛细血管膜膜 - 结合二苯基转移酶,并在酵母中重新设计Artepillin c的重新设计。 村上,A,Kuki,W,Takahashi,Y等。 (1997)Auraptene,一种香豆素,抑制12 -O-四甲基烷酰基-13-乙酸 - 乙酸 - 诱导的ICR小鼠皮肤中的Tu- Mor促进,可能是通过抑制白血细胞中过氧化含量的产生。 JPN J Cancer Res 88:443-452。 Nishikawa,S,Aoyama,H,Kamiya,M等。 (2016)Artepillin C,一种典型的巴西蜂胶成分,诱导棕色 - 像脂肪细胞在C3H10T1/2细胞中形成,原发性腹股沟白色脂肪组织 -Munakata,R,Olry,A,Takemura,T等。(2021)UBIA超家族蛋白的平行演化为植物中的芳族O-前转移酶。Proc Natl Acad Sci USA 118:E2022294118。Munakata,R,Takemura,T,Tatsumi,K等。 (2019)分离用于苯基苯甲酸的毛细血管膜膜 - 结合二苯基转移酶,并在酵母中重新设计Artepillin c的重新设计。 村上,A,Kuki,W,Takahashi,Y等。 (1997)Auraptene,一种香豆素,抑制12 -O-四甲基烷酰基-13-乙酸 - 乙酸 - 诱导的ICR小鼠皮肤中的Tu- Mor促进,可能是通过抑制白血细胞中过氧化含量的产生。 JPN J Cancer Res 88:443-452。 Nishikawa,S,Aoyama,H,Kamiya,M等。 (2016)Artepillin C,一种典型的巴西蜂胶成分,诱导棕色 - 像脂肪细胞在C3H10T1/2细胞中形成,原发性腹股沟白色脂肪组织 -Munakata,R,Takemura,T,Tatsumi,K等。(2019)分离用于苯基苯甲酸的毛细血管膜膜 - 结合二苯基转移酶,并在酵母中重新设计Artepillin c的重新设计。村上,A,Kuki,W,Takahashi,Y等。(1997)Auraptene,一种香豆素,抑制12 -O-四甲基烷酰基-13-乙酸 - 乙酸 - 诱导的ICR小鼠皮肤中的Tu- Mor促进,可能是通过抑制白血细胞中过氧化含量的产生。JPN J Cancer Res 88:443-452。Nishikawa,S,Aoyama,H,Kamiya,M等。 (2016)Artepillin C,一种典型的巴西蜂胶成分,诱导棕色 - 像脂肪细胞在C3H10T1/2细胞中形成,原发性腹股沟白色脂肪组织 -Nishikawa,S,Aoyama,H,Kamiya,M等。(2016)Artepillin C,一种典型的巴西蜂胶成分,诱导棕色 - 像脂肪细胞在C3H10T1/2细胞中形成,原发性腹股沟白色脂肪组织 -
摘要简介:坏死性肠炎(NE)是鸟类胃肠道的感染,由于其巨大的经济损失,是家禽行业的主要关注点。该疾病是由革兰氏阳性细菌性裂孔(C. perfringens)引起的。由于禽类行业禁止使用抗生素使用情况,近年来,NE的发病率大大增加。我们先前已经表明,用亚基嵌合抗原免疫由NE发病机理(α毒素,B样毒素(NETB)和锌金属肽酶(ZMP))组成的最有效的共环蛋白毒素(alpha毒素,B样毒素)组成。材料和方法:在本研究中,鸡被重组蛋白皮下免疫。然后,评估了免疫鸟类中细胞因子的表达谱。为此目的,遵循免疫方案,从鸟类的肠道中取出样品,提取mRNA,并使用定量实时PCR研究了四种不同的细胞因子(IFN-γ,IL-4,IL-17和IL-22)的表达。上述细胞因子是辅助T淋巴细胞的代表,并且在几种免疫系统活性中具有作用,例如细胞,体液和粘膜免疫反应以及炎症。结果:根据细胞因子测定的结果,皮下注射的重组蛋白会引起体液和细胞免疫系统,但无法刺激粘膜免疫系统。J Appl BiotechnolRep。2024; 11(1):1229-1235。 doi:10.30491/jabr.2023.388739.1613候选疫苗引起了免疫系统,因此辅助重组蛋白(AXJ-RNAM组)和对照组之间的差异显着(P <0.001)。结论:除了我们先前的研究输出外,结果表明,我们的策略在完成适当的研究后可以为使用NE治疗中使用抗生素提供替代解决方案。关键字:候选疫苗,坏死肠炎,灌注梭菌,细胞因子测定,细胞免疫引用:Al-Aneed B,Masoudi AA,Katalani C,Ahmadian G,Hajizade A,Hajizade A,Razmyar J.评估IFN-γ,IL-4,IL-17和IL-22细胞因子在用含有α毒素,NETB和ZMP的重组嵌合疫苗免疫的鸟类中的表达。
