技术 HPLC、IC、GCMS、ICPOES、分子克隆、蛋白质印迹、凝集素印迹、酶动力学、生物反应器培养(大肠杆菌、微藻、蓝藻)、共聚焦显微镜、流式细胞术、实时 qPCR、PCR、SDS PAGE、提取(蛋白质、氨基酸、脂肪酸、色素、碳水化合物、PHB) 出版物 Kriechbaum R.、Kronlachner L.、Limbeck A.、Kopp J.、Spadiut O.;迈向循环经济——利用小球藻重新利用马铃薯加工行业的副产品。环境管理杂志 (2024)。DOI:https://doi.org/10.1016/j.jenvman.2024.121796 Kriechbaum R.、Spadiut O.、Kopp J.;普通小球藻对呋喃化合物的生物转化——揭示生物技术潜力。微生物(2024)。 DOI:https://doi.org/10.3390/microorganisms12061222 Grivalský T、Lakatos GE、Štěrbová K、Manoel JAC、Beloša R、Divoká P、Kopp J、Kriechbaum R、Spadiut O、Zwirzitz A、Trenzinger K、Masojídek J (2024)集胞藻 MT_a24 在水道池中利用城市废水生产聚-β-羟基丁酸酯。应用微生物学与生物技术 108 (1):1- 12。doi:10.1007/s00253-023-12924-3 Kriechbaum R、Loaiza SS、Friedl A、Spadiut O、Kopp J (2023) 利用小球藻产生的稻草衍生的半纤维素水解物:为生物精炼方法做出贡献。应用藻类学杂志。doi:10.1007/s10811-023-03082-0 Doppler P、Kriechbaum R、Spadiut O (2022) 使用流式细胞术对丝状蓝藻 Anabaena sp. 进行高通量表征。微生物学方法杂志 199:106510。 doi:10.1016/j.mimet.2022.106510 Doppler P、Gasser C、Kriechbaum R、Ferizi A、Spadiut O (2021) 使用超声增强 ATR-FTIR 光谱探针对光生物反应器培养的集胞藻中的聚羟基丁酸酯进行原位定量分析。生物工程 8 (9):129 Doppler P、Kriechbaum R、Käfer M、Kopp J、Remias D、Spadiut O (2022) Coelastrella terrestris 用于生产 Adonixanthin:生理表征和次级类胡萝卜素生产力评估。 Marine Drugs 20 (3):175 Doppler P, Kriechbaum R , Singer B, Spadiut O (2021) 使微藻培养物再次无菌——利用荧光激活细胞分选的快速简便的工作流程。微生物方法杂志 186:106256。doi:https://doi.org/10.1016/j.mimet.2021.106256 Kriechbaum R , Ziaee E, Grünwald-Gruber C, Buscaill P, van der Hoorn RAL, Castilho A (2020) BGAL1 耗竭可提高 N. benthamiana 中 N- 和 O-聚糖的 β-半乳糖基化水平。植物生物技术杂志 18 (7):1537-1549。 doi:10.1111/pbi.13316 会议和研讨会 AlgaEurope – 希腊雅典 12/2024 海报展示:“循环水产养殖中的小球藻 – 鱼类废水中分析物的定量和预测”研讨会 Kreislauf Alge – Vom Abwasser zur Ressource 06/2024 口头报告和联合主持人
[4] Gibson B, Wilson DJ, Feil E 等人。野生环境中细菌倍增时间的分布。Proc Biol Sci, 2018, 285: 20180789 [5] Yu J, Liberton M, Cliften PF 等人。Synechococcus elongatus UTEX 2973,一种利用光和二氧化碳进行生物合成的快速生长蓝藻底盘。Sci Rep, 2015, 5: 8132 [6] Paddon CJ, Westfall PJ, Pitera DJ 等人。强效抗疟药青蒿素的高水平半合成生产。Nature, 2013, 496: 528-32 [7] Lin MT, Occhialini A, Andralojc PJ 等人。一种更快的 Rubisco,具有提高作物光合作用的潜力。 Nature, 2014, 513: 547-50 [8] Bailey-Serres J, Parker JE, Ainsworth EA 等. 提高作物产量的遗传策略。Nature, 2019, 575: 109-18 [9] Gleizer S, Ben-Nissan R, Bar-On YM 等. 转化大肠杆菌从二氧化碳生成所有生物质碳。Cell, 2019, 179: 1255-63 [10] Chen FYH, Jung HW, Tsuei CY 等. 将大肠杆菌转化为仅靠甲醇生长的合成甲基营养菌。Cell, 2020, 182: 933-46 [11] Kaneko T, Sato S, Kotani H 等.单细胞蓝藻Synechocystis sp. 菌株 PCC6803 的基因组序列分析。II. 整个基因组的序列测定和潜在蛋白质编码区的分配。DNA Res,1996,3:109 [12] van Alphen P、Najafabadi HA、dos Santos FB 等人。通过确定其培养的局限性来提高 Synechocystis sp. PCC 6803 的光自养生长率。Biotechnol J,2018,13:e1700764 [13] Sheng J、Kim HW、Badalamenti JP 等人。温度变化对台式光生物反应器中 Synechocystis sp PCC6803 的生长率和脂质特性的影响。 Bioresour Technol, 2011, 102: 11218-25 [14] 张胜山, 郑胜南, 孙建华, 等. 通过便捷引入 AtpA-C252F 突变快速提高蓝藻细胞工厂的高光和高温耐受性。Front Microbiol, 2021, 12: 647164 [15] Ungerer J, Lin PC, Chen HY, 等. 调整光系统化学计量和电子转移蛋白是蓝藻 Synechococcus elongatus UTEX 2973 快速生长的关键。Mbio, 2018, 9: e02327-17 [16] Wlodarczyk A, Selao TT, Norling B, 等. 新发现的 Synechococcus sp. PCC 11901 是一种可高产生物量的强健蓝藻菌株。Commun Biol, 2020, 3: 215 [17] Jaiswal D, Sengupta A, Sohoni S 等人。从印度分离的一种强健、快速生长且可自然转化的蓝藻 Synechococcus elongatus PCC 11801 的基因组特征和生化特性。Sci Rep, 2018, 8: 16632 [18] Jaiswal D, Sengupta A, Sengupta S 等人。一种新型蓝藻 Synechococcus elongatus PCC 11802 与其邻居 PCC 11801 相比具有不同的基因组和代谢组学特征。Sci Rep, 2020, 10:
