XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemFirmicutes
肠道微生物组和动脉粥样硬化
背景：根据最近的研究，动脉粥样硬化和肠道菌群是相关的。尽管如此，已经发现肠道菌群随着研究而有所不同，其功能仍在争论中，并且这种关系并未被证明是因果关系。因此，我们的研究旨在在不同的分类学水平上识别关键的肠道菌群分类单元（GM分类单元），即门，阶级，秩序，秩序，家庭和属，以研究与动脉粥样硬化的任何潜在因果关系。方法：我们采用了来自肠道微生物群的Mibiogen联盟中的汇总数据来进行复杂的两样本Mendelian随机分析（MR）分析。有关动脉粥样硬化统计的相关信息是从Finngen Consortium R8出版物中获取的。评估因果关系，利用的主分析技术是反向方差加权（IVW）方法。补充IVW，采用了其他MR方法，包括加权中位数，MR-EGGER，加权方法和简单模式。敏感性分析涉及Cochrane的Q检验，MR-Egger截距测试，MR-Presso全球测试和剩余分析的应用。结果：最后，在对动脉粥样硬化的211 gm分类单元进行了211 gm分类单元的风险进行MR研究之后，我们发现了20个名义联系和一个牢固的因果关系。Firmicutes（门ID：1672）（几率（OR）= 0.852（0.763，0.950），p = 0.004）仍然与较低的冠状动脉粥样硬化发生率有关，即使在Bonferroni校正后，也是如此。这项研究可以通过关注肠道菌群来提供有关动脉粥样硬化的治疗目标的新见解。结论：基于发现的数据，确定菲洛姆·菲尼科特斯与冠状动脉粥样硬化的发生率降低表现出因果关系。
完善肠道菌群与常见血液学恶性肿瘤之间的关系：双向Mendelian随机研究的见解
Results: Through forward and reverse MR analyses, we found the risk of lymphoid leukemia was signi fi cantly associated with the abundance of phylum Cyanobacteria, order Methanobacteriales, class Methanobacteria, family Peptococcaceae, family Methanobacteriaceae, and genera Lachnospiraceae UCG010, Methanobrevibacter, Eubacterium brachy组和丁二维伯里奥（Butyrivibrio）。The risk of myeloid leukemia was signi fi cantly associated with the abundance of phylum Actinobacteria, phylum Firmicutes, order Bi fi dobacteriales, order Clostridiales, class Actinobacteria, class Gammaproteobacteria, class Clostridia, family Bi fi dobacteriaceae, and genera Fusicatenibacter, Eubacterium Hallii Group，Blautia，Collinsella，Ruminococcus Gauvreauii组和双杆菌。Hodgkin淋巴瘤的风险与丰富的梭子座Vadinb60组，peptocococus属和Ruminococcaccaceae UCG010属显着相关。恶性等离子体细胞肿瘤的风险与丰富的Romboutsia属和卵细菌的丰度显着相关。弥漫性大B细胞淋巴瘤的风险与丰富的Erysipelatoclostridium和Eubacterium coprostanolostanoligenes组显着相关。成熟T/NK单元的风险
应用数学系
Nanoarchaeota(Nanoarchaeum), Crenarchaeota (Sulfolobus, Thermoproteus) and Euryarchaeota [Methanogens (Methanobacterium, Methanocaldococcus), thermophiles (Thermococcus, Pyrococcus, Thermoplasma), and Halophiles (Halobacterium, Halococcus)] Eubacteria: Introduction and以下组的重要性：革兰氏消极：非蛋白杆菌：合适的例子的一般特征alpha protobacteria：一般特征与合适的例子β蛋白杆菌：一般特征与适当的例子示例蛋白杆菌：γ蛋白杆菌：gamma protebacteria：一般特征，具有合适的例子，具有合适的例子，具有合适的例子，具有适当的典范：蛋白质细菌：具有合适例子的一般特征革兰氏正阳性：低g+ c（公司）：一般特征与适当的例子高g+ c（肌动杆菌）：一般特征，有适当的例子cyanobacteria：简介
Matteo Vismara2，医学博士； Kenneth J. O’Riordan3，博士；约翰……
