抗生素耐药性细菌病原体是一个非常具有挑战性的问题。幽门螺杆菌是最广泛,最成功的人类病原体之一,因为它在世界一半的人群中分布,引起慢性和萎缩性胃炎,消化性溃疡,粘膜相关的淋巴样组织 - 淋巴瘤 - 淋巴瘤,甚至是胃腺癌。此外,它表现出对众多抗生素的抗性。幽门螺杆菌关键转录因子之一HP1043在调节必需细胞过程中起着基本作用。与其他细菌转录因子一样,HP1043不显示真核生物同源物。这些特征使HP1043成为发展新型抗菌策略的有前途的候选人。药物重新定位是药物开发中采用的相对较新的策略;测试对新目标的批准药物大大减少了此过程的时间和成本。组合的计算和体外方法进一步减少了要在体内测试的化合物的数量。我们的目标是确定能够防止HP1043结合DNA启动子的一部分。通过评估通过分子对接HP1043二聚体的结合能力在两个构象中,与DNA结合和未结合,从而达到了这一结果。采用包括MMGBSA分子动力学的临时管道,可获得七种药物。通过电泳迁移率转移测定法在体外测试了这些测定,以评估HP1043 - DNA相互作用。在其中,三个有希望的结果显示了HP1043的DNA结合活性的明显降低。总体而言,我们应用了一种计算方法,结合了结果的实验验证,以筛选幽门螺杆菌基本转录因子之一上的大量已知药物。这种方法允许快速减少测试的药物数量,并且药物重新定位方法大大降低了药物设计成本。鉴定的药物不属于同一药物类别,并且通过计算分析构成了不同的腔体,但都显示了DNA上HP1043结合活性的降低。
抽象目的幽门螺杆菌感染是全球慢性胃炎的常见原因,也是发展胃恶性肿瘤的确定危险因素。预测幽门螺杆菌状况的内窥镜外观以及其诊断精度也是一个持续的研究领域。这项研究旨在建立几种粘膜特征的诊断精度,可预测幽门螺杆菌负面状态,并在内窥镜检查时为使用一个简单的预测模型。设计接受高清上胃肠道(GI)内窥镜检查而无需放大的患者。在内窥镜检查过程中,注意到存在或不存在特定的内窥镜检查结果。悉尼方案活检被用作诊断参考标准,如果采取了尿布测试。结果告知了用于产生简单诊断方法的逻辑回归模型。随后使用30例患者的同类队列对该模型进行了验证。结果招募了153名患者并完成了研究方案。活性幽门螺杆菌感染的患病率为18.3%(28/153)。简单预测模型的总体诊断准确性为80.0%,有效的幽门螺杆菌感染患者中有100%正确分类。定期安排收集静脉(RAC)的存在表现出幽门螺杆菌状态的正预测价值为90.7%,60岁以下患者的幽门螺杆菌状态上升到93.6%。结论一个简单的内窥镜模型可能是预测患者幽门螺杆菌状况的准确性,并且需要基于活检的测试。NCT02385045。RAC在胃中的存在是幽门螺杆菌阴性状态的准确预测指标,尤其是在60岁以下的患者中。试验注册号这项研究已在临床检查中注册。
幽门螺杆菌的惊人特征之一是临床分离株之间广泛的遗传多样性。这种多样性归因于突变率升高,DNA修复受损,DNA转移和频繁重组事件。质粒也已在幽门螺杆菌中鉴定出来,但尚不清楚连接是否可以导致临床分离株之间的DNA转移。检查幽门螺杆菌是否具有共轭质粒转移的固有能力,将穿梭载体引入了幽门螺杆菌中,其中含有含有共轭Incp质粒质粒RP4的原始序列,但没有动员(MOB)基因。表明,这些载体可以稳定复制并在幽门螺杆菌菌株中动员。还证明,幽门螺杆菌染色体上携带的trag和弛豫酶(RLX)同源物对于质粒转移至关重要。引物扩展研究和诱变进一步证实了幽门螺杆菌中的弛豫酶同源物RLX1编码能够在RP4 ORIT上作用的功能酶。此外,这项研究的发现表明,TRAG和RLX1独立于先前描述的IV型分泌系统,包括由CAG致病性岛和梳子转化设备编码的,在介导H. Pylori菌株之间的结合质粒DNA转移中。