背景:卵巢癌(OC)和宫颈癌(CC)是女性死亡的主要原因。因此,确定早期检测和治疗的标记至关重要。CDK1控制细胞周期的G2/M转变,是周期的重要调节蛋白。RO-3306和UBE2C与CDK1表达有关,并可能共同促进OC的发展。CDK1和CDK2磷酸化MLK3,在OC细胞的侵袭和增殖中起重要作用。此外,miR-490-3p靶向CDK1并限制卵巢肿瘤的生长。CDK1在CC的进展中也起着至关重要的作用。例如,CDK1的过表达可以挽救与关键过程有关的RCC1敲低的影响,例如胞质转运,对G1细胞周期进程。使用生物信息学分析,我们评估了共表达基因CDK1在这两种癌症中的功能富集和作用及其对预后的影响。方法:首先,我们筛选了与OC和CC相关的DEG的公共数据集并确定了相交基因。这些基因的富集分析揭示了关键的生物学途径和过程。然后,我们生成蛋白质 - 蛋白质相互作用网络,以鉴定中央基因和重要基因模块。结果:其他富集分析表明,细胞周期调节和生殖细胞成熟是这些核心基因调节的主要过程。我们还检查了CDK1在OC和CC中的功能,证明了其过表达及其与特定的免疫细胞浸润模式的关联。此外,CDK1突变负担,拷贝数变化和患者生存分析表明,CDK1可能是有用的预后标记。最后,免疫组织化学检查证实了某些候选基因在临床样品中的表达。结论:这些发现阐明了OC和CC的分子原因,并将有助于确定有关这些癌症的未来研究的新目标,包括它们的诊断和治疗。
预印本(未通过同行评审认证)是作者/资助者。保留所有权利。未经许可就不允许重复使用。该版本的版权持有人于2025年1月19日发布。 https://doi.org/10.1101/2025.01.15.633177 doi:biorxiv preprint
主要结果:在100名化粪池患者的180个芯片中,我们在ICU入院后的第1天和第2-3天都在幸存者与非活物中的39个上调和2个下调差异表达的基因(DEG)。我们将上调DEG的集线器基因以及CX3CR1和IL1B结合了计算表达比。CDK1/CX3CR1比率具有最佳性能,可以预测全因ICU死亡率,在ROC曲线(AUROC)下的面积为0.77(95%置信区间[CI] 0.88-0.66),在第2天,在ICU下,在ICU下,第1天,0.82(95%CI 0.91-0.72)的面积为0.82(95%CI 0.91-0.72)。这种性能比每个单独的mRNA生物标志物要好。在外部验证队列中,使用RT-QPCR测量的CDK1/CX3CR1比的预测性能与第1天测量时乳酸的预测性能相似,在第2-3天测量时较高。结合乳酸水平和CDK1/CX3CR1比率,我们确定了3组具有ICU死亡率风险增加的患者,范围为9%至60%,中级风险群体死亡率为28%。
摘要:靶向蛋白质降解 (TPD) 是一种新兴的治疗方法,用于选择性消除与疾病相关的蛋白质。虽然分子胶水降解剂表现出类似药物的特性,但它们的发现传统上是偶然的,并且通常需要事后合理化。在这项研究中,我们展示了使用粘合部分合理设计分子胶水降解剂的方法。通过将化学粘合部分附加到几种小分子抑制剂上,我们成功地将它们转化为降解剂,从而无需特定的 E3 泛素连接酶募集剂。具体而言,我们发现将疏水性粘合部分整合到细胞周期依赖性激酶 12 和 13 (CDK12/13) 双重抑制剂中可以募集 DNA 损伤结合蛋白 1 (DDB1),从而将高分子量二价 CDK12 降解剂转化为有效的单价 CDK12/13 分子胶水降解剂。我们还展示了将半胱氨酸反应弹头连接到 BRD4 抑制剂上,通过招募 DDB1 和 CUL4 相关因子 16 (DCAF16) E3 连接酶将其转化为降解剂。
