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singh认为胡须覆盖技术和紧身过滤面件的定量拟合测试（FFP3）
背景：在最近的Covid-19大流行期间，锡克教宗教界的成员参加了医学，牙科，护理或盟友卫生学校，或者已经从事医学专业的人必须做出一个艰难的决定，是否要剃光他们的胡须，以继续他们的学校和职业，还是改变了他们的投影专业或改变他们的专业志向或职业。他们面临着艰巨的任务，即确保自己受到职业空中危害，同时也遵守宗教和文化期望。在大流行的最初阶段缺乏可用的替代方案进一步需要探索创造性解决方案。
FFPE-DNA测序范式上的关键聚光灯
1 Institute of Clinical Molecular Biology, Christian-Albrechts-University and University Medical Center Schleswig-Holstein, Kiel 24105, Germany, 2 Center for Genomic Regulation, Centro Nacional de An ´alisis Gen ´omico, Barcelona 08028, Spain, 3 Department of Gynaecology and Obstetrics, University Medical Center Schleswig-Holstein, Campus Kiel,基尔24105，德国，4勒中心，d'Erence，d'Ennovation，d'Expertance et transpert（crefix），PFMG 2025，´evry 91057，法国5，5中心国家de recherche en g'eng en g·eNomique humaine（Cnrgh）巴黎 - 萨克莱，“法国Evry 91057，6，6诊断与研究中心，分子生物医学中心，诊断与研究研究所，格拉兹医科大学，格拉兹医科大学，格拉斯8010，奥地利7号，奥地利7，大学医疗中心Schleswig-Holstein，Schleswig-Holstein，Kiel Kiel Kiel Kiel，Kiel Kiel 24105，surrying surrying，8 Noregian Pssrant forserpl of Norigian Pss toprant of Norigian Pressurant of Norigian Pressurant of Norigian Pressuration。奥斯陆大学医院Rikshospitalet，奥斯陆0372，挪威9号胃肠病学部分，奥斯陆大学医院Rikshospitalet，Oslo 0372，诺斯洛大学，俄勒冈州司法部，俄勒冈大学，司法部，施用疾病和移植，10372 0372, Norway, 11 Department of Gastroenterology, Hepatology and Endocrinology, Hannover Medical School, Hanover 30625, Germany, 12 Institute of Pathology, University Hospital Heidelberg, Heidelberg 69120, Germany, 13 Institute of Pathology and Neuropathology, RKH Klinikum Ludwigsburg, Ludwigsburg 71640, Germany and 14德国罗斯托克大学医学总外科系罗斯托克，罗斯托克
FFPE DNA 显示出两种主要错误特征，它们源自胞嘧啶和甲基胞嘧啶的脱氨作用，可以使用不同的修复策略来缓解
摘要避免由损伤引起的测序错误是准确识别 DNA 样本中中到稀有频率突变的关键步骤。在 FFPE 样本中，胞嘧啶部分的脱氨作用代表了导致 DNA 材料丢失和测序错误的重大损伤。在这项研究中，我们证明，虽然胞嘧啶和甲基化胞嘧啶部分的脱氨作用造成的损伤会导致 C 到 T 的转换升高，但错误概况和调解策略是不同的并且容易区分。虽然胞嘧啶脱氨引起的损伤诱导测序错误是由 NGS 工作流程中常用的末端修复步骤驱动的，但甲基化胞嘧啶脱氨引起的 DNA 损伤是 CpG 位点测序错误的另一个主要因素。尿嘧啶 DNA 糖基化酶和人胸腺嘧啶 DNA 糖基化酶可以分别消除和减轻 FFPE DNA 样本中的两种损伤，从而显著提高中等等位基因频率变异鉴定的测序准确性。
