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World File Search SystemFaecalibacterium
粪便菌群移植改变了HIV中炎症的蛋白质组学景观：识别细菌驱动因素
这项由安慰剂对照的试点研究评估了八周在稳定的抗逆转录病毒疗法（ART）对29 PWH的全身性炎症的每周FMT与安慰剂对全身性炎症的蛋白质组学影响。选择了三个具有高粪便杆菌和丁酸酯特征的粪便供体。使用接近扩展测定法对血浆中344种炎症蛋白的蛋白质组学变化进行了定量，在基线和第1、8和24周时收集了样品。同时，我们表征了通过shot弹枪宏基因组学的肠道微生物群组成和注释功能的变化。我们拟合了广义的加性模型来评估蛋白质表达的动力学。我们选择了最相关的蛋白质来探索其与微生物组组成和功能的相关性，并使用线性混合模型探索它们的相关性。
菌群组成对结直肠癌患者免疫疗法结果的影响：系统评价
总共确定了5,132篇论文，2017 - 2022年之间进行了三项研究和一项摘要，符合纳入标准，并在描述性合成表中进行了总结。这四项研究符合以下发现，四个主要门，富公司，杆菌，放线杆菌和verrucomicrobobiota与CRC患者对ICIS治疗的临床反应有关。Ruminococaceae主要与CRC患者相关，而对治疗的反应，而微球菌家族在非反应者中更为常见。细菌分类群（例如粪便菌群和prevotellaceae）与对ICIS的更好反应有关，并且可能是预测的生物标志物。粪便菌群与Akkermansia Muciniphila和Eubacterium guctale richment的特征，以及Rothia Mucilaginosa Deptetion可以独立预测CRC患者对ICI的更好反应。
下一代益生菌
当前市场上目前可用的大多数益生菌细菌候选者包括属于不同类别的各种菌株。尽管如此，胃肠道微生物组是未定义的微生物剂的集合，可能会对人类产生一些医学益处。因此，目前，来自不同角落的研究人员集中于研究和识别胃肠道衍生的益生菌菌株，以提高下一代益生菌的发展。下一代益生菌术语是指通过删除，添加或修饰特定基因产生的遗传修饰的微生物，以产生益生菌菌株，从而调节代谢，胃肠道健康并直接递送到粘膜。由不同益生菌菌株产生的下一代益生菌旨在为宿主提供一种或多种健康益处，并有效控制和/或对多种疾病的治疗。即使某些下一代益生菌对几种慢性病的控制和治疗吉祥，但对人类的研究仍然是零星的，因此监管机构的确认很少。此外，需要通过向公众发布广泛的应用来解决一些问题。这篇评论强调了下一代益生菌的益生菌潜力，并讨论了现有和新兴的下一代益生菌的潜在益生菌。Probiotic strains such as Faecalibacterium prausnitzii, Prevotella copri, Bacteroides uniformis , Bacteroides thetaiotaomicron , Bacteroides acidifaciens , Clostridium butyricum , Christensenella minuta , Akkermansia muciniphila and Parabacteroides goldsteinii , have been postulated as next-generation益生菌候选者由于对结肠炎，肥胖，糖尿病和肝病等疾病的治疗或预防作用。
肠道菌群营养不良症与色氨酸代谢改变和炎症反应的改变有关。
