这项研究工作是与其他国家和国际高声誉研究和学术机构合作进行的。其中包括Scripps研究所,La Jolla,(CA),美国国家卫生研究院/NIAAAA BETHESDA(MD),南卡罗来纳州医科大学,查尔斯顿(SC)等。多年来,我的研究活动得到了几项研究赠款的支持,其中包括欧盟(Targalc和Inveromic,FP5和FP6计划)的一些研究赠款,以及NIH/NIAAA和NIH/NIH/NIDA。我在合格的国际期刊上发表了250多种科学文章,包括自然神经科学,科学进步,神经元,贾马精神病学,《美国杂志精神病学》。神经科学,PNA,生物精神病学,神经心理药理学杂志。我还发表了几个Bock章节,并且是国家和国际级别授予的几项专利的发明者。
Data type Name Value byte method the block compression method (and first CRAM version): 0: raw (none)* 1: gzip 2: bzip2 (v2.0) 3: lzma (v3.0) 4: rans4x8 (v3.0) 5: rans4x16 (v3.1) 6: adaptive arithmetic coder (v3.1) 7: fqzcomp (v3.1) 8: name tokeniser (v3.1)字节块内容类型ID块内容类型标识符ITF8障碍物ID块,用于将外部数据块与数据系列ITF8大小相关联的块内容标识符在应用块数据中的大小为block compression inf inf bock inf8 iTf8 iTF8 iTF8原始大小中的大小在字节中*其他字段(标题块)字节[4] CRC32 CRC32 HASH值在块中的所有前字节
2。用于HPC应用程序中的高级HDFO包装解决方案Lihong CAO-高级半导体工程公司Inc. Teck Lee -Advanced Semiconductor Engineering,Inc。Yungshun Chang -Advanced Semiconductor Engineering,Inconyl Huang Huang Huang Huang -semiconductor Engineering,Inc.先进的Semicon -inc. jy incorn -Incorn -Incorn -Incorn incormond conmond conmond杨 - 高级半导体工程公司3.非对比的3D -OPTO -MID软件包的可靠性,用于光总线耦合器Lukas Lorenz -Dresden Florian Hanesch技术大学 - DRESDEN KRZYSZTOF NIEWERED -NIEWERINGIAL -DRESDEN MOHENMENKER -KUREN -KUREN -KUREN -KURENMERMEN -NAMENKER- Au Erlangen -Nuremberg Gerd -Albert Hoffmann -Leibniz Hanover Ludger Overmeyer -Leibniz University -Leibniz University hanover Karlheinz Bock - 德累斯顿技术大学
和对手。通过模拟实验,有人声称块大小对传播时间有很大影响。在本研究中,我们专注于通过优化块大小和最小化延迟来提高具有 PoW 共识的区块链网络的性能。虽然有关于块传播和传输时间的各种研究,但它们并没有从块大小的最佳值的角度来考虑。此外,他们也没有考虑块创建时间,其中包括 Merkle 树生成时间和每个块的开销,这些是我们研究中考虑的因素。预期的挖矿时间取决于目标难度和矿工的计算能力,因为它们不依赖于块大小,所以不在本研究中。另一方面,块大小限制决定了 TPS,它被认为是本研究中优化的参数之一。在本研究中,定义了多目标问题来优化块大小。优化问题的目的是提高具有 PoW 共识的基于区块链的网络的性能。
我还要感谢那些允许我查阅其藏品的档案馆以及那些机构的个人,他们的帮助和耐心令我十分感激:柏林艺术学院建筑档案馆的 Heidemarie Bock 和 Petra Albrecht;柏林州立档案馆的 Andreas Matschenz 和 Barbara Schäche;柏林艺术学院电影档案馆、柏林和科布伦茨联邦档案馆、联邦电影档案馆和盖蒂研究所的工作人员非常乐于助人。在柏林普鲁士文化档案馆、纽约佩利媒体中心、马里兰州帕克市美国国家档案与记录管理局以及美国国家美术馆图书馆工作人员的热情帮助下,我完成了额外的研究,其中 Jacqueline Protka 在安排查阅难以找到的资料方面发挥了特别重要的作用。特别感谢马萨诸塞大学阿默斯特分校的 DEFA 电影图书馆,我在那里放映了书中提到的许多东德电影。
