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使用计算系统生物学方法识别 COVID-19 疾病机制中的药物靶标
Anna Niarakis 1,2 * , Marek Ostaszewski 3 , Alexander Mazein 3 , Inna Kuperstein 4,5,6 , Martina Kutmon 7 , Marc E. Gillespie 8,9 , Akira Funahashi 10 , Marcio Luis Acencio 3 , Ahmed 3 , Michael Kar iche 1 , Kin A 11 Tobias Czauderna 12 , Felicia Burtscher 3 , Takahiro G. Yamada 10 , Yusuke Hiki 13 , Noriko F. Hiroi 14,15 , Finterly Hu 7,16 , Nhung Pham 7,16 , Friederike Ehrhart 16 , Egenov 17 , Alberto Valli . in Dugourd 17, Francesco Messina 18, Marina Esteban-Medina 19,20, Maria Peña-Chilet 19,20,21, Kinza Rian 19, Sylvain Soliman 2, Sara Sadat Aghamiri 22, Bhanwar Lal Puniya 22, Aure Nal, Helik 22 , Vidisha Singh 1 , Marco Fariñas Ferna ́ ndez 23 , Viviam Bermudez 23 , Eirini Tsirvouli 23 , Arnau Montagud 24 , Vincent Noël 4,5,6 , Miguel Ponce-de-Leon 24 , Dieter 25 , Maier Anger 25 , Benjamin Bayoch . 6 , John A. Bachman 26 , Augustin Luna 27.28 , Janet Piñero 29.30 , Laura I. Furlong 29.30 , Irina Balaur 3 , Adrien Rougny 31.32 , Yohan Jarosz 3 , Rupert W. Overall 3 , Robert Pha Lisa 3 , Lisa Lisa 35 36 , Devasahayam Arokia Balaya Rex 37 , Marija Orlic-Milacic 8 , Luis Cristobal Monraz Gomez 4,5,6 , Bertrand De Meulder 38 , Jean Marie Ravel 4,5,6 , Bijay Jassal 8 , Venkata Satagopam 3,39 , Guanling Goalkeeper , Martin 14 wron 3 , Laurence Calzone 4,5,6 , Jacques S. Beckmann 42 , Chris T. Evelo 16 , Peter D ' Eustachio 36 , Falk Schreiber 11,43 , Julio Saez-Rodriguez 17 , Joaquin Dopazo 19,20, 214 , Martin Alfonso , 24 , 24 , Olaf Wolkenhauer 46,47 , Hiroaki Kitano 48 , Emmanuel Barillot 4,5,6 , Charles Auffray 38 , Rudi Balling 49 , Reinhard Schneider 3
简历：Massimo Cristofanilli
Falk 基金会资助（PI：Richard Pestell）针对 CCR5 的癌症治疗该项目的目标是测试 CCr5 抑制剂与化疗的组合。角色：PI ACTIVE P30CA060553 (Platanias) 09/01/13-07/31/18 NIH/NCI 罗伯特·H·卢里综合癌症中心 角色：精准医学和转化科学副主任 P30CA060553 (Platanias) 09/01/13-07/31/18 NIH/NCI 罗伯特·H·卢里综合癌症中心 职业发展基金 角色：职业发展奖获得者 R01CA207468 (Yang) NIH 09/01/17-08/31/22 基于人群的转移性乳腺癌结果单一 CTC 分析方法 角色：Sub-PI 1UG3OD023189-01 (Greenland/Ahsan/Winn/Daviglus) 07/06/16 - 12/31/21 NIH/主任办公室 伊利诺伊州精准医学联盟(IPMC) 这是伊利诺伊州精准医学联盟为响应 RFA-PM-16-002 而提出的一项多 PI、多站点协作申请，旨在充当精准医学计划队列计划医疗保健提供者组织 (HPO) 招生中心。角色：联合研究员 METAVIVOR 创始人奖：“揭示新的细胞因子介导机制以增强 ER+/HER2- 转移性乳腺癌对 CDK4/6 抑制的反应”2/20-1/2023。角色：PI 已完成：联合项目负责人：Cynvenio Biosystems Inc. SBIR 第二阶段主题 293：使用液体活检开发转移性乳腺癌的预测生物标志物。HHSN261201300073C。08/27/14-8/26/15；30,500 美元。 （0.12 日历）DOD-DARPA（唐）：研究血液中新发现的免疫细胞并评估其潜在的医学应用。Creatv Microtech, Inc. 的替代品。7/15/14-7/14/16。48,000 美元。（0.48 日历）NIH（唐）。MBC 中的循环巨噬细胞：转移的新型预后生物标志物。Creatv MicroTech, Inc. 的替代品。12/01/14-11/30/15。（0.6 日历）。NIH（Shih）：低成本血液分子恶性肿瘤测试以检测乳腺癌复发。Lenima 的替代品。4/1/15-3/31/16。（1.2 日历）。
使用计算系统生物学方法
Anna Niarakis 1.2 *†，Ostaszewski 3，Alexander Mazein 3，11，Carsten 11，Tobias 12，Felicia Burtcher L. Bhanwar Lal Lal Lal Puni 22，Aure´lien 2，4,5,6，4,5,6，Miguel Ponce-De-De-Leon 25约翰·A·3（John A.
