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World File Search SystemCorynebacterium
谷氨酸棒杆菌重组工程优化
这是作者手稿，已接受出版并经过完整的同行评审，但尚未经过编辑、排版、分页和校对过程，这可能导致此版本与记录版本之间存在差异。请引用本文 doi: 10.1002/bit.27737 。本文受版权保护。保留所有权利。
Loeffler Medium-用于Corynebacterium -Biotrading
商业准备的培养基的最终用户应根据适用的政府监管机构进行质量控制测试，并符合认证要求。Hardy Diagnostics建议最终用户检查是否有污染和恶化的迹象，如果由实验室质量控制程序或法规决定，请执行质量控制测试以证明生长或积极的反应并表现出抑制作用或负面反应（如果适用）。Hardy Diagnostics质量控制测试记录在Hardy Diagnostics分析证书网站上的分析证书（COFA）上。还请参阅文档“成品质量控制程序”，以及有关商业准备的微生物培养基的CLSI文档M22-A3质量保证，以获取有关适当QC程序的更多信息。请参阅下面的参考文献。
牛杆菌牛菌监视和通过采样快速检测
牛杆菌是裸体（FOXN1，NU/NU）小鼠种群的机会感染。被确定为裸小鼠过度性皮炎或“鳞状皮肤病”的病因，牛梭菌会导致短期临床疾病，其后是终身亚临床皮肤定殖的临床疾病。尽管临床体征的持续时间有限，但对异种移植肿瘤发育的影响可能很大，导致肿瘤生长延迟，减慢或失败。正如2010年全国AALAS会议小组讨论中所强调的那样：“对丘脑裸鼠的控制和消除与Corynebacterium相关的高肿瘤（CAH）”，C。Bovis遭受了学术和行业研究设施，作为一种细菌污染物，这是一种极难消除的细菌污染物。现代啮齿动物哨兵监测计划依靠脏床上用品前哨的计划并非旨在早日检测迅速传播，环境稳定且空气传播的细菌（如C. bovis）。有必要建立一种可以可靠地使用的方法，以更有效地监测裸露的小鼠菌落以外的裸露床上用品前哨。为了解决这个问题，我们提议通过PCR监视单独的通风笼（IVC）机架排气系统，以便牛梭菌的存在。先前通过PCR来监测小鼠病原体的IVC架空气排气，例如Helicobacter spp。，鼠病毒和内骨和骨质寄生虫。
Corynebacterium Diphtheriae感染，南非，2015年...
白喉的复兴是由几个因素引起的，包括在社会经济状况低下或政治不稳定的国家中疫苗接种过程中的破坏（2，3），提高了无氧感染的认识和提高（4，5），以及在某些设置中的变化（4、5）（6）。青少年和成年人在没有持续的毒素菌株传播或足够的增强免疫免疫力的情况下，其疫苗诱导或自然诱导的保护减弱，在白喉暴发期间特别容易受到攻击（7）。疫苗覆盖率为80％–85％，以前已建议在人口水平上维持牛群的免疫力（8）；但是，最新数据建议覆盖阈值> 90％（9）。白喉毒素是毒corynebacterium spp。的主要毒力因子，抑制靶宿主细胞中蛋白质的合成（10）。通过位点特异性重组，噬菌体编码的毒素基因Tox将其整合到细菌基因组中。如果用毒素基因 - 携带corynephage溶解蛋白，则无氧化物甲状腺菌可以产生毒素。某些无氧二甲状腺菌分离株含有托克斯基因，但由于该基因中的移料突变或插入序列（称为非氧基因，毒素基因基因[nttb] C. diphtheriae），无法表达毒素（11）（11）。尽管很少见，但据报道，NTTB C.二骨在某些国家是新兴的病原体（11，12）。由doci-Genic corynebacterium菌株引起的经典呼吸双性白喉的特征是喉咙痛，低度发烧，颈部肿胀和灰色/白色假膜覆盖
全基因组的关联研究对绵羊菌群中菌群的抗体反应