1. Ferrarini M、Moretto M、Ward JA、Surbanovski N、Stevanovic V、Giongo L、Viola 88 R、Cavalieri D、Velasco R、Cestaro A、Sargent DJ。2013 年。对 89 PacBio RS 平台进行叶绿体基因组测序和从头组装的评估。BMC 基因组学 14:670。91 2. Stadermann KB、Weisshaar B、Holtgräwe D。2015 年。仅 SMRT 测序甜菜 (Beta vulgaris) 叶绿体基因组的从头组装。BMC 93 生物信息学 16:295。 94 3. Pucker B、Holtgräwe D、Stadermann KB、Frey K、Huettel B、Reinhardt R、95 Weisshaar B。2019 年。染色体水平序列组装揭示了拟南芥 Nd-1 基因组及其基因集的结构。PLoS One 97 14:e0216233。98 4. Altschul SF、Gish W、Miller W、Myers EW、Lipman DJ。1990 年。基本局部比对搜索工具。分子生物学杂志 215:403-410。100 5. Koren S、Walenz BP、Berlin K、Miller JR、Bergman NH、Phillippy AM。2017 年。Canu:通过自适应 k-mer 加权和 102 重复分离实现可扩展且准确的长读组装。基因组研究 27:722-736。103 6. Jansen RK、Kaittanis C、Saski C、Lee SB、Tomkins J、Alverson AJ、Daniell H. 2006. 基于完整叶绿体基因组序列的葡萄科(Vitaceae)系统发育分析:分类单元抽样和系统发育方法对解决蔷薇科间关系的影响。BMC 进化生物学 6:32。107 7. Goremykin VV、Salamini F、Velasco R、Viola R. 2009. 葡萄的线粒体 DNA 和猖獗的水平基因转移问题。分子生物学与进化 26:99-110。110 8. Wick RR、Schultz MB、Zobel J、Holt KE。 2015. Bandage:从头基因组组装的交互式可视化。生物信息学 31:3350-2。112 9. Wheeler TJ、Eddy SR。2013. nhmmer:使用概要 HMM 进行 DNA 同源性搜索。113 生物信息学 29:2487-2489。114 10. Chan PP、Lowe TM。2019. tRNAscan-SE:在基因组序列中搜索 tRNA 基因,第 1-14 页。在 Kollmar M(编辑)的《基因预测:方法和协议》中,116 2019/04/26 编辑,第 1962 卷。Springer New York,纽约。117 11. Lowe TM、Eddy SR。 1997. tRNAscan-SE:一种改进基因组序列中 118 种转移 RNA 基因检测的程序。核酸研究 25:955-964。119 12. Laslett D、Canback B。2004. ARAGORN,一种检测核苷酸序列中的 tRNA 基因和 120 种 tmRNA 基因的程序。核酸研究 32:11-16。121 13. Tillich M、Lehwark P、Pellizzer T、Ulbricht-Jones ES、Fischer A、Bock R、Greiner 122 S。2017. GeSeq - 多功能且准确的细胞器基因组注释。123 核酸研究 45:W6-W11。 124 14. Lohse M、Drechsel O、Kahlau S、Bock R. 2013. OrganellarGenomeDRAW——一套用于生成质体和线粒体基因组物理图谱并可视化表达数据集的工具。核酸研究 41:W575-581。127 15. Lohse M、Drechsel O、Bock R. 2007. OrganellarGenomeDRAW (OGDRAW):128 一个用于轻松生成高质量自定义质体和 129 线粒体基因组图形图的工具。当代遗传学 52:267-274。130
Sven Dorkenwald 1,2 , Arie Matsliah 1 , Amy R Sterling 1,3 , Philipp Schlegel 4,5 , Szi-chieh Yu 1 , Claire E. McKellar 1 , Albert Lin 1,6 , Marta Costa 5 , Katharina Eichler 5 , Yijie Yin 5 , Will Silversmith 1 , Casey Schneider-Mizell 7 , Chris S. Jordan 1 , Derrick Brittain 7 , Akhilesh Halageri 1 , Kai Kuehner 1 , Oluwaseun Ogedengbe 1 , Ryan Morey 1 , Jay Gager 1 , Krzysztof Kruk 3 , Eric Perlman 8 , Runzhe Yang 1,2 , David Deutsch 1,9 , Doug Bland 1 , Marissa Sorek 1,3 , Ran卢 1 , Thomas