摘要简介:大肠杆菌血红素利润(CHUA)蛋白是一种外膜蛋白,已显示为疫苗设计研究的可正常靶标。在本研究中,我们旨在识别和表征Chua蛋白最有效的B和T细胞表位,以揭示其最免疫原性的区域。材料和方法:在本研究中,调用同源性建模以确定大肠杆菌血红素利润蛋白(CHUA)的三维(3D)结构。,为CHUA预测了CHUA的CHUA,线性和构象B细胞表位和T细胞表位的膜拓扑,配体结合位点,表面可及性和裂缝。在分子对接分析后,绘制了最有效的T细胞表位与HLA-A020和HLA-DRB0101结构之间的2D和3D相互作用图。结果:我们的结果表明Chua是血红素配体转运蛋白,它形成了常见的β-桶结构。它通过22个膜跨度区域位于膜中。基于残余的口袋和裂缝在Chua蛋白上鉴定出来。免疫学分析显示9个高效的B细胞表位。在预测的T细胞表位2中2分析了大多数有效的表位,以通过分子对接进行HLA结合。YSKQPGYG和FAAATTMSY表位显示与HLA-A020和HLA-DRB0101的相互作用稳定。结论:我们的免疫学,生化和功能分析强调了CHUA蛋白的区域,该区域具有最高的免疫原性,以实现疫苗接种的目的。J Appl BiotechnolRep。2024; 11(1):1207-1219。 doi:10.30491/jabr.2023.388522.1612我们采用3D结构预测和表位预测结果的策略可以被视为在各种平台中有效疫苗设计的一种可正常的方法。关键字:尿路感染,疫苗,铁受体,生物信息学,OMP引用:Sefid F,Payandeh Z,Khalili S,Hashemi ZS,Zakeri A,Zakeri A,Alagheband Bahrami A等。基于血红素利润蛋白的疫苗设计的表位硅化表征。
[1] Egger G,Liang G,Aparicio A等。人类疾病的表观遗传学和表观遗传疗法的前景。 自然,2004,429:457-63 [2] Varmus H.为基于基因的药物做好准备。 New Engl J Med,2002,347:1526-7 [3] Pogue RE,Cavalcanti DP,Shanker S等。 罕见的遗传疾病:诊断,治疗和在线资源的更新。 Div> Discov今天,2018年,23:187-95 [4] Fischer A,Cavazzana-Calvo M.遗传疾病的基因治疗。 Lancet,2008,371:2044-7 [5] Porteus M.基因组编辑:一种新的人类治疗方法。 Annu Rev Pharmacol Toxicol,2016,56:163-90 [6] Cox DBT,Platt RJ,ZhangF。治疗基因组编辑:前景和挑战。 nat Med,2015,21:121-31 [7] Barrangou R,Fremaux C,Deveau H等。 crispr提供了对原核生物中病毒的抗药性。 Science,2007,315:1709-12 [8] Deltcheva E,Chylinski K,Sharma CM等。 CRISPR RNA通过反式编码的小RNA和宿主因子RNase III成熟。 自然,2011,471:602-7 [9] Cong L,Ran FA,Cox D等。 使用CRISPR/CAS系统的多重基因组工程。 Science,2013,339:819-23 [10] Jinek M,Chylinski K,Fonfara I等。 适应性细菌免疫中可编程的双RNA引导的DNA内切酶。 Science,2012,337:816-21 [11] Maruyama T,Dougan SK,Truttmann MC等。 通过抑制非同源末端连接来提高精确基因组编辑的效率。 nat Biotechnol,2015,33:538-42 [12] Shmakov S,Smargon A,Scott D等。 快照:2类CRISPR-CAS系统。人类疾病的表观遗传学和表观遗传疗法的前景。自然,2004,429:457-63 [2] Varmus H.为基于基因的药物做好准备。New Engl J Med,2002,347:1526-7 [3] Pogue RE,Cavalcanti DP,Shanker S等。罕见的遗传疾病:诊断,治疗和在线资源的更新。Div> Discov今天,2018年,23:187-95 [4] Fischer A,Cavazzana-Calvo M.遗传疾病的基因治疗。Lancet,2008,371:2044-7 [5] Porteus M.基因组编辑:一种新的人类治疗方法。