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整合基因组学、表型分析
豆科植物是人类饮食的重要组成部分，为牲畜提供饲料，并通过生物固氮补充土壤肥力。全球对食用豆科植物的需求正在增加，因为它们可以补充谷物的蛋白质需求，并且具有很高的可消化蛋白质百分比。气候变化增加了干旱胁迫的频率和强度，对生产造成了严重的限制，尤其是在生产大多数豆科植物的雨养地区。在过去的半个世纪里，豆科植物的遗传改良与其他作物一样，主要基于谱系和基于性能的选择。为了在雨养条件下更快地实现豆科植物的遗传增益，本综述提出了将现代基因组学方法、高通量表型组学和模拟建模相结合，以支持作物改良，从而产生具有适当农艺性能的改良品种。选择强度、世代间隔和育种操作效率的提高有望进一步提高实验地块的遗传增益。改善农民的种子获取途径，再加上农民田地中适当的农艺方案，将带来更高的遗传增益。增强遗传增益，不仅包括生产力，还包括营养和市场特性，将提高农业的盈利能力和负担得起的营养食品的供应，特别是在发展中国家。
计算基因组学科学家
£竞争性薪水我们正在寻找一位驱动的计算基因组学科学家，在NGS中具有强大的背景，以加入我们的扩展团队。在YouSeq，我们利用人类遗传和基因组数据来了解疾病的风险。 如果您热衷于利用基因组学来推动科学创新（尤其是在诸如Oncegenetics之类的领域），您可能是我们团队的完美选择。 具有基因组数据分析的经验至关重要，对靶向测序方法（例如整个外显子组测序）的扎实理解将是一个巨大的优势。 动手湿实验室经验也是一个加号，但不是必需的。 该角色位于我们的计算基因组学函数中，该功能的重点是将基因组学的能力应用于分子测试中的创新。 您将与跨职能团队和外部合作伙伴合作，以开发和优化大规模基因组数据分析的管道。 您将在与尖端的生物信息学解决方案桥接科学问题中发挥关键作用，同时与计算和实验学科的同事无缝合作。在YouSeq，我们利用人类遗传和基因组数据来了解疾病的风险。如果您热衷于利用基因组学来推动科学创新（尤其是在诸如Oncegenetics之类的领域），您可能是我们团队的完美选择。具有基因组数据分析的经验至关重要，对靶向测序方法（例如整个外显子组测序）的扎实理解将是一个巨大的优势。动手湿实验室经验也是一个加号，但不是必需的。该角色位于我们的计算基因组学函数中，该功能的重点是将基因组学的能力应用于分子测试中的创新。您将与跨职能团队和外部合作伙伴合作，以开发和优化大规模基因组数据分析的管道。您将在与尖端的生物信息学解决方案桥接科学问题中发挥关键作用，同时与计算和实验学科的同事无缝合作。关键责任：设计，更新和维护管道以自动化大规模测序数据的变体识别变体，迭代分析过程，与团队成员合作，与（外部）合作者合作，并协助计划研究遗传学和基因组合的遗传学和基因学问题的研究，以将遗传和基因合作作为分解型的特征，以构图的范围，以置于遗传学和基因上，以构图的措施，这些疾病的特征，该行动的特征，是成本的特征，该措施的特征是，这些疾病的特征，是成本的特征。 to identify key needs and questions that can be addressed using genomics, sequencing, or bioinformatics in general Follow relevant cutting-edge advancements in the fast-paced field of genomics, bringing developments in-house or building upon them as appropriate Partner with team members to improve or expand computational methods and develop best-practice, easy-to-use analytical workflows to answer common genomics questions Minimum Qualifications:
分子遗传学和基因组学
所有考试将在正常授课时间进行，可能通过 BrightSpace 进行。如果您没有可用于在 BrightSpace 上参加考试的设备，请在课程开始时联系我们，我们将指导您获取资源（例如，图书馆的“借用笔记本电脑”计划）。考试时长为 50 分钟，从授课时间段开始算起，并且有一个严格的结束时间，您必须在此时间之前提交考试。只有在出现技术问题时才会允许临时延长考试时间，例如，如果与 BrightSpace 服务器的连接中断。学生必须立即通知监考人员互联网连接中断。如果您身体健康，可以参加考试，但不应来校园（例如，为了防止传染病传播），请尽早联系教师讨论其他选择。
动脉粥样硬化的功能基因组学
