XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemIIE
评估HIFI长读取测序与整个基因组Bisulfite测序和甲基化史诗般的Beadchip阵列：利用DNA
DNA甲基化是最丰富，最广泛研究的表观遗传修饰之一，在各种生物学过程中起着至关重要的作用，例如发育，癌症，衰老和复杂疾病。在癌症基因组图集（TCGA）等大型队列研究中，Illumina阵列已被广泛用作高通量筛查的经典平台。但是，这种类型的阵列覆盖了人类基因组中的CpG位点的3％。最新一代的DNA测序技术以PACBIO HIFI系统为例，具有产生长序列读数的独特能力，最高为25千碱基。太平洋生物科学（PACBIO）的最新进步致力于提高每碱基准确性和检测DNA修饰的能力。在这项研究中，我们使用DNA甲基化标准评估了PACBIO HIFI测序的性能。由人DNA在CpG部位酶甲基化的DNA标准和未甲基化的人DNA源自HCT116 DKO细胞系。1 ug。样品被测序为约8倍覆盖范围。DNA甲基化数据，并使用PB-CPG-Tools从BAM文件中提取甲基化值。然后，我们比较了从PACBIO HIFI测序获得的结果与由史诗阵列和整个基因组亚硫酸盐测序（WGB）产生的结果。我们发现WGB和PACBIO HIFI天然DNA甲基化调用表现出很高的一致性，表现优于史诗般的阵列，这两种史诗阵列都与甲基化标准和报道的CPG数量一致。使用甲基化的标准样品，HIFI数据报告约有85％的CpG位点的甲基化比大于90％，平均基因组宽93％。同样，WGBS数据显示了约85％的CpG位点的甲基化比大于90％，平均基因组宽95％。相比之下，Epic阵列仅报告40％的CpG位点的甲基化比大于90％，而整个基因组中平均为87％。这些结果表明，HIFI长读取测序可以准确检测到接近100％甲基化的区域的DNA甲基化信号。我们的研究提供了对检测DNA甲基化模式的PACBIO HIFI测序表现的见解及其作为史诗阵列的替代方案的潜力。这项研究的发现说明了如何将DNA甲基化标准用作评估DNA甲基化调用模型的基础真实参考。
秋天，1964年
[？f'g f e; e f r ['！。 '-d c t g s f t f t i i; + e i r d e 5€a; “ l e i：g r4 iie€jf1;？e是iltig fs ieieg i5ri ii; f rei a i i i ii eril *：te i ifhil; ii f; ii f; 3gte+a; 3 i; 3 i;：;？iii *$ i =：1 h i =：1 H i 3 f;3;我l I * + 3 i 1; l€g iit + siiirc？gi; ailih f€tii r€ + riliii ii s€rif s *'i 3：f + s i a + [h？ f g g i i i€i i; S];我i l i l i g f t i l z a t + 5 f; g i a f t f $ a *' - * l; t l f i f s r; T I I J I E F L M F R 3 * E I T I = R？ f s + + * 7 = +; * g; S I;我; s f; + s -f * i q h f e'a il d q？ c d 3 t t +; ; + f ic e f r t 3 e * i e e：r e a a a a;我i i i i l i l i i i; n a，a s＃; e; -f; a r * s e = e p + - r = q i g l i s i * * f i'; i i * {i e i * i a -r a s * i'= i e e e; p“ t; i！ i {n f＃s r a i $ g i f 3 g s 6 *; t t t 3 s'i i l e％;我r：s; $？ i 3 3 f€g€c 1l：[iifitir i ri：fi; g i irsi* i; sli* fi：？i e r？ $ i i {i i s： ;是 ; e; 8。 5 s e g f s s＆a s i [1 r f l i l i l i = i r r r a -e n r i'e r q q i x t * + i i;3 i 1; l€g iit + siiirc？gi; ailih f€tii r€ + riliii ii s€rif s *'i 3：f + s i a + [h？f g g i i i€i i; S];我i l i l i g f t i l z a t + 5 f; g i a f t f $ a *' - * l; t l f i f s r; T I I J I E F L M F R 3 * E I T I = R？