Annu Rev Pharmacol Toxicol,2016,56:163-90 [6] Cox DBT,Platt RJ,ZhangF。治疗基因组编辑:前景和挑战。nat Med,2015,21:121-31 [7] Barrangou R,Fremaux C,Deveau H等。crispr提供了对原核生物中病毒的抗药性。Science,2007,315:1709-12 [8] Deltcheva E,Chylinski K,Sharma CM等。CRISPR RNA通过反式编码的小RNA和宿主因子RNase III成熟。自然,2011,471:602-7 [9] Cong L,Ran FA,Cox D等。使用CRISPR/CAS系统的多重基因组工程。Science,2013,339:819-23 [10] Jinek M,Chylinski K,Fonfara I等。适应性细菌免疫中可编程的双RNA引导的DNA内切酶。Science,2012,337:816-21 [11] Maruyama T,Dougan SK,Truttmann MC等。通过抑制非同源末端连接来提高精确基因组编辑的效率。nat Biotechnol,2015,33:538-42 [12] Shmakov S,Smargon A,Scott D等。快照:2类CRISPR-CAS系统。2类CRISPR-CAS系统的多样性和演变。Nat Rev Microbiol,2017,15:169-82 [13] Makarova KS,Zhang F,Koonin EV。Cell,2017,168:328-328.e1 [14] Zetsche B,Gootenberg JS,Abudayyeh Oo等。CPF1是2类CRISPR- CAS系统的单个RNA引导的内切酶。 Cell,2015,163:759-71 [15] Ran Fa,Cong L,Yan WX等。 使用金黄色葡萄球菌Cas9的体内基因组编辑。 自然,2015,520:186-91 [16] Kim E,Koo T,Park SW等。 在体内基因组编辑中,带有弯曲杆菌的小Cas9直系同源CPF1是2类CRISPR- CAS系统的单个RNA引导的内切酶。Cell,2015,163:759-71 [15] Ran Fa,Cong L,Yan WX等。使用金黄色葡萄球菌Cas9的体内基因组编辑。 自然,2015,520:186-91 [16] Kim E,Koo T,Park SW等。 在体内基因组编辑中,带有弯曲杆菌的小Cas9直系同源使用金黄色葡萄球菌Cas9的体内基因组编辑。自然,2015,520:186-91 [16] Kim E,Koo T,Park SW等。在体内基因组编辑中,带有弯曲杆菌的小Cas9直系同源在体内基因组编辑中,带有弯曲杆菌的小Cas9直系同源
《BIOSECURE 法案》利用美国联邦政府的合同和研究资助职能,有效地迫使企业在与美国政府合作还是与中国生物技术公司合作之间做出选择。该法案禁止美国政府与任何实体签订合同,无论该实体是美国公司还是外国公司,只要该实体 (a) 使用受关注生物技术公司提供的生物技术设备或服务,或 (b) 与受关注生物技术公司签订了使用此类设备或服务的合同。《BIOSEC URE 法案》将“受关注生物技术公司”定义为受美国外国对手(如中国、俄罗斯、朝鲜和伊朗)控制或代表其运作、涉足生物技术设备或服务行业并与外国对手的军事、内部安全或情报机构开展研究或服务的实体。此外,众议院版本的《BIOSECURE 法案》明确指出五家中国公司 —— 华大基因 (原北京基因组研究所)、Complete Genomics、华大基因、药明康德和药明生物 — 是值得关注的生物技术公司。该法案要求管理和预算办公室公布其他值得关注的公司名单,并每年更新名单。参议院版本的法案将药明生物排除在外,但由于其与药明康德的关联,如果法案的最终版本仍然将其排除在外,药明生物很可能受到影响和/或被列入其他公司名单。最后,该法案对生物技术设备或服务进行了广泛的定义。 漫长的赦免期 一旦《BIOSECURE 法案》签署成为法律,将有一个漫长的过渡期,而众议院版本确实提供了安全港和有限的豁免程序。《BIOSECURE 法案》试图将直接影响限制在制药和生物技术供应链上。众议院版本的法案包含一项祖父条款,即法案生效日前签订的现有合同有效期至 2032 年 1 月 1 日。参议院版本的法案包含一项不过期的祖父条款。众议院版本还包括一项安全港机制,该机制将列入黑名单的生物技术公司以前提供但现在不再提供的设备或服务排除在外。还有一个豁免程序,允许在提供海外服务(例如在中国)时免除禁令。