在整体磷化镀磷层元素中的第二次谐波产生
*通讯作者：Muyi Yang，固态物理研究所，弗里德里希·席勒大学Jena，Max-Wien-Platz 1，07743 Jena，德国；弗里德里希·席勒（Friedrich Schiller）大学Jenafriedrich Schiller大学耶拿（Jena），Albert-Einstein-STR的ABBE光子学中心应用物理学研究所。15，07745德国耶拿；和Max Planck Photonics，Hans-Knöll-Straße1，07745德国Jena，电子邮件：muyi.yang@uni-jena.de。https://orcid.org/0000-0002-1738-4536 Maximilian A. Weissflog，应用物理研究所，Abbe Photonics，Friedrich Schiller University，Albert-Einstein-STR。15，07745德国耶拿；以及汉斯·斯特拉斯（Hans-Knöll-Straße）1，07745德国耶拿（Jena），麦克斯·普朗克（Max Planck）光子学院。https://orcid.org/0000-0002-3091-1441 Zlata Fedorova，固态物理研究所，弗里德里希·施莱尔·史列尔（Friedrich Schiller Uni-Cersity Jena），Max-Wien-Platz 1，07743 Jena，德国Jena，德国；和应用物理研究所，Abbe光子学中心，弗里德里希·席勒大学（Friedrich Schiller）大学耶拿，阿尔伯特·恩斯坦 - 斯特（Albert-Einstein-STR）。15，07745德国耶拿，安吉拉·贝雷达（Angela I. Barreda），固态物理研究所，弗里德里希·席勒（Friedrich Schiller Uni-Cersity），耶拿（Jena），马克斯 - 韦恩·普拉茨（Max-Wien-Platz）1，07743德国耶拿（Jena）；弗里德里奇（Friedrichschilleruniversityjena），阿尔伯特·埃因斯坦（Albert-Einstein-STR），弗里德里希（Friedrichschilleruniversityjena）应用物理学研究所。15，07745德国耶拿；以及AVDA马德里大学卡洛斯三世分校的展示和光量应用程序。de la大学，30岁，莱加纳，28911马德里，西班牙，斯特凡·伯纳，应用物理研究所，阿贝·光子学院，弗里德里希·席勒大学耶拿，阿尔伯特·史特恩·斯特林。15，07745德国耶拿；和麦克斯·普朗克（Max Planck）摄影学院，汉斯·斯特拉斯（Hans-Knöll-Straße）1，07745德国耶拿（Jena）15，07745 Jena，Ger-许多Falk Eilenberger和Thomas Pertsch，Applied Physics研究所，Abbe Photonics，弗里德里希·席勒大学Jena，Albert- Einstein-STR。15，07745德国耶拿； Max Planck Photonics，Hans-Knöll-Straße1，07745 Jena，德国；和弗劳恩霍夫（Fraunhofer）应用光学和精密工程IOF，Albert-Einstein-Straße7，07745 Jena，德国伊萨贝尔·斯塔德（Isabelle Staude），固体状态研究所，弗里德里希·施莱尔·施莱尔·席勒（Friedrich Schiller Uni-Versity）弗里德里奇（Friedrichschilleruniversityjena），阿尔伯特·埃因斯坦（Albert-Einstein-STR），弗里德里希（Friedrichschilleruniversityjena）应用物理学研究所。
一生中的皮质厚度和静息状态心脏功能：横断面汇总大型分析
朱利安·科尼格 1,2 |比尔吉特·阿布勒 3 |英格丽德·阿加茨 4,5,6 |托比约恩·阿克施泰特 7,8 |奥勒·安德烈亚斯森 4,9 |米娅·安东尼 10 |卡尔·尤尔根·贝尔 11 |卡佳·伯茨 12 |丽贝卡·C·布朗 13 |罗穆亚尔德·布伦纳 14 |卢卡嘉年华 15 |雨果·D·克里奇利 16 |凯瑟琳·R·卡伦 17 | Geus 18 的 Eco JC |十字架的费利伯特 11 |伊莎贝尔·吉奥贝克 19 |马克·D·费格 3 |哈坎·菲舍尔 20 |赫塔弗洛尔 21 |迈克尔·盖布勒 22,23 |彼得·J·吉安罗斯 24 | Melita J. Giummarra 25.26 |史蒂文·G·格林宁 27 |西蒙·根德尔曼 28 |詹姆斯·AJ·希瑟斯 29 |萨宾·J·赫珀茨 12 | Mandy X. 