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转录驱动的 DNA 超螺旋抵消了 H-NS-...
在所有活细胞中，基因组 DNA 都是通过与专用蛋白质相互作用和/或形成多聚螺旋而压缩的。在细菌中，DNA 压缩是动态实现的，与密集且不断变化的转录活性相协调。H-NS 是一种主要的细菌类核结构蛋白，由于其与 RNA 聚合酶的相互作用而特别受关注。H-NS：DNA 核蛋白丝抑制 RNA 聚合酶的转录起始。然而，H-NS 沉默的基因可以通过来自邻近区域的转录激活这一发现表明，延长的 RNA 聚合酶可以分解 H-NS：DNA 丝。在这项研究中，我们提供了证据表明转录诱导的反沉默不需要转录到达沉默基因；相反，它在远处发挥作用。通过在中间片段内引入 DNA 旋转酶结合位点可抑制反沉默，这表明长距离效应是由转录驱动的正 DNA 超螺旋向沉默基因扩散引起的。我们提出了一个模型，其中 H-NS：DNA 复合物在体内在负超螺旋 DNA 上形成，H-NS 桥接了多面体的两条臂。相邻转录产生的正超螺旋的旋转扩散将导致 H-NS 结合的负超螺旋多面体“展开”，从而破坏 H-NS 桥并释放 H-NS。
吉泊汀和佐利氟达星如何稳定与细菌IIA型拓扑异构酶的DNA裂解复合物？1.金属结合位点的实验定义
摘要：21 世纪实验结构生物学面临的挑战之一是观察化学反应的发生。金黄色葡萄球菌 (S. aureus) DNA 旋转酶是一种 IIA 型拓扑异构酶，可产生暂时的双链 DNA 断裂来调节 DNA 拓扑结构。吉泊汀、佐利氟达星和喹诺酮类莫西沙星等药物可以稳定这些通常短暂的 DNA 链断裂并杀死细菌。在相同的 P6 1 空间群 (a = b ≈ 93 Å，c ≈ 412 Å) 中，已解析出含有吉泊汀前体 (2.1 Å GSK2999423) 或双裂 DNA 和佐利氟达星 (或其前体 QPT-1) 的未裂解 DNA 的晶体结构。这表明可能可以观察到该 P6 1 空间群中的两个 DNA 切割步骤（和两个 DNA 连接步骤）。这里，解决了这种晶体形式的 2.58 Å 异常锰数据集，并重新细化了这种晶体形式的四个先前的晶体结构（1.98 Å、2.1 Å、2.5 Å 和 2.65 Å）以阐明晶体接触。这些结构清楚地表明了单一移动金属机制——在附带的（第二篇）论文中提出。先前发表的酵母拓扑异构酶 II 的 2.98 Å 结构，它在晶体二重轴周围具有静态无序，被发表为在一个活性位点包含两种金属。这个 2.98 Å 酵母结构的重新细化坐标与其他 IIA 型拓扑异构酶结构一致，在两个不同的活性位点各只有一个金属离子。
抗生素药物分类PDF
抗菌剂，也称为化学疗法，旨在通过抑制或杀死感染微生物，同时最大程度地减少对宿主的伤害来对抗感染。抗生素是一种由微生物产生的一种抗生素，可有选择地抑制或杀死低浓度的其他微生物的生长或杀死其他微生物。该定义不包括较高生物体产生的物质。可以根据其化学结构，作用机理，靶向生物类型，活性谱和来源分类。某些抗菌作用直接在细菌细胞壁上发挥作用，或者必须通过它，然后才能在细胞内水平破坏细菌代谢。类红霉素这样的抗生素可以靶向革兰氏阳性细菌，但对革兰氏阴性菌的含量无效，除非在极少数情况下。大多数细菌基于实验室中使用的染色技术属于这两类。革兰氏阴性物种，即使用最少的营养迅速繁殖，并且在医院和革兰氏阳性对应物的同时也发现。