收集和储存福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 临床样本是世界各地医院的标准程序,是回顾性分析的宝贵资源。为了分解和识别致癌作用、患者治疗和疾病结果之间的分子相关性,纯化大量高质量 DNA 至关重要。然而,在使用 FFPE 材料进行后续下游分子应用时存在几个问题。固定过程会导致核酸交联,从而导致严重碎片化。此外,FFPE 提取方案通常涉及繁琐的手动步骤和二甲苯等危险化学品。
产品描述Quick-DNA/RNA™FFPE试剂盒为一个简单可靠的方法,用于从一个单独的福尔马林膜状帕片蛋白嵌入(FFPE)组织样品中的两个单独的部分中的一种洗脱酸或DNA和RNA中的总核酸分离(DNA/RNA)。该产品的独特化学成分已被优化,以最大程度地恢复DNA和大小和小RNA物种。只需使用脱氧蛋白溶液将组织脱氧化,使用蛋白酶K消化,进行热化学交联,然后使用Zymo-Spin™柱技术进行纯化。结果是不含DNA的高质量DNA和总RNA(包括小RNA),可以用于RT/QPCR,杂交,测序等。
福尔马林固定石蜡包埋组织 (FFPE) 中的基因组 DNA 是基因组研究的常见来源,但由于固定损伤、碎片化和提取 DNA 的产量低,文库制备和测序具有挑战性。面对需要评估全基因组体细胞变异调用、正常边缘变异调用和甲基化状态的研究设计,输入的 FFPE DNA 数量和质量变得有限。用于生成全基因组测序和甲基化数据的既定方法(长读测序或标准短读 + 甲基化测序或阵列)需要高输入 DNA 数量和质量。生物模态 evoC 文库制备方法提供了一种替代化学方法,可实现标准全基因组测序,对 DNA 的输入要求低(<80ng),同时提供 5mC(和 5hmC 选项)调用。
Active Motif 的 ChIP-IT® FFPE 染色质制备 II 和 ChIP-IT® FFPE II 试剂盒是我们的第二代 FFPE ChIP 试剂盒,其中繁琐的脱蜡和脱水程序已简化,可使用更少的试剂和手动时间制备高质量的 ChIP 富集 DNA。这种新的染色质制备方案最适合处理有限数量的新鲜制备或高质量 FFPE 组织(第一代 FFPE 染色质制备方案应用于珍贵或高度降解的 FFPE 样本)。ChIP-IT FFPE II 试剂盒已针对染色质制备后使用进行了优化,使用专门配制的试剂和方案指南来提高灵敏度,并能够从极其有限的起始材料中进行 qPCR 和下一代测序分析。
在每个书签处以及影片结尾处,都有要提出和讨论的问题,如本包中所述。您的角色是确保小组充分涵盖每个要点。每个问题都以粗体显示。这不是脚本 - 您可能希望讨论其他内容,或者可能会出现其他问题,但这些是要涵盖的关键点。
■ Genexus ™ 纯化仪独立配置与集成配置. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ...
样本考虑:由于组织特征,例如纤维率,脂质组成,核酸酶水平和组织部分可用的细胞数,FFPE组织样品中的DNA纯化可能具有挑战性。此外,在固定之前和固定过程中处理组织的变化,包括在组织固定过程中组织暴露于福尔马林的持续时间,极大地影响了FFPE组织中核酸的交联程度和碎片。所有这些属性可能会影响可以从FFPE组织切片中纯化的可放大核酸的质量和量。在开发过程中,使用多种人类FFPE组织类型和格式(例如,幻灯片与卷发与卷曲的FFPE组织切片)评估了Maxwell®RSCXcelere DNA FFPE试剂盒,以确保对可用的可利用DNA的最佳纯化。
商标:Qiagen®,样本到Insight®,AllPrep®,EZ2®(Qiagen Group)。注册名称,商标等。在本文档中使用的,即使没有明确标记,法律也不被认为不受保护。
2。向下按墨盒以将其捕捉到。小心地将密封剥落,使所有塑料都从墨盒顶部脱落。确保将所有密封胶带和所有残留粘合剂删除,然后将墨盒放入仪器中。3。将一个柱塞放在每个墨盒的#8井中。#8是最接近洗脱管的。4。将一个空洗脱管放入每个墨盒的洗脱管位置。将30 - 100µl无核酸酶的水加到每个洗脱管的底部。注意:仅使用套件中提供的洗脱管(0.5ml);其他试管可能与受支持的Maxwell®仪器不兼容。