1.) Ishino, Y.、Shinagawa, H.、Makino, K.、Amemura, M. 和 Nakata, A. (1987)。负责大肠杆菌碱性磷酸酶同工酶转化的 iap 基因的核苷酸序列以及该基因产物的鉴定。J. Bacteriol. 169:5429-5433 2.) Jansen, R.、van Embden, JDA、Gaastra, W. 和 Schouls, LM (2002)。在原核生物中鉴定一种新型序列重复家族。OMICS 6:23-33 3.) Schaeffer, SK 和 Nakata, PA (2015)。CRISPR/Cas9 介导的植物基因组编辑和基因替换:从实验室到田野的转变。植物科学。 240:130-142 4.) Gomaa, AA, Klumpe, HE, Luo, ML, Selle, K., Barrangou, R. 和 Beisel, CL (2014) 使用基因组靶向 CRISPR-Cas 系统可编程去除细菌菌株。mBio 5(1):e00928-13 5.) Cui, L. 和 Bikard, D. (2016). Cas9 切割对大肠杆菌染色体的影响。Nucleic Acids Res. 44(9):4243-4251 6.) Yang, H., Jia, M., Geornaras, I., Woerner, DR, Morley, PS 和 Belk, KE (2017). 扩展 CRISPR-Cas9 系统在牛肉生产中序列特异性消除食源性病原体的能力。最终报告由美国科罗拉多州立大学肉类安全与质量中心提交给美国全国牛肉协会,科罗拉多州柯林斯堡,24 页。7.) Yang, H., Jia, M., Geornaras, I., Woerner, DR, Morley, PS 和 Belk, KE (2018)。构建噬菌体介导系统以递送 CRISPR-Cas9 抗菌剂,从而针对序列特异性地消除牛肉生产中的食源性病原体。最终报告由美国科罗拉多州立大学肉类安全与质量中心提交给美国全国牛肉协会,科罗拉多州柯林斯堡,32 页。8.) Luo, ML, Leenay, RT 和 Beisel, CL (2016)。基于 CRISPR 的细菌工具的现状和未来前景。生物技术与生物工程。113(5):930-43。 9.) de la Fuente-Núñez, C. 和 Lu, TK (2017)。CRISPR-Cas9 技术:在基因组工程中的应用、序列特异性抗菌药物的开发以及未来前景。Integr Biol (Camb)。9(2):109-122。10.) Es, I.、Gavahian, M.、Marti-Quijal, FJ、Lorenzo, JM、Khaneghah, AM、Tsatsanis, C.、Kampranis, SC 和 Barba, FJ (2019)。CRISPR-Cas9 基因组编辑机制在食品和农业科学中的应用:现状、未来前景和相关挑战。Biotechnol. Adv. 37:410-421 11.) Van der Berg, JP、Kleter, GA、Battaglia, E.、Groenen, MAM 和 Kok, EJ (2020)。牛基因改造的发展及其对监管、安全和可追溯性的影响。农业科学工程前沿 7:136-147 12.) Yang, H., Dong, J., Geornaras, I., Thomas, MG, Prenni, JE & Belk, KE (2021). 使用基于组学的分析方法和牛细胞系模型系统评估和减轻基于 CRISPR-Cas9 的靶向杀灭系统在肉牛生产中的潜在生物安全风险。科罗拉多州立大学肉类安全与质量中心(科罗拉多州柯林斯堡)提交给美国全国牛肉协会的最终报告,58 页。
细菌免疫。Science。337 : 816-821, 2012。6)Gaj T, Gersbach CA, Barbas CF.: 基于ZFN、TALEN 和CRISPR/Cas 的基因组工程方法。Trends. Biotechnol. 31 : 397-405, 2013。7)Doudna JA, Charpentier E.: 基因组编辑。利用CRISPR-Cas9 进行基因组工程的新前沿。Science。346 : 1258096, 2014。8)Strecker J, Ladha A, Gardner Z 等:利用CRISPR 相关转座酶进行RNA 引导的DNA 插入。Science。 365 :48-53,2019。9)Klompe SE,Vo PLH,Halpin-Healy TS 等:转座子编码的 CRISPR-Cas 系统直接介导 RNA 引导的 DNA 整合。Nature。571 :219-225,2019。10)Jacobi AM,Rettig GR,Turk R 等:用于高效基因组编辑的简化 CRISPR 工具及其向哺乳动物细胞和小鼠受精卵中的精简协议。方法。121-122 :16-28,2017。11)Lino CA,Harper JC,Carney JP 等:CRISPR 的递送:挑战和方法综述。药物递送。 12)Kaneko T.:用于产生和维持有价值动物品系的生殖技术。J. Reprod. Dev. 64:209-215,2018。 13)Mizuno N,Mizutani E,Sato H等:通过腺相关病毒载体通过CRISPR/Cas9介导的基因组编辑实现胚胎内基因盒敲入。iScience。9:286-297,2018。 14)Yoon Y,Wang D,Tai PWL等:利用重组腺相关病毒在小鼠胚胎中精简体外和体内基因组编辑。Nat. Commun. 9 : 412, 2018。15)Takahashi G, Gurumurthy CB, Wada K, 等:GONAD:通过输卵管核酸递送系统进行基因组编辑:一种新型的小鼠微注射独立基因组工程方法。Sci. Rep. 5 : 11406, 2015。16)Sato M, Ohtsuka M, Nakamura S.:输卵管内滴注溶液作为在体内操纵植入前哺乳动物胚胎的有效途径。New Insights into Theriogenology, InTechOpen, London, 2018, pp 135-150。 17)Sato M,Takabayashi S,Akasaka E 等:基因组编辑试剂在小鼠生殖细胞、胚胎和胎儿体内靶向递送的最新进展和未来展望。Cells。9:799,2020。18)Alapati D,Zacharias WJ,Hartman HA 等:宫内基因编辑治疗单基因肺疾病。Sci. Transl. Med。11:eaav8375,2019。19)Nakamura S,Ishihara M,Ando N 等:基因组编辑成分经胎盘递送导致中期妊娠小鼠胎儿胚胎心肌细胞突变。IUBMB life。 20)Sato T, Sakuma T, Yokonishi T 等:利用 TALEN 和双切口 CRISPR/Cas9 在小鼠精原干细胞系中进行基因组编辑。Stem Cell Reports。5:75-82,2015。21)Wu Y, Zhou H, Fan X 等:通过 CRISPR-Cas9 介导的基因编辑纠正小鼠精原干细胞中的一种遗传疾病