在西方社会，心肌梗死、中风和外周动脉疾病等心血管疾病是导致死亡的主要原因。这些心血管疾病的根本原因是动脉粥样硬化。动脉粥样硬化病变的早期阶段通常出现在生命的前十年，不会引起临床问题。更晚期但稳定的病变可能导致心绞痛等临床表现。当稳定病变变得不稳定并破裂时，就会出现最严重的危及生命的并发症。病变成分暴露于血液会导致血栓形成，从而完全阻塞血流。冠状动脉闭塞可能导致心肌梗死，脑动脉闭塞可能导致中风。稳定斑块变得不稳定并破裂的具体机制尚不清楚。然而，已知细胞外基质重塑在斑块稳定中发挥作用，并受到多种蛋白酶（包括组织蛋白酶）的影响。在这篇论文中，我们发现半胱氨酸蛋白酶组织蛋白酶 K 在稳定病变和含有血栓的病变之间表达存在差异。此外，通过基因缺陷和抑制，我们研究了组织蛋白酶 K 在两种心血管疾病（动脉粥样硬化和动脉瘤形成）中的作用。此外，我们使用功能基因组学方法来识别在动脉粥样硬化斑块（去）稳定中发挥作用的新基因/肽。
洋葱：育种和基因组学
摘要洋葱是一种起源于中亚的长期文化蔬菜作物。几乎所有世界各地的洋葱都因其烹饪，营养，药物和健康益处而被种植。使用传统的育种方法，育种者和农民多年来一直在努力提高洋葱产量。目前很难满足不断增长的客户需求并应对不利的气候条件。由于其两年一的生命周期，交叉授粉和近交抑郁症，表征重要的特征一直具有挑战性。因此，最近可用的洋葱基因组序列和当代分子育种技术的使用将帮助研究人员克服这些挑战并加快洋葱作物的发展。关键字：洋葱，葱属CEPA，遗传资源，质量特征，基因组学和分子育种。
海洋基因组学（C004045）
该课程涉及对基因组启用的见解，对环境海洋科学的更广泛框架。本课程中的主题包括从个体到生态系统级别的海洋生物的基因，基因组和元基因组的进化和功能方面。先决条件。该课程旨在为学生提供分子生态学领域的介绍，专门针对其生物体的海洋环境。该课程涉及将分子种群遗传学，系统发育学以及（元）基因组学和（meta-）转录组学应用于传统的生态和进化问题（例如，物种诊断，生物多样性的物种诊断，保护和评估，定量性遗传学，特质和繁殖研究和繁殖的研究和繁殖的遗传性和繁殖性生物学的遗传能力，以及行为的生物学生态学）。
精准医学中的基因组学
精准医学中的基因组学 Shivani S. 库马拉古鲁技术学院生物技术系 *通讯作者电子邮箱：shivanisivakumar157@gmail.com 摘要 --- 精准医学 (PM) 一词在药物研发领域引起了广泛关注。PM 的根源可以追溯到人类基因组计划启动之前（21 世纪初），但直到 2010 年才开始出现。PM 是一种预防策略，通过考虑每个人的基因、环境和生活方式的变化来注重改善患者护理。PM 是一项长期努力，包括美国国立卫生研究院 (NIH) 和其他多个研究中心在内的先驱者都是资助和开展与 PM 相关的前沿研究的人。了解一个人的基因组成将有助于我们更好地理解和预测疾病风险，这将进一步有助于个性化的诊断和治疗策略。尽管关于精准医学的研究文章数量可观，但据我所知，这些文章并未过多强调精准医学未能成为疾病诊断和患者护理的首选的原因。因此，本文将解释精准医学将如何改变我们今天所知的医疗保健的未来。此外，本文还讨论了有助于精准医学发展的因素。关键词 --- 精准医疗、基因组成、疾病、诊断。简介目前的药物治疗实践是无效的，因为它们没有考虑到个体基因组成随着时间的推移而发生的变化以及与这些基因组改变相关的症状 [1]。基因组变化（例如突变）会对人类健康造成多种不利影响，并且有各种研究都强调了这个问题。例如，患有类风湿性关节炎的患者通常会被开高剂量的萘普生，在分析药物效果后，20 名患者中有 4 名会显示出良好的预后，其余患者将接受另一种药物甲氨蝶呤的初始剂量，但很少有人会对这种药物产生反应，而其他人可能会出现红斑、胃痛和水肿等不良反应。上述问题可以通过采取精准医疗方法来解决 - 医生/临床医生将分析基因图谱并研究个人对甲氨蝶呤等药物的具体反应，并开出有效反应的定制药物 [2]。通过了解完整的
基因组学国家 2023
现在，来自学术界、商界、政府和慈善机构的全球研究人员都可以使用它来进行改善人类健康的科学发现。英国生物样本库首席研究员、英国皇家学会院士、医学学士罗里·柯林斯教授很好地抓住了该项目的重要性，他说：“当科学家们想知道从生活方式、环境、遗传到疾病的途径时，他们会把英国生物样本库当成谷歌地图来查看，他们不会去谷歌，而是去英国生物样本库。”英国生物样本库现在提供了现存最详细的人类健康状况图景，为研究人员提供了终极工具箱，使他们能够发现以前无法触及的疾病发展联系和发现。但英国在基因组学方面的能力和机会远远超出生物样本库，我们拥有更多资产——既在公共部门，也在蓬勃发展的私营部门，包括出色的中小型企业。这项技术的大规模应用正在重塑全球医疗保健和制药行业，加速我们对疾病以及如何预防和治疗疾病的理解，而哪个国家最能抓住利用这项技术而发展起来的新产业的价值，都将获得巨大的经济回报。有了正确的投资、熟练的专业人员和 NHS 生态系统内的合作伙伴关系，英国基因组学中小企业完全有能力成为全球生物技术和生命科学增长最快的领域之一的关键参与者，为国家带来经济增长，同时为全球带来健康见解。这就是创新型基因组学公司对我们国家的生命科学产业如此重要的原因。如果说我对英国生物银行 2 亿英镑项目的构建方式有什么遗憾的话，那就是没有充分考虑从一开始就找到一种方法让英国中小企业与学术公司和大型制药公司一起参与这个项目的潜在产业战略利益。