摘要 37 强迫症 (OCD) 和重度抑郁症 (MDD) 经常同时发生，抑郁症状会影响 OCD 进展，反之亦然。识别生物标记物 39 对于改善诊断和治疗至关重要。虽然肠道微生物群在精神疾病中的作用已得到充分研究，但本研究重点关注口腔微生物群的变化及其与 BDNF（脑源性神经营养因子）DNA 甲基化的关系，并与健康对照组进行比较。我们的研究结果揭示了微生物群 43 组成的显著变化，强迫症患者的放线菌门和厚壁菌门丰度 44 增加（p<0.05；CTRL=n.24，OCD=n.21），而 MDD 患者的放线菌门和厚壁菌门丰度增加，拟杆菌门和变形菌门丰度减少（p<0.05；CTRL=n.24，46 MDD=n.16）。这些变化（包括潜在的链球菌感染后自身免疫）凸显了微生物群在强迫症和 MDD 病理生理学中的作用。在两种疾病中，外显子 I 和 IV 的 CpG 位点均观察到 BDNF DNA 48 甲基化的选择性变化，在 OCD 和 MDD 中显著减少（p<0.05；CTRL=n.24，OCD=n.23，MDD=n.16），并且 miRNome 分析 50 显示 BDNF 靶向微小 RNA 的表达发生改变，其中 miR-16-5p 和 miR-29a-3p 51 在 OCD 中上调（p<0.05；CTRL=n.24，OCD=n.17），而 miR-29a-3p 上调而 miR-191- 52 5p 下调（p<0.05；CTRL=n.24，MDD=n.16）。这些发现表明了疾病特异性的微生物群和表观遗传特征，将唾液定位为一种非侵入性生物标志物识别工具。这项研究促进了对强迫症 55 和抑郁症中微生物表观遗传相互作用的理解，可能指导早期诊断和针对性治疗。56
性别特异性细菌微生物组变异章鱼皮肤
对脊椎动物的宿主微生物群的知识越来越多，已经表明，微生物组的性别特异性差异的流行率。但是，几乎没有研究评估头足动物微生物组的性别差异。在这里，我们使用靶向原核生物16S rRNA基因的V4高变量区域的扩增子测序评估了共同章鱼（章鱼）皮肤微生物组的性别特异性变化。皮肤和地幔相关的粘液是从普通章鱼（章鱼）的野生成年个体中收集的（9名男性和7种相似大小的女性）。在性别之间与皮肤或地幔粘膜相关的微生物群落的α多样性中没有显着差异。但是，我们的结果清楚地表明，成年章鱼雄性和女性在皮肤和地幔相关的粘液群落中都具有独特的微生物群落组成，女性微生物组以富富（48.1％）为主（48.1％），而雄性的男性则包含大多数蛋白质（60.5％），而不是代表3.30％的企业，并不是属于3.30％的属性。探索组织之间的社区。不同分类群在女性和雄性的皮肤中的主导地位（例如，女性，雄性，根瘤菌，根瘤菌和雄性细菌中的霉菌性和乳酸菌在男性中提出了一种性别的共生性，这些性别是这些微生物从这些微生物中受益于易于访问的女性，并伴随着女性的成分，并在不可或缺的情况下进行了面板。大多数对头足动物微生物群的知识仅限于消化道和生殖系统。但是，头足动物皮肤是具有大量功能的器官。鉴于在这项研究中，两性标本之间缺乏大小差异，我们假设激素表明的差异以及野外性别之间的行为或生态差异，这是性别间分化的主要驱动因素。这是表征头足动物皮肤微生物群并确定性别影响的第一次尝试。
咖啡对健康和疾病中肠道菌群和肠作用的影响：文献评论
摘要：背景和目标：作为世界上最受欢迎的饮料之一，咖啡长期以来一直在影响肠子功能，例如运动，分泌和吸收。在人类和动物研究中获得的最新证据表明，咖啡对肠道菌群的影响有调节。我们旨在概述咖啡对肠道菌群组成，多样性和生长的特定影响。我们还将批判性地回顾咖啡对健康和疾病中肠子功能的影响，并讨论肠道微生物群在胃肠道的咖啡相关功能变化中是否起作用。方法：我们使用PubMed，Web of Science和其他来源搜索了文献，例如咖啡，咖啡因，微生物群，胃静态感染，运动，分泌，肠道轴，吸收和药物互动。包括啮齿动物的患者和临床前研究的临床研究。 结果：大多数研究发现，适度的咖啡消费（每天<4杯）增加了有益细菌门的相对丰富，例如Firmicutes和cinticutes and statinobacteria and Statobacteria and降低了拟杆菌。 中度咖啡消耗也增加了双歧杆菌属。 并减少了肠杆菌的丰度。 据报道，咖啡消耗增加了肠道菌群的多样性。 尽管咖啡对肠功能的影响已经很长时间了，但直到最近，我们才意识到咖啡的某些影响可能部分是由于它对微生物群的影响。包括啮齿动物的患者和临床前研究的临床研究。结果：大多数研究发现，适度的咖啡消费（每天<4杯）增加了有益细菌门的相对丰富，例如Firmicutes和cinticutes and statinobacteria and Statobacteria and降低了拟杆菌。中度咖啡消耗也增加了双歧杆菌属。并减少了肠杆菌的丰度。咖啡消耗增加了肠道菌群的多样性。尽管咖啡对肠功能的影响已经很长时间了，但直到最近，我们才意识到咖啡的某些影响可能部分是由于它对微生物群的影响。结论：当前的文献表明，中等咖啡的消费对口腔和肠道菌群以及运动功能具有有益的影响。然而，过多的咖啡摄入量（每天> 5杯）与克罗恩病的反流疾病，牙周疾病和进展有关。需要在该领域进行进一步的研究，因为咖啡在胃肠道中的影响有许多相互矛盾的结果。
微生物易位及其临床...