5。eke pi,dye ba,wei L等。美国成人期间泰迪斯的患病率更新:NHANES 2009年至2012年。J pendenontol。2015; 86(5):611-622。 6。 Eke Pi,Wei L,Borgnakke WS等。 在美国,成年人≥65岁的成年人的牙周炎。 2000年。 2016; 72(1):76-95。 7。 KönigJ,Holtfreter B,Kocher T.欧洲的牙周健康:基于治疗需求和提供杂型服务的促进趋势 - 位置论文1. Eur J Dent Educ。 2010; 14(增刊1):4-24。 8。 LópezR,Smith PC,GöstemeyerG,Schwendicke F.老化,龋齿和牙周疾病。 J Clin Accentoltol。 2017; 44(S18):S 145-S152。 9。 Helal O,GöstemeyerG,Krois J,Fawzy El Sayed K,Graetz C,Schwendicke F.牙周炎的预测因素:系统评价和荟萃分析。 J Clin Accentoltol。 2019; 46(7):699-712。 10。 Pitchika V,Jordan RA,Norderyd O等。 因素影响欧洲人口牙齿脱落的因素。 J Clin Accentoltol。 2022; 49(7):642-653。 11。 Papapanou PN,Sanz M,Buduneli N等。 牙周炎:2017年世界研讨会的工作组共识报告,涉及牙周和植入物疾病和条件的分类。 J pendenontol。 2018; 89(增刊1):S173-S182。 12。 Rajpurkar P,Chen E,Banerjee O,Topol EJ。 AI健康和医疗。 13。2015; 86(5):611-622。6。Eke Pi,Wei L,Borgnakke WS等。 在美国,成年人≥65岁的成年人的牙周炎。 2000年。 2016; 72(1):76-95。 7。 KönigJ,Holtfreter B,Kocher T.欧洲的牙周健康:基于治疗需求和提供杂型服务的促进趋势 - 位置论文1. Eur J Dent Educ。 2010; 14(增刊1):4-24。 8。 LópezR,Smith PC,GöstemeyerG,Schwendicke F.老化,龋齿和牙周疾病。 J Clin Accentoltol。 2017; 44(S18):S 145-S152。 9。 Helal O,GöstemeyerG,Krois J,Fawzy El Sayed K,Graetz C,Schwendicke F.牙周炎的预测因素:系统评价和荟萃分析。 J Clin Accentoltol。 2019; 46(7):699-712。 10。 Pitchika V,Jordan RA,Norderyd O等。 因素影响欧洲人口牙齿脱落的因素。 J Clin Accentoltol。 2022; 49(7):642-653。 11。 Papapanou PN,Sanz M,Buduneli N等。 牙周炎:2017年世界研讨会的工作组共识报告,涉及牙周和植入物疾病和条件的分类。 J pendenontol。 2018; 89(增刊1):S173-S182。 12。 Rajpurkar P,Chen E,Banerjee O,Topol EJ。 AI健康和医疗。 13。Eke Pi,Wei L,Borgnakke WS等。在美国,成年人≥65岁的成年人的牙周炎。2000年。2016; 72(1):76-95。 7。 KönigJ,Holtfreter B,Kocher T.欧洲的牙周健康:基于治疗需求和提供杂型服务的促进趋势 - 位置论文1. Eur J Dent Educ。 2010; 14(增刊1):4-24。 8。 LópezR,Smith PC,GöstemeyerG,Schwendicke F.老化,龋齿和牙周疾病。 J Clin Accentoltol。 2017; 44(S18):S 145-S152。 9。 Helal O,GöstemeyerG,Krois J,Fawzy El Sayed K,Graetz C,Schwendicke F.牙周炎的预测因素:系统评价和荟萃分析。 J Clin Accentoltol。 2019; 46(7):699-712。 10。 Pitchika V,Jordan RA,Norderyd O等。 因素影响欧洲人口牙齿脱落的因素。 J Clin Accentoltol。 2022; 49(7):642-653。 11。 Papapanou PN,Sanz M,Buduneli N等。 牙周炎:2017年世界研讨会的工作组共识报告,涉及牙周和植入物疾病和条件的分类。 J pendenontol。 2018; 89(增刊1):S173-S182。 12。 Rajpurkar P,Chen E,Banerjee O,Topol EJ。 AI健康和医疗。 13。2016; 72(1):76-95。7。KönigJ,Holtfreter B,Kocher T.欧洲的牙周健康:基于治疗需求和提供杂型服务的促进趋势 - 位置论文1. Eur J Dent Educ。 2010; 14(增刊1):4-24。 8。 LópezR,Smith PC,GöstemeyerG,Schwendicke F.老化,龋齿和牙周疾病。 J Clin Accentoltol。 2017; 44(S18):S 145-S152。 9。 Helal O,GöstemeyerG,Krois J,Fawzy El Sayed K,Graetz C,Schwendicke F.牙周炎的预测因素:系统评价和荟萃分析。 J Clin Accentoltol。 2019; 46(7):699-712。 10。 Pitchika V,Jordan RA,Norderyd O等。 因素影响欧洲人口牙齿脱落的因素。 J Clin Accentoltol。 2022; 49(7):642-653。 11。 Papapanou PN,Sanz M,Buduneli N等。 牙周炎:2017年世界研讨会的工作组共识报告,涉及牙周和植入物疾病和条件的分类。 J pendenontol。 2018; 89(增刊1):S173-S182。 12。 Rajpurkar P,Chen E,Banerjee O,Topol EJ。 AI健康和医疗。 13。KönigJ,Holtfreter B,Kocher T.欧洲的牙周健康:基于治疗需求和提供杂型服务的促进趋势 - 位置论文1.Eur J Dent Educ。2010; 14(增刊1):4-24。8。LópezR,Smith PC,GöstemeyerG,Schwendicke F.老化,龋齿和牙周疾病。J Clin Accentoltol。2017; 44(S18):S 145-S152。 9。 Helal O,GöstemeyerG,Krois J,Fawzy El Sayed K,Graetz C,Schwendicke F.牙周炎的预测因素:系统评价和荟萃分析。 J Clin Accentoltol。 2019; 46(7):699-712。 10。 