至 30 |塞巴斯蒂安·延奇克 31,32 |迈克尔·凯斯 1.33 |托拜厄斯·考夫曼 4.9 | Bonnie Klimes-Dougan 34 |斯特凡·科尔施 31.35 |玛琳·克劳奇 12 |丹尼斯·库姆拉尔 22.23 | Femke Lamers 30 |李泰浩 36 |马茨·亚历山大 7.8 |凤林10 |马丁洛策 37 |埃琳娜·马科瓦茨 38.39 |马泰奥·曼奇尼 40.41 |福尔克·曼克 12 | Kristoffer NT 价格 20,42 |斯蒂芬·B·马努克 24 |玛拉·马瑟 43 |弗朗西斯·米滕 44 |闵正元 45 |布莱恩·穆勒 17 |薇拉·穆恩奇 13 |弗劳克·尼斯 21.46 |林雅 45 |古斯塔夫·尼尔松内 8,20 |丹妮拉·奥尔多涅斯·阿库纳 31 |贝尔热·奥斯内斯 35.47 |克里斯蒂娜·奥塔维亚尼 39.48 |布伦达 WJH 彭尼克斯 30 |艾莉森·庞齐奥 45 |戈文达·R·普德尔 49 |詹尼斯·雷内尔特 22 |平忍10 |榊道子 50.51 |安迪舒曼 11 |林索伦森 35 |卡尔斯滕·施佩希特 35.52 |乔安娜·施特劳布 13 |桑德拉·塔姆 8,20,53 |米歇尔泰国 17 |朱利安·F·塞耶 54 |本杰明·乌巴尼 55 |丹尼斯·范德米 18 |劳拉·S·范维尔岑 56.57.58 |卡洛斯·文图拉-博特 59 |阿诺·维尔林格 22,23 |大卫·沃森 60 |魏鲁清 61 |朱莉娅·温特 59 |梅琳达·韦斯特伦德·施莱纳 34 |拉尔斯·T·韦斯特莱 4,9,62 |马蒂亚斯·威玛 59.63 |托拜厄斯·温克尔曼 21 |吴国荣 61 |刘贤珠 45 |丹尼尔·S·金塔纳 4.9
愿景计划：事实说明
该愿景计划是与社区成员、当地商界领袖、城市设计师和交通专家合作的两年愿景过程的结晶 纽约，纽约州（2021 年 1 月 19 日）-- 联合广场合作组织今天宣布发布联合广场-14 街区愿景计划（“愿景计划”），这是一项针对联合广场-14 街社区未来的雄心勃勃的新提案，将使公共空间大幅增加 33%。 “我们很自豪地公布这项愿景计划，该计划通过促进开放、公平、安全和可达性，将联合广场-14 街社区的需求放在首位。这里的最终目标是让公园游客知道他们已经到达了一个特别的地方，”联合广场合作组织执行董事 Jennifer Falk 说。 “该愿景计划最初是为了应对拟议的 L 列车关闭而发起的，随着 COVID-19 颠覆了我们的世界，并随之颠覆了我们与公共空间的关系，该计划也在不断发展。更多的开放空间、更安全的行人和自行车出行、更便捷的交通、更多的户外座位和绿化——所有这些变化都是该计划所要求的，在我们规划该地区的下一章时，这些变化将为我们的社区带来不可估量的好处。” 该愿景计划由纽约联合广场设计公司联合设计，是与社区成员、当地商界领袖、城市设计师、景观建筑师、交通专家以及市和州机构合作伙伴合作的两年过程的结晶。在 20 场独立的活动中，有超过一千人参与，这是该合作伙伴关系 45 年历史上规模最大的一次外展活动。 “对许多纽约人来说，联合广场是城市的中心，吸引着居民、购物者和上班族等罕见而充满活力的组合。我们的设计保留了吸引人们前往联合广场-14 街的美好品质，并通过将公园延伸到邻近区域并缓解交通拥堵为行人提供了更多的空间。通过找到一种让公园与周围城市一起成长和演变的方法，我们保持了空间的平衡，让它变得更加美丽，让每个人都能享受其中，”Marvel 创始合伙人 Guido Hartray, AIA 说道。愿景计划提出了五个关键项目：1. 将第 14 街改造成世界一流的林荫大道和交通干道。该计划希望在该市公交专用道计划初步产生积极影响的基础上，将第 14 街打造成世界一流的林荫大道。这包括扩大步行区和指定公交上车区，以及优先考虑出入和连通性，以创建活跃的街道景观。新的小公园、树木、花坛和其他元素将增强步行体验。联合广场的人行道将增加一倍宽，以缓解交通入口的拥堵，并允许激活底层的零售店。2.将联合广场西延伸至周围的建筑物，转变为无缝的步行广场。
住院后2年，在Covid -19患有舒适后症状的Covid -19中存在SARS -COV -2 RNA：毒蛇研究