参考文献 1. Eriksson, D. (2020) 改革欧盟转基因生物立法的选项:范围和定义。Trends Biotechnol 38, 231 – 234 2. Eriksson, D. (2018) 恢复欧盟转基因生物风险评估和管理的初衷。Front. Bioeng. Biotechnol. 6, 52 3. Casacuberta, JM 和 Puigdomenech, P. (2018) 对基因编辑植物进行比例和科学合理的风险评估。EMBO Rep. 19, e46907 4. Steinberg, P. 等人。 (2019) 在 Wistar Han RCC 大鼠中,草甘膦抗性转基因玉米 NK603 的亚慢性和慢性毒性/致癌性研究中没有发现不良影响。Arch. Toxicol. 93, 1095 – 1139 5. Sanvido, O. 等人 (2012) 评估转基因作物的环境风险:监管决策的生态危害标准。环境科学政策 15, 82 – 91 6. Herman, RA 等人 (2013) 将政策相关性和科学纪律带入转基因作物的环境风险评估。Trends Biotechnol. 31, 493 – 496 7. Devos, Y. 等人 (2015) 优化环境风险评估。考虑生态系统服务有助于将广泛的政策保护目标转化为环境风险评估的具体操作目标。EMBO Rep. 16, 1060 – 1063 8. Smart, RD 等人 (2015) 欧盟成员国投票授权转基因作物:监管僵局。Ger. J. Agr. Econ. 64, 244 – 262 9. Purnhagen, KP 等人 (2018) 欧盟法院总检察长意见和新植物育种技术。Nat. Biotechnol. 36, 573 – 575 10. Raybould, A. 和 Macdonald, P. (2018) 政策主导的转基因作物比较环境风险评估:测试增加的风险而不是分析表型可实现可预测和透明的决策。Front. Bioeng. Biotech. 6, 43 11. Faure, M. (2018) 欧盟食品法协调的经济学。《欧盟食品安全监管和管理》(Bremmers, H. 和 Purnhagen, K. 编辑),第 263 – 290 页,Springer 12. Eriksson, D. 等人 (2018) 欧盟为何需要国家转基因选择加入机制。《自然生物技术》36, 18 – 19 13. Eriksson, D. 等人 (2019) 实施欧盟转基因作物种植选择加入机制。EMBO Rep. 20, e48036
摘要:制药和化学工业提供社会大部分日常使用的材料,但是它们是主要污染者,对碳排放量产生了重大贡献,并且产生了比产品多5-100倍。在这种情况下,生物催化成为一种有前途的方法,可以发展出蓝细菌作为当前使用的异养费用的替代底盘的绿色,更可持续和更便宜的化学制造。旨在表达与工业相关的异源酶,例如氢化酶和单加氧化酶[1],产生了几种具有流线性光合电子流量的综合囊体突变体。我们的目标包括编码推定竞争电子水槽的基因,例如:双向氢化酶HOX,Flavodiiron蛋白FLV1/3,NDH-1复合物的NDHD2亚基,Cox终端氧化酶和天然CYP120A1。当前,这些底盘的有效性,从电子流向氧化还原酶方面,正在通过P450传感器蛋白(CYP1A1)通过乙氧基resorufin-O-二甲基酶(EROD)测定进行评估。初步结果表明,与野生型相比,突变体的CYP1A1活性更高。并行,生成并测试了合成装置的合成装置,并生成了合成装置,并生成了并测试并测试了合成装置,并具有合成装置,并测试了。 与野生型相比,该装置在综合囊体突变体中缺乏生产的生产中缺乏天然兼容溶质葡萄糖基甘油(δGGP)增强了3%NaCl的生长[2,3]。 参考文献1。 Mascia等。 Ferreira等。 (2018)Synt。。与野生型相比,该装置在综合囊体突变体中缺乏生产的生产中缺乏天然兼容溶质葡萄糖基甘油(δGGP)增强了3%NaCl的生长[2,3]。参考文献1。Mascia等。Ferreira等。(2018)Synt。通过将AHBET装置引入EPS生产中的突变体中,评估了推定碳竞争途径的损害,即细胞外聚合物(EPS)对甘氨酸甜菜碱的产生的影响。Δkpsm_AHBET突变体比δGGPS_AHBET产生的甘氨酸蛋白甜味蛋白多2倍,并增加了前体甘氨酸的可用性,从而产生了更高的甘氨酸菜碱的产生。然而,作为δGGPS_AHBET,δkpsm_AHBET突变体在3%NaCl以下的生长没有增加。因此,针对海水中的大规模培养,例如AHBET被引入染色体中性位点[4]。(2022)绿色化学,doi.org/10.1039/d1gc04714k 2。biol。,doi.org/10.1093/synbio/ysy014 3。Ferreira等。(2022)正面。Bioeng。Biotechnol。,doi.org/10.3389/fbioe.2021.821075 4。Pinto等。(2015)DNA res。,doi.org/ 10.1093/dnares/dsv024