Pitchika V,Jordan RA,Norderyd O等。 因素影响欧洲人口牙齿脱落的因素。 J Clin Accentoltol。 2022; 49(7):642-653。 11。 Papapanou PN,Sanz M,Buduneli N等。 牙周炎:2017年世界研讨会的工作组共识报告,涉及牙周和植入物疾病和条件的分类。 J pendenontol。 2018; 89(增刊1):S173-S182。 12。 Rajpurkar P,Chen E,Banerjee O,Topol EJ。 AI健康和医疗。 13。2017; 44(S18):S 145-S152。9。Helal O,GöstemeyerG,Krois J,Fawzy El Sayed K,Graetz C,Schwendicke F.牙周炎的预测因素:系统评价和荟萃分析。J Clin Accentoltol。2019; 46(7):699-712。 10。 Pitchika V,Jordan RA,Norderyd O等。 因素影响欧洲人口牙齿脱落的因素。 J Clin Accentoltol。 2022; 49(7):642-653。 11。 Papapanou PN,Sanz M,Buduneli N等。 牙周炎:2017年世界研讨会的工作组共识报告,涉及牙周和植入物疾病和条件的分类。 J pendenontol。 2018; 89(增刊1):S173-S182。 12。 Rajpurkar P,Chen E,Banerjee O,Topol EJ。 AI健康和医疗。 13。2019; 46(7):699-712。10。Pitchika V,Jordan RA,Norderyd O等。因素影响欧洲人口牙齿脱落的因素。J Clin Accentoltol。2022; 49(7):642-653。11。Papapanou PN,Sanz M,Buduneli N等。牙周炎:2017年世界研讨会的工作组共识报告,涉及牙周和植入物疾病和条件的分类。J pendenontol。2018; 89(增刊1):S173-S182。 12。 Rajpurkar P,Chen E,Banerjee O,Topol EJ。 AI健康和医疗。 13。2018; 89(增刊1):S173-S182。12。Rajpurkar P,Chen E,Banerjee O,Topol EJ。AI健康和医疗。 13。AI健康和医疗。13。nat Med。2022; 28(1):31-38。Ahmed N,Abbasi MS,Zuberi F等。 人工智能技术:牙科中的分析,应用和结果 - 系统审查。 Biomed res int。 2021; 2021:9751564。 14。 Revilla-LeónM,Gómez-Polo M,Barmak AB等。 用于诊断牙龈炎和牙周疾病的人工智能模型:系统评价。 J假肢。 2023; 130(6):816-824。 15。 Bartold PM,Ivanovski S. P4药物作为精确牙周护理的模型。 临床口腔调查。 2022; 26(9):5517-5533。 16。 Schwendicke F,Krois J. 精确牙科 - 是什么,在哪里失败(尚)以及如何到达那里。 临床口腔调查。 2022; 26(4):3395-3403。 17。 金斯堡GS,麦卡锡JJ。 个性化医学:革命性药物发现和患者护理。 趋势生物技术。 2001; 19(12):491-496。 18。 Giannobile WV,Braun TM,Caplis AK,Doucette-Stamm L,Duff GW,Kornman KS。 患者分层进行预防性护理。 j dent res。 2013; 92(8):694-701。 19。 Wang CW,Hao Y,Di Gianfilippo R等。 机器学习 -Ahmed N,Abbasi MS,Zuberi F等。人工智能技术:牙科中的分析,应用和结果 - 系统审查。Biomed res int。2021; 2021:9751564。14。Revilla-LeónM,Gómez-Polo M,Barmak AB等。用于诊断牙龈炎和牙周疾病的人工智能模型:系统评价。J假肢。2023; 130(6):816-824。15。Bartold PM,Ivanovski S. P4药物作为精确牙周护理的模型。临床口腔调查。2022; 26(9):5517-5533。16。Schwendicke F,Krois J.精确牙科 - 是什么,在哪里失败(尚)以及如何到达那里。临床口腔调查。2022; 26(4):3395-3403。17。金斯堡GS,麦卡锡JJ。个性化医学:革命性药物发现和患者护理。趋势生物技术。2001; 19(12):491-496。 18。 Giannobile WV,Braun TM,Caplis AK,Doucette-Stamm L,Duff GW,Kornman KS。 患者分层进行预防性护理。 j dent res。 2013; 92(8):694-701。 19。 Wang CW,Hao Y,Di Gianfilippo R等。 机器学习 -2001; 19(12):491-496。18。Giannobile WV,Braun TM,Caplis AK,Doucette-Stamm L,Duff GW,Kornman KS。患者分层进行预防性护理。j dent res。2013; 92(8):694-701。 19。 Wang CW,Hao Y,Di Gianfilippo R等。 机器学习 -2013; 92(8):694-701。19。Wang CW,Hao Y,Di Gianfilippo R等。 机器学习 -Wang CW,Hao Y,Di Gianfilippo R等。机器学习 -
1. Langedijk J、Mantel-Teeuwisse AK、Slijkerman DS、Schutjens M- HDB。药物重新定位和重新利用:文献中的术语和定义。今日药物发现。2015;20:1027-1034。2. Sivapalarajah S、Krishnakumar M、Bickerstaffe H 等人。用于癫痫药物再利用研究的实验性癫痫可处方药物 (PDE3) 数据库。癫痫。2018;59:492-501。3. Mercorelli B、Palu G、Loregian A。用于病毒性传染病的药物再利用:我们还有多远?趋势微生物学。2018;26:865-876。 4. Kakkar AK、Singh H、Medhi B。新瓶装旧酒:帕金森病的重新利用机会。欧洲药理学杂志。2018;830:115-127。5. Ashburn TT、Thor KB。药物重新定位:识别和开发现有药物的新用途。自然药物发现评论。2004;3:673-683。6. Shah RR、Stonier PD。肿瘤学中旧药的重新利用:未来临床和监管挑战带来的机遇。临床药物治疗杂志。2019;44:6-22。7. Paul SM、Mytelka DS、Dunwiddie CT 等。如何提高研发效率:制药行业的巨大挑战。自然药物发现评论。2010;9:203-214。 8. Hay M、Thomas DW、Craighead JL、Economides C、Rosenthal J。研究药物的临床开发成功率。Nat Biotechnol。