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线虫秀丽隐杆线虫可以从其共存的真菌微生物组成员Barnettozyma Californica
线虫秀丽隐杆线虫在其环境中以细菌为食，并已成为微生物组研究的模型生物。然而，尽管在其自然栖息地中存在许多真菌物种，但秀丽隐杆线虫是否以及如何与同时发生的真菌相互作用仍然很大。在这里，我们将酵母Barnettozyma californica与秀丽隐杆线虫的中cosm隔离，并表征其基因组和与线虫的相互作用。我们发现B. californica被秀丽隐杆线虫摄入，可以用作食物来源的唯一，尽管很差。然而，当与大肠杆菌OP50一起使用时，真菌会导致人口增长和觅食行为改变，这表明这种真菌 - 细菌混合物比单独的细菌提供了更好的食物来源。这种效果在不同的天然秀丽隐杆线虫菌株之间有所不同，这表明线虫与加利福尼亚州的相互作用是基因组基础。分离的加州菌菌株的完全组装和注释的基因组并未表明其与秀丽隐杆线虫和/或大肠杆菌OP50相互作用的任何明显的候选基因。总的来说，我们的结果提供了一个有趣的例子，说明了自然相互作用的真菌，细菌和动物之间的复杂性和多层关系。
表达定量性状基因座结构的神秘遗传变异秀丽隐杆线虫
在不同遗传背景中的遗传扰动会导致物种内的一系列表型。这些表型差异可能是遗传背景与扰动之间相互作用的结果。以前，我们报道说，秀丽隐杆线虫发育控制的重要参与者GLD-1的扰动释放了影响不同遗传背景的适应性的隐性遗传变异（CGV）。在这里，我们研究了转录体系结构的变化。我们发现了414个基因，具有顺式表达定量性状基因座（EQTL）和991个基因，具有跨eqTL，这些基因在GLD-1 RNAI处理中特异性发现。总共检测到16个EQTL热点，其中7个仅在GLD-1 RNAi处理中发现。对这7个热点的富集分析表明，受调节的基因与神经元和咽部有关。 此外，我们在GLD-1 RNAi处理的线虫中发现了加速的Tran术语衰老的证据。 总体而言，我们的结果表明，研究CGV会导致发现隐藏的多态性调节剂。对这7个热点的富集分析表明，受调节的基因与神经元和咽部有关。此外，我们在GLD-1 RNAi处理的线虫中发现了加速的Tran术语衰老的证据。总体而言，我们的结果表明，研究CGV会导致发现隐藏的多态性调节剂。
摄入单个引导 RNA 可通过激活 CRISPR 来诱导基因过度表达并延长秀丽隐杆线虫的寿命
秀丽隐杆线虫是一种用于研究发育和衰老遗传学的多功能模型生物，通过给线虫喂养表达特定 dsRNA 的细菌可以抑制其基因表达。之前已证实通过常规转基因技术过表达缺氧诱导因子 1 ( hif-1 ) 或热休克因子 1 ( hsf-1 ) 可延长线虫寿命。然而，目前尚不清楚其他基因过表达方法是否可行，尤其是随着基于 CRISPR 的技术的出现。本文中，我们表明，给经过基因改造以稳定表达 Cas9 衍生的合成转录因子的秀丽隐杆线虫喂养表达启动子特异性单向导 RNA (sgRNA) 的细菌也可以激活基因表达。我们证明，通过摄取针对 hif-1 或 hsf-1 各自启动子区域的 sgRNA 激活 CRISPR 可增加基因表达并延长秀丽隐杆线虫的寿命。此外，作为旨在使用 CRISPR 激活秀丽隐杆线虫的未来研究的计算机资源，我们提供了预测的启动子特异性 sgRNA 靶序列，用于超过 13,000 个秀丽隐杆线虫基因，并具有实验定义的转录起始位点。我们预计本文描述的方法和组件将有助于促进全基因组基因过表达研究，例如，通过将表达 sgRNA 的细菌喂给线虫来诱导转录，以识别衰老或其他感兴趣的表型的调节因子。
TIR1 转基因在秀丽隐杆线虫生殖干细胞中激发生长素诱导的 LAG-1 降解的效率比较
生长素诱导降解 (AID) 系统最初由 Dernburg 实验室引入秀丽隐杆线虫，现已成为研究基因功能的组织特异性和/或时间方面的一种广泛使用的方法（Zhang 等人，2015 年；Ashley 等人，2020 年；Martinez 等人，2020 年）。AID 系统利用植物来源的 E3 泛素连接酶 TIR1，在用植物生长激素生长素处理后特异性地降解与“降解决定子”标签融合的蛋白质。为了提高 AID 系统的实用性，Ward 实验室最近生成了一组扩展的 TIR1s 转基因，由不同的组织特异性启动子控制（Ashley 等人，2020 年）。在这里，我们旨在比较不同种系表达的 TIR1 转基因降解转录因子 LAG-1 的效率，该转录因子的 C 端带有降解决定子 (Chen et al. , 2020)。如图 1 所示，这些 TIR1 转基因由以下启动子驱动：gld-1p (Zhang et al. 2015)、mex-5p (Ashley et al. 2020)、sun-1p (Ashley et al. 2020) 和 pie-1p (Kasimatis et al. 2018)，并含有所示的 C 端荧光蛋白和 3' 非翻译区 (图 1A)。
体外益生菌特性和体内抗衰老作用pl lantibacillus plantarum pfa2018au菌株从秀丽隐杆线虫上的胡萝卜中分离出来