摘要。病例淋巴结炎（CLA）是一种慢性且高度传染性的疾病，在绵羊和山羊中广泛影响，对动物福利和生产产生不利影响。这项研究旨在揭示宿主地球杆菌对二氧杆菌抗体抗体水平的影响，作为疾病易感性或抗性的指标，从而有可能识别与这些性状相关的遗传标记。从四个大捷克羊群的321只羊中收集了血液样本。萨福克品种的动物年龄从2至8岁不等，每年定期采样4年。基于两种不同的商业酶连接的免疫吸附测定（ELISA）血清学抗原测试，将绵羊分为健康和患病的组。基因组DNA与Geneseek®基因组pro-firer™卵子50 K进行基因分型，并将41 301个标记用于全基因组关联分析（GWAS）。进行了一种病例 - 对比GWA，包括143种血清阳性和178羊绵羊，以评估使用GCTA软件的绵羊基因组和对磷酸梭菌的磷脂酶D抗原的抗体反应之间的关系。这项研究揭示了染色体11和20上的两个暗示性SNP（单核苷酸多态性），在Trim16的第一个外显子（含三方 - 含量的16）基因中，具有最显着的SNP。通过分析阳性动物和阴性动物之间的基因组改变及其背景，包括对暗示性SNP±500 Kb区域内基因的基因分析（GO）分析，我们鉴定了基因以及与免疫相关的过程以及潜在地影响CLA敏感性的过程和途径。这些包括通过主要的组织相容性复合物（MHC）I和II，Th17粘膜细胞分化，细胞自噬和与吞噬相关的机制的抗原加工和外基肽的呈现。这项研究提供了对抗二链球菌抗体反应的遗传基础的见解，确定了暗示性的关联和潜在的生物学机制，可以指导未来的繁殖和遗传策略，以提高对绵羊CLA的耐药性。
谷氨酰胺的Corynebacterium的代谢工程，用于有效的L- tryptophan生产
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本（未经同行评审认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2024年11月5日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2024.11.04.621991 doi：Biorxiv Preprint
Copper Resistance Mechanism and Copper Response Genes in Corynebacterium crenatum
摘要：重金属抗性机制和重金属响应基因是微生物利用重金属修复的关键。本文证明棒状杆菌对铜具有良好的耐受性。随后，研究了其对铜胁迫的转录组响应，确定了棒状杆菌抗铜的重要途径和基因。基于转录组分析结果，筛选出9个与金属离子转运相关的显著上调的DEGs进行进一步研究。其中，GY20_RS0100790和GY20_RS0110535属于转录因子，GY20_RS0110270、GY20_RS0100790和GY20_RS0110545属于铜结合肽。研究了这两个转录因子对基因表达的调控功能。将这三个铜结合肽展示在棒状杆菌表面进行铜吸附测试。此外，我们删除了9个相关的金属离子转运基因，以研究其在铜胁迫下对生长的影响。这项研究为利用C. crenatum进行铜生物修复提供了基础。
气道菌群干扰肺炎链球菌和金黄色葡萄球菌感染
•肺炎链球菌在全球范围内的鼻咽度占5-70％，是下气道感染的重要前体。•S。肺炎是5岁以下儿童的主要感染原因，是社区获得性细菌性肺炎的最常见原因。•当前的肺炎球菌疫苗靶向多达23种肺炎链球菌的血清型，但是，循环中有100多种血清型，并且在覆盖的血清型中只有60-70％的有效性，这仅提供部分保护。•金黄色葡萄球菌渐近地定居于20-30％的人口的前鼻孔，并与远处感染的风险增加，包括皮肤和软组织感染，心内膜炎，菌血症和肺炎。•目前没有用于金黄色葡萄球菌的疫苗，预防策略仅限于卫生和接触预防。•corynebacterium是气道中的共生细菌，与减少的金黄色葡萄球菌和肺炎链球菌定殖以及促进更稳定的气道微生物组相关。•在这里，我们调查了Corynebacterium菌落化作为针对病原体感染的预防策略的潜力。
基于新型特征描述符和特征选择技术预测谷氨酸棒状杆菌启动子
启动子是重要的非编码DNA调控元件，与RNA聚合酶结合激活下游基因的表达。工业上人工精氨酸主要由谷氨酸棒杆菌合成，特定启动子区域的复制可增加精氨酸的产量，因此需要对谷氨酸棒杆菌中的启动子进行准确定位。在湿实验中，启动子的识别依赖于sigma因子和DNA剪接技术，这是一项费力的工作。为了快速方便地识别谷氨酸棒杆菌中的启动子，我们发展了一种基于新型特征表示和特征选择的方法来完成这项任务，通过多种理化性质的统计参数描述DNA序列，结合方差分析和层次聚类过滤冗余特征，其预测准确率高达91.6%，灵敏度91.9%可以有效识别启动子，特异性91.2%可以准确识别非启动子。此外，我们的模型可以在400个独立样本中正确识别181个启动子和174个非启动子，证明了所开发的预测模型具有良好的稳健性。