1. Li, D. 等人。扩展分辨率结构化照明成像的内吞和细胞骨架动力学。91 Science 349 , 944–944 (2015)。92 2. Gustafsson, MGL 使用结构化照明显微镜将横向分辨率极限提高两倍。Journal of Microscopy 198 , 82-87 (2000)。94 3. Gustafsson, MGL 等人。通过结构化照明在宽视场荧光显微镜中实现三维分辨率加倍。Biophysical Journal 94 , 4957-4970 (2008)。96 4. Cragg, GE 和 So, PTC 使用驻波增强横向分辨率。Opt. Lett. 97 25 , 46-48 (2000)。 98 5. Kner, P. 等人。通过结构化照明对活细胞进行超分辨率视频显微镜检查。自然方法 6 , 99 339–342 (2009)。00 6. Hirvonen, LM 等人。活细胞的结构化照明显微镜检查。欧洲生物物理杂志 38 , 807–812 01 (2009)。02 7. Guo, Y. 等人。在毫秒时间尺度上以纳米级分辨率可视化细胞内细胞器和细胞骨架相互作用。Cell 175 , 1430-1442 (2018)。04 8. Huang, X. 等人。使用 Hessian 结构化照明显微镜实现快速、长期、超分辨率成像。自然生物技术 36 , 451–459 (2018)。 06 9. Chu, K. 等人。低信号水平结构照明显微镜的图像重建。Opt. 07 Express 22 , 8687-8702 (2014)。08 10. Wen, G. 等人。通过点扩展函数工程实现高保真结构照明显微镜。09 Light Sci Appl 10 , 70 (2021)。10 11. Jin, L. 等人。深度学习使结构照明显微镜具有低光照水平和更快的速度。Nat Commun 11 , 1934 (2020)。12 12. Qiao, C. 等人。用于光学显微镜图像超分辨率的深度神经网络的评估和开发。Nat Methods 18 , 194–202 (2021)。 14 13. Kobler, E. 等人。线性逆问题的总深度变分。CVPR,7546-7555(2020 年)。15 14. S. Bhadra。等人。断层扫描图像重建中的幻觉。IEEE 医学成像学报 40,3249-3260(2021 年)。17 15. Jakobs, S. 和 Wurm, CA 线粒体的超分辨率显微镜。化学生物学最新观点 20,9-15(2014 年)。19
1. Chopra, G. 等人,利用 CANDO 平台重新利用疗法对抗埃博拉病毒。Molecules,2016 年。21 (12):第 1537 页。2. Falls, Z. 等人,探索 CANDO 平台中的相互作用评分标准。BMC Research Notes,2019 年。12 (1):第 318 页。3. Mangione, W. 和 R. Samudrala,利用 CANDO 平台识别提高药物重新利用准确度的蛋白质特征:对药物设计的启示。Molecules,2019 年。24 (1):第 167 页。4. Minie, M. 等人,CANDO 和无限的药物发现前沿。当今药物发现,2014 年。19 (9):第 1353-1363 页。 5. Schuler, J. 等人,Foundations for a Realism-based Drug Repurposing Ontology,第十届国际生物医学本体论年会。2019 年:纽约州布法罗。6. Schuler, J. 和 R. Samudrala,Fingerprinting CANDO:通过基于结构和配体的霰弹枪式药物再利用提高准确性。ACS omega,2019 年。4 (17):第 17393-17403 页。7. Fine, J. 等人,计算化学蛋白质组学以了解选定的精神活性物质在治疗精神健康指征中的作用。科学报告,2019 年。9 (1):第 1-15 页。8. Mangione, W. 