摘要：乳酸细菌（LAB）共享并对人类健康提供了几种有益的影响，例如生物活性代谢产物的释放，病原体竞争和免疫刺激。益生菌微生物的两个主要储层是人类胃肠道和发酵乳制品。但是，由于其较大的分布和营养价值，其他来源（例如植物性食品）代表了重要的替代品。在这里，通过体外和体内方法研究了自plastiblantibacillus plantarum plantarum plantarum plantarum plantarum plantarum plantarum partarum plantarum plantarum plantarum plantarum planarum plantarum plantarum Pfa2018au，它是从富西诺高地（Fucino Highland）（意大利）（意大利）收获的胡萝卜中分离出来的。菌株被送往意大利的iStituto Zoopro fintico sperimentale della lombardia emilia romagna，目的是根据《布达佩斯条约》下的专利程序。在体外模拟的胃肠道条件下，分离株显示出很高的生存能力，抗生素易感性，疏水性，聚集以及抑制肠道肠内鼠伤寒沙门氏菌的体外生长的能力Caenorhabditis秀丽隐杆线虫被用作体内模型，以分析促进性和抗衰老效应。L. plantarum pfa2018au显着殖民了蠕虫的肠道，延长了其寿命并刺激了他们的先天免疫力。总体而言，这些结果表明，来自蔬菜的自毒实验室（例如胡萝卜）具有可以视为新型益生菌候选物的功能特征。
BRCA1-BARD1 E3泛素连接酶活性在DNA损伤修复和减数分裂中的差异要求
肿瘤抑制剂BRCA1-BARD1复合物调节许多细胞过程。对其肿瘤抑制功能的批评是其在基因组完整性中的作用。尽管环E3泛素连接酶活性是复合物的唯一已知酶促活性，但对BRCA1-BARD1 E3泛素连接酶活性的体内需求一直存在争议。在这里，我们使用C探索Brca1-bard1 E3泛素连接酶活性的作用。elesgans。遗传，细胞生物学和生化分析E3连接酶活性有缺陷的突变体表明，在DNA损伤修复和减数分裂的背景下，Complex的E3连接酶依赖性和独立功能既存在。我们表明，E3连接酶活性对于复合物的核积累至关重要，特别是集中在减数分裂重组位点，而在增殖生殖细胞中的DNA损伤位点不重要。虽然仅BRCA1才能进行单位素化，但BRCA1需要Bard1来促进聚氨基化。我们发现，通过推动BRCA1的核积累和自我关联，可以部分缓解E3连接酶活性和BARD1在DNA损伤信号传导和修复中的需求。我们的数据表明，除了E3连接酶活性外，BRCA1还可以在DNA损伤信号传导和修复中起结构作用，而BARD1在增强BRCA1功能方面发挥了可观的作用。
靶向基因编辑技术在秀丽隐杆线虫中的应用
引用格式 : 陈向阳 , 冯雪竹 , 光寿红 .靶向基因编辑技术在秀丽隐杆线虫中的应用 .中国科学 : 生命科学 , 2018, 48: 266–277 Chen X Y, Feng X Z, Guang S H. Application of targeted genome-editing technologies in Caenorhabditis elegans (in Chinese).Sci Sin Vitae, 2018, 48: 266–277, doi: 10.1360/N052017-00250
在此问题中
microRNA是小型非编码RNA，在转录后调节质量RNA的表达水平，从而控制局部蛋白质表达，这对于神经元等偏振细胞很重要。他们最初是在秀丽隐杆线虫（Caenorhabditis elegrans）中发现的，这是一种公认的多功能线虫模型生物体，是发育时机中的关键调节剂。由于模型和哺乳动物之间基因的高保守性，在其他物种中也发现了这些miRNA。此外，由于1993年对miRNA LIN-4的里程碑发现，已经确定了250多个内源性microRNA，以及许多功能。这些小的RNA已经参与了不同多系统水平的过程，因此以多种方式影响神经元功能。但是，在实验上只有一个特定的特定证明与秀丽隐杆线虫中的神经功能有关，尤其是Lin-4，Let-7，miR-1，miR-1，miR-273，miR-84和miR-29。在这篇综述中，我们将通过介绍和假设其在秀丽隐杆线虫神经系统中的功能来探索各种miRNA。
evolvulus alsinoides的整个植物提取物对热应激
已知流行的阿育吠陀植物Evolvulus Alsinoides具有适应性特性。适应原会减轻压力和焦虑，从而促进个人的整体福祉。由于慢性应激与预期寿命低于正常寿命相关，因此任何已知减少应力的草药都应产生相反的影响。因此，这项研究旨在研究evolvulus alsinoides在良好的老化模型Caenorhabditis elegans中的抗衰老活性。在秀丽隐杆线虫的最佳生长和生存条件下评估了长寿增强的影响。氧化应激，并在转基因秀丽隐杆线虫TJ 356中诱导热应力，该曲杆秀丽隐杆线虫TJ 356在控制热休克蛋白启动子的控制下表达了绿色荧光蛋白（GFP），以可见抗压肿基因诱导的诱导。通过寿命分析分析了应力的影响，并通过Kaplein Meyer统计分析分析了数据。结果表明，在0.1 mg/ml -1和1 mg/ml -1的浓度下，在最佳的生长和生存条件下，在0.1 mg/ml -1和1 mg/ml -1的浓度下，埃及素依赖的剂量依赖性依赖性的剂量将其平均寿命增加18.0％和26.2％。针对热诱导的应激，绿ote虫的E. alsinoides提取的秀丽隐杆线虫的存活率大于未经处理的秀丽隐杆线虫的存活率。对于氧化应激，阿尔西诺伊斯E. alsinoides的处理不是显着的。发现，Evolvulus Alsinoides提取物通过促进抗压力耐受性和修补胰岛素/IGF信号传导途径来促进秀丽隐杆线虫的寿命。