1。世界卫生组织。谁冠状病毒（Covid-19）Dash-董事会。2024年4月5日访问。http：//covid19.who.int/ 2。Zheng C，Shao W，Chen X，Zhang B，Wang G，Zhang W. Covid -19疫苗的真正世界有效性：文献综述和元分析。 int j Infect dis。 2022; 114：252- 260。 3。 fernández-de -de -las -peñasC。长covid：当前定义。 感染。 2022; 50：285 -286。 4。 Soriano JB，Murthy S，Marshall JC，Relan P，Diaz JV，后者临床案例定义工作组 - COVID -19条件。 通过Delphi共识对后COVID -19条件的临床案例定义。 柳叶刀感染。 2022; 22：e102 -e107。 5。 Chen C，Haupert SR，Zimmermann L，Shi X，Fritsche LG，Mukherjee B. 2019年冠状病毒后的全球患病率（COVID-19）或长期covid：元分析和系统综述。 J感染。 2022; 226：1593 -1607。 6。 Han Q，Zheng B，Daines L，Sheikh A. 长期的covid -19的后遗症：一年的系统综述和元分析，遵循有关后症状后症状的研究。 病原体。 2022; 11：269。 7。 fernandez -de -las -peñasC，Notarte KI，Macasaet R等。 在SARS-COV-2感染两年后，普通人群中的covid症状持续存在：系统审查和元分析。 J感染。 2024; 88：77- 88。 8。 Rahmati M，Udeh R，Yon DK等。Zheng C，Shao W，Chen X，Zhang B，Wang G，Zhang W. Covid -19疫苗的真正世界有效性：文献综述和元分析。int j Infect dis。2022; 114：252- 260。3。fernández-de -de -las -peñasC。长covid：当前定义。感染。2022; 50：285 -286。4。Soriano JB，Murthy S，Marshall JC，Relan P，Diaz JV，后者临床案例定义工作组 - COVID -19条件。通过Delphi共识对后COVID -19条件的临床案例定义。柳叶刀感染。2022; 22：e102 -e107。5。Chen C，Haupert SR，Zimmermann L，Shi X，Fritsche LG，Mukherjee B.2019年冠状病毒后的全球患病率（COVID-19）或长期covid：元分析和系统综述。J感染。2022; 226：1593 -1607。6。Han Q，Zheng B，Daines L，Sheikh A. 长期的covid -19的后遗症：一年的系统综述和元分析，遵循有关后症状后症状的研究。 病原体。 2022; 11：269。 7。 fernandez -de -las -peñasC，Notarte KI，Macasaet R等。 在SARS-COV-2感染两年后，普通人群中的covid症状持续存在：系统审查和元分析。 J感染。 2024; 88：77- 88。 8。 Rahmati M，Udeh R，Yon DK等。Han Q，Zheng B，Daines L，Sheikh A.长期的covid -19的后遗症：一年的系统综述和元分析，遵循有关后症状后症状的研究。病原体。2022; 11：269。7。fernandez -de -las -peñasC，Notarte KI，Macasaet R等。在SARS-COV-2感染两年后，普通人群中的covid症状持续存在：系统审查和元分析。J感染。2024; 88：77- 88。8。Rahmati M，Udeh R，Yon DK等。对SARS -COV -2感染后的Covid -19 2-年度长期后遗症的系统综述和元分析：神经，身体和心理学科学的行动呼吁。J Med Virol。2023; 95：e28852。9。Amdal CD，PE M，Falk RS等。活跃的Covid -19或Covid -19患者的生活质量问题（包括症状），包括症状，包括症状；系统文献综述。Qual Life Res。2021; 30：3367 -3381。10。tene L，Bergroth T，Eisenberg A，David SSB，ChodickG。风险因素，健康结果，医疗服务利用以及长期共同患者的直接医疗费用。int j Infect dis。2023; 128：3 -10。11。Hayes LD，Ingram J，Sculthorpe NF。SARS -COV -2的100多个持续症状（长covid）：范围审查。前药。2021; 8：750378。12。