f s + + * 7 = +; * g; S I;我; s f; + s -f * i q h f e'a il d q？c d 3 t t +; ; + f ic e f r t 3 e * i e e：r e a a a a;我i i i i l i l i i i; n a，a s＃; e; -f; a r * s e = e p + - r = q i g l i s i * * f i'; i i * {i e i * i a -r a s * i'= i e e e; p“ t; i！i {n f＃s r a i $ g i f 3 g s 6 *; t t t 3 s'i i l e％;我r：s; $？i 3 3 f€g€c 1l：[iifitir i ri：fi; g i irsi* i; sli* fi：？i e r？$ i i {i i s： ;是 ; e; 8。5 s e g f s s＆a s i [1 r f l i l i l i = i r r r a -e n r i'e r q q i x t * + i i;
v:iririf wa ,.u k: - eVols
' nu huiiremR tn nrim mand，并且经常必须带领如此庞大的军队。我问过他的许多朋友，他如何能同时成为这两种人。拥有，（我们想象中彼此之间会相互争斗的特质。“他确实拥有它们，仅此而已”是我得到的最好的答案；“我不知道他是怎么做到的，但他确实拥有。”“他拥有一切，以最正确的方式对待人们，”一位非常了解他的人说道。“他拥有记住每个人的皇家天赋；公正机智的人性品质；以及超越人类的正义天赋。好人——喜欢他是因为他好；亲切地，我们在他天性中找到了一个回应的和弦，那些严厉的人会觉得他，100，有时很严厉。”他称赞过一个“汤米”士兵精神，以赢得士兵的忠诚，直到他生命的尽头和投降，就在同一天，他命令一位将军回家，他知道，这个命令带着一个和他一样好的人的仇恨，但没有能力实现他的野心。他的军队会做任何让他疲惫的事情；行军更久，挨饿更严重，在没有帐篷、毯子和朗姆酒的情况下度过更多的天和星期，死亡的人数比任何其他活着的人都要多。他们会心甘情愿、高兴地做所有这些事情，而其他军队可能会抗议和抱怨，然后继续抱怨。他可以从军队中获得更多；从卫队到最野蛮的侦察部队，就像在莫德河和布洛尼夫河之间所做的那样：。?in( 比任何俄罗斯人或德国人用铁腕勒索的还要多，而且 dl .11 j 1 。.- ..fiioe nim auaiiiaiiiine auuioriiy。它是所谓的“伦敦宠物”，Ouaida 打破了所有欧洲纪录，并且是三人组”。marcti into, tne Fr.-- e Stte 他们没有抱怨，而是把它当作吹嘘的事情。每当其他私人谴责另一位领导人时，罗伯特的人就会简单地说：“鲍勃知道他在做什么；鲍勃会做好工作。”大多数人只需用一句话来概括罗伯茨勋爵：“他是一个男人。”他不会犯任何让军队认识到的错误。无论他下达什么命令或做什么，都被视为超人灵感的体现。即使他失败了，他最终也肯定会被认为是绝对可靠的。过去英国军队的首领可能有不止一个，但英国历史上从未有过像罗伯茨这样受人崇拜的人，也从未有过如此有魅力的领导者。当他访问莫德河时，他遇到了梅休因勋爵，他住在旅馆里，将军。一直在清理“建筑”的一部分。-.-？fnl 将其指定为陆军元帅的住所。但罗伯茨勋爵感谢他。注意到他已下令将他的帐篷放在草原上，他打算留在那里。当他军队在运动、行军和战斗时，用有篷马车和帐篷运送物资，第一层是他的房子，第二层是他的工作室。马车是一辆轻型货车
v:iririf wa ,.uk: - eVols
' nu huiiremR tn nrim mand，并且经常必须带领如此庞大的军队。我问过他的许多朋友，他如何能同时成为这两种人。拥有我们想象中相互争斗的特质。“他确实拥有这些特质，仅此而已”是我得到的最好的答案；“我不知道他怎么拥有这些特质，但他确实拥有这些特质。”“他拥有所有的东西，对人们来说都是如此，从最好的意义上来说，”一位非常了解他的人说道。“他拥有记住每个人的皇家天赋；拥有无私机智的人性；拥有超越人类的正义天赋。好人喜欢他，因为他是好的；善于在他的天性中找到回应的和弦，那些严厉的人会觉得他有时很严厉。”他称赞了一位“汤米”的军人精神，以赢得这个人的忠诚，直到他生命的尽头和投降，就在同一天，他命令一位将军回国，知道这个命令带有一个和他一样好但没有能力实现他的野心的人的愤怒。他的军队会做任何让他疲惫的事情；行军更久，挨饿更严重，在没有帐篷、毯子和朗姆酒的情况下多呆几天和几周，死亡人数比任何其他活着的人都要多。他们会心甘情愿地做所有这些事情，而其他军队可能会抗议和抱怨，然后怀着怨恨继续前进。他可以从军队中得到更多；从卫队到最粗暴的侦察部队，就像在莫德河和布莱斯之间所做的那样。