Alt-R HDR Enhancer V2 可提高脂质转染细胞的 HDR 效率。使用 0.75 μL Lipofectamine ® RNAiMAX ® 试剂(赛默飞世尔科技)将稳定表达 Cas9 的 HEK-293 细胞反向转染 gRNA 复合物(Alt-R CRISPR-Cas9 crRNA 与 tracrRNA 复合),靶向人类基因组中的 SAA1、STAT3、SERPINC1 和 HPRT 38087(最终浓度 = 10 nM)和设计用于在 Cas9 裂解位点插入六个碱基的 Alt-R HDR 供体块(最终浓度 = 3 nM)。脂质转染后,立即将细胞培养在含有无处理(深蓝色)、DMSO(载体对照,浅蓝色)、30 μM Alt-R HDR 增强剂(深灰色)、0.5 μM Alt-R HDR 增强剂 V2(浅灰色)或 1 μM Alt-R HDR 增强剂 V2(绿色)的培养基中。24 小时后,移除旧培养基,并用不含 DMSO、Alt-R HDR 增强剂或 Alt-R HDR 增强剂 V2 的新鲜细胞培养基替换。脂质转染 48 小时后从每种样本类型中分离基因组 DNA,并通过 PCR 扩增目标编辑位点。使用 rhAmpSeq ™ CRISPR 分析系统对效率进行量化,该系统使用 NGS 分析来评估目标位置的 HDR 百分比。使用 rhAmpSeq CRISPR 分析工具分析了 NGS 读数。使用最终浓度为 1 μM 的 Alt-R HDR 增强剂 V2 实现了最高的 HDR。
摘要:Trichostatin A(TSA)是一种代表性的组蛋白脱乙酰基酶(HDAC)抑制剂,该抑制剂通过调节细胞中的染色质重塑来调节表观遗传基因的表达。调查TSA对染色质DE稳态的调节是否会影响Cas9蛋白 - 蛋白 - 核核糖核蛋白(RNP)的效率提高,从植物细胞中检查了基因组编辑的基因组,使用生菜和烟草原子量进行了多种浓度,在几次浓度的TSA治疗后(tsa)(0.1)(0.1)(0.1和10,0.1)。RNP从原生质体递送。有趣的是,在莴苣原生质体中,TSA处理中SOC1基因的indel频率是DMSO处理的3.3至3.8倍。尽管没有太大差异,但糖基因原生质体中SOC1基因的indel频率的增加发生在浓度依赖性的方式中。类似于生菜,TSA在PDS基因组编辑期间使用烟草原生质体以浓度依赖性方式将indel频率提高了1.5至1.8倍。MNase测试清楚地表明,使用TSA处理的染色质可及性高于DMSO治疗的染色质。此外,TSA处理显着提高了生菜原生质体的组蛋白H3和H4乙酰化水平。QRT-PCR分析表明,通过TSA处理,增加了细胞分裂相关基因的表达(LSCYCD1-1,LSCYCD3-2,LSCYCD6-1和LSCYCU4-1)。这些发现可能有助于提高CRISPR/CAS9介导的基因组编辑的效率。此外,这可以应用于使用带有植物原生质体的CRISPR/CAS9系统开发有用的基因组编辑的作物。
Lot Quantity Description 3070014 0.2 kU Phusion DNA Polymerase 3130783 0.4 mL 10 mM dNTP MixPhusion kit component 3048246 0.04 mL Lambda-DNA 3085897 0.4 mL Lambda & PhiX MixReady to Use Marker 3016845 0.05 mL Primer Mix 1.3 kb 3083834 0.05 mL Primer Mix 10 kb 3121943 3×1.5 ml 5x phusion hf缓冲液3121933 1.5 ml 50 mm MGCl2 3087331 1.5 ml 5x 5x phusion GC缓冲液3085597 0.5 ml DMSO