COVID-19的临床过程是可变的，通常是不可预测的。测试了以下假设：疾病的进展和弹性反应与微生物组和代谢组的变化相关，我们分析了元基因组，代谢组，细胞因子和转录组对住院Covid-19患者和无源性对照组的重复样品的转录组和转录样品的分析。严重的COVID-19与有益的肠道微生物的耗竭有关，而口咽微生物群扰动主要与抗生素使用有关。cOVID-19也与血浆浓度升高的雌激素和其他几种色氨酸代谢产物，溶血磷脂酰胆碱和继发胆汁酸的水平降低有关。此外，各种色氨酸代谢产物的浓度降低与粪便酸的耗竭有关，色氨酸降低和kynurenine升高与增强炎症细胞因子的产生有关。总体而言，我们的研究确定了将微生物组和代谢组改变相关，这是严重COVID-19的炎症失调的潜在促进者。
人类肠道菌群用于诊断和治疗抑郁>
摘要：如今，抑郁症在世界各地迅速传播。因此，关注该疾病发病机理的研究以寻找新的早期诊断和治疗方式正在增加科学和医学界的增长。特别注意通过微生物群 - gut-脑轴的生物标志物和治疗策略。众所周知，肠道微生物与宿主之间的共生相互作用会影响心理健康。审查分析了肠道菌群对抑制作用的病理生理学的机制和作用方式。将抑郁症患者的菌群分类学组成和代谢谱的知识作为选择基因组成（元基因组签名）作为疾病的生物标志物的可能性。给出了基于肠道微生物群的生物标志物的硅技术（机器学习）诊断抑郁症的使用。通过通过饮食改性和使用添加剂，即益生菌，生物学后（包括囊泡）和益生元作为精神病生物和粪便移植来平衡微生物组成和使用微生物组成，从而考虑了抑郁症治疗的替代方法。粪便菌细菌正在考虑是一种有希望的新一代益生菌和辅助诊断生物标志物的抑郁症。本综述中进行的分析可能对临床实践和药理学有用。
Insights
炎症性肠病（IBD）是一组疾病，其特征是胃胃道（GIT）的炎症，代表了主要的社会和经济负担。尽管对这种多因素疾病的病因和病理生理学进行了持续的研究，但治疗方案仍然有限。从这个角度来看，肠道菌群已经成为IBD发病机理的潜在参与者，动物和人类研究支持了这一假设。的确，人类的肠道是最复杂的生态群落之一（由10 13 -10 14微生物组成），它通过通过其集体代谢活动和托管相互作用来影响正常的生理学和疾病易感性，在人类健康中起关键作用。此外，一些食品中存在的活益生菌（通过GIT过境）已被证明与宿主免疫系统相互作用并赋予了一些健康益处。这篇综述的目的是概述粪便核酸杆菌与大肠杆菌和IBD之间的联系，强调了该领域的主要研究领域。对肠道微生物群的生态学观点可能会为针对这个细菌群落的临床疗法的发展提供新的见解，以改善人类健康。
性别，年龄和体重指数对肠道的影响...
方法论/主要发现：我们根据粪便样品的全元素shot弹枪测序对185名中国成年人的肠道菌群进行了分析。我们的研究重点是评估三个级别的性别，年龄和BMI对肠道微生物群的影响：多样性，基因/系统发育组成和功能组成。我们的发现表明，与肠型相比，这些表型对构成肠道微生物组的影响很小，它们在样本内或样本之间的多样性内或样本间多样性内无显着相关性。我们确定了大量与表型相关的基因和宏基因组链接组（MLG），表明肠道微环形组成的变化。特别是，在老年人和BMI较高的人群中，我们观察到有益的公司微生物，例如Eubacterium，Roseburia，Roseburia，Faecalibacterium和Ruminococcus spp。随着年龄的增长而增加。此外，Blautia和Dorea spp。随着BMI的增加而增加，与先前的研究保持一致。令人惊讶的是，年龄较大或超重的个体表现出缺乏细菌植物，这是人类肠道菌群中的主要门，包括机会性病原体，而某些众所周知的益生菌的某些物种则富集在这些组中，暗示了这些细菌的复杂相互作用。关于性别，雌性中的几种来自细菌，副细胞杆菌，梭状芽胞杆菌和阿克米西的MLG富含雌性。功能分析显示了许多与表型相关的KEGG直系同源物（KOS）。
对476日语的全肠病毒蛋白分析揭示了噬菌体与自身免疫性疾病之间的联系