Maxwell®RSCXtractall FFPE DNA/RNA套件
2。向下按墨盒以将其捕捉到。小心地将密封剥落，使所有塑料都从墨盒顶部脱落。确保将所有密封胶带和所有残留粘合剂删除，然后将墨盒放入仪器中。3。将一个柱塞放在每个墨盒的＃8井中。＃8是最接近洗脱管的。4。将一个空洗脱管放入每个墨盒的洗脱管位置。将30 - 100µl无核酸酶的水加到每个洗脱管的底部。注意：仅使用套件中提供的洗脱管（0.5ml）；其他试管可能与受支持的Maxwell®仪器不兼容。
ChIP-IT FFPE 染色质制备 II 53031
Active Motif 的 ChIP-IT® FFPE 染色质制备 II 和 ChIP-IT® FFPE II 试剂盒是我们的第二代 FFPE ChIP 试剂盒，其中繁琐的脱蜡和脱水程序已简化，可使用更少的试剂和手动时间制备高质量的 ChIP 富集 DNA。这种新的染色质制备方案最适合处理有限数量的新鲜制备或高质量 FFPE 组织（第一代 FFPE 染色质制备方案应用于珍贵或高度降解的 FFPE 样本）。ChIP-IT FFPE II 试剂盒已针对染色质制备后使用进行了优化，使用专门配制的试剂和方案指南来提高灵敏度，并能够从极其有限的起始材料中进行 qPCR 和下一代测序分析。
使用 Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment 检测 FFPE 肿瘤样本中的罕见体细胞变异
将组织活检基因组分析的结果与补充液体活检数据相结合，可以全面了解肿瘤生物学。Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment 是一种多功能文库制备试剂盒，可用于从循环无细胞 DNA (cfDNA) 或从 FFPE 组织样本中提取的基因组 DNA (gDNA) 制备可用于测序的文库 (图 1)。该工作流程包括用于纠正错误和减少假阳性的唯一分子标识符 (UMI)，从而能够准确、灵敏地检测 FFPE 肿瘤样本中的低频突变。Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment 与 Illumina 和第三方富集探针或面板兼容，以支持灵活的实验设计。本应用说明展示了 Illumina Cell-Free DNA Prep with Enrichment 在生成高质量 NGS 文库和从 FFPE 样本中鉴定低频体细胞变异方面的优异性能。
低输入/FFPE 样本的选项
福尔马林固定石蜡包埋组织 (FFPE) 中的基因组 DNA 是基因组研究的常见来源，但由于固定损伤、碎片化和提取 DNA 的产量低，文库制备和测序具有挑战性。面对需要评估全基因组体细胞变异调用、正常边缘变异调用和甲基化状态的研究设计，输入的 FFPE DNA 数量和质量变得有限。用于生成全基因组测序和甲基化数据的既定方法（长读测序或标准短读 + 甲基化测序或阵列）需要高输入 DNA 数量和质量。生物模态 evoC 文库制备方法提供了一种替代化学方法，可实现标准全基因组测序，对 DNA 的输入要求低（<80ng），同时提供 5mC（和 5hmC 选项）调用。
使用富集
组织活检的基因组分析结果与液体活检的互补数据的结合提供了有关肿瘤生物学的详尽信息。用富集来照亮无细胞的DNA制备是一种多功能试剂盒，可用于准备准备从循环DNA（CFDNA，无细胞DNA）和基因组DNA（GDNA，GDNA，基因组DNA）从FFPE织物中提取的书架（图1）。工作流程包括唯一的分子标识符（UMI，唯一的分子标识符），以校正误差和误报降低，从而可以准确且敏感地检测FFPE肿瘤样品中的低频突变。用ENRIGHMP照亮无细胞的DNA Prep与探针或富集面板照明和第三方，以支持灵活的实验设计。该应用程序上的注释表明，在高质量的NGS书店的一代中，没有光明细胞的DNA准备表现出色，并确定了FFPE冠军的低频体细胞变体。
从 FFPE 组织中提取核酸
在每个书签处以及影片结尾处，都有要提出和讨论的问题，如本包中所述。您的角色是确保小组充分涵盖每个要点。每个问题都以粗体显示。这不是脚本 - 您可能希望讨论其他内容，或者可能会出现其他问题，但这些是要涵盖的关键点。