2014;32:40-51。9. Nosengo N。你能教旧药新技巧吗?Nature。2016;534:314-316。10. Nishimura Y、Tagawa M、Ito H、Tsuruma K、Hara H。克服日本药物重新定位的障碍。Front Pharmacol。2017;8:729。11. Shim JS、Liu JO。药物重新定位在发现新型抗癌药物方面的最新进展。Int J Biol Sci。2014;10:654-663。12. Turanli B、Grøtli M、Boren J 等人。药物重新定位可有效治疗前列腺癌。Front Physiol。2018;9:500。13. Huang R、Southall N、Wang Y 等人。NCGC 药物集合:全面的临床批准药物资源,可用于重新利用和化学基因组学。Sci Transl Med。2011;3:80ps16。14. Chong CR、Sullivan DJ Jr。旧药的新用途。Nature。2007;448:645-646。15. Pantziarka P、Verbaanderd C、Sukhatme V 等人。ReDO_DB:肿瘤学数据库中的重新利用药物。Ecancermedicalscience。2018;12:886。16. Pantziarka P、Sukhatme V、Bouche G、Meheus L、Sukhatme VP。肿瘤学中的药物再利用 (ReDO)-双氯芬酸作为抗癌剂。Ecancermedicalscience。2016;10:610。17. Nowak-Sliwinska P、Scapozza L、Altaba ARI。肿瘤学中的药物再利用:结直肠癌的化合物、途径、表型和计算方法。Biochim Biophys Acta Rev Cancer。2019;1871:434-454。18. Frattini V、Trifonov V、Chan JM 等人。胶质母细胞瘤驱动基因组改变的综合概况。Nat Genet。2013;45:1141-1149。19. Abbruzzese C、Matteoni S、Signore M 等人。药物再利用用于治疗多形性胶质母细胞瘤。 J Exp Clin Cancer Res.2017;36:169。
1. 什么是蛋白质?它们有什么作用?:MedlinePlus Genetics。访问日期:2021 年 5 月 3 日。https://medlineplus.gov/genetics/understanding/howgeneswork/protein/ 2. Klaips CL、Jayaraj GG、Hartl FU。衰老和疾病中的细胞蛋白质稳态途径。J Cell Biol。2017;217(1):51-63。doi:10.1083/jcb.201709072 3. Ciechanover A。蛋白水解:从溶酶体到泛素和蛋白酶体。Nat Rev Mol Cell Biol。2005;6(1):79-87。doi:10.1038/nrm1552 4. Oprea TI、Bologa CG、Brunak S 等人。人类基因组中未探索的治疗机会。天然药物发现评论。2018;17(5):317-332。doi:10.1038/nrd.2018.14 5. Hopkins AL、Groom CR。可用药基因组。天然药物发现评论。2002;1(9):727-730。doi:10.1038/nrd892 6. Collins I、Wang H、Caldwell JJ、Chopra R。通过调节泛素-蛋白酶体途径进行靶向蛋白质降解的化学方法。Biochem J。2017;474(7):1127-1147。doi:10.1042/BCJ20160762 7. Ito T、Ando H、Suzuki T 等人。确定沙利度胺致畸性的主要靶点。Science。 2010;327(5971):1345-1350。doi:10.1126/science.1177319 8. Krönke J、Udeshi ND、Narla A 等。来那度胺可导致多发性骨髓瘤细胞中 IKZF1 和 IKZF3 选择性降解。Science。2014;343(6168):301-305。doi:10.1126/science.1244851 9. Lu G、Middleton RE、Sun H 等。骨髓瘤药物来那度胺可促进 cereblon 依赖性 Ikaros 蛋白破坏。Science。2014;343(6168):305-309。 doi:10.1126/science.1244917 10. Gandhi AK、Kang J、Havens CG 等。免疫调节剂来那度胺和泊马度胺通过调节 E3 泛素连接酶复合物 CRL4(CRBN.) 诱导 T 细胞阻遏物 Ikaros 和 Aiolos 降解,从而共刺激 T 细胞。Br J Haematol。2014;164(6):811-821。doi:10.1111/bjh.12708 11. Chamberlain PP、Lopez-Girona A、Miller K 等。人类 Cereblon–DDB1–来那度胺复合物的结构揭示了对沙利度胺类似物反应的基础。Nat Struct Mol Biol。2014;21(9):803-809。 doi:10.1038/nsmb.2874 12. Ito T, Handa H. Cereblon 及其下游底物作为免疫调节药物的分子靶点。Int J Hematol。2016;104(3):293-299。doi:10.1007/s12185-016-2073-4 13. Matyskiela ME, Lu G, Ito T 等人。一种新型 cereblon 调节剂将 GSPT1 募集到 CRL4 CRBN 泛素连接酶中。Nature。2016;535(7611):252-257。doi:10.1038/nature18611 14. Chamberlain PP, Cathers BE。Cereblon 调节剂:低分子量蛋白质降解诱导剂。Drug Discov Today Technol。 2019;31:29-34。doi:10.1016/j.ddtec.2019.02.004 15. Baek K、Schulman BA。分子胶概念固化。Nat Chem Biol。2020;16(1):2-3。doi:10.1038/s41589-019-0414-3 16. Scheepstra M、Hekking KFW、van Hijfte L、Folmer RHA。药物发现中用于蛋白质降解的双价配体。Comput Struct Biotechnol J。2019;17:160-176。doi:10.1016/j.csbj.2019.01.006