抽象目标已经深入研究了自身免疫性疾病与肠道微生物组之间的关系，并且已经确定了几种与自身免疫相关的细菌分类单元。然而，关于肠道病毒在自身免疫性疾病中的作用知之甚少。在这里，我们根据476个日语的shot弹枪测序进行了整个肠道病毒蛋白分析，其中包括类风湿关节炎（RA），全身性红斑狼疮（SLE），多发性硬化症和健康控制受试者。结果我们的病毒丰度的病例对照比较表明，像健康肠道病毒蛋白的主要组成部分一样，斑点样噬菌体在患有自身免疫性疾病的患者（特别是RA和SLE患者）的肠道中大大降低。此外，podoviridae的SLE肠道肠道显着降低。为了了解这些病毒如何影响细菌组，我们进行了定量病毒 - 细菌关联分析，并定期插入了短期间隔短的短裂重复基于基于基于病毒的病毒 - 基杆菌相互作用分析。我们确定了podovirida E和粪便核之间的共生。此外，还鉴定了多个细菌靶标（例如，Ruminococcus spp）。结论我们的数据表明，肠道病毒蛋白可以直接或通过细菌影响我们的身体。我们的分析已经阐明了与自身免疫相关的肠道微生物组的先前缺失的部分，并提出了有助于自身免疫性疾病的新候选者。
Long W，Li M，Gao Y，Zhang Y，Yuan X，Ye H，Huang H，Liang W，Zhang R，Du G.微生物群落，致病细菌和高风险的抗生物生物分离
抽象目标。该研究的目的是探索微生物群落，致病细菌和高风险抗生素抗生素基因的特征，沿海海滩与多功能宿主之间的相关性，以确定中国热带海岸海滩上的粪便源污染物的潜在物种生物标志物。“一项健康”方法用于海滩和温血宿主的微生物研究。微生物使用16S rRNA基因扩增子和shot弹枪元基因组学上分析了社区。非盐海滩的混乱，辛普森，香农和王牌索引大于属属和OTU级别的盐海滩（P <0.001）。bacteroidota，halanaerobiaeota，蓝细菌和富公司在盐海滩上很丰富（p <0.01）。人类采购的微生物在盐海滩上更丰富，占0.57％。粪便核酸杆菌和hallii菌群被认为是人类粪便污染的可靠指标。在盐海滩上观察到了耐高风险的碳苯甲酸克雷伯氏菌肺炎和基因型KPC-14和KPC-24。TET（X3）/TET（X4）基因和四种类型的MCR基因在海滩和人类上共发生； MCR9.1占多数。TET（X4）在蓝细菌中发现。在中国海滩上很少报道，但观察到病原体，例如藤本植物，肺炎军团菌和幽门螺杆菌。低微生物社区的多样性并未表明风险降低。高危ARM向极端沿海环境的转移应受到足够的关注。
重新定义肠心轴
心力衰竭 (HF) 增加了全球心血管健康的负担。最近有研究表明，心力衰竭患者的肠道微生物群具有独特的变化，这些变化会影响免疫稳态和代谢。在本次文献系统综述中，我们旨在确定肠道菌群失调对心力衰竭的影响。我们使用了系统评价和荟萃分析的首选报告项目 (PRISMA) 2020 指南进行系统评价。我们在 PubMed、PubMed Central (PMC)、Medline 和 ScienceDirect 等数据库上搜索了文献。纳入了十篇文章进行审查。心力衰竭患者的肠道微生物组组成存在显著差异。瘤胃球菌、大肠杆菌、志贺氏菌、链球菌属、韦荣球菌属和放线菌相对丰度较高，真细菌、普氏菌、粪杆菌、SMB53 和巨单胞菌相对减少。这种组成因年龄、心力衰竭分期和失代偿水平而异。但射血分数不变，其组成保持不变。负责氨基酸、碳水化合物、胆碱三甲胺裂解酶 (TMA-裂解酶)、脂多糖 (LPS) 生物合成、色氨酸和脂质代谢的基因表达增加。由此产生的变化影响了代谢物（如三甲胺 N-氧化物 (TMAO)、吲哚硫酸盐 (IS) 和 LPS）以及粪便和血浆中的炎症标志物的水平，从而导致心力衰竭。这些心力衰竭生物标志物可以作为预防和治疗心力衰竭的目标。心力衰竭患者拥有独特的肠道微生物群，这些微生物群会影响心力衰竭的发病机制。需要进一步研究来了解菌群失调与心力衰竭之间的因果关系。