fernández-de -de -las -peñasC，Raveendran AV，Giordano R，Arendt -Nielsen L. Long Covid或Covid -19条件 - 19条状态：过去，现在和未来的研究指导。微生物。2023; 11：2959。13。Chen B，Julg B，Mohandas S，Bradfute SB。恢复机械途径工作组。长期相互兴趣的病毒持久性，重新激活和机械性。Elife。 2023; 12：e86015。 14。 Proal AD，Vanelzakker MB，Aleman S等。 sars -cov -2储存库，在covid -19后急性后遗症（PASC）。 nat免疫。 2023; 24：1616- 1627。 15。 Clin Chem Lab Med。Elife。2023; 12：e86015。14。Proal AD，Vanelzakker MB，Aleman S等。sars -cov -2储存库，在covid -19后急性后遗症（PASC）。nat免疫。2023; 24：1616- 1627。15。Clin Chem Lab Med。fernandez -the -page C，Torres J，Macase R等。在Covid -19的幸存者中存在SARS -2 RNA：2024; 62：1044 -1052。
atezolizumab和bevacizumab，用于不可切除或转移性的肝细胞癌 - 胆管癌：一项多中心回顾性研究
罕见的原发性肝癌。JHEPREP。2021; 3（1）：100174。 https：// doi。 org/10.1016/j.jhepr.2020.100174 2。 Sempoux C，Kakar S，Kondo F，Schirmacher P.合并肝细胞壁 - 胆管癌和未分化的原发性肝癌。 in：Arends MJ，Fukuyama M，Fukuyama M，Klimstra DS，Klimstra DS等人，编辑。 谁的肿瘤分类：消化系统肿瘤。 第五。 里昂：IARC; 2019年。 260。 3。 Brunt E，Aishima S，Clavien PA，Fowler K，Goodman Z，Gores G等。 CHCC -CCA：原发性肝癌的识别术语，具有肝细胞和胆管细胞的分化。 肝病学。 2018; 68（1）：113–26。 https://doi.org/10.1002/hep.29789 4。 Gigante E，Ronot M，Bertin C，Ciolina M，Bouattour M，Dondero F等。 结合成像和肿瘤活检可改善肝细胞 - 胆管癌联合的诊断。 肝脏Int。 2019; 39（12）：2386–96。 https://doi.org/10.1111/liv.14261 5。 BeaufrèreA，Calderaro J，Paradis V.结合肝细胞 - 胆管癌：更新。 J hepatol。 2021; 74（5）：1212–24。 https://doi.org/10.1016/j.jhep.2021.01.035 6。 Gentile D，Donadon M，Lleo A，Aghemo A，Roncalli M，Di Tommaso L等。 肝癌的手术治疗：系统评价。 肝癌。 2020; 9（1）：15–27。 https://doi.org/10.1159/ 000503719 7。 Xue R，Chen L，Zhang C，Fujita M，Li R，Yan SM等。 癌细胞。 2019; 35（6）：932–47.e8。 PO.20.00397。JHEPREP。2021; 3（1）：100174。 https：// doi。org/10.1016/j.jhepr.2020.100174 2。Sempoux C，Kakar S，Kondo F，Schirmacher P.合并肝细胞壁 - 胆管癌和未分化的原发性肝癌。in：Arends MJ，Fukuyama M，Fukuyama M，Klimstra DS，Klimstra DS等人，编辑。谁的肿瘤分类：消化系统肿瘤。第五。里昂：IARC; 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一种机器学习算法，以使狗的心脏杂音和临床前椎间盘瓣疾病
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透明的人工智能披露义务：谁、什么、何时、何地、为什么、如何
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