等人,cando.py:用于大规模药物-蛋白质-疾病数据预测生物分析的开源软件。 bioRxiv, 2020: 第 845545 页。9. Fine, J. 等人,CANDOCK:基于化学原子网络的分层灵活对接算法,使用广义统计势。BioRxiv, 2019: 第 442897 页。10. Jenwitheesuk, E. 等人,药物发现的新范式:计算多靶点筛选。药理学趋势,2008 年。29 (2): 第 62-71 页。11. Michael, SF 等人,优化的登革热病毒进入抑制肽 (10AN)。2014 年,Google Patents。12. Michael, SF 等人,优化的登革热病毒进入抑制肽 (dn81)。2013 年,Google Patents。 13. Harrison, C.,冠状病毒使药物再利用走上了快车道。Nat Biotechnol,2020 年。14. Samudrala, R.、W. Mangione 和 Z. Falls。CANDO 对 COVID-19 的初步预测。2020 年 [引用于 2020 年 3 月 16 日];可从以下网址获取:http://protinfo.compbio.buffalo.edu/cando/results/covid19/。15. Dyall, J. 等人,重新利用临床开发的药物治疗中东呼吸综合征冠状病毒感染。抗菌剂和化学疗法,2014 年。58 (8):第 4885-4893 页。16. Shen, L. 等人,高通量筛选和鉴定有效的广谱冠状病毒抑制剂。病毒学杂志,2019 年。93 (12):第 4885-4893 页。 e00023-19。
Ravin,St.S.,Reik,A.,Liu,P.Q.,Li,L.,Wu,X,X,South,L。和Al。 (2016)。 具有灾难粒状编年史的人类中的靶标添加。 nat。 生物技术 34,424–429。 10.1038/nbt。 (2016)。 crispr/cas9在人和干细胞中的β-珠蛋白基因。 自然539,384–389。 doi:10.1038/nature2 (2017)。 基因治疗者在CD34( +)后代和患者贫血中编辑。 贝尔摩尔。 但是。 9,1574–1588。 doi:10.15252/母亲20170750 Eyquem,J.,Mansilla-Soto,J (2017)。 自然543,113–117。 doi:10.1038/nature2 (2014)。 基因组基因组和人类重生和干细胞。 自然510,235–240。 doi:10.1038/自然 (2019)。 人类基因组编辑的造血刺激炎性疾病的细胞。 nat。 公社。 ISCIENCE 12,369–3Ravin,St.S.,Reik,A.,Liu,P.Q.,Li,L.,Wu,X,X,South,L。和Al。(2016)。具有灾难粒状编年史的人类中的靶标添加。nat。生物技术34,424–429。10.1038/nbt。(2016)。crispr/cas9在人和干细胞中的β-珠蛋白基因。自然539,384–389。doi:10.1038/nature2(2017)。基因治疗者在CD34( +)后代和患者贫血中编辑。贝尔摩尔。但是。9,1574–1588。doi:10.15252/母亲20170750 Eyquem,J.,Mansilla-Soto,J(2017)。自然543,113–117。doi:10.1038/nature2(2014)。基因组基因组和人类重生和干细胞。自然510,235–240。doi:10.1038/自然(2019)。人类基因组编辑的造血刺激炎性疾病的细胞。nat。公社。ISCIENCE 12,369–3ISCIENCE 12,369–310:4045。 doi:10.1038/s41467-019-11962-8 Greiner,V.,Bou Puerto,R.,Liu,S.,Herbel,C.,Carmona,E。M.和Goldberg,M.S。(2019)。CRISPR介导的B细胞受体在原代人B细胞中的编辑。 doi:10.1016/j.isci.2019.01.032 Hartweger,H.,McGuire,A.T.,Horning,M.,Taylor,J.J.,Dosenovic,P.,Yost P.,Yost,D。等。 (2019)。 HIV特定的体液免疫反应由CRISPR/CAS9编辑的B细胞。 J. Exp。 Med。 216,1301–1310。 doi:10.1084/jem.20190287 Hubbard,N.,Hagin,D.,Sommer,K.,Song,Y.,Khan,I.,Clough,C。