Macrina 1,2 , Kisuk Lee 1,10 , J. Alexander Bae 1,11 , Shang Mu 1 , Barak Nehoran 1,2 , Eric Mitchell 1 , Sergiy Popovych 1,2 , Jingpeng Wu 1 , Zhuan Jia 1 , Manuel Castro 1 , Nico Kemnitz 1 , Dodam Ih 1 , Alexander Shakeel Bates 4,5,12,13 , Nils Eckstein 14 , Jan Funke 14 , Forrest Collman 7 , Davi D. Bock 15 , Gregory SXE Jefferis 4,5 , H. Sebastian Seung 1,2 * , Mala Murthy 1 *, FlyWire 联盟
Michael Bevis Chris Jekeli CK Shum 俄亥俄州杰出学者和大地测量学教授 大地测量学名誉教授 大地测量学教授 俄亥俄州立大学 俄亥俄州立大学 俄亥俄州立大学 Dave Zilkoski Richard Salman William Carter 美国国家地理空间研究所前所长 美国国家大地测量局前局长 美国国家大地测量局测绘办公室前研究主管 James Davis Thomas Herring Craig Glennie Lamont 研究教授 大地测量学教授 大地测量工程教授 哥伦比亚大学纽约市分校 麻省理工学院 休斯顿大学 David Sandwell Stephen Hilla 加州大学圣地亚哥分校 Yehuda Bock 大地测量学教授 美国国家大地测量局杰出研究大地测量学家和美国国家科学院前研究主管 Ken Hudnut Jeff Freymueller John Factor 大地测量学教授前地球物理学家 美国地质调查局前大地测量学家 密歇根州立大学 NGA 测绘办公室
Sven Dorkenwald 1,2 , Arie Matsliah 1 , Amy R Sterling 1,3 , Philipp Schlegel 4,5 , Szi-chieh Yu 1 , Claire E. McKellar 1 , Albert Lin 1,6 , Marta Costa 5 , Katharina Eichler 5 , Yijie Yin 5 , Will Silversmith 1 , Casey Schneider-Mizell 7 , Chris S. Jordan 1 , Derrick Brittain 7 , Akhilesh Halageri 1 , Kai Kuehner 1 , Oluwaseun Ogedengbe 1 , Ryan Morey 1 , Jay Gager 1 , Krzysztof Kruk 3 , Eric Perlman 8 , Runzhe Yang 1,2 , David Deutsch 1,9 , Doug Bland 1 , Marissa Sorek 1,3 , Ran卢 1 , Thomas Macrina 1,2 , Kisuk Lee 1,10 , J. Alexander Bae 1,11 , Shang Mu 1 , Barak Nehoran 1,2 , Eric Mitchell 1 , Sergiy Popovych 1,2 , Jingpeng Wu 1 , Zhuan Jia 1 , Manuel Castro 1 , Nico Kemnitz 1 , Dodam Ih 1 , Alexander Shakeel Bates 4,5,12,13 , Nils Eckstein 14 , Jan Funke 14 , Forrest Collman 7 , Davi D. Bock 15 , Gregory SXE Jefferis 4,5 , H. Sebastian Seung 1,2 * , Mala Murthy 1 *, FlyWire 联盟 +
吡咯赖氨酸-tRNA 合成酶(PylRS)通常用于将非规范氨基酸(ncAA)位点特异性掺入蛋白质中。最近,Methanomethylophilus alvus PylRS(Ma PylRS)的活性位点经过合理设计,以扩大其底物兼容性,从而能够掺入难以结合的 ncAA。然而,尚未报道活性位点以外的可增强 Ma PylRS 酶特性的突变。我们利用噬菌体辅助非连续进化(PANCE)来进化 Ma PylRS,以有效掺入 N ε -Boc- L -赖氨酸(BocK)。定向进化产生了活性位点外的几种突变,这些突变大大提高了酶的活性。我们结合最有效的突变来生成一种新的 PylRS 变体(PylRS opt),它对几种赖氨酸和苯丙氨酸衍生物具有高活性和选择性。 PylRS opt 中的突变可用于增强先前设计的 PylRS 构建体,例如 Ma PylRS N166S,并且 PylRS opt 适用于需要双 ncAA 掺入的应用,并可显著提高这些目标蛋白的产量。