1。Haendel MA,Chute CG,Robinson PN。 分类,本体论和精密医学。 n Engl J Med。 2018; 379:1452-1462。 2。 Zehir A,Benayed R,Shah RH等。 对征收癌症的突变景观揭示了10,000名患者的前瞻性临床测序。 nat Med。 2017; 23:703-713。 3。 Kou T,Kanai M,Matsumoto S,Okuno Y,MutoM。在癌症治疗中进行临床测序的可能性。 JPN J Clin Oncol。 2016; 46:399-406。 4。 Kou T,Kanai M,Yamamoto Y等。 在晚期实体瘤患者中使用下一代测序的多重基因测定法进行临床测序。 癌症科学。 2017; 108:1440-1446。 5。 Sunami K,Ichikawa H,Kubo T等。 在临床环境中,针对114个癌症相关基因的面板测试的可行性和实用性:基于医院的研究。 癌症科学。 2019; 110:1480-1490。 6。 Le Tourneau C,Delord J-P,GonçalvesA等。 基于肿瘤分子分析与常规癌症(SHIVA)的分子靶向治疗:一种多中心,开放标签,概念验证,随机,随机,受控的2期试验。 lancet oncol。 2015; 16:1324-1334。 7。 TrédanO,Wang Q,Pissaloux D等。 分子筛选程序,以选择基于分子的建议疗法,用于大量癌症患者:分析探险仪试验。 Ann Oncol。 2019; 30:757-765。 8。Haendel MA,Chute CG,Robinson PN。分类,本体论和精密医学。n Engl J Med。2018; 379:1452-1462。 2。 Zehir A,Benayed R,Shah RH等。 对征收癌症的突变景观揭示了10,000名患者的前瞻性临床测序。 nat Med。 2017; 23:703-713。 3。 Kou T,Kanai M,Matsumoto S,Okuno Y,MutoM。在癌症治疗中进行临床测序的可能性。 JPN J Clin Oncol。 2016; 46:399-406。 4。 Kou T,Kanai M,Yamamoto Y等。 在晚期实体瘤患者中使用下一代测序的多重基因测定法进行临床测序。 癌症科学。 2017; 108:1440-1446。 5。 Sunami K,Ichikawa H,Kubo T等。 在临床环境中,针对114个癌症相关基因的面板测试的可行性和实用性:基于医院的研究。 癌症科学。 2019; 110:1480-1490。 6。 Le Tourneau C,Delord J-P,GonçalvesA等。 基于肿瘤分子分析与常规癌症(SHIVA)的分子靶向治疗:一种多中心,开放标签,概念验证,随机,随机,受控的2期试验。 lancet oncol。 2015; 16:1324-1334。 7。 TrédanO,Wang Q,Pissaloux D等。 分子筛选程序,以选择基于分子的建议疗法,用于大量癌症患者:分析探险仪试验。 Ann Oncol。 2019; 30:757-765。 8。2018; 379:1452-1462。2。Zehir A,Benayed R,Shah RH等。对征收癌症的突变景观揭示了10,000名患者的前瞻性临床测序。nat Med。2017; 23:703-713。 3。 Kou T,Kanai M,Matsumoto S,Okuno Y,MutoM。在癌症治疗中进行临床测序的可能性。 JPN J Clin Oncol。 2016; 46:399-406。 4。 Kou T,Kanai M,Yamamoto Y等。 在晚期实体瘤患者中使用下一代测序的多重基因测定法进行临床测序。 癌症科学。 2017; 108:1440-1446。 5。 Sunami K,Ichikawa H,Kubo T等。 在临床环境中,针对114个癌症相关基因的面板测试的可行性和实用性:基于医院的研究。 癌症科学。 2019; 110:1480-1490。 6。 Le Tourneau C,Delord J-P,GonçalvesA等。 基于肿瘤分子分析与常规癌症(SHIVA)的分子靶向治疗:一种多中心,开放标签,概念验证,随机,随机,受控的2期试验。 lancet oncol。 2015; 16:1324-1334。 7。 TrédanO,Wang Q,Pissaloux D等。 分子筛选程序,以选择基于分子的建议疗法,用于大量癌症患者:分析探险仪试验。 Ann Oncol。 2019; 30:757-765。 8。2017; 23:703-713。3。Kou T,Kanai M,Matsumoto S,Okuno Y,MutoM。在癌症治疗中进行临床测序的可能性。JPN J Clin Oncol。2016; 46:399-406。 4。 Kou T,Kanai M,Yamamoto Y等。 在晚期实体瘤患者中使用下一代测序的多重基因测定法进行临床测序。 癌症科学。 2017; 108:1440-1446。 5。 Sunami K,Ichikawa H,Kubo T等。 在临床环境中,针对114个癌症相关基因的面板测试的可行性和实用性:基于医院的研究。 癌症科学。 2019; 110:1480-1490。 6。 Le Tourneau C,Delord J-P,GonçalvesA等。 基于肿瘤分子分析与常规癌症(SHIVA)的分子靶向治疗:一种多中心,开放标签,概念验证,随机,随机,受控的2期试验。 lancet oncol。 2015; 16:1324-1334。 7。 TrédanO,Wang Q,Pissaloux D等。 分子筛选程序,以选择基于分子的建议疗法,用于大量癌症患者:分析探险仪试验。 Ann Oncol。 2019; 30:757-765。 8。2016; 46:399-406。4。Kou T,Kanai M,Yamamoto Y等。 在晚期实体瘤患者中使用下一代测序的多重基因测定法进行临床测序。 癌症科学。 2017; 108:1440-1446。 5。 Sunami K,Ichikawa H,Kubo T等。 在临床环境中,针对114个癌症相关基因的面板测试的可行性和实用性:基于医院的研究。 癌症科学。 2019; 110:1480-1490。 6。 Le Tourneau C,Delord J-P,GonçalvesA等。 基于肿瘤分子分析与常规癌症(SHIVA)的分子靶向治疗:一种多中心,开放标签,概念验证,随机,随机,受控的2期试验。 lancet oncol。 2015; 16:1324-1334。 7。 TrédanO,Wang Q,Pissaloux D等。 分子筛选程序,以选择基于分子的建议疗法,用于大量癌症患者:分析探险仪试验。 Ann Oncol。 2019; 30:757-765。 8。Kou T,Kanai M,Yamamoto Y等。在晚期实体瘤患者中使用下一代测序的多重基因测定法进行临床测序。癌症科学。2017; 108:1440-1446。 5。 Sunami K,Ichikawa H,Kubo T等。 在临床环境中,针对114个癌症相关基因的面板测试的可行性和实用性:基于医院的研究。 癌症科学。 2019; 110:1480-1490。 6。 Le Tourneau C,Delord J-P,GonçalvesA等。 基于肿瘤分子分析与常规癌症(SHIVA)的分子靶向治疗:一种多中心,开放标签,概念验证,随机,随机,受控的2期试验。 lancet oncol。 2015; 16:1324-1334。 7。 TrédanO,Wang Q,Pissaloux D等。 分子筛选程序,以选择基于分子的建议疗法,用于大量癌症患者:分析探险仪试验。 Ann Oncol。 2019; 30:757-765。 8。2017; 108:1440-1446。5。Sunami K,Ichikawa H,Kubo T等。