革兰氏阳性生物的例子包括金黄色葡萄球菌，化脓性链球菌和肺炎链球菌，而革兰氏阴性菌的葡萄球菌包括大肠杆菌，Neisseria Gonorrhea和Klebsiella。厌氧菌可在没有游离氧气的情况下生存，但需要特殊的条件才能在实验室中生长。但是，在某些情况下，它们会引起严重的感染。使用抗菌药物的问题之一是毒性，在注射部位或影响各种器官的全身毒性上可能表现为局部刺激。一些常见的分类包括： *磺酰胺和相关药物 *奎诺酮，如环丙沙星 *β-乳糖抗生素，例如青霉素和头孢菌素 * tetracyclines * tetracyclines，包括强力霉素 *氨基糖苷，包括氨基糖苷，包括链霉菌素和雌雄同体，包括Er雌激素 * Macrolosiv，酸毛霉素，酸糖尿病，酸糖苷，酸糖苷，酸糖尿病红唑和氯咪唑抗生素也可以根据其作用机制进行分类： *抑制细胞壁合成，例如青霉素和头孢菌素 *抑制蛋白质合成，包括四环素和红霉素在内*也可以根据它们主要针对的生物类型来分类： *抗菌剂，包括青霉素和氨基糖苷 *抗真菌药物，例如抗菌剂 *抗真菌药物，例如ZIDOVUDINE和ACYCLOVIR抗菌抗菌剂，也可以根据其靶向： *抗菌剂进行分类。抗吡喹剂，例如氯喹和甲硝唑 *抗智能剂，例如甲苯二唑和丙ama剂，也可以根据其活性谱进行分类： *狭窄的 - 谱抗微生物剂，例如青霉素g和erythromycin and themimictram and themicramic and themicriame and themicriame andimicrials，themicriame themiccl themiccl tatect themiccl themicrials themiCrimicClateCcltic themiCrimicClateCclticramic tatect the最后，抗菌物质通过迅速杀死细菌或阻止其复制来起作用。氯霉素会导致骨髓抑郁症，而四环素可能会损害肝脏和肾脏。抗菌剂还会引发无法预测且不与剂量有关的超敏反应。这些反应从轻度皮疹到严重的过敏性休克。它们可能是由青霉素，头孢菌素，磺酰胺或氟喹诺酮引起的。另一个主要问题是耐药性，随着时间的流逝，微生物对抗菌药物产生无反应性。这可能是由于某些微生物中的自然耐药性或由于这些药物长时间使用而获得的耐药性。超级感染是指抗菌治疗后新感染的发展。是因为人体的正常微生物菌群发生了改变，导致失衡会导致致病生物更容易确定自己。的例子包括念珠菌过度生长，这通常与四环素和氯霉素等广谱抗生素有关。为了最大程度地减少超级感染，尽可能使用特定的抗菌药物至关重要，避免使用这些药物治疗微不足道的感染，而不是不必要地延长抗菌治疗。使用抗菌剂会导致各种问题，例如肠道菌群被破坏时的维生素缺乏。这种破坏可能是由于某些改变肠道平衡的药物的使用可能会导致这种中断。此外，抗菌药物可以掩盖感染，暂时抑制症状，但可能导致后来更严重的结果。例如，将单剂量的青霉素用于淋病，可能会掩盖梅毒或TB，这是由于短期链霉素引起的。磺酰胺是一类较旧的抗菌剂，由于细菌耐药性和不良副作用的发展而被大大替换。这些化合物主要用作抑制抑制剂，抑制各种细菌的生长，包括革兰氏阳性和革兰氏阴性生物。其作用背后的机制涉及细菌干扰叶酸的合成，而人类可以从饮食中利用预先形成的叶酸。磺酰胺以不同的形式可用，每种都具有其独特的特征。可以根据其作用方式将它们广泛分为三个主要组：（1）抑制细胞壁合成，包括甲基核苷和奥沙西林等青霉素； （2）抑制蛋白质合成； （3）抑制细菌核酸合成。