等。 (2016)。 靶向基因编辑可恢复X连锁超级IGM综合征中调节的CD40L功能。 血液127,2513–2522。 doi:10.1182/Blood-2015-11-683235 Kuo,C.Y.,Long,J.D.,Campo-Fernandez,B.,De Oliveira,S.,Cooper,A.R.,Romero,Z。等。 (2018)。 部位特异性基因编辑人类造血干细胞的X连锁性高IGM综合征。 细胞代表。 23,2606–2616。 doi:10.1016/j.celrep.2018.04.103 Laoharawee,K.,Dekelver,R.C.,Podetz-Pedersen,K.M.,Rohde,M.,Sproul,S.,Nguyen,H.O。等。 (2018)。 通过ZFN介导的体内基因组编辑中的鼠MPS II中代谢和神经疾病的剂量依赖性预防。 mol。 ther。 26,1127–1136。 doi:10.1016/j.ymthe.2018.03.002 Li,H.,Haurigot,V.,Doyon,Y.,Li,T.,Wong,S.Y.,Bhagwat,A.S。等。 (2011)。 体内基因组编辑在血友病的小鼠模型中恢复止血。 自然475,217–221。 (2007)。 nat。CRISPR介导的B细胞受体在原代人B细胞中的编辑。doi:10.1016/j.isci.2019.01.032 Hartweger,H.,McGuire,A.T.,Horning,M.,Taylor,J.J.,Dosenovic,P.,Yost P.,Yost,D。等。(2019)。HIV特定的体液免疫反应由CRISPR/CAS9编辑的B细胞。 J. Exp。 Med。 216,1301–1310。 doi:10.1084/jem.20190287 Hubbard,N.,Hagin,D.,Sommer,K.,Song,Y.,Khan,I.,Clough,C。等。 (2016)。 靶向基因编辑可恢复X连锁超级IGM综合征中调节的CD40L功能。 血液127,2513–2522。 doi:10.1182/Blood-2015-11-683235 Kuo,C.Y.,Long,J.D.,Campo-Fernandez,B.,De Oliveira,S.,Cooper,A.R.,Romero,Z。等。 (2018)。 部位特异性基因编辑人类造血干细胞的X连锁性高IGM综合征。 细胞代表。 23,2606–2616。 doi:10.1016/j.celrep.2018.04.103 Laoharawee,K.,Dekelver,R.C.,Podetz-Pedersen,K.M.,Rohde,M.,Sproul,S.,Nguyen,H.O。等。 (2018)。 通过ZFN介导的体内基因组编辑中的鼠MPS II中代谢和神经疾病的剂量依赖性预防。 mol。 ther。 26,1127–1136。 doi:10.1016/j.ymthe.2018.03.002 Li,H.,Haurigot,V.,Doyon,Y.,Li,T.,Wong,S.Y.,Bhagwat,A.S。等。 (2011)。 体内基因组编辑在血友病的小鼠模型中恢复止血。 自然475,217–221。 (2007)。 nat。HIV特定的体液免疫反应由CRISPR/CAS9编辑的B细胞。J. Exp。Med。216,1301–1310。doi:10.1084/jem.20190287 Hubbard,N.,Hagin,D.,Sommer,K.,Song,Y.,Khan,I.,Clough,C。等。(2016)。靶向基因编辑可恢复X连锁超级IGM综合征中调节的CD40L功能。血液127,2513–2522。doi:10.1182/Blood-2015-11-683235 Kuo,C.Y.,Long,J.D.,Campo-Fernandez,B.,De Oliveira,S.,Cooper,A.R.,Romero,Z。等。(2018)。部位特异性基因编辑人类造血干细胞的X连锁性高IGM综合征。细胞代表。23,2606–2616。doi:10.1016/j.celrep.2018.04.103 Laoharawee,K.,Dekelver,R.C.,Podetz-Pedersen,K.M.,Rohde,M.,Sproul,S.,Nguyen,H.O。等。(2018)。通过ZFN介导的体内基因组编辑中的鼠MPS II中代谢和神经疾病的剂量依赖性预防。mol。