Jean Ching-Yi Tien, 1,2 Jie Luo, 1,2,14 Yu Chang, 1,2,14 Yuping Zhang, 1,2,14 Yunhui Cheng, 1,2,14 Xiaoju Wang, 1,2 Jianzhang Yang, 3,4 Rahul Mannan, 1,2 Somnath Mahapatra, 1,2 Palak Shah, 1,2 Xiao-Ming Wang, 1,2 Abigail J. Todd, 1,2 Sanjana Eyunni, 1,2 Caleb Cheng, 1 Ryan J. Rebernick, 1,2 Lanbo Xiao, 1,2 Yi Bao, 1,2 James Neiswender, 5 Rachel Brough, 5 Stephen J. Pettitt, 5 Xuhong Cao, 1,2 Stephanie J.), arul@med.umich.edu (A.M.C.)https://doi.org/10.1016/j.xcrm.2024.101758
CDK13相关疾病是由CDK13基因中的变化(变体)引起的。在遗传条件下常见,每个人的影响都不同(Bostwick,2019; Sifrim 2016)。是什么导致CDK13相关疾病?基因是在我们的成长和发展中具有重要作用的指示。它们是由DNA制成的,并被掺入称为染色体的有组织结构中。染色体因此包含我们的遗传信息。染色体位于我们的细胞内,即身体的构建块。CDK13-相关疾病是由特异性变化(称为致病变体)引起的,称为CDK13的基因的DNA序列(CDK13是基因的全名Cyclin-center-center-center-激酶13)引起的。CDK13基因位于7号染色体的短“ P”臂上,该区域称为P14.1,如下图所示。我们的细胞中有两个染色体的两个副本,因此我们也有两个CDK13基因的副本。CDK13仅影响CDK13基因的一个副本时,就会发生。第二份副本是完全功能的。这被称为常染色体显性,因为所有编号的染色体都称为常染色体和遗传条件,而当仅一个常染色体基因的一个副本受到影响时,就会称为遗传体。
Wojciechowska K,KwaśnyM,Pietrzyk A,LejmanM。与宪法CDK13致病变体相关的先天性心脏缺陷,面部畸形和智力发育障碍(CHDFIDD)。案例报告和文献综述。Ann Agric Environ Med。2024; 31(1):147–150。doi:10.26444/aaem/175610摘要有21种人类细胞周期蛋白依赖性激酶参与细胞周期,转录,RNA剪接,凋亡和神经发生的调节。其中五个:CDK4,CDK5,CDK6,CDK10和CDK13与人类表型有关。迄今为止,只有62例CDK13基因出现了62例。这些患者的发育迟缓,畸形面部特征,喂养困难,不同的结构心脏和脑缺陷。36具有影响CDK13蛋白激酶结构域的错义突变。我们的患者是到目前为止报告的第一人,该人在CDK13基因的第一个外显子中引入了过早的终止密码子。她具有先天性心脏缺陷,面部畸形和智力发育障碍(CHDFIDD)的症状特征。
途径在RO-3306的影响下,我们对经过各种治疗的U2932细胞进行了细致的RNA-Seq研究:DMSO,Ibrutinib,RO-3306,以及Ibrutinib和RO-3306的组合。这种方法促进了几种差异表达的RNA的识别,特别是指向与JAK2/STAT3途径激活的关联(图3)。Western印迹和免疫荧光实验,结果表明RO-3306抑制JAK2/STAT3信号,从而抑制了NF-κB的表达和Bcl-2。增强Bax的表达;并影响DLBCL细胞对依鲁替尼的生存,凋亡和药物敏感性。
。cc-by 4.0未经同行评审获得的未获得的国际许可证是作者/筹款人,他已授予Biorxiv的许可证,以永久显示预印本。它是此预印本的版权持有人(该版本发布于2023年7月18日。; https://doi.org/10.1101/2022.05.05.05.02.490309 doi:biorxiv Preprint