在临床环境中,针对114个癌症相关基因的面板测试的可行性和实用性:基于医院的研究。癌症科学。2019; 110:1480-1490。 6。 Le Tourneau C,Delord J-P,GonçalvesA等。 基于肿瘤分子分析与常规癌症(SHIVA)的分子靶向治疗:一种多中心,开放标签,概念验证,随机,随机,受控的2期试验。 lancet oncol。 2015; 16:1324-1334。 7。 TrédanO,Wang Q,Pissaloux D等。 分子筛选程序,以选择基于分子的建议疗法,用于大量癌症患者:分析探险仪试验。 Ann Oncol。 2019; 30:757-765。 8。2019; 110:1480-1490。6。Le Tourneau C,Delord J-P,GonçalvesA等。 基于肿瘤分子分析与常规癌症(SHIVA)的分子靶向治疗:一种多中心,开放标签,概念验证,随机,随机,受控的2期试验。 lancet oncol。 2015; 16:1324-1334。 7。 TrédanO,Wang Q,Pissaloux D等。 分子筛选程序,以选择基于分子的建议疗法,用于大量癌症患者:分析探险仪试验。 Ann Oncol。 2019; 30:757-765。 8。Le Tourneau C,Delord J-P,GonçalvesA等。基于肿瘤分子分析与常规癌症(SHIVA)的分子靶向治疗:一种多中心,开放标签,概念验证,随机,随机,受控的2期试验。lancet oncol。2015; 16:1324-1334。 7。 TrédanO,Wang Q,Pissaloux D等。 分子筛选程序,以选择基于分子的建议疗法,用于大量癌症患者:分析探险仪试验。 Ann Oncol。 2019; 30:757-765。 8。2015; 16:1324-1334。7。TrédanO,Wang Q,Pissaloux D等。分子筛选程序,以选择基于分子的建议疗法,用于大量癌症患者:分析探险仪试验。Ann Oncol。 2019; 30:757-765。 8。Ann Oncol。2019; 30:757-765。8。Frampton GM,Fichtenholtz A,Otto GA等。基于据称平行DNA测序的临床癌症基因组分析测试的开发和验证。nat生物技术。2013; 31:1023-1031。 9。 Van Cutsem E,KöhneCH,Hitre E等。 西妥昔单抗和化学疗法作为转移性结直肠癌的初始治疗方法。 n Engl J Med。 2009; 360:1408-1417。 10。 日本癌症协会。 癌症诊断和治疗中下一代测序的临床实践指南(2.0版); 2020。 11。 Sunami K,Takahashi H,Tsuchihara K等。 临床实践指南,用于癌症诊断和治疗中的下一代测序(1.0版)。 癌症科学。 2018; 109:2980-2985。 12。 Chakravarty D,Gao J,Phillips SM等。 Oncokb:精确的Ogy知识库。 JCO Precis Oncol。 2017.1:PO.17.00011。 13。 Sicklick JK,Kato S,Okamura R等。 癌症患者的分子分析可以实现个性化联合疗法:I-Predict研究。 nat Med。 2019; 25:744-750。 14。 Dalton WB,Forde PM,Kang H等。 肿瘤学诊所的个性化医学:约翰·霍普金斯分子肿瘤委员会的实施和结果。 JCO Precis Oncol。 2017; 1:1-19。 15。 Pishvaian MJ,Blais EM,Brody JR等。 lancet oncol。 2020; 21:508-518。 16。2013; 31:1023-1031。9。Van Cutsem E,KöhneCH,Hitre E等。 西妥昔单抗和化学疗法作为转移性结直肠癌的初始治疗方法。 n Engl J Med。 2009; 360:1408-1417。 10。 日本癌症协会。 癌症诊断和治疗中下一代测序的临床实践指南(2.0版); 2020。 11。 Sunami K,Takahashi H,Tsuchihara K等。 临床实践指南,用于癌症诊断和治疗中的下一代测序(1.0版)。 癌症科学。 2018; 109:2980-2985。 12。 Chakravarty D,Gao J,Phillips SM等。 Oncokb:精确的Ogy知识库。 JCO Precis Oncol。 2017.1:PO.17.00011。 13。 Sicklick JK,Kato S,Okamura R等。 癌症患者的分子分析可以实现个性化联合疗法:I-Predict研究。 nat Med。 2019; 25:744-750。 14。 Dalton WB,Forde PM,Kang H等。 肿瘤学诊所的个性化医学:约翰·霍普金斯分子肿瘤委员会的实施和结果。 JCO Precis Oncol。 2017; 1:1-19。 15。 Pishvaian MJ,Blais EM,Brody JR等。 lancet oncol。 2020; 21:508-518。 16。Van Cutsem E,KöhneCH,Hitre E等。西妥昔单抗和化学疗法作为转移性结直肠癌的初始治疗方法。n Engl J Med。2009; 360:1408-1417。 10。 日本癌症协会。 癌症诊断和治疗中下一代测序的临床实践指南(2.0版); 2020。 11。 Sunami K,Takahashi H,Tsuchihara K等。 临床实践指南,用于癌症诊断和治疗中的下一代测序(1.0版)。 癌症科学。 2018; 109:2980-2985。 12。 Chakravarty D,Gao J,Phillips SM等。 Oncokb:精确的Ogy知识库。 JCO Precis Oncol。 2017.1:PO.17.00011。 13。 Sicklick JK,Kato S,Okamura R等。 癌症患者的分子分析可以实现个性化联合疗法:I-Predict研究。 nat Med。 2019; 25:744-750。 14。 Dalton WB,Forde PM,Kang H等。 肿瘤学诊所的个性化医学:约翰·霍普金斯分子肿瘤委员会的实施和结果。 JCO Precis Oncol。 2017; 1:1-19。 15。 Pishvaian MJ,Blais EM,Brody JR等。 lancet oncol。 2020; 21:508-518。 16。2009; 360:1408-1417。10。日本癌症协会。癌症诊断和治疗中下一代测序的临床实践指南(2.0版); 2020。11。Sunami K,Takahashi H,Tsuchihara K等。临床实践指南,用于癌症诊断和治疗中的下一代测序(1.0版)。癌症科学。2018; 109:2980-2985。 12。 Chakravarty D,Gao J,Phillips SM等。 Oncokb:精确的Ogy知识库。 JCO Precis Oncol。 2017.1:PO.17.00011。 13。 Sicklick JK,Kato S,Okamura R等。 癌症患者的分子分析可以实现个性化联合疗法:I-Predict研究。 nat Med。 