图1。a)IK-595的晶体结构与BRAF和MEK复合在一起。IK-595在BRAF蛋白中诱导A C螺旋“ OUT”无活性构象。 b)用IK-595,Trametinib,avutometinib或Trametiglue处理的HCT-116(KRAS G13D)细胞中MEK-CRAF共免疫沉淀的蛋白质印迹4小时。 c)MEK免疫沉淀物的质谱法证明了用DMSO,IK-595,Trametinib或Avutometinib处理的ASPC-1(KRAS G12D)细胞中的MEK-ARAF相互作用。 d)在HCT-116(BRAF WILD-TYPE),HT-29(BRAF V600E),NCI-H1755(NCI-H1755(BRAF STALS II)(BRAF STALS II)和NCI-H1666(NCI-H1666(NCI-H1666(BRAF Class III)),IK-595治疗4小时后,MEK-BRAF共免疫沉积量化了MEK-BRAF共免疫沉积。 所有化合物均以各自的IC 90浓度处理。IK-595在BRAF蛋白中诱导A C螺旋“ OUT”无活性构象。b)用IK-595,Trametinib,avutometinib或Trametiglue处理的HCT-116(KRAS G13D)细胞中MEK-CRAF共免疫沉淀的蛋白质印迹4小时。c)MEK免疫沉淀物的质谱法证明了用DMSO,IK-595,Trametinib或Avutometinib处理的ASPC-1(KRAS G12D)细胞中的MEK-ARAF相互作用。d)在HCT-116(BRAF WILD-TYPE),HT-29(BRAF V600E),NCI-H1755(NCI-H1755(BRAF STALS II)(BRAF STALS II)和NCI-H1666(NCI-H1666(NCI-H1666(BRAF Class III)),IK-595治疗4小时后,MEK-BRAF共免疫沉积量化了MEK-BRAF共免疫沉积。所有化合物均以各自的IC 90浓度处理。
摘要:使用定量峰值力测量原子力显微镜和带能量色散光谱的扫描电子显微镜对 Linothele fallax (Mello-Leita ̃ o) (L. fallax) 蜘蛛网进行了研究,这种蜘蛛网是一种很有潜力的组织工程材料,在天然状态下和用不同蛋白质亲和力的溶剂(即水、乙醇和二甲基亚砜 (DMSO))处理后都进行了研究。天然的 L. fallax 丝线被球状物体密集覆盖,这些球状物体构成了它们不可分割的部分。根据溶剂的不同,处理 L. fallax 会改变其外观。在使用水和乙醇的情况下,变化很小。相反,DMSO 几乎可以去除小球并将丝线融合成致密的带状。此外,溶剂处理会影响丝线表面的化学性质,改变其粘附性,从而改变其生物相容性和细胞粘附特性。另一方面,溶剂处理的网状材料对不同类型的生物物质的接触效果存在很大差异。富含蛋白质的物质在用疏水性更强的溶剂处理的蜘蛛丝包裹时,可以更好地控制湿度。然而,碳水化合物植物材料在用天然蜘蛛丝包裹时会保留更多的水分。使用核磁共振 (NMR) 和液相色谱-质谱技术分析了用溶剂产生的提取物,发现不饱和脂肪酸是代表性的吸附物质,这可以解释蜘蛛丝的温和抗菌作用。提取的代谢物对于不同的溶剂是相似的,这意味着小球不是“溶解”的,而是“融合”到丝线本身中,据说是蛋白质链的卷结。■ 简介
图1:LY3023414是一个能够增加NMD靶标转录的小分子。a)用于鉴定NMD抑制剂的HTS示意图。突变转录本在卡通中以较小的长度表示,仅出于说明目的。b)突变RNA相对于野生型读取的读数是HTS的前8个命中。虚线表示被视为命中所需的最小分数(> DMSO控制高于5标准偏差)。全屏结果如图S4所示。c)靶向的RNA测序结果,在10 µm下用HTS的8个最佳命中处理的等源性RPTEC敲除克隆的靶向结果。虚线表示相对的RNA表达水平为1,等于DMSO处理的井的相对RNA表达水平。仅在图S8中显示了未在任何线上验证的Ceritinib的数据。RPE TP53 224上的TP53 Western blot,其中包含纯合TP53突变,使用了在RPTEC等源性线中验证的四个命中化合物。e)用两个NMD抑制剂铅候选物处理后全长TP53α和同工型TP53β的Western印迹分析。tp53β(已知由NMD控制的表达)以及突变体TP53由LY3023414诱导,而全长诱导。请注意,RPE TP53 223是一种杂合基因敲除克隆,一个近乎野生型等位基因,而RPTEC TP53 588包含一个纯合TP53诱导突变。f)QPCR显示LY3023414治疗导致RPE1和RPTEC的母细胞系中NMD受控的TP53,TP53β的NMD控制替代转录物的表达增加。由学生的t检验确定的重要性。除非指示其他细胞暴露于5 µm的测试化合物16小时。