引言人类肠上皮层是一个细胞厚，扮演两个主要角色。它吸收了急需的营养素和水为宿主吸收，并将细菌，抗原和其他非自身物质排除在将肠道屏障越过无菌部位。人类肠道中包含多种细菌物种，主要是非致病性物种，作为其正常微生物菌群的一部分。在正常情况下，一个人的肠道微生物组包含约牛un中的非致病细菌的105个菌落形成单位（CFU）/ml，远端卵巢和Cecum中的108 cfu/ml约为108 cfu/ml，在COLON中最多为1012 cfu/ml [1]。无关紧要的肠道细菌的例子包括属于静脉细菌和蛋白质细菌的成员，而大多数肠道细菌是系统发育谱系，坚硬和细菌植物的成员[2]。已估计
广谱抗CRISPR蛋白促进水平基因转移
CRISPR-Cas 适应性免疫系统保护细菌和古细菌免受入侵的遗传寄生虫（包括噬菌体/病毒和质粒）的侵害。为了应对这种免疫力，许多噬菌体都具有抑制 CRISPR-Cas 靶向的抗 CRISPR (Acr) 蛋白。迄今为止，抗 CRISPR 基因主要在噬菌体或原噬菌体基因组中发现。在这里，我们使用李斯特菌 acrIIA1 基因作为标记，发现了厚壁菌中存在的质粒和其他接合元件上的 acr 基因座。在李斯特菌、肠球菌、链球菌和葡萄球菌基因组中发现的四个已识别基因可以抑制 II-A 型 SpyCas9 或 SauCas9，因此被命名为 acrIIA16-19。在粪肠球菌中，Cas9 靶向质粒的结合通过源自肠球菌结合元件的抗 CRISPR 得到增强，凸显了 Acrs 在质粒传播中的作用。相互共免疫沉淀表明，每个 Acr 蛋白
探索农业领域的微生物多样性响应
暴露于农药会改变受污染农业领域的微生物群落结构。为分析天然微生物组成QRT-PCR的变化，进行了一项宏基因组学研究。QRT-PCR结果表明，相对于被农药污染的土壤，未污染的土壤具有较高的16S rDNA拷贝数。元基因组分析解释了与富含农药污染的土壤相比，未污染的土壤富含蛋白质。然而，发现存在于农药的土壤中的静脉细菌，坚硬和杀菌剂的存在。此外，在农药刺的土壤中发现了新的门，例如氯氟氯氟，平霉菌和ver肉，而酸虫细胞杆菌和crenarchaeota灭绝。这些发现强调了暴露于土壤上的农药显着影响土壤的生物组成。在农药胁迫下，大量的微生物组成可以更好地用于治疗受污染环境中农药的生物降解和生物修复。
菌群组成对结直肠癌患者免疫疗法结果的影响：系统评价
总共确定了5,132篇论文，2017 - 2022年之间进行了三项研究和一项摘要，符合纳入标准，并在描述性合成表中进行了总结。这四项研究符合以下发现，四个主要门，富公司，杆菌，放线杆菌和verrucomicrobobiota与CRC患者对ICIS治疗的临床反应有关。Ruminococaceae主要与CRC患者相关，而对治疗的反应，而微球菌家族在非反应者中更为常见。细菌分类群（例如粪便菌群和prevotellaceae）与对ICIS的更好反应有关，并且可能是预测的生物标志物。粪便菌群与Akkermansia Muciniphila和Eubacterium guctale richment的特征，以及Rothia Mucilaginosa Deptetion可以独立预测CRC患者对ICI的更好反应。