ther。26,1127–1136。doi:10.1016/j.ymthe.2018.03.002 Li,H.,Haurigot,V.,Doyon,Y.,Li,T.,Wong,S.Y.,Bhagwat,A.S。等。(2011)。体内基因组编辑在血友病的小鼠模型中恢复止血。自然475,217–221。(2007)。nat。doi:10.1038/nature10177伦巴多(A.使用锌纤维核酸酶和整合酶缺陷式慢病毒载体递送中的人类干细胞中的基因编辑。生物技术。25,1298–1306。doi:10.1038/nbt1353 Macleod,D.T.,Antony,J.,Martin,A.J.,Moser,R.J.,Hekele,A.,Wetzel,K.J.等。(2017)。将CD19汽车的整合到TCRα链基因座中,简化了同种异体基因编辑的CAR T细胞的产生。mol。ther。25,949–961。 doi:10.1016/j.ymthe.2017.02.005 Mo i Q. (2019)。 B细胞设计用于表达病原体特异性抗体防止感染的细胞。 SCI。 免疫。 4:AAX0644。 doi:10.1126/sciimmunol.aax0644 Ou,L.,Dekelver,R.C.,Rohde,M.,Tom,S.,Radeke,R.,St Martin,S.J。等。 (2019)。 ZFN介导的体内基因组编辑纠正了鼠hurler综合征。 mol。 ther。 27,178–187。 doi:10.1016/j.ymthe.2018.10.018 OU,L.,Przybilla,M.J.,Ahlat,O. (2020)。 高度有效的PS基因编辑系统纠正了I. mol的粘多糖含量的代谢和神经系统并发症。 ther。 28,1442–1454。 doi:10.1016/j.ymthe.2020.03.018 Rai,R.,Romito,M.,Rivers,E.,Turchiano,G.,Blattner,G.,G.,Vetharoy,W。等。 (2020)。 nat。 社区。25,949–961。doi:10.1016/j.ymthe.2017.02.005 Mo i Q.(2019)。B细胞设计用于表达病原体特异性抗体防止感染的细胞。SCI。 免疫。 4:AAX0644。 doi:10.1126/sciimmunol.aax0644 Ou,L.,Dekelver,R.C.,Rohde,M.,Tom,S.,Radeke,R.,St Martin,S.J。等。 (2019)。 ZFN介导的体内基因组编辑纠正了鼠hurler综合征。 mol。 ther。 27,178–187。 doi:10.1016/j.ymthe.2018.10.018 OU,L.,Przybilla,M.J.,Ahlat,O. (2020)。 高度有效的PS基因编辑系统纠正了I. mol的粘多糖含量的代谢和神经系统并发症。 ther。 28,1442–1454。 doi:10.1016/j.ymthe.2020.03.018 Rai,R.,Romito,M.,Rivers,E.,Turchiano,G.,Blattner,G.,G.,Vetharoy,W。等。 (2020)。 nat。 社区。SCI。免疫。4:AAX0644。doi:10.1126/sciimmunol.aax0644 Ou,L.,Dekelver,R.C.,Rohde,M.,Tom,S.,Radeke,R.,St Martin,S.J。等。(2019)。ZFN介导的体内基因组编辑纠正了鼠hurler综合征。mol。ther。27,178–187。doi:10.1016/j.ymthe.2018.10.018 OU,L.,Przybilla,M.J.,Ahlat,O.(2020)。高度有效的PS基因编辑系统纠正了I. mol的粘多糖含量的代谢和神经系统并发症。ther。28,1442–1454。doi:10.1016/j.ymthe.2020.03.018 Rai,R.,Romito,M.,Rivers,E.,Turchiano,G.,Blattner,G.,G.,Vetharoy,W。等。(2020)。nat。社区。针对人类造血干细胞的靶向基因校正,以治疗Wiskott -Aldrich综合征。11:4034。 doi:10.1038/s41467-020-17626-2 Scharenberg,S.G.,Poletto,E.,Lucot,K.L.,Colella,P.,Sheikali,A.(2020)。工程单核细胞/巨噬细胞特异性葡萄糖脑苷酶