ACGIH American Conference of Governmental Industrial Hygienists AIC Akaike's information criterion ALD approximate lethal dosage ALT alanine aminotransferase AST aspartate aminotransferase atm atmosphere ATSDR Agency for Toxic Substances and Disease Registry BMD benchmark dose BMDL benchmark dose lower confidence limit BMDU benchmark dose upper confidence limit BML benchmark concentration lower confidence limit BMCU benchmark concentration upper confidence limit BMDS Benchmark Dose Software BMR benchmark response BUN blood urea nitrogen BW body weight CA chromosomal aberration CASRN Chemical Abstracts Service Registry Number CBI covalent binding index CHO Chinese hamster ovary (cell line) CL confidence limit CNS central nervous system CPN chronic progressive nephropathy CYP450 cytochrome P450 DAF循环系统的DAF剂量测定调节因子DCS疾病DEN二乙基硝基胺DMSO DMSO二甲基硫氧化二甲基二甲基二甲基甲酸DNA DNA脱氧核心酸EPA环境保护剂环境保护局FDA食品和药物管理FEV 1二秒ggd gd gd gd gd gd gd gd gd gd gdm glitem glutem ste转移酶GSH谷胱甘肽GST GST谷胱甘肽-S-转移酶HAWC健康评估工作空间协作HB/G-A动物血液:气体分区系数HB/G-H人体血液人体血液:气体分配系数HEC人类等效浓度HED人类等效剂量剂量剂量英雄健康和环境研究在线在线
将氧化成SN IV物种,通过电子陷阱的不良形成和材料的P掺杂导致性能大幅下降。[6]先前的研究报道了这种氧化的许多起源,例如溶剂[7,8]处理条件[9],甚至是通过在锡贫乏环境中占比例的。[10]停止这种氧化是实现高效且稳定的锡卤化物PSC的要求之一。因此,已经进行了几项试验,以应对SN II的氧化。这些包括使用新的溶剂系统来避免二甲基硫氧化物(DMSO)氧化[11],[11]使用还原剂消除SN IV的含量,例如金属sn粉[12]或下磷酸[13]或介入添加剂来减轻诸如Snn IV的形成,snf snf,snf,snf snf snf snf snf。[6,14]
这项研究工作旨在开发简单,准确,精确的分析方法,以同时估算盐酸普萘洛尔和盐酸胺碘酮,用于治疗心血管疾病。为估计建立了紫外可见分光光度计方法。盐酸盐盐酸盐在甲醇中显示出更好的溶解度,盐酸普萘洛尔盐酸盐的溶解度会增加。紫外可见分光光度计方法的线性在16-24 µg/ml的范围内,丙酮的含量为4 -8µg/ml。λmax分别为288 nm和242nm。普萘洛尔和胺碘酮的回收率分别为100%和98.6%。发现普萘洛尔的相关系数为0.998,胺碘酮为0.999。紫外可见的光谱法是快速,成本效益,更精确和准确的。此方法可以很有用,因为没有开发用于丙诺酚和胺碘酮的分析方法。
MIC是根据临床和实验室标准研究所方法论和指南确定的,麦克风90被推论用于评估其体外效力。BWC0977溶解在DMSO中以制造初始库存溶液并进行肉汤微稀释,并将其进一步稀释为阳离子调整后的Mueller-Hinton Broth(CAMHB),以在测试板中的顺序稀释。比较器化合物。连续分离株(社区和医院相关的来源,包括皮肤和软组织,呼吸道,血液,尿路和胃肠道感染)在2017 - 2018年收集的全球医疗中心在IHMA上收集的,没有特定的偏见,而没有特定的偏见。MIC,分别是从血液,腹腔内,生殖器官,呼吸道,呼吸道,流动和软组织和尿道的感染中分别从全球医疗中心收集的。