2019; 25:744-750。 14。 Dalton WB,Forde PM,Kang H等。 肿瘤学诊所的个性化医学:约翰·霍普金斯分子肿瘤委员会的实施和结果。 JCO Precis Oncol。 2017; 1:1-19。 15。 Pishvaian MJ,Blais EM,Brody JR等。 lancet oncol。 2020; 21:508-518。 16。2018; 109:2980-2985。12。Chakravarty D,Gao J,Phillips SM等。Oncokb:精确的Ogy知识库。JCO Precis Oncol。2017.1:PO.17.00011。13。Sicklick JK,Kato S,Okamura R等。癌症患者的分子分析可以实现个性化联合疗法:I-Predict研究。nat Med。2019; 25:744-750。 14。 Dalton WB,Forde PM,Kang H等。 肿瘤学诊所的个性化医学:约翰·霍普金斯分子肿瘤委员会的实施和结果。 JCO Precis Oncol。 2017; 1:1-19。 15。 Pishvaian MJ,Blais EM,Brody JR等。 lancet oncol。 2020; 21:508-518。 16。2019; 25:744-750。14。Dalton WB,Forde PM,Kang H等。 肿瘤学诊所的个性化医学:约翰·霍普金斯分子肿瘤委员会的实施和结果。 JCO Precis Oncol。 2017; 1:1-19。 15。 Pishvaian MJ,Blais EM,Brody JR等。 lancet oncol。 2020; 21:508-518。 16。Dalton WB,Forde PM,Kang H等。肿瘤学诊所的个性化医学:约翰·霍普金斯分子肿瘤委员会的实施和结果。JCO Precis Oncol。2017; 1:1-19。 15。 Pishvaian MJ,Blais EM,Brody JR等。 lancet oncol。 2020; 21:508-518。 16。2017; 1:1-19。15。Pishvaian MJ,Blais EM,Brody JR等。lancet oncol。2020; 21:508-518。16。胰腺癌患者的总体存活率接受了伴侣分析后接受匹配的疗法:对您的肿瘤登记试验的回顾性分析。Rekhtman N,Leighl NB,Somerfield MR。分子检测肺癌患者表皮生长因子抑制剂和变性淋巴瘤激酶酪氨酸激酶抑制剂的分子测试:美国临床肿瘤学会认可
1. Yiannopoulou KG,Papageorgiou SG。阿尔茨海默病的当前和未来治疗:最新进展。J Cent Nerv Syst Dis。2020;12:1179573520907397。2. Krahn AI,Wells C,Drewry DH,Beitel LK,Durcan TM,Axtman AD。定义神经激酶组:针对神经退行性疾病的小分子药物发现策略和机会。ACS Chem Neurosci。2020;11:1871-1886。3. Cummings J,Lee G,Ritter A,Sabbagh M,Zhong K。阿尔茨海默病药物开发渠道:2020。Alzheimers Dement(纽约)。2020;6:e12050。 4. https://www.nia.nih.gov/research/amp-ad 5. Hodes RJ、Buckholtz N. 加速药物伙伴关系:阿尔茨海默病 (AMP-AD) 知识门户通过开放数据共享帮助发现阿尔茨海默病药物。Expert Opin Ther Targets。2016;20:389-391。 6. Mullard A. NIH 启动开放科学阿尔茨海默病计划。Nat Rev Drug Discov。2019;18:895。 7. Lee WH. 开放获取靶标验证是加速药物发现的更有效方法。PLoS Biol。2015;13:e1002164。 8. Frye SV. 化学探针的艺术。Nat Chem Biol。2010;6:159-161。 9. Arrowsmith CH、Audia JE、Austin C 等人。化学探针的前景和危险。自然化学生物学。2015;11:536-541。10. Wells CI、Drewry DH、Pickett JE 等人。开发一种针对多效性激酶 CK2 的强效选择性化学探针。细胞化学生物学。2021;28:546-558。11. Wells C、Couñago RM、Limas JC 等人。SGC-AAK1-1:一种针对 AAK1 和 BMP2K 的化学探针。ACS Med Chem Lett。2019;11:340-345。12. Asquith CRM、Berger BT、Wan J 等人。SGC-GAK-1:一种针对细胞周期蛋白 G 相关激酶(GAK)的化学探针。J Med Chem。 2019;62:2830-2836。13. Picado A、Chaikuad A、Wells CI 等人。暗激酶 STK17B 的化学探针通过独特的 P 环构象获得其效力和高选择性。J Med Chem。2020;63:14626-14646。14. Brown PJ、Müller S。用于表观遗传靶标的开放获取化学探针。未来医学化学。2015;7:1901-1917。15. Barnash KD、Lamb KN、Stuckey JI 等人。通过靶标类别定向组合重利用进行 Chromodomain 配体优化。ACS Chem Biol。2016;11:2475-2483。 16. Elkins JM、Fedele V、Szklarz M 等人。已发表激酶抑制剂集的综合表征。Nat Biotechnol。2016;34:95-103。17. Drewry DH、Wells CI、Andrews DM 等人。蛋白激酶公共化学基因组学集及征文进展。PLoS One。2017;12:e0181585。18. Drewry DH、Wells CI、Zuercher WJ、Willson TM。极端开放科学视角:公司无限制共享化合物。SLAS Discov。2019;24:505-514。19. Wells CI、Al-Ali H、Andrews DM 等人。激酶化学基因组集 (KCGS):用于激酶脆弱性识别的开放科学资源。Int J Mol Sci。2021;22:566。20. Müller S、Ackloo S、Arrowsmith CH 等人。为开放科学捐赠化学探针。Elife。2018;7:e34311。21. 勃林格殷格翰国际公司。https://opnme.com/ 22. Basu A、Bodycombe NE、Cheah JH、等人。一种用于识别小分子靶向的癌症遗传和谱系依赖性的交互式资源。细胞。2013;154:1151-1161。23. Clemons PA、Bittker JA、Wagner FF 等人。筛选中使用信息集:关于识别新探针的有效策略的观点。SLAS Discov。2021:24725552211019410。24. Antolin AA、Tym JE、Komianou A、Collins I、Workman P、Al-Lazikani B。客观、定量、数据驱动的化学探针评估。细胞化学生物学。2018;25:194-205。